MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 13561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020561	CTCG	2	8	479	486	0 %	25 %	25 %	50 %	470211965
2	NC_020561	CAGG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	470211965
3	NC_020561	TCGC	2	8	597	604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020561	CCCG	2	8	1116	1123	0 %	0 %	25 %	75 %	470211966
5	NC_020561	TGGC	2	8	1564	1571	0 %	25 %	50 %	25 %	470211966
6	NC_020561	GATC	2	8	1673	1680	25 %	25 %	25 %	25 %	470211966
7	NC_020561	GACC	2	8	1730	1737	25 %	0 %	25 %	50 %	470211966
8	NC_020561	CGAT	2	8	2078	2085	25 %	25 %	25 %	25 %	470211966
9	NC_020561	GCCC	2	8	2261	2268	0 %	0 %	25 %	75 %	470211967
10	NC_020561	CAGC	2	8	3710	3717	25 %	0 %	25 %	50 %	470211967
11	NC_020561	CGAT	2	8	4054	4061	25 %	25 %	25 %	25 %	470211967
12	NC_020561	GAAG	2	8	4183	4190	50 %	0 %	50 %	0 %	470211967
13	NC_020561	TCGC	2	8	4653	4660	0 %	25 %	25 %	50 %	470211967
14	NC_020561	TGGC	2	8	5532	5539	0 %	25 %	50 %	25 %	470211968
15	NC_020561	AGCG	2	8	5747	5754	25 %	0 %	50 %	25 %	470211968
16	NC_020561	GACC	2	8	5874	5881	25 %	0 %	25 %	50 %	470211968
17	NC_020561	CGGC	2	8	5882	5889	0 %	0 %	50 %	50 %	470211968
18	NC_020561	GCCC	2	8	6354	6361	0 %	0 %	25 %	75 %	470211968
19	NC_020561	ATGG	2	8	6462	6469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020561	TCGA	3	12	6630	6641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020561	GCGG	2	8	6875	6882	0 %	0 %	75 %	25 %	470211969
22	NC_020561	GCGG	2	8	6980	6987	0 %	0 %	75 %	25 %	470211969
23	NC_020561	CGGC	2	8	7194	7201	0 %	0 %	50 %	50 %	470211969
24	NC_020561	TCGA	2	8	7397	7404	25 %	25 %	25 %	25 %	470211969
25	NC_020561	TTCG	2	8	8492	8499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020561	TCCG	2	8	8705	8712	0 %	25 %	25 %	50 %	470211970
27	NC_020561	GGCG	2	8	8840	8847	0 %	0 %	75 %	25 %	470211970
28	NC_020561	GCGA	2	8	9354	9361	25 %	0 %	50 %	25 %	470211970
29	NC_020561	AGGA	2	8	9414	9421	50 %	0 %	50 %	0 %	470211970
30	NC_020561	CGTT	2	8	9435	9442	0 %	50 %	25 %	25 %	470211970
31	NC_020561	GTTC	2	8	9546	9553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020561	GGCC	2	8	9656	9663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020561	TCGA	2	8	10156	10163	25 %	25 %	25 %	25 %	470211971
34	NC_020561	GTCG	2	8	10398	10405	0 %	25 %	50 %	25 %	470211971
35	NC_020561	CCGG	2	8	10711	10718	0 %	0 %	50 %	50 %	470211972
36	NC_020561	GACC	2	8	10845	10852	25 %	0 %	25 %	50 %	470211972
37	NC_020561	ACGA	2	8	10985	10992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020561	GCCA	2	8	11193	11200	25 %	0 %	25 %	50 %	470211973
39	NC_020561	GGTC	2	8	11622	11629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020561	GCCG	2	8	11810	11817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020561	GCCG	2	8	12258	12265	0 %	0 %	50 %	50 %	470211975
42	NC_020561	CCGC	2	8	12901	12908	0 %	0 %	25 %	75 %	470211975
43	NC_020561	CTGC	2	8	13728	13735	0 %	25 %	25 %	50 %	470211976
44	NC_020561	GCCA	2	8	14083	14090	25 %	0 %	25 %	50 %	470211977
45	NC_020561	CGGC	2	8	14204	14211	0 %	0 %	50 %	50 %	470211977
46	NC_020561	CGGG	2	8	14751	14758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020561	GCGG	2	8	14773	14780	0 %	0 %	75 %	25 %	470211979
48	NC_020561	CCGG	2	8	15265	15272	0 %	0 %	50 %	50 %	470211980
49	NC_020561	CGAG	2	8	17002	17009	25 %	0 %	50 %	25 %	470211980
