MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP2

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020543	GC	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	472434165
2	NC_020543	GC	3	6	694	699	0 %	0 %	50 %	50 %	472434165
3	NC_020543	TG	3	6	1239	1244	0 %	50 %	50 %	0 %	472434166
4	NC_020543	GC	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	472434167
5	NC_020543	CG	4	8	1782	1789	0 %	0 %	50 %	50 %	472434167
6	NC_020543	GA	3	6	2030	2035	50 %	0 %	50 %	0 %	472434167
7	NC_020543	GC	3	6	2276	2281	0 %	0 %	50 %	50 %	472434168
8	NC_020543	GC	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	472434168
9	NC_020543	GA	3	6	2968	2973	50 %	0 %	50 %	0 %	472434169
10	NC_020543	GC	3	6	3920	3925	0 %	0 %	50 %	50 %	472434172
11	NC_020543	CG	4	8	3984	3991	0 %	0 %	50 %	50 %	472434172
12	NC_020543	GC	3	6	4346	4351	0 %	0 %	50 %	50 %	472434174
13	NC_020543	CG	3	6	4438	4443	0 %	0 %	50 %	50 %	472434174
14	NC_020543	GC	3	6	4502	4507	0 %	0 %	50 %	50 %	472434174
15	NC_020543	CG	5	10	4708	4717	0 %	0 %	50 %	50 %	472434174
16	NC_020543	AT	3	6	5796	5801	50 %	50 %	0 %	0 %	472434177
17	NC_020543	GC	3	6	6034	6039	0 %	0 %	50 %	50 %	472434177
18	NC_020543	CG	3	6	6086	6091	0 %	0 %	50 %	50 %	472434177
19	NC_020543	GC	3	6	6382	6387	0 %	0 %	50 %	50 %	472434177
20	NC_020543	CG	3	6	6764	6769	0 %	0 %	50 %	50 %	472434177
21	NC_020543	GA	3	6	8059	8064	50 %	0 %	50 %	0 %	472434179
22	NC_020543	CG	3	6	8729	8734	0 %	0 %	50 %	50 %	472434180
23	NC_020543	GC	4	8	9202	9209	0 %	0 %	50 %	50 %	472434181
24	NC_020543	CT	3	6	9502	9507	0 %	50 %	0 %	50 %	472434181
25	NC_020543	GC	4	8	10458	10465	0 %	0 %	50 %	50 %	472434181
26	NC_020543	CG	3	6	11030	11035	0 %	0 %	50 %	50 %	472434181
27	NC_020543	AT	3	6	11806	11811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020543	CG	3	6	12234	12239	0 %	0 %	50 %	50 %	472434182
29	NC_020543	GC	3	6	12449	12454	0 %	0 %	50 %	50 %	472434182
30	NC_020543	AG	3	6	12837	12842	50 %	0 %	50 %	0 %	472434182
31	NC_020543	GC	3	6	12901	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	472434182
32	NC_020543	GC	3	6	13046	13051	0 %	0 %	50 %	50 %	472434182
33	NC_020543	GC	3	6	14207	14212	0 %	0 %	50 %	50 %	472434184
34	NC_020543	GC	3	6	14580	14585	0 %	0 %	50 %	50 %	472434185
35	NC_020543	AT	3	6	15342	15347	50 %	50 %	0 %	0 %	472434186
36	NC_020543	CG	3	6	16206	16211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020543	GC	3	6	17148	17153	0 %	0 %	50 %	50 %	472434188
38	NC_020543	TA	4	8	17600	17607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020543	CG	3	6	17768	17773	0 %	0 %	50 %	50 %	472434189
40	NC_020543	GC	4	8	17895	17902	0 %	0 %	50 %	50 %	472434189
41	NC_020543	GC	3	6	18043	18048	0 %	0 %	50 %	50 %	472434189
42	NC_020543	CG	3	6	18221	18226	0 %	0 %	50 %	50 %	472434189
43	NC_020543	TG	3	6	18266	18271	0 %	50 %	50 %	0 %	472434189
44	NC_020543	CG	3	6	19119	19124	0 %	0 %	50 %	50 %	472434191
45	NC_020543	GC	3	6	19235	19240	0 %	0 %	50 %	50 %	472434192
46	NC_020543	CG	3	6	19623	19628	0 %	0 %	50 %	50 %	472434192
47	NC_020543	CA	3	6	19881	19886	50 %	0 %	0 %	50 %	472434192
48	NC_020543	CG	3	6	20051	20056	0 %	0 %	50 %	50 %	472434192
49	NC_020543	CG	3	6	20158	20163	0 %	0 %	50 %	50 %	472434192
50	NC_020543	GC	3	6	20287	20292	0 %	0 %	50 %	50 %	472434192
51	NC_020543	GA	3	6	20521	20526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020543	CG	3	6	20885	20890	0 %	0 %	50 %	50 %	472434193
