MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020564	CGA	2	6	225587	225592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218108
5502	NC_020564	GAA	3	9	225793	225801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218108
5503	NC_020564	CAT	2	6	225937	225942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_020564	AGG	2	6	225949	225954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020564	CAT	2	6	225957	225962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218109
5506	NC_020564	TGG	2	6	225993	225998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218109
5507	NC_020564	GAT	2	6	226086	226091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
5508	NC_020564	TTG	2	6	226154	226159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218109
5509	NC_020564	GGT	2	6	226164	226169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218109
5510	NC_020564	GAC	2	6	226260	226265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218109
5511	NC_020564	TAA	2	6	226296	226301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218109
5512	NC_020564	ATT	2	6	226311	226316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218109
5513	NC_020564	CA	3	6	226339	226344	50 %	0 %	0 %	50 %	470218109
5514	NC_020564	A	6	6	226363	226368	100 %	0 %	0 %	0 %	470218109
5515	NC_020564	TGGT	2	8	226385	226392	0 %	50 %	50 %	0 %	470218109
5516	NC_020564	TAG	2	6	226400	226405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
5517	NC_020564	TGGG	2	8	226440	226447	0 %	25 %	75 %	0 %	470218109
5518	NC_020564	AAC	2	6	226589	226594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218109
5519	NC_020564	GAT	2	6	226645	226650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218109
5520	NC_020564	AGCA	2	8	226683	226690	50 %	0 %	25 %	25 %	470218109
5521	NC_020564	ATTT	2	8	226772	226779	25 %	75 %	0 %	0 %	470218109
5522	NC_020564	AT	3	6	226789	226794	50 %	50 %	0 %	0 %	470218109
5523	NC_020564	AAAGC	2	10	226820	226829	60 %	0 %	20 %	20 %	470218109
5524	NC_020564	GA	3	6	226861	226866	50 %	0 %	50 %	0 %	470218109
5525	NC_020564	AGA	2	6	226902	226907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218109
5526	NC_020564	GAA	2	6	226924	226929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218109
5527	NC_020564	ATT	2	6	227004	227009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020564	AT	3	6	227010	227015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020564	AAG	2	6	227038	227043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020564	TAT	2	6	227078	227083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
5531	NC_020564	TGGAT	2	10	227130	227139	20 %	40 %	40 %	0 %	470218110
5532	NC_020564	GGT	2	6	227158	227163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
5533	NC_020564	GTT	2	6	227196	227201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218110
5534	NC_020564	CAGA	2	8	227243	227250	50 %	0 %	25 %	25 %	470218110
5535	NC_020564	AAG	2	6	227315	227320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218110
5536	NC_020564	GTT	2	6	227374	227379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218110
5537	NC_020564	GAT	2	6	227407	227412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218110
5538	NC_020564	AT	3	6	227625	227630	50 %	50 %	0 %	0 %	470218110
5539	NC_020564	TGG	2	6	227659	227664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
5540	NC_020564	TGC	2	6	227682	227687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218110
5541	NC_020564	TCA	2	6	227718	227723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218110
5542	NC_020564	TTA	3	9	227882	227890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
5543	NC_020564	TAT	2	6	227931	227936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218110
5544	NC_020564	AGA	2	6	227943	227948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218110
5545	NC_020564	CAG	2	6	228002	228007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470218110
5546	NC_020564	TGG	2	6	228013	228018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218110
5547	NC_020564	ATA	2	6	228021	228026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218110
5548	NC_020564	TGG	2	6	228066	228071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020564	TGAA	2	8	228078	228085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020564	TTGT	2	8	228137	228144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020564	AAG	2	6	228146	228151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020564	TA	3	6	228160	228165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020564	TA	3	6	228222	228227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020564	ATA	2	6	228252	228257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020564	A	7	7	228257	228263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020564	TGT	2	6	228267	228272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020564	AATAT	2	10	228312	228321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_020564	TGA	2	6	228364	228369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020564	TCT	2	6	228404	228409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218111
5560	NC_020564	TAA	2	6	228448	228453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5561	NC_020564	GT	3	6	228472	228477	0 %	50 %	50 %	0 %	470218111
5562	NC_020564	TAA	3	9	228478	228486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5563	NC_020564	ATG	2	6	228506	228511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218111
5564	NC_020564	AAG	2	6	228515	228520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218111
5565	NC_020564	TA	3	6	228543	228548	50 %	50 %	0 %	0 %	470218111
5566	NC_020564	TAA	2	6	228558	228563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5567	NC_020564	AAT	2	6	228584	228589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5568	NC_020564	ACC	2	6	228604	228609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218111
5569	NC_020564	TAA	2	6	228618	228623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5570	NC_020564	ATAA	2	8	228626	228633	75 %	25 %	0 %	0 %	470218111
5571	NC_020564	TAA	2	6	228699	228704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218111
5572	NC_020564	GT	3	6	228739	228744	0 %	50 %	50 %	0 %	470218111
5573	NC_020564	ATAG	2	8	228866	228873	50 %	25 %	25 %	0 %	470218111
5574	NC_020564	ATG	2	6	228878	228883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218111
5575	NC_020564	TCC	2	6	228884	228889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470218111
5576	NC_020564	ACA	2	6	228923	228928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218111
5577	NC_020564	TATT	2	8	228969	228976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020564	TAA	2	6	229036	229041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020564	AT	3	6	229074	229079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020564	T	6	6	229118	229123	0 %	100 %	0 %	0 %	470218112
