MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1

Total Repeats: 115866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020561	CCG	2	6	197516	197521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5502	NC_020561	AAGG	2	8	197560	197567	50 %	0 %	50 %	0 %	470212152
5503	NC_020561	GCG	2	6	197591	197596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5504	NC_020561	CCG	2	6	197597	197602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5505	NC_020561	GA	4	8	197623	197630	50 %	0 %	50 %	0 %	470212152
5506	NC_020561	CGC	2	6	197670	197675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5507	NC_020561	CGG	2	6	197709	197714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5508	NC_020561	TGA	2	6	197724	197729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5509	NC_020561	CCG	3	9	197735	197743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5510	NC_020561	GCC	2	6	197776	197781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5511	NC_020561	GCC	2	6	197848	197853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5512	NC_020561	GCA	2	6	197865	197870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5513	NC_020561	GCC	2	6	197929	197934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5514	NC_020561	TGA	2	6	197982	197987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5515	NC_020561	CCG	3	9	197993	198001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5516	NC_020561	CCA	2	6	198003	198008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212152
5517	NC_020561	TTGCCG	2	12	198026	198037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5518	NC_020561	CGG	2	6	198084	198089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5519	NC_020561	TAT	2	6	198090	198095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212152
5520	NC_020561	GGC	2	6	198097	198102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212152
5521	NC_020561	CCAGGC	2	12	198249	198260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470212152
5522	NC_020561	CGC	2	6	198261	198266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5523	NC_020561	GGT	2	6	198286	198291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212152
5524	NC_020561	CGC	3	9	198330	198338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5525	NC_020561	TGT	2	6	198432	198437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212152
5526	NC_020561	GC	3	6	198461	198466	0 %	0 %	50 %	50 %	470212152
5527	NC_020561	TCG	2	6	198483	198488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5528	NC_020561	GTT	2	6	198505	198510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470212152
5529	NC_020561	AGG	2	6	198588	198593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212152
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5532	NC_020561	GCC	2	6	198640	198645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
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5534	NC_020561	CGA	2	6	198879	198884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
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5536	NC_020561	GCCGAT	2	12	198898	198909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5537	NC_020561	CGA	2	6	198927	198932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
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5539	NC_020561	GAGC	2	8	199087	199094	25 %	0 %	50 %	25 %	470212152
5540	NC_020561	GCC	2	6	199108	199113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5541	NC_020561	CTGC	3	12	199118	199129	0 %	25 %	25 %	50 %	470212152
5542	NC_020561	CGA	2	6	199134	199139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5543	NC_020561	CCG	2	6	199163	199168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5544	NC_020561	GTCACG	2	12	199247	199258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5545	NC_020561	TGGCC	2	10	199305	199314	0 %	20 %	40 %	40 %	470212152
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5547	NC_020561	CGC	2	6	199389	199394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5548	NC_020561	GAG	2	6	199415	199420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212152
5549	NC_020561	TGA	2	6	199449	199454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
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5551	NC_020561	GTCCA	2	10	199471	199480	20 %	20 %	20 %	40 %	470212152
5552	NC_020561	CGA	2	6	199497	199502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212152
5553	NC_020561	CCG	2	6	199560	199565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5554	NC_020561	GCC	2	6	199589	199594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212152
5555	NC_020561	GGT	2	6	199618	199623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212152
5556	NC_020561	GAT	2	6	199659	199664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212152
5557	NC_020561	GACC	2	8	199672	199679	25 %	0 %	25 %	50 %	470212152
5558	NC_020561	GCC	2	6	199754	199759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_020561	TATGA	2	10	199765	199774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_020561	AAT	2	6	199778	199783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_020561	CGGG	2	8	199791	199798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5562	NC_020561	G	6	6	199796	199801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020561	GCTC	2	8	199888	199895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5564	NC_020561	GGC	2	6	199898	199903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_020561	TGG	2	6	199991	199996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212153