53	NC_020543	CG	3	6	21136	21141	0 %	0 %	50 %	50 %	472434193
54	NC_020543	GC	3	6	21352	21357	0 %	0 %	50 %	50 %	472434193
55	NC_020543	CG	3	6	22726	22731	0 %	0 %	50 %	50 %	472434194
56	NC_020543	GC	3	6	22953	22958	0 %	0 %	50 %	50 %	472434194
57	NC_020543	CG	3	6	23162	23167	0 %	0 %	50 %	50 %	472434194
58	NC_020543	GC	3	6	23454	23459	0 %	0 %	50 %	50 %	472434195
59	NC_020543	CG	3	6	23518	23523	0 %	0 %	50 %	50 %	472434195
60	NC_020543	GC	4	8	23707	23714	0 %	0 %	50 %	50 %	472434195
61	NC_020543	CG	3	6	24139	24144	0 %	0 %	50 %	50 %	472434196
62	NC_020543	GC	3	6	24367	24372	0 %	0 %	50 %	50 %	472434197
63	NC_020543	CG	3	6	24718	24723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020543	CG	3	6	24905	24910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020543	CG	3	6	25219	25224	0 %	0 %	50 %	50 %	472434198
66	NC_020543	CG	4	8	25355	25362	0 %	0 %	50 %	50 %	472434198
67	NC_020543	CG	3	6	26343	26348	0 %	0 %	50 %	50 %	472434199
68	NC_020543	GC	3	6	26784	26789	0 %	0 %	50 %	50 %	472434199
69	NC_020543	TG	3	6	27199	27204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020543	TG	3	6	27608	27613	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
71	NC_020543	GC	3	6	27969	27974	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
72	NC_020543	GC	3	6	28029	28034	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
73	NC_020543	CT	3	6	28713	28718	0 %	50 %	0 %	50 %	472434200
74	NC_020543	GC	3	6	28946	28951	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
75	NC_020543	CG	3	6	29064	29069	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
76	NC_020543	CG	3	6	29786	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
77	NC_020543	GC	3	6	30021	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
78	NC_020543	TG	3	6	30088	30093	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
79	NC_020543	AG	3	6	30122	30127	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
80	NC_020543	GC	4	8	30192	30199	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
81	NC_020543	TG	3	6	30480	30485	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
82	NC_020543	GC	3	6	30626	30631	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
83	NC_020543	CG	3	6	31931	31936	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
84	NC_020543	CG	3	6	32426	32431	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
85	NC_020543	GC	3	6	33128	33133	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
86	NC_020543	GC	3	6	33828	33833	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
87	NC_020543	GC	4	8	35052	35059	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
88	NC_020543	GC	3	6	35330	35335	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
89	NC_020543	GC	3	6	35956	35961	0 %	0 %	50 %	50 %	472434201
90	NC_020543	GC	4	8	36083	36090	0 %	0 %	50 %	50 %	472434201
91	NC_020543	GC	3	6	36094	36099	0 %	0 %	50 %	50 %	472434201
92	NC_020543	GC	4	8	36411	36418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020543	GC	3	6	38397	38402	0 %	0 %	50 %	50 %	472434202
94	NC_020543	GC	3	6	39327	39332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020543	TC	3	6	39581	39586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020543	AG	3	6	40047	40052	50 %	0 %	50 %	0 %	472434203
97	NC_020543	GC	4	8	40395	40402	0 %	0 %	50 %	50 %	472434204
98	NC_020543	CG	3	6	40489	40494	0 %	0 %	50 %	50 %	472434204
99	NC_020543	CG	3	6	40775	40780	0 %	0 %	50 %	50 %	472434204
