MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP2

Total Repeats: 1123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020543	GC	3	6	24367	24372	0 %	0 %	50 %	50 %	472434197
502	NC_020543	ATC	2	6	24421	24426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434197
503	NC_020543	CTT	2	6	24508	24513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434197
504	NC_020543	ACC	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_020543	TTC	2	6	24672	24677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020543	CG	3	6	24718	24723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_020543	CGC	3	9	24772	24780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_020543	CGG	2	6	24818	24823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_020543	CCG	3	9	24857	24865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_020543	CG	3	6	24905	24910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_020543	CGCC	2	8	24977	24984	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
512	NC_020543	ACGCG	2	10	25065	25074	20 %	0 %	40 %	40 %	472434198
513	NC_020543	CGC	2	6	25166	25171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434198
514	NC_020543	CG	3	6	25219	25224	0 %	0 %	50 %	50 %	472434198
515	NC_020543	CGT	2	6	25232	25237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434198
516	NC_020543	GCA	2	6	25300	25305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434198
517	NC_020543	CG	4	8	25355	25362	0 %	0 %	50 %	50 %	472434198
518	NC_020543	CCG	3	9	25370	25378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434198
519	NC_020543	CGT	2	6	25412	25417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434198
520	NC_020543	TGGCA	2	10	25567	25576	20 %	20 %	40 %	20 %	472434198
521	NC_020543	AGG	2	6	25580	25585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434198
522	NC_020543	TGA	2	6	25601	25606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434198
523	NC_020543	GAAG	2	8	25634	25641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020543	GCG	2	6	25648	25653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020543	GCC	2	6	25667	25672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_020543	TCA	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020543	C	6	6	25819	25824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_020543	CGG	2	6	25897	25902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020543	CGCC	3	12	25914	25925	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
530	NC_020543	TGGA	2	8	25992	25999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020543	CCG	2	6	26086	26091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434199
532	NC_020543	AGA	2	6	26127	26132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434199
533	NC_020543	TCC	2	6	26145	26150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434199
534	NC_020543	CGTGC	2	10	26231	26240	0 %	20 %	40 %	40 %	472434199
535	NC_020543	GGA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434199
536	NC_020543	CG	3	6	26343	26348	0 %	0 %	50 %	50 %	472434199
537	NC_020543	ATG	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434199
538	NC_020543	C	6	6	26443	26448	0 %	0 %	0 %	100 %	472434199
539	NC_020543	CCG	2	6	26491	26496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434199
540	NC_020543	ATGCG	2	10	26579	26588	20 %	20 %	40 %	20 %	472434199
541	NC_020543	GCAT	2	8	26598	26605	25 %	25 %	25 %	25 %	472434199
542	NC_020543	CAT	2	6	26650	26655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434199
543	NC_020543	CTT	2	6	26681	26686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472434199
544	NC_020543	CGG	2	6	26725	26730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434199
545	NC_020543	TGA	2	6	26735	26740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434199
546	NC_020543	GC	3	6	26784	26789	0 %	0 %	50 %	50 %	472434199
547	NC_020543	TGCT	2	8	26790	26797	0 %	50 %	25 %	25 %	472434199
548	NC_020543	GAC	2	6	26804	26809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434199
549	NC_020543	GAT	2	6	26810	26815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434199
550	NC_020543	TGAT	2	8	26887	26894	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020543	GTC	2	6	27003	27008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_020543	CAA	2	6	27051	27056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_020543	AGG	2	6	27190	27195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020543	TG	3	6	27199	27204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020543	CTC	2	6	27257	27262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434200
556	NC_020543	GGGAA	2	10	27264	27273	40 %	0 %	60 %	0 %	472434200
557	NC_020543	CGA	2	6	27301	27306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
558	NC_020543	ATTC	2	8	27430	27437	25 %	50 %	0 %	25 %	472434200
559	NC_020543	GGC	2	6	27488	27493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
560	NC_020543	CGG	2	6	27553	27558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
561	NC_020543	TG	3	6	27608	27613	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
562	NC_020543	CGGAT	2	10	27615	27624	20 %	20 %	40 %	20 %	472434200
563	NC_020543	GCC	2	6	27713	27718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
564	NC_020543	TCGA	2	8	27773	27780	25 %	25 %	25 %	25 %	472434200
565	NC_020543	GTC	2	6	27809	27814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
566	NC_020543	CGTC	2	8	27853	27860	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
567	NC_020543	ATCGA	2	10	27906	27915	40 %	20 %	20 %	20 %	472434200
568	NC_020543	TCA	2	6	27957	27962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
569	NC_020543	GC	3	6	27969	27974	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
570	NC_020543	CGG	2	6	28009	28014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
571	NC_020543	CGA	2	6	28015	28020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
572	NC_020543	GC	3	6	28029	28034	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
573	NC_020543	CGC	2	6	28135	28140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
574	NC_020543	GCG	3	9	28318	28326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
575	NC_020543	CCA	2	6	28460	28465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
576	NC_020543	GAA	2	6	28468	28473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
577	NC_020543	GGC	2	6	28496	28501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
578	NC_020543	GGCGCG	2	12	28610	28621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
579	NC_020543	CT	3	6	28713	28718	0 %	50 %	0 %	50 %	472434200
580	NC_020543	GGC	2	6	28742	28747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
581	NC_020543	GAA	2	6	28823	28828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
582	NC_020543	CCG	2	6	28837	28842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
583	NC_020543	CGG	2	6	28849	28854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
584	NC_020543	GCA	2	6	28883	28888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
585	NC_020543	GC	3	6	28946	28951	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
586	NC_020543	GCC	2	6	28964	28969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
587	NC_020543	GTG	2	6	29013	29018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
588	NC_020543	CCA	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
589	NC_020543	CG	3	6	29064	29069	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
590	NC_020543	GCG	2	6	29110	29115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
591	NC_020543	TCG	2	6	29118	29123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
592	NC_020543	AGC	2	6	29139	29144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
593	NC_020543	ATA	2	6	29153	29158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434200