50	NC_020561	CAGC	2	8	17108	17115	25 %	0 %	25 %	50 %	470211980
51	NC_020561	GCTC	2	8	18108	18115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020561	GCAG	2	8	18130	18137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020561	TGGC	2	8	18211	18218	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020561	GGCA	2	8	18582	18589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020561	GAGC	2	8	18619	18626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020561	CGGT	2	8	18701	18708	0 %	25 %	50 %	25 %	470211981
57	NC_020561	CGAT	2	8	18868	18875	25 %	25 %	25 %	25 %	470211981
58	NC_020561	CGCC	2	8	19266	19273	0 %	0 %	25 %	75 %	470211981
59	NC_020561	CCCG	2	8	19826	19833	0 %	0 %	25 %	75 %	470211982
60	NC_020561	CCGA	2	8	20002	20009	25 %	0 %	25 %	50 %	470211982
61	NC_020561	TCCG	2	8	20446	20453	0 %	25 %	25 %	50 %	470211983
62	NC_020561	AAGG	2	8	21122	21129	50 %	0 %	50 %	0 %	470211984
63	NC_020561	CGCC	2	8	22208	22215	0 %	0 %	25 %	75 %	470211985
64	NC_020561	AGCC	2	8	23574	23581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020561	GGGC	2	8	23613	23620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020561	GCTG	2	8	23777	23784	0 %	25 %	50 %	25 %	470211986
67	NC_020561	ATCG	2	8	23880	23887	25 %	25 %	25 %	25 %	470211986
68	NC_020561	CGGC	2	8	24130	24137	0 %	0 %	50 %	50 %	470211987
69	NC_020561	GCGG	2	8	24488	24495	0 %	0 %	75 %	25 %	470211987
70	NC_020561	GTCG	2	8	24638	24645	0 %	25 %	50 %	25 %	470211987
71	NC_020561	CGGC	2	8	24821	24828	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
72	NC_020561	CGAG	2	8	25197	25204	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
73	NC_020561	CGGC	2	8	25341	25348	0 %	0 %	50 %	50 %	470211988
74	NC_020561	CGAG	2	8	25383	25390	25 %	0 %	50 %	25 %	470211988
75	NC_020561	CCCG	2	8	25453	25460	0 %	0 %	25 %	75 %	470211988
76	NC_020561	TCCG	2	8	25509	25516	0 %	25 %	25 %	50 %	470211988
77	NC_020561	AGCG	2	8	25605	25612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020561	CAGG	2	8	25775	25782	25 %	0 %	50 %	25 %	470211989
79	NC_020561	TGCG	2	8	25854	25861	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
80	NC_020561	GGCT	2	8	26045	26052	0 %	25 %	50 %	25 %	470211989
81	NC_020561	CCAG	2	8	26055	26062	25 %	0 %	25 %	50 %	470211989
82	NC_020561	TGCC	2	8	26164	26171	0 %	25 %	25 %	50 %	470211989
83	NC_020561	GCAA	2	8	26457	26464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020561	TGGG	2	8	26573	26580	0 %	25 %	75 %	0 %	470211990
85	NC_020561	GGGC	3	12	26631	26642	0 %	0 %	75 %	25 %	470211990
86	NC_020561	CGTC	2	8	26807	26814	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020561	GGGC	3	12	27284	27295	0 %	0 %	75 %	25 %	470211991
88	NC_020561	TCGA	2	8	27989	27996	25 %	25 %	25 %	25 %	470211991
89	NC_020561	CCGG	2	8	28003	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	470211991
90	NC_020561	CGTC	2	8	28317	28324	0 %	25 %	25 %	50 %	470211991
91	NC_020561	GGCG	2	8	28335	28342	0 %	0 %	75 %	25 %	470211991
92	NC_020561	AATG	2	8	28980	28987	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020561	GGCC	2	8	29223	29230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020561	CGAG	2	8	29372	29379	25 %	0 %	50 %	25 %	470211992
95	NC_020561	CGAC	2	8	29507	29514	25 %	0 %	25 %	50 %	470211992
96	NC_020561	GATC	2	8	29832	29839	25 %	25 %	25 %	25 %	470211992
