MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020564	TGG	2	6	20175	20180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217958
502	NC_020564	TGC	2	6	20199	20204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217958
503	NC_020564	ACA	2	6	20250	20255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217958
504	NC_020564	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020564	A	6	6	20331	20336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020564	AAG	2	6	20347	20352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020564	CTT	2	6	20375	20380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020564	A	6	6	20442	20447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020564	CAA	2	6	20466	20471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020564	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020564	GGT	2	6	20547	20552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020564	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020564	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_020564	AAG	2	6	20695	20700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020564	AC	3	6	20720	20725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_020564	GTCT	2	8	20823	20830	0 %	50 %	25 %	25 %	470217959
517	NC_020564	ATT	2	6	20839	20844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217959
518	NC_020564	TAC	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217959
519	NC_020564	ATG	2	6	20932	20937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
520	NC_020564	ATA	2	6	20951	20956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217959
521	NC_020564	TGT	2	6	20967	20972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217959
522	NC_020564	TGAA	2	8	21008	21015	50 %	25 %	25 %	0 %	470217959
523	NC_020564	ACG	2	6	21061	21066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217959
524	NC_020564	TAT	2	6	21079	21084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217959
525	NC_020564	GCAT	2	8	21102	21109	25 %	25 %	25 %	25 %	470217959
526	NC_020564	GATT	2	8	21119	21126	25 %	50 %	25 %	0 %	470217959
527	NC_020564	ATG	2	6	21149	21154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
528	NC_020564	ATG	2	6	21161	21166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
529	NC_020564	ATC	2	6	21219	21224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217959
530	NC_020564	CAG	2	6	21359	21364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470217959
531	NC_020564	GGTA	2	8	21609	21616	25 %	25 %	50 %	0 %	470217959
532	NC_020564	TGA	2	6	21642	21647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
533	NC_020564	GTC	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217959
534	NC_020564	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470217959
535	NC_020564	ACT	2	6	21731	21736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217959
536	NC_020564	ACA	2	6	21780	21785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217959
537	NC_020564	TC	3	6	21800	21805	0 %	50 %	0 %	50 %	470217959
538	NC_020564	GTG	2	6	21869	21874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217959
539	NC_020564	AAC	2	6	21878	21883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217959
540	NC_020564	ATG	2	6	21901	21906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
541	NC_020564	TGA	2	6	21969	21974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
542	NC_020564	GGC	2	6	21988	21993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470217959
543	NC_020564	GAT	2	6	22000	22005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
544	NC_020564	GAT	2	6	22009	22014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
545	NC_020564	GGT	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217959
546	NC_020564	ATG	2	6	22037	22042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
547	NC_020564	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470217959
548	NC_020564	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470217959
549	NC_020564	ATA	2	6	22124	22129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217959
550	NC_020564	ATG	2	6	22162	22167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217959
551	NC_020564	A	6	6	22169	22174	100 %	0 %	0 %	0 %	470217959
552	NC_020564	AAT	2	6	22187	22192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020564	GAT	2	6	22199	22204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020564	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020564	TCA	2	6	22451	22456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217960
556	NC_020564	GTA	2	6	22460	22465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217960
557	NC_020564	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
558	NC_020564	CG	3	6	22537	22542	0 %	0 %	50 %	50 %	470217960
559	NC_020564	GGT	2	6	22550	22555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470217960
560	NC_020564	AAT	2	6	22556	22561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217960
561	NC_020564	GTT	2	6	22664	22669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217960
562	NC_020564	GAA	2	6	22793	22798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
563	NC_020564	A	6	6	22832	22837	100 %	0 %	0 %	0 %	470217960
564	NC_020564	ATT	2	6	22921	22926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217960
565	NC_020564	CAT	2	6	22986	22991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217960
566	NC_020564	TGA	2	6	22993	22998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217960
567	NC_020564	GAA	2	6	23006	23011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
568	NC_020564	TGC	2	6	23017	23022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217960
569	NC_020564	ATT	2	6	23287	23292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217960
570	NC_020564	CAT	2	6	23306	23311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470217960
571	NC_020564	ACA	3	9	23339	23347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217960
572	NC_020564	CGT	2	6	23357	23362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217960
573	NC_020564	GGTT	2	8	23366	23373	0 %	50 %	50 %	0 %	470217960
574	NC_020564	TCG	2	6	23398	23403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217960
575	NC_020564	AGA	2	6	23578	23583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
576	NC_020564	AGA	2	6	23605	23610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217960
577	NC_020564	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470217960
578	NC_020564	TCT	2	6	23676	23681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470217960
579	NC_020564	AACA	2	8	23700	23707	75 %	0 %	0 %	25 %	470217960
580	NC_020564	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020564	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020564	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020564	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_020564	GAT	2	6	23890	23895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020564	AAG	2	6	23909	23914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020564	TAA	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020564	ATT	2	6	24021	24026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020564	ATA	2	6	24027	24032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020564	TTC	2	6	24072	24077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_020564	A	6	6	24078	24083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020564	A	6	6	24101	24106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020564	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_020564	CGG	2	6	24197	24202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_020564	T	6	6	24235	24240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020564	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_020564	T	7	7	24343	24349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020564	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020564	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020564	TTA	2	6	24492	24497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020564	TTC	2	6	24529	24534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020564	CCA	2	6	24546	24551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_020564	TCC	2	6	24553	24558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_020564	AAT	2	6	24590	24595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020564	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020564	TAT	2	6	24651	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020564	TCA	2	6	24670	24675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_020564	CCG	2	6	24701	24706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_020564	TAA	2	6	24715	24720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020564	A	6	6	24719	24724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020564	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020564	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020564	T	6	6	24855	24860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020564	A	6	6	24885	24890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020564	ATA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020564	GTT	2	6	24946	24951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470217961
616	NC_020564	TGA	3	9	24957	24965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217961
617	NC_020564	A	7	7	24999	25005	100 %	0 %	0 %	0 %	470217961
618	NC_020564	ATG	2	6	25040	25045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217961
619	NC_020564	GAA	3	9	25063	25071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470217961
620	NC_020564	A	6	6	25141	25146	100 %	0 %	0 %	0 %	470217961
621	NC_020564	AAT	3	9	25158	25166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470217961
622	NC_020564	CGT	2	6	25285	25290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217961
623	NC_020564	A	6	6	25381	25386	100 %	0 %	0 %	0 %	470217961
624	NC_020564	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470217961
625	NC_020564	ATT	2	6	25433	25438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217961
626	NC_020564	TTA	2	6	25477	25482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470217961
627	NC_020564	GTAC	2	8	25516	25523	25 %	25 %	25 %	25 %	470217961
628	NC_020564	TCG	2	6	25539	25544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470217961
629	NC_020564	GAT	2	6	25564	25569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470217961
630	NC_020564	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	470217961
631	NC_020564	TCC	2	6	25616	25621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470217961
632	NC_020564	AAC	2	6	25622	25627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217961
633	NC_020564	AAC	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470217962
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