MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 3822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020562	CGG	2	6	66489	66494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434038
1502	NC_020562	TCGA	2	8	66536	66543	25 %	25 %	25 %	25 %	472434038
1503	NC_020562	GCT	2	6	66621	66626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434038
1504	NC_020562	TCT	2	6	66696	66701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434038
1505	NC_020562	TCT	2	6	66717	66722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434038
1506	NC_020562	CAT	2	6	66759	66764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020562	AG	3	6	66811	66816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020562	AAC	2	6	66864	66869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020562	AGGCA	2	10	66984	66993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_020562	CG	3	6	67027	67032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_020562	TCA	2	6	67050	67055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434039
1512	NC_020562	CTG	2	6	67118	67123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434039
1513	NC_020562	ACG	3	9	67179	67187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434039
1514	NC_020562	CTT	2	6	67201	67206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434039
1515	NC_020562	CAT	2	6	67243	67248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434039
1516	NC_020562	CGG	2	6	67265	67270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434039
1517	NC_020562	TCA	2	6	67289	67294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434039
1518	NC_020562	CTG	2	6	67486	67491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1519	NC_020562	CG	3	6	67512	67517	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1520	NC_020562	AGC	2	6	67548	67553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1521	NC_020562	GGCC	2	8	67576	67583	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1522	NC_020562	CCCAG	2	10	67588	67597	20 %	0 %	20 %	60 %	472434040
1523	NC_020562	GCT	2	6	67615	67620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1524	NC_020562	CG	3	6	67719	67724	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1525	NC_020562	AATG	2	8	67781	67788	50 %	25 %	25 %	0 %	472434040
1526	NC_020562	TTC	2	6	67796	67801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434040
1527	NC_020562	ATG	2	6	67810	67815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1528	NC_020562	GCCC	2	8	67861	67868	0 %	0 %	25 %	75 %	472434040
1529	NC_020562	ACC	2	6	67884	67889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434040
1530	NC_020562	GCG	2	6	67915	67920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1531	NC_020562	CGG	2	6	67925	67930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1532	NC_020562	TCT	2	6	67947	67952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434040
1533	NC_020562	GAT	2	6	67991	67996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1534	NC_020562	AGC	2	6	68049	68054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1535	NC_020562	CGC	2	6	68133	68138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1536	NC_020562	ATC	2	6	68171	68176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434040
1537	NC_020562	CCA	2	6	68179	68184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434040
1538	NC_020562	CGAT	2	8	68188	68195	25 %	25 %	25 %	25 %	472434040
1539	NC_020562	CGA	2	6	68296	68301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1540	NC_020562	CG	3	6	68358	68363	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1541	NC_020562	CAA	2	6	68390	68395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472434040
1542	NC_020562	CGC	2	6	68483	68488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1543	NC_020562	TGATCA	2	12	68500	68511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472434040
1544	NC_020562	GAT	2	6	68614	68619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434040
1545	NC_020562	GCC	2	6	68628	68633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1546	NC_020562	CG	3	6	68635	68640	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1547	NC_020562	GGC	2	6	68696	68701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1548	NC_020562	CCT	2	6	68722	68727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434040
1549	NC_020562	GGC	2	6	68743	68748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1550	NC_020562	GC	3	6	68761	68766	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1551	NC_020562	GCC	3	9	68772	68780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1552	NC_020562	CAT	2	6	68786	68791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434040
1553	NC_020562	GCC	2	6	68889	68894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1554	NC_020562	GGC	2	6	68900	68905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434040
1555	NC_020562	TCG	2	6	68976	68981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1556	NC_020562	GAC	2	6	69194	69199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1557	NC_020562	CCG	2	6	69264	69269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1558	NC_020562	AGA	2	6	69285	69290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434040
1559	NC_020562	AGC	2	6	69299	69304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1560	NC_020562	GCC	2	6	69314	69319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1561	NC_020562	TGC	2	6	69354	69359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1562	NC_020562	CG	3	6	69439	69444	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1563	NC_020562	CCG	3	9	69450	69458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1564	NC_020562	CG	3	6	69457	69462	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1565	NC_020562	ATC	2	6	69494	69499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434040
1566	NC_020562	TCC	2	6	69525	69530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434040
1567	NC_020562	GC	3	6	69535	69540	0 %	0 %	50 %	50 %	472434040
1568	NC_020562	GCA	2	6	69607	69612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1569	NC_020562	CCG	2	6	69622	69627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434040
1570	NC_020562	TCG	2	6	69660	69665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1571	NC_020562	ACG	2	6	69780	69785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1572	NC_020562	CAG	2	6	69788	69793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1573	NC_020562	AGG	2	6	69849	69854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434040
1574	NC_020562	AGC	3	9	69873	69881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434040
1575	NC_020562	CTT	2	6	69932	69937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434040
1576	NC_020562	GTTC	2	8	69949	69956	0 %	50 %	25 %	25 %	472434040