100	NC_020543	AT	3	6	41870	41875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020543	TG	3	6	42612	42617	0 %	50 %	50 %	0 %	472434206
102	NC_020543	GA	3	6	42632	42637	50 %	0 %	50 %	0 %	472434206
103	NC_020543	CG	3	6	43823	43828	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
104	NC_020543	CG	3	6	44187	44192	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
105	NC_020543	GC	3	6	45088	45093	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
106	NC_020543	CG	4	8	45100	45107	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
107	NC_020543	GC	3	6	45148	45153	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
108	NC_020543	GC	3	6	45345	45350	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
109	NC_020543	GC	3	6	45618	45623	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
110	NC_020543	CG	4	8	46086	46093	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
111	NC_020543	GC	3	6	46120	46125	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
112	NC_020543	GC	3	6	46412	46417	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
113	NC_020543	GC	3	6	46503	46508	0 %	0 %	50 %	50 %	472434207
114	NC_020543	GC	3	6	47031	47036	0 %	0 %	50 %	50 %	472434208
115	NC_020543	GC	4	8	47549	47556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020543	CG	3	6	47618	47623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020543	CT	3	6	47794	47799	0 %	50 %	0 %	50 %	472434209
118	NC_020543	CG	3	6	48577	48582	0 %	0 %	50 %	50 %	472434210
119	NC_020543	CG	3	6	48693	48698	0 %	0 %	50 %	50 %	472434211
120	NC_020543	CG	3	6	48731	48736	0 %	0 %	50 %	50 %	472434211
121	NC_020543	GC	3	6	48865	48870	0 %	0 %	50 %	50 %	472434211
122	NC_020543	CG	4	8	49134	49141	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
123	NC_020543	TC	3	6	49287	49292	0 %	50 %	0 %	50 %	472434212
124	NC_020543	CG	4	8	49344	49351	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
125	NC_020543	CG	3	6	49544	49549	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
126	NC_020543	CG	3	6	49697	49702	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
127	NC_020543	CG	3	6	49708	49713	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
128	NC_020543	GC	3	6	49740	49745	0 %	0 %	50 %	50 %	472434212
129	NC_020543	GC	3	6	50018	50023	0 %	0 %	50 %	50 %	472434213
130	NC_020543	TC	3	6	50330	50335	0 %	50 %	0 %	50 %	472434213
131	NC_020543	CG	4	8	50390	50397	0 %	0 %	50 %	50 %	472434213
132	NC_020543	CG	3	6	50440	50445	0 %	0 %	50 %	50 %	472434213
133	NC_020543	CG	3	6	50649	50654	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
134	NC_020543	CG	4	8	50675	50682	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
135	NC_020543	GC	3	6	50897	50902	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
136	NC_020543	CG	3	6	51185	51190	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
137	NC_020543	GC	3	6	51750	51755	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
138	NC_020543	CG	5	10	51794	51803	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
139	NC_020543	GC	3	6	51878	51883	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
140	NC_020543	CG	3	6	51948	51953	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
141	NC_020543	CG	3	6	52089	52094	0 %	0 %	50 %	50 %	472434214
142	NC_020543	GC	3	6	53069	53074	0 %	0 %	50 %	50 %	472434216
143	NC_020543	AT	3	6	53614	53619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.