MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP1

Total Repeats: 3822

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020562	TCG	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433993
502	NC_020562	TCG	2	6	23358	23363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433993
503	NC_020562	CCGA	2	8	23406	23413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_020562	ATGA	2	8	23439	23446	50 %	25 %	25 %	0 %	472433994
505	NC_020562	GAG	2	6	23488	23493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433994
506	NC_020562	TCG	2	6	23528	23533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
507	NC_020562	TCG	2	6	23666	23671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
508	NC_020562	GTC	2	6	23683	23688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
509	NC_020562	GCAT	2	8	23722	23729	25 %	25 %	25 %	25 %	472433994
510	NC_020562	CGG	2	6	23730	23735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
511	NC_020562	GAA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433994
512	NC_020562	CGA	2	6	23781	23786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
513	NC_020562	CG	3	6	23801	23806	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
514	NC_020562	CG	3	6	23854	23859	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
515	NC_020562	GCT	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
516	NC_020562	GCG	2	6	23930	23935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
517	NC_020562	TCA	2	6	23936	23941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433994
518	NC_020562	ATCGGC	2	12	24001	24012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472433994
519	NC_020562	TCA	2	6	24029	24034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433994
520	NC_020562	GCG	2	6	24035	24040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
521	NC_020562	ATC	2	6	24064	24069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433994
522	NC_020562	AGG	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433994
523	NC_020562	CGAC	2	8	24119	24126	25 %	0 %	25 %	50 %	472433994
524	NC_020562	TCG	3	9	24128	24136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
525	NC_020562	CCG	2	6	24140	24145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433994
526	NC_020562	GC	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
527	NC_020562	TCG	2	6	24173	24178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433994
528	NC_020562	GGC	2	6	24259	24264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
529	NC_020562	CGA	2	6	24296	24301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
530	NC_020562	ACGTCA	2	12	24305	24316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472433994
531	NC_020562	AACC	2	8	24330	24337	50 %	0 %	0 %	50 %	472433994
532	NC_020562	GCG	2	6	24350	24355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433994
533	NC_020562	TC	3	6	24443	24448	0 %	50 %	0 %	50 %	472433994
534	NC_020562	GA	3	6	24449	24454	50 %	0 %	50 %	0 %	472433994
535	NC_020562	CGA	2	6	24462	24467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433994
536	NC_020562	GAA	2	6	24492	24497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433994
537	NC_020562	CG	3	6	24507	24512	0 %	0 %	50 %	50 %	472433994
538	NC_020562	CGC	2	6	24574	24579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_020562	CGG	2	6	24721	24726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020562	GCG	2	6	24801	24806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020562	GCA	2	6	24832	24837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_020562	AGC	2	6	24858	24863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020562	GCC	2	6	24919	24924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_020562	CGG	2	6	24977	24982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_020562	GCC	2	6	24990	24995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_020562	GCT	2	6	24999	25004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020562	TAC	2	6	25024	25029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020562	ACA	2	6	25033	25038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020562	GATC	2	8	25051	25058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_020562	TGGA	2	8	25155	25162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020562	GCA	2	6	25328	25333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_020562	CACG	2	8	25372	25379	25 %	0 %	25 %	50 %	472433995
553	NC_020562	GTT	2	6	25397	25402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433995
554	NC_020562	CTCCG	2	10	25403	25412	0 %	20 %	20 %	60 %	472433995
555	NC_020562	CGA	2	6	25517	25522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433995
556	NC_020562	GC	3	6	25525	25530	0 %	0 %	50 %	50 %	472433995
557	NC_020562	ATG	2	6	25552	25557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433995
558	NC_020562	CAT	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
559	NC_020562	TCA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
560	NC_020562	ATGCG	2	10	25664	25673	20 %	20 %	40 %	20 %	472433996
561	NC_020562	GAC	2	6	25683	25688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
562	NC_020562	TGA	3	9	25716	25724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433996
563	NC_020562	CGG	2	6	25736	25741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
564	NC_020562	TCGC	2	8	25751	25758	0 %	25 %	25 %	50 %	472433996
565	NC_020562	CGC	2	6	25812	25817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
566	NC_020562	GCA	2	6	25857	25862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
567	NC_020562	GTC	2	6	25882	25887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
