MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 6345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020542	AGC	2	6	109096	109101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_020542	GAT	2	6	109106	109111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020542	A	7	7	109173	109179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_020542	GCAA	2	8	109190	109197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2505	NC_020542	CGC	2	6	109199	109204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_020542	GGA	2	6	109265	109270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020542	TGC	2	6	109274	109279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_020542	AGC	2	6	109373	109378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_020542	CCG	2	6	109426	109431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433769
2510	NC_020542	AGC	2	6	109462	109467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433769
2511	NC_020542	CGGAC	2	10	109482	109491	20 %	0 %	40 %	40 %	472433769
2512	NC_020542	GCTTCG	2	12	109495	109506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433769
2513	NC_020542	TCCG	2	8	109578	109585	0 %	25 %	25 %	50 %	472433769
2514	NC_020542	GCA	2	6	109616	109621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433769
2515	NC_020542	CG	3	6	109660	109665	0 %	0 %	50 %	50 %	472433769
2516	NC_020542	GCCCT	2	10	109741	109750	0 %	20 %	20 %	60 %	472433769
2517	NC_020542	CGC	2	6	109791	109796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433769
2518	NC_020542	GCC	2	6	109805	109810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433769
2519	NC_020542	GCC	2	6	109852	109857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433769
2520	NC_020542	TCT	2	6	109860	109865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433769
2521	NC_020542	TCA	2	6	109895	109900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433769
2522	NC_020542	CGG	2	6	109905	109910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433769
2523	NC_020542	GGA	2	6	109923	109928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433769
2524	NC_020542	CGA	2	6	109989	109994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433769
2525	NC_020542	TC	3	6	110034	110039	0 %	50 %	0 %	50 %	472433769
2526	NC_020542	GCG	2	6	110048	110053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433769
2527	NC_020542	CG	3	6	110052	110057	0 %	0 %	50 %	50 %	472433769
2528	NC_020542	GGC	2	6	110109	110114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433769
2529	NC_020542	GGCT	2	8	110122	110129	0 %	25 %	50 %	25 %	472433769
2530	NC_020542	CGTCC	2	10	110153	110162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2531	NC_020542	GAT	2	6	110189	110194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_020542	CGGC	2	8	110228	110235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2533	NC_020542	CGG	2	6	110272	110277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2534	NC_020542	CG	3	6	110290	110295	0 %	0 %	50 %	50 %	472433770
2535	NC_020542	CTC	2	6	110317	110322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433770
2536	NC_020542	GCG	2	6	110366	110371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2537	NC_020542	CGC	3	9	110466	110474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2538	NC_020542	GCA	2	6	110541	110546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433770
2539	NC_020542	CGG	2	6	110547	110552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2540	NC_020542	GCC	2	6	110584	110589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2541	NC_020542	CGC	2	6	110626	110631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2542	NC_020542	CAG	2	6	110654	110659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433770
2543	NC_020542	TCC	2	6	110744	110749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433770
2544	NC_020542	CGG	2	6	110841	110846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2545	NC_020542	ACC	2	6	110879	110884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433770
2546	NC_020542	GCA	2	6	110889	110894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433770
2547	NC_020542	CTT	2	6	110896	110901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433770
2548	NC_020542	GGT	2	6	110971	110976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433770
2549	NC_020542	ACG	2	6	110981	110986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433770
2550	NC_020542	CGC	2	6	111042	111047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2551	NC_020542	CGG	2	6	111087	111092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2552	NC_020542	CCG	2	6	111093	111098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2553	NC_020542	GGC	2	6	111169	111174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433770
2554	NC_020542	GC	3	6	111183	111188	0 %	0 %	50 %	50 %	472433770
2555	NC_020542	GC	3	6	111219	111224	0 %	0 %	50 %	50 %	472433770
2556	NC_020542	CGC	2	6	111257	111262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433770
2557	NC_020542	TAGGG	2	10	111290	111299	20 %	20 %	60 %	0 %	472433770
2558	NC_020542	CT	3	6	111327	111332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_020542	CTG	2	6	111376	111381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_020542	GCCC	2	8	111449	111456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2561	NC_020542	GCC	2	6	111471	111476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_020542	GAA	2	6	111531	111536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020542	TTTTCC	2	12	111568	111579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_020542	GCCG	2	8	111602	111609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_020542	CGG	2	6	111624	111629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_020542	GGCGC	2	10	111630	111639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2567	NC_020542	CCG	2	6	111695	111700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433771
2568	NC_020542	CTC	2	6	111738	111743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433771
2569	NC_020542	CAGC	2	8	111777	111784	25 %	0 %	25 %	50 %	472433771
2570	NC_020542	TC	3	6	111807	111812	0 %	50 %	0 %	50 %	472433771
2571	NC_020542	GGC	2	6	111853	111858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2572	NC_020542	AGG	2	6	111952	111957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433771
2573	NC_020542	AGC	2	6	112006	112011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433771
