MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020564	TCA	2	6	249529	249534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218123
6002	NC_020564	ATTG	2	8	249611	249618	25 %	50 %	25 %	0 %	470218124
6003	NC_020564	AATT	2	8	249658	249665	50 %	50 %	0 %	0 %	470218124
6004	NC_020564	AAT	2	6	249679	249684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218124
6005	NC_020564	CTT	2	6	249804	249809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218124
6006	NC_020564	TTTA	2	8	249958	249965	25 %	75 %	0 %	0 %	470218124
6007	NC_020564	CCA	2	6	249989	249994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218124
6008	NC_020564	TAAA	2	8	250091	250098	75 %	25 %	0 %	0 %	470218124
6009	NC_020564	CAT	2	6	250209	250214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218124
6010	NC_020564	TTC	2	6	250225	250230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218124
6011	NC_020564	AG	3	6	250243	250248	50 %	0 %	50 %	0 %	470218124
6012	NC_020564	ATT	2	6	250252	250257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218124
6013	NC_020564	AGC	2	6	250303	250308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218124
6014	NC_020564	TTC	2	6	250372	250377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218124
6015	NC_020564	AAT	2	6	250395	250400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218124
6016	NC_020564	TCT	2	6	250433	250438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218124
6017	NC_020564	AAC	2	6	250474	250479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218124
6018	NC_020564	GTC	2	6	250501	250506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218124
6019	NC_020564	CTT	2	6	250590	250595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218124
6020	NC_020564	TAAA	2	8	250600	250607	75 %	25 %	0 %	0 %	470218124
6021	NC_020564	TTG	2	6	250615	250620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218124
6022	NC_020564	AGT	2	6	250640	250645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218124
6023	NC_020564	TGTAA	2	10	250668	250677	40 %	40 %	20 %	0 %	470218124
6024	NC_020564	ATC	2	6	250714	250719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218124
6025	NC_020564	GTT	2	6	250721	250726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218124
6026	NC_020564	TTTAC	2	10	250733	250742	20 %	60 %	0 %	20 %	470218124
6027	NC_020564	TAA	2	6	250788	250793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218124
6028	NC_020564	TAA	2	6	250801	250806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218124
6029	NC_020564	A	6	6	250850	250855	100 %	0 %	0 %	0 %	470218124
6030	NC_020564	ATT	2	6	250870	250875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218124
6031	NC_020564	GAA	2	6	250898	250903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218124
6032	NC_020564	ATC	2	6	250954	250959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218124
6033	NC_020564	CGG	2	6	251067	251072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218124
6034	NC_020564	ATCAC	2	10	251105	251114	40 %	20 %	0 %	40 %	470218124
6035	NC_020564	TGT	2	6	251129	251134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218124
6036	NC_020564	CAAG	2	8	251158	251165	50 %	0 %	25 %	25 %	470218124
6037	NC_020564	ATAAC	2	10	251230	251239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_020564	ATA	2	6	251277	251282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020564	TGAAT	2	10	251341	251350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020564	TA	3	6	251365	251370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020564	ATTAA	2	10	251482	251491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020564	TAT	2	6	251500	251505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_020564	ATC	2	6	251542	251547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218125
6044	NC_020564	GAA	2	6	251548	251553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218125
6045	NC_020564	AGA	2	6	251564	251569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218125
6046	NC_020564	ACA	2	6	251571	251576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218125
6047	NC_020564	TCA	2	6	251619	251624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218125
6048	NC_020564	ACAT	2	8	251653	251660	50 %	25 %	0 %	25 %	470218125
6049	NC_020564	AAG	2	6	251735	251740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218125
6050	NC_020564	AATC	2	8	251761	251768	50 %	25 %	0 %	25 %	470218125
6051	NC_020564	ATG	2	6	251785	251790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218125
6052	NC_020564	AGA	2	6	251915	251920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218125
6053	NC_020564	TAA	2	6	252005	252010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218125
6054	NC_020564	TTC	2	6	252072	252077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218125
6055	NC_020564	TTA	2	6	252121	252126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218125
6056	NC_020564	GGC	2	6	252141	252146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218125
6057	NC_020564	TAT	2	6	252172	252177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218125
6058	NC_020564	TAG	2	6	252244	252249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218125
6059	NC_020564	GAA	2	6	252258	252263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218125
6060	NC_020564	ATT	2	6	252279	252284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218125