5581	NC_020564	CTTT	2	8	229200	229207	0 %	75 %	0 %	25 %	470218112
5582	NC_020564	AAC	2	6	229247	229252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218112
5583	NC_020564	GGC	2	6	229258	229263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218112
5584	NC_020564	TAT	2	6	229396	229401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5585	NC_020564	CTTA	2	8	229408	229415	25 %	50 %	0 %	25 %	470218112
5586	NC_020564	ATT	2	6	229480	229485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5587	NC_020564	TGG	2	6	229525	229530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
5588	NC_020564	ATA	2	6	229611	229616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218112
5589	NC_020564	GGT	2	6	229619	229624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
5590	NC_020564	GGT	2	6	229634	229639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470218112
5591	NC_020564	TTC	2	6	229664	229669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218112
5592	NC_020564	ATT	2	6	229735	229740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5593	NC_020564	GAT	2	6	229751	229756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218112
5594	NC_020564	AGA	2	6	229759	229764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
5595	NC_020564	GAA	2	6	229784	229789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
5596	NC_020564	A	6	6	229856	229861	100 %	0 %	0 %	0 %	470218112
5597	NC_020564	TAT	2	6	230040	230045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5598	NC_020564	TTA	2	6	230063	230068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5599	NC_020564	GTC	2	6	230073	230078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218112
5600	NC_020564	TGT	2	6	230119	230124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218112
5601	NC_020564	ATG	2	6	230153	230158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218112
5602	NC_020564	ATT	2	6	230206	230211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5603	NC_020564	GGC	2	6	230323	230328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470218112
5604	NC_020564	TGGA	2	8	230380	230387	25 %	25 %	50 %	0 %	470218112
5605	NC_020564	TCT	2	6	230403	230408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218112
5606	NC_020564	ATT	2	6	230416	230421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470218112
5607	NC_020564	GAA	2	6	230459	230464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470218112
5608	NC_020564	AT	3	6	230598	230603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_020564	CT	3	6	230749	230754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_020564	GAAA	2	8	230767	230774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020564	GCTT	2	8	230857	230864	0 %	50 %	25 %	25 %	470218113
5612	NC_020564	AAT	2	6	230867	230872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
5613	NC_020564	T	6	6	230895	230900	0 %	100 %	0 %	0 %	470218113
5614	NC_020564	AAT	2	6	231014	231019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
5615	NC_020564	TCGCA	2	10	231054	231063	20 %	20 %	20 %	40 %	470218113
5616	NC_020564	CAA	2	6	231140	231145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470218113
5617	NC_020564	ATA	2	6	231156	231161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
5618	NC_020564	ATC	2	6	231162	231167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218113
5619	NC_020564	CAT	2	6	231197	231202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218113
5620	NC_020564	TTG	2	6	231234	231239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218113
5621	NC_020564	TAA	2	6	231243	231248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
5622	NC_020564	TAA	2	6	231303	231308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
5623	NC_020564	ATG	2	6	231321	231326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218113
5624	NC_020564	AT	3	6	231343	231348	50 %	50 %	0 %	0 %	470218113
5625	NC_020564	ATA	2	6	231368	231373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218113
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5747	NC_020564	CTTA	2	8	237068	237075	25 %	50 %	0 %	25 %	470218117
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5875	NC_020564	CCA	2	6	243243	243248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470218120
5876	NC_020564	AT	3	6	243265	243270	50 %	50 %	0 %	0 %	470218120
5877	NC_020564	CTT	2	6	243280	243285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470218120
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5887	NC_020564	TCA	2	6	243901	243906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218120
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5889	NC_020564	TGA	2	6	243986	243991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470218120
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5891	NC_020564	TCGT	2	8	244051	244058	0 %	50 %	25 %	25 %	470218120
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5893	NC_020564	CAT	2	6	244180	244185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218120
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5895	NC_020564	TTGCT	2	10	244211	244220	0 %	60 %	20 %	20 %	470218120
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5897	NC_020564	ATC	2	6	244272	244277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470218120
5898	NC_020564	CT	3	6	244278	244283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5899	NC_020564	T	6	6	244351	244356	0 %	100 %	0 %	0 %	470218121
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5903	NC_020564	GTTT	2	8	244591	244598	0 %	75 %	25 %	0 %	470218121
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5907	NC_020564	TAA	2	6	244831	244836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470218121
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5948	NC_020564	T	6	6	246702	246707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5949	NC_020564	ATT	2	6	246732	246737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5963	NC_020564	TACT	2	8	247828	247835	25 %	50 %	0 %	25 %	470218122
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5969	NC_020564	TCAT	2	8	248089	248096	25 %	50 %	0 %	25 %	470218123
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5979	NC_020564	TCG	2	6	248422	248427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470218123
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5997	NC_020564	T	6	6	249420	249425	0 %	100 %	0 %	0 %	470218123
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5999	NC_020564	GTT	2	6	249476	249481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470218123
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