568	NC_020562	GCGCC	2	10	25921	25930	0 %	0 %	40 %	60 %	472433996
569	NC_020562	CGAC	2	8	25938	25945	25 %	0 %	25 %	50 %	472433996
570	NC_020562	TGC	2	6	25946	25951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
571	NC_020562	GGC	2	6	26010	26015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
572	NC_020562	GC	3	6	26014	26019	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
573	NC_020562	GCG	2	6	26036	26041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
574	NC_020562	TCG	2	6	26045	26050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
575	NC_020562	TCA	2	6	26069	26074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
576	NC_020562	TGG	2	6	26292	26297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433996
577	NC_020562	CGCTTA	2	12	26298	26309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472433996
578	NC_020562	GGCGC	2	10	26320	26329	0 %	0 %	60 %	40 %	472433996
579	NC_020562	ATG	2	6	26344	26349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433996
580	NC_020562	TGGC	2	8	26386	26393	0 %	25 %	50 %	25 %	472433996
581	NC_020562	CAA	2	6	26463	26468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433996
582	NC_020562	CAT	2	6	26485	26490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
583	NC_020562	GCT	2	6	26514	26519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
584	NC_020562	GCC	2	6	26537	26542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
585	NC_020562	CTG	2	6	26604	26609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
586	NC_020562	GCT	2	6	26616	26621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
587	NC_020562	GAT	2	6	26668	26673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433996
588	NC_020562	GTC	2	6	26698	26703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
589	NC_020562	GGC	2	6	26745	26750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
590	NC_020562	GCC	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
591	NC_020562	TCG	2	6	26861	26866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
592	NC_020562	CTG	2	6	26867	26872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433996
593	NC_020562	GC	3	6	26881	26886	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
594	NC_020562	ACG	2	6	26939	26944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
595	NC_020562	TCA	2	6	26959	26964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433996
596	NC_020562	GCG	2	6	26974	26979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
597	NC_020562	GCGG	2	8	27006	27013	0 %	0 %	75 %	25 %	472433996
598	NC_020562	A	6	6	27046	27051	100 %	0 %	0 %	0 %	472433996
599	NC_020562	CGC	2	6	27166	27171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
600	NC_020562	CGA	2	6	27198	27203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
601	NC_020562	ACG	2	6	27209	27214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
602	NC_020562	ACC	2	6	27283	27288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433996
603	NC_020562	GGCAAC	2	12	27289	27300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433996
604	NC_020562	CG	3	6	27405	27410	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
605	NC_020562	CTC	2	6	27412	27417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433996
606	NC_020562	GCC	2	6	27445	27450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433996
607	NC_020562	GGCC	2	8	27453	27460	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
608	NC_020562	CAC	2	6	27519	27524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433996
609	NC_020562	GCCG	2	8	27525	27532	0 %	0 %	50 %	50 %	472433996
610	NC_020562	CGCT	2	8	27552	27559	0 %	25 %	25 %	50 %	472433996
611	NC_020562	CGG	2	6	27575	27580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433996
612	NC_020562	TTC	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433996
613	NC_020562	GGT	2	6	27658	27663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020562	TTG	2	6	27695	27700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020562	CTG	3	9	27702	27710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020562	ACG	2	6	27722	27727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_020562	CTT	2	6	27733	27738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_020562	TC	3	6	27764	27769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_020562	GTC	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020562	GACAT	2	10	27785	27794	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
621	NC_020562	GCC	2	6	27854	27859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_020562	TTA	2	6	28010	28015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020562	ATC	2	6	28028	28033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_020562	CAT	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020562	ATA	2	6	28201	28206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020562	ACA	2	6	28256	28261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020562	GC	3	6	28284	28289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_020562	GAA	2	6	28303	28308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020562	TC	3	6	28423	28428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_020562	ATTA	2	8	28444	28451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020562	ATT	2	6	28486	28491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020562	CCA	2	6	28507	28512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_020562	GGGTT	2	10	28582	28591	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020562	CCA	2	6	28675	28680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_020562	GTC	2	6	28693	28698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_020562	GTT	2	6	28876	28881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020562	ATG	2	6	28923	28928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020562	GCG	2	6	28971	28976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433997