6061	NC_020564	ATT	2	6	252329	252334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218125
6062	NC_020564	TGC	2	6	252341	252346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218125
6063	NC_020564	CAG	2	6	252376	252381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218125
6064	NC_020564	ATT	2	6	252419	252424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218125
6065	NC_020564	CGTG	2	8	252441	252448	0 %	25 %	50 %	25 %	470218125
6066	NC_020564	TGG	2	6	252458	252463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218125
6067	NC_020564	TTG	2	6	252484	252489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218125
6068	NC_020564	TGC	2	6	252491	252496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218125
6069	NC_020564	ATTT	2	8	252641	252648	25 %	75 %	0 %	0 %	470218125
6070	NC_020564	TG	3	6	252659	252664	0 %	50 %	50 %	0 %	470218125
6071	NC_020564	AGAA	2	8	252718	252725	75 %	0 %	25 %	0 %	470218125
6072	NC_020564	AAC	2	6	252733	252738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218125
6073	NC_020564	A	6	6	252741	252746	100 %	0 %	0 %	0 %	470218125
6074	NC_020564	AAT	3	9	252754	252762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218125
6075	NC_020564	GGAATA	2	12	252827	252838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020564	A	6	6	252851	252856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020564	TA	3	6	252892	252897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_020564	TAA	2	6	252925	252930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020564	TCA	2	6	252946	252951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_020564	GTT	2	6	253085	253090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218126
6081	NC_020564	AGC	2	6	253150	253155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
6082	NC_020564	TAA	2	6	253212	253217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
6083	NC_020564	ATTA	2	8	253270	253277	50 %	50 %	0 %	0 %	470218126
6084	NC_020564	ATC	2	6	253279	253284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
6085	NC_020564	TAT	2	6	253293	253298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
6086	NC_020564	TTA	2	6	253310	253315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
6087	NC_020564	T	6	6	253327	253332	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
6088	NC_020564	TCA	2	6	253436	253441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
6089	NC_020564	T	6	6	253471	253476	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
6090	NC_020564	GAC	2	6	253518	253523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
6091	NC_020564	TAA	2	6	253582	253587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
6092	NC_020564	TTTG	2	8	253608	253615	0 %	75 %	25 %	0 %	470218126
6093	NC_020564	AT	3	6	253634	253639	50 %	50 %	0 %	0 %	470218126
6094	NC_020564	ATGAT	2	10	253718	253727	40 %	40 %	20 %	0 %	470218126
6095	NC_020564	T	7	7	253755	253761	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
6096	NC_020564	AAG	2	6	253785	253790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218126
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6099	NC_020564	TTA	2	6	253869	253874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
6100	NC_020564	ATC	2	6	253876	253881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218126
6101	NC_020564	ATT	2	6	253909	253914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218126
6102	NC_020564	TCT	2	6	253919	253924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218126
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6105	NC_020564	T	7	7	254208	254214	0 %	100 %	0 %	0 %	470218126
6106	NC_020564	TGA	2	6	254321	254326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218126
6107	NC_020564	AAT	2	6	254375	254380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218126
6108	NC_020564	GCA	2	6	254387	254392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218126
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6110	NC_020564	TTCAT	2	10	254543	254552	20 %	60 %	0 %	20 %	470218126
6111	NC_020564	CT	3	6	254558	254563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_020564	CAA	2	6	254585	254590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_020564	TGT	2	6	254626	254631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020564	ATT	2	6	254644	254649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020564	AATT	2	8	254657	254664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020564	GTA	2	6	254665	254670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020564	AAAT	2	8	254685	254692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_020564	AT	3	6	254737	254742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_020564	CTG	2	6	254760	254765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_020564	TAC	2	6	254769	254774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_020564	TGC	2	6	254799	254804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_020564	AAT	2	6	254984	254989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020564	TAT	2	6	255059	255064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_020564	TGT	2	6	255149	255154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_020564	GAC	2	6	255160	255165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6239	NC_020564	AT	3	6	260331	260336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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