594	NC_020543	GGC	2	6	29170	29175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
595	NC_020543	GGT	2	6	29285	29290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
596	NC_020543	TGCC	2	8	29325	29332	0 %	25 %	25 %	50 %	472434200
597	NC_020543	TCG	2	6	29373	29378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
598	NC_020543	CGT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
599	NC_020543	GTG	2	6	29541	29546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
600	NC_020543	GCC	2	6	29594	29599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
601	NC_020543	ATGA	2	8	29679	29686	50 %	25 %	25 %	0 %	472434200
602	NC_020543	GCT	2	6	29704	29709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
603	NC_020543	TCG	2	6	29748	29753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
604	NC_020543	CG	3	6	29786	29791	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
605	NC_020543	ACCGAT	2	12	29807	29818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472434200
606	NC_020543	CGC	2	6	29827	29832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
607	NC_020543	AAG	2	6	29879	29884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472434200
608	NC_020543	CGTG	2	8	29923	29930	0 %	25 %	50 %	25 %	472434200
609	NC_020543	ATC	2	6	29946	29951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
610	NC_020543	GCC	2	6	29959	29964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
611	NC_020543	AGC	2	6	29994	29999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
612	NC_020543	TCTGC	2	10	30004	30013	0 %	40 %	20 %	40 %	472434200
613	NC_020543	GC	3	6	30021	30026	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
614	NC_020543	CGC	2	6	30073	30078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
615	NC_020543	TG	3	6	30088	30093	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
616	NC_020543	AG	3	6	30122	30127	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
617	NC_020543	AGGA	2	8	30129	30136	50 %	0 %	50 %	0 %	472434200
618	NC_020543	GC	4	8	30192	30199	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
619	NC_020543	TGG	2	6	30279	30284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472434200
620	NC_020543	GCG	3	9	30288	30296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
621	NC_020543	TCCA	2	8	30404	30411	25 %	25 %	0 %	50 %	472434200
622	NC_020543	CCGG	2	8	30414	30421	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
623	NC_020543	GGC	2	6	30439	30444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
624	NC_020543	TG	3	6	30480	30485	0 %	50 %	50 %	0 %	472434200
625	NC_020543	CGG	2	6	30535	30540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
626	NC_020543	CAG	2	6	30563	30568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
627	NC_020543	CGA	2	6	30598	30603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
628	NC_020543	GC	3	6	30626	30631	0 %	0 %	50 %	50 %	472434200
629	NC_020543	GAT	2	6	30680	30685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
630	NC_020543	TCC	2	6	30696	30701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434200
631	NC_020543	TCA	2	6	30735	30740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434200
632	NC_020543	TCG	2	6	30757	30762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
633	NC_020543	GGC	2	6	30828	30833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
634	NC_020543	GCC	2	6	30854	30859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434200
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639	NC_020543	CGG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
640	NC_020543	ATG	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434200
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644	NC_020543	GGC	2	6	31732	31737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
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657	NC_020543	CGG	2	6	32398	32403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
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704	NC_020543	GGA	2	6	34123	34128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
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708	NC_020543	AGG	2	6	34410	34415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
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711	NC_020543	GAG	2	6	34577	34582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472434200
712	NC_020543	AGC	2	6	34599	34604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434200
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715	NC_020543	TCG	2	6	34785	34790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434200
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730	NC_020543	ACC	2	6	35503	35508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434200
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732	NC_020543	GCG	2	6	35595	35600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434200
733	NC_020543	TCC	2	6	35622	35627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472434200
734	NC_020543	GCC	2	6	35650	35655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434201
735	NC_020543	CCA	2	6	35787	35792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472434201
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738	NC_020543	GAC	2	6	36049	36054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434201
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741	NC_020543	GC	3	6	36094	36099	0 %	0 %	50 %	50 %	472434201
742	NC_020543	GCC	2	6	36241	36246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
743	NC_020543	CTT	2	6	36268	36273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
744	NC_020543	TCT	2	6	36332	36337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
745	NC_020543	GTG	2	6	36395	36400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
746	NC_020543	GC	4	8	36411	36418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
747	NC_020543	GGA	2	6	36495	36500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
748	NC_020543	GCGG	2	8	36605	36612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
749	NC_020543	CAG	2	6	36645	36650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_020543	CCT	2	6	36664	36669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
751	NC_020543	CGG	2	6	36693	36698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_020543	GCG	2	6	36707	36712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_020543	ACCGG	2	10	36856	36865	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
754	NC_020543	CCGT	2	8	36953	36960	0 %	25 %	25 %	50 %	472434202
755	NC_020543	CGG	2	6	37070	37075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472434202
756	NC_020543	ATC	2	6	37102	37107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434202
757	NC_020543	CAT	2	6	37269	37274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472434202
758	NC_020543	CGC	2	6	37295	37300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434202
759	NC_020543	GTC	2	6	37455	37460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472434202
760	NC_020543	ATA	2	6	37461	37466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472434202
761	NC_020543	CGC	2	6	37523	37528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472434202
762	NC_020543	CGAG	2	8	37621	37628	25 %	0 %	50 %	25 %	472434202
763	NC_020543	CGA	2	6	37634	37639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434202
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765	NC_020543	TGA	3	9	37754	37762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472434202
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783	NC_020543	CGA	2	6	38462	38467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472434202
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998	NC_020543	GGC	2	6	47684	47689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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