2574	NC_020542	GGC	2	6	112043	112048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2575	NC_020542	GGC	2	6	112068	112073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2576	NC_020542	CGG	2	6	112100	112105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2577	NC_020542	ACG	2	6	112123	112128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433771
2578	NC_020542	TCC	2	6	112138	112143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433771
2579	NC_020542	CGA	2	6	112160	112165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433771
2580	NC_020542	CGC	2	6	112388	112393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433771
2581	NC_020542	CGG	2	6	112430	112435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2582	NC_020542	GCG	2	6	112438	112443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433771
2583	NC_020542	CCG	2	6	112565	112570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433771
2584	NC_020542	CTC	2	6	112789	112794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2585	NC_020542	GCC	2	6	112795	112800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_020542	CAT	2	6	112883	112888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_020542	ATG	2	6	112977	112982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_020542	GCA	2	6	112983	112988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_020542	GAC	2	6	113044	113049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_020542	TGG	2	6	113141	113146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020542	CAA	2	6	113158	113163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_020542	GC	3	6	113181	113186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_020542	GGA	2	6	113257	113262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_020542	GGA	2	6	113359	113364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_020542	CTT	2	6	113371	113376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_020542	ATC	2	6	113441	113446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_020542	CAT	2	6	113500	113505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_020542	CCA	2	6	113506	113511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_020542	GCG	2	6	113643	113648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_020542	CGC	2	6	113727	113732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_020542	CGA	2	6	113737	113742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_020542	AAG	2	6	113744	113749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020542	CAG	2	6	113759	113764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_020542	CGATC	2	10	113776	113785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2605	NC_020542	GTC	2	6	113786	113791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_020542	GAAA	2	8	113807	113814	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_020542	T	7	7	113841	113847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_020542	GCA	2	6	113907	113912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_020542	TGC	2	6	114190	114195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433772
2610	NC_020542	CCG	2	6	114203	114208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433772
2611	NC_020542	CGG	2	6	114352	114357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_020542	ATC	2	6	114371	114376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_020542	ACGG	2	8	114449	114456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_020542	GC	3	6	114474	114479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_020542	GCT	2	6	114527	114532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_020542	T	6	6	114598	114603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020542	GAG	2	6	114655	114660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_020542	CTG	2	6	114668	114673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_020542	AGGC	2	8	114707	114714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2620	NC_020542	GAA	2	6	114738	114743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_020542	GCA	2	6	114852	114857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433773
2622	NC_020542	CGACAC	2	12	114862	114873	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	472433773
2623	NC_020542	TCA	2	6	114923	114928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433773
2624	NC_020542	CATC	2	8	114935	114942	25 %	25 %	0 %	50 %	472433773
2625	NC_020542	TCG	2	6	114996	115001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433773
2626	NC_020542	GGT	2	6	115005	115010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433773
2627	NC_020542	CCG	2	6	115122	115127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433773
2628	NC_020542	CAT	2	6	115139	115144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433773
2629	NC_020542	AGG	2	6	115252	115257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_020542	GCC	2	6	115296	115301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_020542	GATG	2	8	115377	115384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_020542	C	6	6	115391	115396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2633	NC_020542	GAAC	2	8	115399	115406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2634	NC_020542	GCCGG	2	10	115411	115420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2635	NC_020542	G	6	6	115446	115451	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_020542	G	7	7	115455	115461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_020542	TGCCCC	2	12	115466	115477	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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2643	NC_020542	CAG	2	6	115706	115711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433774
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2647	NC_020542	TGA	2	6	115822	115827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433774
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2679	NC_020542	GTCGG	2	10	116797	116806	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2738	NC_020542	TC	6	12	119040	119051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2750	NC_020542	C	6	6	119740	119745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2751	NC_020542	GCCG	2	8	119769	119776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2752	NC_020542	GCCG	2	8	119783	119790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2753	NC_020542	CCG	2	6	119809	119814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2754	NC_020542	GC	3	6	119840	119845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2755	NC_020542	CGA	2	6	119864	119869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433778