1577	NC_020562	GT	3	6	70066	70071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020562	CGA	2	6	70112	70117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_020562	TCCG	2	8	70169	70176	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_020562	AC	3	6	70214	70219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_020562	CAGA	2	8	70241	70248	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_020562	AG	4	8	70304	70311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020562	GA	3	6	70323	70328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020562	ATC	2	6	70372	70377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434041
1585	NC_020562	CGGG	2	8	70407	70414	0 %	0 %	75 %	25 %	472434041
1586	NC_020562	GGC	2	6	70489	70494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434041
1587	NC_020562	GCG	2	6	70512	70517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434041
1588	NC_020562	GA	3	6	70535	70540	50 %	0 %	50 %	0 %	472434041
1589	NC_020562	CG	3	6	70542	70547	0 %	0 %	50 %	50 %	472434041
1590	NC_020562	CGC	3	9	70629	70637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_020562	CGT	2	6	70656	70661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_020562	ACG	2	6	70679	70684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1593	NC_020562	GAT	2	6	70737	70742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434042
1594	NC_020562	CGA	2	6	70745	70750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1595	NC_020562	CAT	2	6	70769	70774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434042
1596	NC_020562	GCT	2	6	70823	70828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1597	NC_020562	GCTG	2	8	70836	70843	0 %	25 %	50 %	25 %	472434042
1598	NC_020562	GGT	2	6	70859	70864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434042
1599	NC_020562	GGC	2	6	70876	70881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434042
1600	NC_020562	GAA	2	6	70901	70906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434042
1601	NC_020562	GCG	2	6	70916	70921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434042
1602	NC_020562	TG	3	6	70979	70984	0 %	50 %	50 %	0 %	472434042
1603	NC_020562	TCG	2	6	70996	71001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1604	NC_020562	GGAA	2	8	71019	71026	50 %	0 %	50 %	0 %	472434042
1605	NC_020562	CAT	2	6	71042	71047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434042
1606	NC_020562	CGA	2	6	71048	71053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1607	NC_020562	GCG	2	6	71087	71092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434042
1608	NC_020562	GCCC	2	8	71146	71153	0 %	0 %	25 %	75 %	472434042
1609	NC_020562	TCG	2	6	71185	71190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1610	NC_020562	CGGC	2	8	71213	71220	0 %	0 %	50 %	50 %	472434042
1611	NC_020562	TCT	2	6	71323	71328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434042
1612	NC_020562	TGG	2	6	71361	71366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434042
1613	NC_020562	AGC	2	6	71397	71402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434042
1614	NC_020562	AACT	2	8	71508	71515	50 %	25 %	0 %	25 %	472434042
1615	NC_020562	TGA	3	9	71573	71581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020562	GCG	2	6	71582	71587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020562	TGCT	2	8	71637	71644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_020562	GC	3	6	71709	71714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_020562	CGC	2	6	71717	71722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_020562	GGCA	2	8	71772	71779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_020562	GGC	2	6	71893	71898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434043
1622	NC_020562	TCG	2	6	71912	71917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434043
1623	NC_020562	CGA	2	6	71925	71930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434043
1624	NC_020562	GGC	2	6	71986	71991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434043
1625	NC_020562	GC	3	6	72131	72136	0 %	0 %	50 %	50 %	472434043
1626	NC_020562	CCAG	2	8	72198	72205	25 %	0 %	25 %	50 %	472434043
1627	NC_020562	CCT	2	6	72215	72220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434043
1628	NC_020562	GCA	2	6	72237	72242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434043
1629	NC_020562	GGA	2	6	72404	72409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434043
1630	NC_020562	TGT	2	6	72465	72470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472434043
1631	NC_020562	GC	3	6	72549	72554	0 %	0 %	50 %	50 %	472434043
1632	NC_020562	CAC	2	6	72571	72576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434043
1633	NC_020562	CGT	2	6	72604	72609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434043
1634	NC_020562	CGGCT	2	10	72622	72631	0 %	20 %	40 %	40 %	472434043
1635	NC_020562	CCG	2	6	72633	72638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434043
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1640	NC_020562	TGCCCG	2	12	72756	72767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	472434043
1641	NC_020562	CTT	2	6	72877	72882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434043
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1651	NC_020562	TCGC	2	8	73520	73527	0 %	25 %	25 %	50 %	472434044
1652	NC_020562	GC	3	6	73526	73531	0 %	0 %	50 %	50 %	472434044
1653	NC_020562	AGCGA	2	10	73545	73554	40 %	0 %	40 %	20 %	472434044
1654	NC_020562	TCC	2	6	73640	73645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434044
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1657	NC_020562	GCC	2	6	73739	73744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1658	NC_020562	CAG	2	6	73772	73777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1659	NC_020562	CCTT	2	8	73942	73949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1660	NC_020562	AT	3	6	73982	73987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1661	NC_020562	CAT	2	6	74033	74038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1662	NC_020562	GCA	2	6	74059	74064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434045
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1702	NC_020562	TTG	2	6	76078	76083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1703	NC_020562	GGA	2	6	76087	76092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1704	NC_020562	ACG	2	6	76101	76106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434047
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1739	NC_020562	GCC	2	6	77928	77933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434048
1740	NC_020562	TTGA	2	8	77967	77974	25 %	50 %	25 %	0 %	472434048
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1744	NC_020562	TGCT	2	8	78143	78150	0 %	50 %	25 %	25 %	472434049
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1747	NC_020562	GCA	2	6	78416	78421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1748	NC_020562	GAT	2	6	78427	78432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1749	NC_020562	TGC	2	6	78509	78514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434050
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1752	NC_020562	GC	3	6	78649	78654	0 %	0 %	50 %	50 %	472434050
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1878	NC_020562	ATG	2	6	84331	84336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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