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5581	NC_020561	CG	3	6	200563	200568	0 %	0 %	50 %	50 %	470212153
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5591	NC_020561	CGG	2	6	201005	201010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_020561	CG	3	6	201084	201089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_020561	CGC	2	6	201146	201151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_020561	TCC	2	6	201158	201163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_020561	TCCG	2	8	201171	201178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_020561	GC	3	6	201195	201200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_020561	GCG	2	6	201249	201254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_020561	GCG	2	6	201287	201292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212154
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5601	NC_020561	TCGA	2	8	201423	201430	25 %	25 %	25 %	25 %	470212154
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5610	NC_020561	TAGA	2	8	201734	201741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020561	GGC	2	6	201753	201758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_020561	GGGA	2	8	201782	201789	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_020561	ATC	2	6	201831	201836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5619	NC_020561	GCCT	2	8	202068	202075	0 %	25 %	25 %	50 %	470212155
5620	NC_020561	AAGC	2	8	202135	202142	50 %	0 %	25 %	25 %	470212155
5621	NC_020561	CAGG	2	8	202176	202183	25 %	0 %	50 %	25 %	470212155
5622	NC_020561	GCCGG	2	10	202227	202236	0 %	0 %	60 %	40 %	470212156
5623	NC_020561	GCC	2	6	202323	202328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212156
5624	NC_020561	CCG	2	6	202337	202342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212156
5625	NC_020561	CGG	2	6	202368	202373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212156
5626	NC_020561	CGCC	2	8	202397	202404	0 %	0 %	25 %	75 %	470212156
5627	NC_020561	CGA	2	6	202488	202493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212156
5628	NC_020561	GC	3	6	202505	202510	0 %	0 %	50 %	50 %	470212156
5629	NC_020561	CTG	2	6	202534	202539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212156
5630	NC_020561	GGAT	2	8	202565	202572	25 %	25 %	50 %	0 %	470212156
5631	NC_020561	CGG	2	6	202608	202613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212156
5632	NC_020561	GAC	2	6	202629	202634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212156
5633	NC_020561	CGGA	2	8	202667	202674	25 %	0 %	50 %	25 %	470212156
5634	NC_020561	GCAAA	2	10	202680	202689	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5635	NC_020561	GAT	2	6	202724	202729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212157
5636	NC_020561	TCA	2	6	202732	202737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212157
5637	NC_020561	TGGTC	2	10	202834	202843	0 %	40 %	40 %	20 %	470212157
5638	NC_020561	TTC	2	6	202854	202859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212157
5639	NC_020561	CTG	2	6	202863	202868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212157
5640	NC_020561	CG	3	6	202870	202875	0 %	0 %	50 %	50 %	470212157
5641	NC_020561	ATT	2	6	202876	202881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470212157
5642	NC_020561	TGC	2	6	202933	202938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212157
5643	NC_020561	TGG	2	6	202978	202983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212157
5644	NC_020561	CCG	2	6	202984	202989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212157
5645	NC_020561	CGC	2	6	202994	202999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212157
5646	NC_020561	CG	3	6	203052	203057	0 %	0 %	50 %	50 %	470212157
5647	NC_020561	TGAA	2	8	203120	203127	50 %	25 %	25 %	0 %	470212157
5648	NC_020561	GCTCG	2	10	203156	203165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5649	NC_020561	GCC	2	6	203177	203182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5650	NC_020561	T	7	7	203189	203195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5651	NC_020561	CGCT	2	8	203219	203226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5652	NC_020561	TGA	2	6	203302	203307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212158
5653	NC_020561	GCC	2	6	203337	203342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212158
5654	NC_020561	CGG	2	6	203425	203430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212158
5655	NC_020561	GC	4	8	203433	203440	0 %	0 %	50 %	50 %	470212158
5656	NC_020561	AGC	2	6	203455	203460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212158
5657	NC_020561	ATCT	2	8	203463	203470	25 %	50 %	0 %	25 %	470212158
5658	NC_020561	ACCG	2	8	203502	203509	25 %	0 %	25 %	50 %	470212158
5659	NC_020561	GCG	2	6	203517	203522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212158
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5661	NC_020561	TGA	2	6	203632	203637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212158
5662	NC_020561	TCA	2	6	203644	203649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212158
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5664	NC_020561	GGC	2	6	203720	203725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212158
5665	NC_020561	GCG	3	9	203759	203767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212159