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2760	NC_020542	CAT	2	6	120041	120046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433778
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2762	NC_020542	CGT	2	6	120098	120103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433778
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2764	NC_020542	GGC	2	6	120198	120203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2765	NC_020542	CGC	2	6	120276	120281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433779
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2767	NC_020542	TTCG	2	8	120330	120337	0 %	50 %	25 %	25 %	472433779
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2773	NC_020542	GCG	2	6	120578	120583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433779
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2804	NC_020542	ATA	2	6	121606	121611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2828	NC_020542	A	6	6	122840	122845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2853	NC_020542	GC	3	6	123732	123737	0 %	0 %	50 %	50 %	472433782
2854	NC_020542	CGCAT	2	10	123814	123823	20 %	20 %	20 %	40 %	472433782
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2868	NC_020542	CTG	2	6	124197	124202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433782
2869	NC_020542	CGA	2	6	124217	124222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2870	NC_020542	GAA	2	6	124241	124246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2871	NC_020542	GAC	2	6	124260	124265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2872	NC_020542	ACC	2	6	124300	124305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433783
2873	NC_020542	CCG	3	9	124333	124341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433783
2874	NC_020542	CGT	2	6	124380	124385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2875	NC_020542	ACG	2	6	124391	124396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2876	NC_020542	ACG	2	6	124427	124432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2877	NC_020542	GAG	2	6	124519	124524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433783
2878	NC_020542	CGCGC	2	10	124548	124557	0 %	0 %	40 %	60 %	472433783
2879	NC_020542	CGG	2	6	124570	124575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433783
2880	NC_020542	GAA	2	6	124599	124604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433783
2881	NC_020542	CGA	2	6	124641	124646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2882	NC_020542	ATC	2	6	124660	124665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433783
2883	NC_020542	GGA	2	6	124692	124697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433783
2884	NC_020542	GCT	2	6	124734	124739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
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2887	NC_020542	GCT	2	6	124788	124793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
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2891	NC_020542	CGA	2	6	124908	124913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2892	NC_020542	GC	3	6	124932	124937	0 %	0 %	50 %	50 %	472433783
2893	NC_020542	GCG	2	6	124959	124964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433783
2894	NC_020542	GCT	3	9	124986	124994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2895	NC_020542	GCT	2	6	125046	125051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
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2899	NC_020542	ATC	2	6	125215	125220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433783
2900	NC_020542	CGA	2	6	125244	125249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433783
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2902	NC_020542	CGC	3	9	125284	125292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433783
2903	NC_020542	CG	3	6	125294	125299	0 %	0 %	50 %	50 %	472433783
2904	NC_020542	GCT	2	6	125382	125387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433783
2905	NC_020542	GCG	2	6	125388	125393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433783
2906	NC_020542	GACC	2	8	125503	125510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2907	NC_020542	ACC	2	6	125523	125528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472433784
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2909	NC_020542	TTCG	2	8	125570	125577	0 %	50 %	25 %	25 %	472433784
2910	NC_020542	CGC	2	6	125610	125615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433784
2911	NC_020542	GCC	2	6	125645	125650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433784
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2933	NC_020542	GAC	2	6	126493	126498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2942	NC_020542	CTG	2	6	126825	126830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433786
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2948	NC_020542	TCC	2	6	126927	126932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472433786
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2953	NC_020542	G	6	6	127142	127147	0 %	0 %	100 %	0 %	472433786
2954	NC_020542	GCC	2	6	127153	127158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433786
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2962	NC_020542	GCC	2	6	127629	127634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433786
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2978	NC_020542	TCG	2	6	128278	128283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433786
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2989	NC_020542	GGCT	2	8	128564	128571	0 %	25 %	50 %	25 %	472433786
2990	NC_020542	GGC	2	6	128598	128603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433786
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2992	NC_020542	CAG	2	6	128636	128641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433786
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2994	NC_020542	GCC	2	6	128666	128671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433786
2995	NC_020542	GGA	2	6	128702	128707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472433786
2996	NC_020542	GATC	2	8	128714	128721	25 %	25 %	25 %	25 %	472433786
2997	NC_020542	CGC	2	6	128748	128753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433786
2998	NC_020542	CGG	2	6	128765	128770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433786
2999	NC_020542	A	7	7	128830	128836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_020542	GATC	2	8	128904	128911	25 %	25 %	25 %	25 %	472433787

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