MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020564	TGT	2	6	99184	99189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2502	NC_020564	TTG	2	6	99193	99198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2503	NC_020564	GTT	2	6	99308	99313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2504	NC_020564	TGT	2	6	99358	99363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2505	NC_020564	TTG	2	6	99367	99372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2506	NC_020564	T	6	6	99411	99416	0 %	100 %	0 %	0 %	470218011
2507	NC_020564	GTC	2	6	99450	99455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218011
2508	NC_020564	TGAA	2	8	99466	99473	50 %	25 %	25 %	0 %	470218011
2509	NC_020564	TTG	2	6	99531	99536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2510	NC_020564	TTG	2	6	99541	99546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2511	NC_020564	TTG	2	6	99555	99560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2512	NC_020564	ATC	2	6	99633	99638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218011
2513	NC_020564	TTG	2	6	99714	99719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218011
2514	NC_020564	GCA	2	6	99736	99741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218011
2515	NC_020564	GCA	2	6	99745	99750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218011
2516	NC_020564	CCA	2	6	99760	99765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218011
2517	NC_020564	TTTTTC	2	12	99832	99843	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470218011
2518	NC_020564	TGTA	2	8	99858	99865	25 %	50 %	25 %	0 %	470218011
2519	NC_020564	TCA	2	6	99875	99880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218011
2520	NC_020564	TTAAAT	2	12	99927	99938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020564	AAAT	2	8	99958	99965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020564	TAA	2	6	100030	100035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_020564	T	6	6	100058	100063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020564	A	6	6	100094	100099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020564	GTT	2	6	100181	100186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020564	A	6	6	100209	100214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020564	ATT	2	6	100265	100270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218012
2528	NC_020564	TAA	2	6	100302	100307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218012
2529	NC_020564	TAA	2	6	100323	100328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218012
2530	NC_020564	TGC	2	6	100345	100350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218012
2531	NC_020564	TTTC	2	8	100375	100382	0 %	75 %	0 %	25 %	470218012
2532	NC_020564	TTA	2	6	100403	100408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218012
2533	NC_020564	T	6	6	100420	100425	0 %	100 %	0 %	0 %	470218012
2534	NC_020564	ATT	2	6	100428	100433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218012
2535	NC_020564	TGG	2	6	100462	100467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218012
2536	NC_020564	AAG	2	6	100488	100493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218012
2537	NC_020564	ATA	2	6	100519	100524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218012
2538	NC_020564	T	6	6	100563	100568	0 %	100 %	0 %	0 %	470218012
2539	NC_020564	ATA	2	6	100570	100575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218012
2540	NC_020564	CAT	2	6	100596	100601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218012
2541	NC_020564	ATC	2	6	100633	100638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218012
2542	NC_020564	TC	3	6	100712	100717	0 %	50 %	0 %	50 %	470218012
2543	NC_020564	GTT	2	6	100718	100723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218012
2544	NC_020564	TCA	2	6	100753	100758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218012
2545	NC_020564	AT	3	6	100780	100785	50 %	50 %	0 %	0 %	470218012
2546	NC_020564	TCT	2	6	100853	100858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218012
2547	NC_020564	GT	3	6	100868	100873	0 %	50 %	50 %	0 %	470218012
2548	NC_020564	TGA	2	6	100882	100887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218012
2549	NC_020564	AATA	2	8	100888	100895	75 %	25 %	0 %	0 %	470218012
2550	NC_020564	T	6	6	100944	100949	0 %	100 %	0 %	0 %	470218012
2551	NC_020564	AT	3	6	100963	100968	50 %	50 %	0 %	0 %	470218012
2552	NC_020564	TTA	2	6	101005	101010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218012
2553	NC_020564	ATA	2	6	101064	101069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020564	AAT	2	6	101075	101080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020564	ATA	2	6	101100	101105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020564	TTA	2	6	101114	101119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020564	GAA	2	6	101197	101202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020564	ATTG	2	8	101204	101211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020564	TA	3	6	101242	101247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_020564	TAACAA	2	12	101284	101295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2561	NC_020564	A	7	7	101309	101315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020564	GTTA	2	8	101326	101333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020564	TAA	2	6	101376	101381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_020564	TAA	3	9	101405	101413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218013
2565	NC_020564	GAA	2	6	101420	101425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218013
2566	NC_020564	AGC	2	6	101438	101443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218013
2567	NC_020564	AATA	2	8	101444	101451	75 %	25 %	0 %	0 %	470218013
2568	NC_020564	CTG	2	6	101455	101460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218013