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640	NC_020562	GCCT	3	12	29017	29028	0 %	25 %	25 %	50 %	472433997
641	NC_020562	ATG	2	6	29040	29045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433997
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643	NC_020562	GTT	2	6	29180	29185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472433997
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648	NC_020562	GGC	2	6	29542	29547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_020562	TCA	2	6	29562	29567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_020562	CT	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
651	NC_020562	CT	3	6	29611	29616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
652	NC_020562	AGG	2	6	29694	29699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
653	NC_020562	GAG	2	6	29706	29711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
654	NC_020562	TCGC	2	8	29839	29846	0 %	25 %	25 %	50 %	472433998
655	NC_020562	GATC	2	8	29865	29872	25 %	25 %	25 %	25 %	472433998
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658	NC_020562	CT	3	6	30038	30043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_020562	CGAG	2	8	30060	30067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
660	NC_020562	TGG	2	6	30100	30105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
661	NC_020562	ACCT	2	8	30113	30120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
662	NC_020562	GTT	2	6	30128	30133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_020562	GCTC	2	8	30238	30245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
664	NC_020562	CGTTC	2	10	30251	30260	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
665	NC_020562	CAA	2	6	30265	30270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_020562	CG	3	6	30273	30278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
667	NC_020562	CG	4	8	30288	30295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
668	NC_020562	TCA	2	6	30298	30303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
669	NC_020562	CCCA	2	8	30313	30320	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
670	NC_020562	CGTC	2	8	30321	30328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
671	NC_020562	GAAG	2	8	30332	30339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
672	NC_020562	GCA	2	6	30348	30353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_020562	AAC	2	6	30394	30399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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675	NC_020562	TGC	2	6	30488	30493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_020562	CCG	2	6	30518	30523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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678	NC_020562	CGC	2	6	30599	30604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
679	NC_020562	GCC	2	6	30679	30684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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682	NC_020562	ATCG	2	8	30839	30846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
683	NC_020562	CG	3	6	30845	30850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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703	NC_020562	CGG	2	6	31745	31750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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705	NC_020562	GCT	2	6	31847	31852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434002
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742	NC_020562	GCG	2	6	33132	33137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_020562	GCG	2	6	33169	33174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
744	NC_020562	CGA	2	6	33208	33213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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746	NC_020562	GCCG	3	12	33291	33302	0 %	0 %	50 %	50 %	472434003
747	NC_020562	ATA	2	6	33323	33328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434003
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750	NC_020562	GAT	2	6	33470	33475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434003
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752	NC_020562	CGC	2	6	33625	33630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434003
753	NC_020562	GATCTC	2	12	33713	33724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	472434003
754	NC_020562	GCC	2	6	33725	33730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434003
755	NC_020562	GATCG	2	10	33779	33788	20 %	20 %	40 %	20 %	472434003
756	NC_020562	GCT	2	6	33805	33810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434003
757	NC_020562	GTA	2	6	33824	33829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434003
758	NC_020562	CCG	2	6	33858	33863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434003
759	NC_020562	GCA	2	6	33919	33924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434003
760	NC_020562	CGT	2	6	33932	33937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434003
761	NC_020562	GCG	2	6	33945	33950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434003
762	NC_020562	GTG	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434003
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764	NC_020562	CGG	2	6	34157	34162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434003
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