97	NC_020561	GGGC	2	8	30378	30385	0 %	0 %	75 %	25 %	470211992
98	NC_020561	GCCG	2	8	31255	31262	0 %	0 %	50 %	50 %	470211993
99	NC_020561	TGTT	2	8	31384	31391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020561	GGCC	2	8	31501	31508	0 %	0 %	50 %	50 %	470211994
101	NC_020561	CGGG	2	8	31791	31798	0 %	0 %	75 %	25 %	470211994
102	NC_020561	GACG	2	8	31837	31844	25 %	0 %	50 %	25 %	470211994
103	NC_020561	GGCG	2	8	32143	32150	0 %	0 %	75 %	25 %	470211994
104	NC_020561	GCCG	2	8	32630	32637	0 %	0 %	50 %	50 %	470211995
105	NC_020561	CGGC	2	8	32708	32715	0 %	0 %	50 %	50 %	470211995
106	NC_020561	GATC	2	8	33250	33257	25 %	25 %	25 %	25 %	470211995
107	NC_020561	GGCT	2	8	33965	33972	0 %	25 %	50 %	25 %	470211996
108	NC_020561	GGCT	2	8	34932	34939	0 %	25 %	50 %	25 %	470211998
109	NC_020561	CTGG	2	8	35824	35831	0 %	25 %	50 %	25 %	470211999
110	NC_020561	AGCC	2	8	36002	36009	25 %	0 %	25 %	50 %	470211999
111	NC_020561	GCGT	2	8	36644	36651	0 %	25 %	50 %	25 %	470212000
112	NC_020561	GCTG	2	8	37033	37040	0 %	25 %	50 %	25 %	470212001
113	NC_020561	GGCC	2	8	37403	37410	0 %	0 %	50 %	50 %	470212001
114	NC_020561	ATCG	2	8	38164	38171	25 %	25 %	25 %	25 %	470212002
115	NC_020561	CGGG	2	8	38221	38228	0 %	0 %	75 %	25 %	470212002
116	NC_020561	CGTG	2	8	38280	38287	0 %	25 %	50 %	25 %	470212002
117	NC_020561	GCCG	2	8	38407	38414	0 %	0 %	50 %	50 %	470212002
118	NC_020561	GCCG	2	8	39018	39025	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
119	NC_020561	GCGG	2	8	39207	39214	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
120	NC_020561	GTGC	2	8	39279	39286	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
121	NC_020561	TCGA	2	8	39484	39491	25 %	25 %	25 %	25 %	470212003
122	NC_020561	GGCG	2	8	39723	39730	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
123	NC_020561	CTGG	2	8	40044	40051	0 %	25 %	50 %	25 %	470212003
124	NC_020561	GGGC	2	8	40254	40261	0 %	0 %	75 %	25 %	470212003
125	NC_020561	GCCG	2	8	40434	40441	0 %	0 %	50 %	50 %	470212003
126	NC_020561	ATCG	2	8	41312	41319	25 %	25 %	25 %	25 %	470212004
127	NC_020561	CAGA	2	8	41538	41545	50 %	0 %	25 %	25 %	470212004
128	NC_020561	CTGG	2	8	41573	41580	0 %	25 %	50 %	25 %	470212004
129	NC_020561	CCCG	2	8	42999	43006	0 %	0 %	25 %	75 %	470212006
130	NC_020561	CAGC	2	8	43771	43778	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
131	NC_020561	CTGC	2	8	44113	44120	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
132	NC_020561	CGGC	2	8	44238	44245	0 %	0 %	50 %	50 %	470212008
133	NC_020561	CCAG	2	8	44283	44290	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
134	NC_020561	CACG	2	8	44467	44474	25 %	0 %	25 %	50 %	470212008
135	NC_020561	ATGC	2	8	45113	45120	25 %	25 %	25 %	25 %	470212008
136	NC_020561	CTTC	2	8	45259	45266	0 %	50 %	0 %	50 %	470212008
137	NC_020561	CGTC	2	8	45307	45314	0 %	25 %	25 %	50 %	470212008
138	NC_020561	GCCT	2	8	45579	45586	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
139	NC_020561	CTGG	2	8	46328	46335	0 %	25 %	50 %	25 %	470212009
140	NC_020561	CTCG	2	8	46370	46377	0 %	25 %	25 %	50 %	470212009
141	NC_020561	TCGG	2	8	46650	46657	0 %	25 %	50 %	25 %	470212009
142	NC_020561	GCTC	2	8	47109	47116	0 %	25 %	25 %	50 %	470212010
143	NC_020561	CGAC	2	8	47421	47428	25 %	0 %	25 %	50 %	470212010
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