5666	NC_020561	GCT	2	6	203791	203796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212159
5667	NC_020561	GCTCG	2	10	203815	203824	0 %	20 %	40 %	40 %	470212159
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5670	NC_020561	CGATC	2	10	203998	204007	20 %	20 %	20 %	40 %	470212159
5671	NC_020561	GGA	4	12	204010	204021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212159
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5700	NC_020561	TTCCT	2	10	205172	205181	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5701	NC_020561	CGG	4	12	205209	205220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212161
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5711	NC_020561	GGC	2	6	205636	205641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5712	NC_020561	GGC	2	6	205696	205701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212162
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5726	NC_020561	CACC	2	8	206119	206126	25 %	0 %	0 %	75 %	470212162
5727	NC_020561	CCGGC	2	10	206214	206223	0 %	0 %	40 %	60 %	470212162
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5733	NC_020561	TCT	2	6	206475	206480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470212162
5734	NC_020561	CCTTGT	2	12	206499	206510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5735	NC_020561	CG	3	6	206553	206558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5736	NC_020561	CGC	2	6	206570	206575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5737	NC_020561	GC	3	6	206609	206614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5738	NC_020561	GGC	3	9	206672	206680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212163
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5741	NC_020561	CCAG	2	8	206782	206789	25 %	0 %	25 %	50 %	470212163
5742	NC_020561	GCG	2	6	206794	206799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212163
5743	NC_020561	TGC	2	6	206800	206805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212163
5744	NC_020561	TGCC	2	8	206810	206817	0 %	25 %	25 %	50 %	470212163
5745	NC_020561	TA	3	6	206903	206908	50 %	50 %	0 %	0 %	470212163
5746	NC_020561	CGG	2	6	206946	206951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212163
5747	NC_020561	CGG	2	6	206954	206959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212163
5748	NC_020561	AGG	2	6	206974	206979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470212163
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5843	NC_020561	GGCA	2	8	210452	210459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5844	NC_020561	TGCG	2	8	210513	210520	0 %	25 %	50 %	25 %	470212166
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5850	NC_020561	GCCTTG	2	12	210777	210788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5860	NC_020561	GC	3	6	211105	211110	0 %	0 %	50 %	50 %	470212166
5861	NC_020561	CAC	2	6	211112	211117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470212166
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5864	NC_020561	TGC	2	6	211246	211251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5867	NC_020561	CAGG	2	8	211361	211368	25 %	0 %	50 %	25 %	470212166
5868	NC_020561	GCG	2	6	211395	211400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
5869	NC_020561	GCA	2	6	211411	211416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212166
5870	NC_020561	TCC	2	6	211440	211445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470212166
5871	NC_020561	AGC	3	9	211446	211454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470212166
5872	NC_020561	GCCG	2	8	211510	211517	0 %	0 %	50 %	50 %	470212166
5873	NC_020561	CGG	2	6	211582	211587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
5874	NC_020561	CGC	2	6	211607	211612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212166
5875	NC_020561	GTC	2	6	211691	211696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212166
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5878	NC_020561	GGC	2	6	211790	211795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212166
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5881	NC_020561	GCCCTT	2	12	211919	211930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470212166
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5955	NC_020561	TGA	3	9	214551	214559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212169
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5988	NC_020561	CGCGC	2	10	216040	216049	0 %	0 %	40 %	60 %	470212170
5989	NC_020561	CTGC	2	8	216096	216103	0 %	25 %	25 %	50 %	470212170
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5992	NC_020561	GAT	2	6	216228	216233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470212170
5993	NC_020561	GGT	2	6	216252	216257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470212170
5994	NC_020561	CGC	2	6	216270	216275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5995	NC_020561	ATC	2	6	216304	216309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470212170
5996	NC_020561	GCC	2	6	216333	216338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
5997	NC_020561	GCG	2	6	216369	216374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5998	NC_020561	CGG	2	6	216392	216397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470212170
5999	NC_020561	GCC	2	6	216401	216406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470212170
6000	NC_020561	TCG	2	6	216425	216430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470212170

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