2569	NC_020564	CTT	2	6	101464	101469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218013
2570	NC_020564	AAT	2	6	101525	101530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218013
2571	NC_020564	GTG	2	6	101587	101592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218013
2572	NC_020564	CTA	2	6	101620	101625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218013
2573	NC_020564	TAG	2	6	101650	101655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218013
2574	NC_020564	TAAGCC	2	12	101693	101704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218013
2575	NC_020564	TCA	2	6	101718	101723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218013
2576	NC_020564	AAC	2	6	101760	101765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218013
2577	NC_020564	GCA	2	6	101856	101861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218013
2578	NC_020564	AAC	2	6	101907	101912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218013
2579	NC_020564	GAT	2	6	101930	101935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218013
2580	NC_020564	ATC	2	6	101985	101990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218013
2581	NC_020564	ACA	2	6	102066	102071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218013
2582	NC_020564	CAC	2	6	102085	102090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218013
2583	NC_020564	ATA	2	6	102102	102107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218013
2584	NC_020564	T	6	6	102126	102131	0 %	100 %	0 %	0 %	470218013
2585	NC_020564	ATC	2	6	102297	102302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218013
2586	NC_020564	AGATG	2	10	102343	102352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020564	T	6	6	102362	102367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020564	ATA	2	6	102407	102412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2589	NC_020564	ATT	2	6	102476	102481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218014
2590	NC_020564	CAA	2	6	102489	102494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2591	NC_020564	TGG	2	6	102559	102564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218014
2592	NC_020564	TAA	2	6	102565	102570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2593	NC_020564	TGA	2	6	102651	102656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218014
2594	NC_020564	ATA	2	6	102659	102664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2595	NC_020564	ATC	2	6	102665	102670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2596	NC_020564	GTC	2	6	102712	102717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218014
2597	NC_020564	TCA	2	6	102723	102728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2598	NC_020564	TG	3	6	102738	102743	0 %	50 %	50 %	0 %	470218014
2599	NC_020564	AAT	2	6	102787	102792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2600	NC_020564	ATA	2	6	102843	102848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2601	NC_020564	ATA	2	6	102872	102877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218014
2602	NC_020564	ATCGCA	2	12	102908	102919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470218014
2603	NC_020564	GGTGA	2	10	102939	102948	20 %	20 %	60 %	0 %	470218014
2604	NC_020564	CAA	2	6	102978	102983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2605	NC_020564	AAC	2	6	102994	102999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2606	NC_020564	A	6	6	103075	103080	100 %	0 %	0 %	0 %	470218014
2607	NC_020564	CAA	2	6	103147	103152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2608	NC_020564	GCA	2	6	103169	103174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218014
2609	NC_020564	ACA	2	6	103220	103225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218014
2610	NC_020564	CTA	2	6	103320	103325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218014
2611	NC_020564	ATT	2	6	103392	103397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218015
2612	NC_020564	ATC	2	6	103495	103500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
2613	NC_020564	GTT	2	6	103510	103515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218015
2614	NC_020564	GCA	2	6	103583	103588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218015
2615	NC_020564	TAC	2	6	103612	103617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
2616	NC_020564	CTTT	2	8	103649	103656	0 %	75 %	0 %	25 %	470218015
2617	NC_020564	ATA	2	6	103670	103675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218015
2618	NC_020564	TTA	2	6	103709	103714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218015
2619	NC_020564	CCA	2	6	103754	103759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218015
2620	NC_020564	AAC	2	6	103792	103797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218015
2621	NC_020564	ATC	2	6	103864	103869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218015
2622	NC_020564	CTT	2	6	103893	103898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218015
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2624	NC_020564	TTTGAA	2	12	103939	103950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470218015
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2748	NC_020564	CA	3	6	109580	109585	50 %	0 %	0 %	50 %	470218019
2749	NC_020564	A	6	6	109611	109616	100 %	0 %	0 %	0 %	470218019
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2995	NC_020564	CAA	2	6	120604	120609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218029
2996	NC_020564	ATG	2	6	120632	120637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218029
2997	NC_020564	TAT	2	6	120674	120679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218029
2998	NC_020564	ATACG	2	10	120684	120693	40 %	20 %	20 %	20 %	470218029
2999	NC_020564	TAA	2	6	120701	120706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218029
3000	NC_020564	TAG	2	6	120797	120802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218029

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