MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingomonas sp. MM-1 plasmid pISP0

Total Repeats: 6345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020542	CGA	2	6	44152	44157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433706
1002	NC_020542	GGC	2	6	44172	44177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433706
1003	NC_020542	CGG	2	6	44212	44217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433706
1004	NC_020542	ACA	2	6	44268	44273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433706
1005	NC_020542	CG	3	6	44306	44311	0 %	0 %	50 %	50 %	472433706
1006	NC_020542	CCCAG	2	10	44341	44350	20 %	0 %	20 %	60 %	472433706
1007	NC_020542	CG	3	6	44369	44374	0 %	0 %	50 %	50 %	472433706
1008	NC_020542	GCC	2	6	44396	44401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433706
1009	NC_020542	GAT	2	6	44420	44425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433706
1010	NC_020542	CGGC	2	8	44430	44437	0 %	0 %	50 %	50 %	472433706
1011	NC_020542	GCC	2	6	44463	44468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433706
1012	NC_020542	GCC	2	6	44504	44509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433706
1013	NC_020542	TGA	2	6	44512	44517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433706
1014	NC_020542	CTTCCG	2	12	44552	44563	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	472433707
1015	NC_020542	CGC	2	6	44584	44589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433707
1016	NC_020542	CG	3	6	44618	44623	0 %	0 %	50 %	50 %	472433707
1017	NC_020542	GCG	2	6	44629	44634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433707
1018	NC_020542	AG	3	6	44654	44659	50 %	0 %	50 %	0 %	472433707
1019	NC_020542	TCG	3	9	44668	44676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433707
1020	NC_020542	GCC	2	6	44709	44714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433707
1021	NC_020542	CGG	2	6	44743	44748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433707
1022	NC_020542	GCG	2	6	44775	44780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020542	GGC	2	6	44784	44789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020542	GCC	2	6	44839	44844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433708
1025	NC_020542	AAG	2	6	44879	44884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433708
1026	NC_020542	GCG	2	6	44939	44944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433708
1027	NC_020542	AGC	2	6	44945	44950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433708
1028	NC_020542	GC	3	6	44949	44954	0 %	0 %	50 %	50 %	472433708
1029	NC_020542	GTCGAG	2	12	44965	44976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	472433708
1030	NC_020542	GCT	2	6	45012	45017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433708
1031	NC_020542	CTT	2	6	45022	45027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433708
1032	NC_020542	GC	5	10	45036	45045	0 %	0 %	50 %	50 %	472433708
1033	NC_020542	CAT	2	6	45094	45099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433708
1034	NC_020542	AG	3	6	45202	45207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020542	GC	3	6	45215	45220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_020542	CGT	2	6	45226	45231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_020542	TCA	2	6	45298	45303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433709
1038	NC_020542	CGT	2	6	45410	45415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1039	NC_020542	CG	3	6	45465	45470	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1040	NC_020542	CG	3	6	45547	45552	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1041	NC_020542	CGG	2	6	45895	45900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1042	NC_020542	CG	4	8	45959	45966	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1043	NC_020542	ATC	2	6	45981	45986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433709
1044	NC_020542	TGA	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433709
1045	NC_020542	TGG	2	6	46132	46137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433709
1046	NC_020542	GCG	2	6	46156	46161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1047	NC_020542	AGC	2	6	46198	46203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1048	NC_020542	GC	3	6	46211	46216	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1049	NC_020542	GTG	2	6	46294	46299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433709
1050	NC_020542	CCGGCA	2	12	46381	46392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	472433709
1051	NC_020542	GC	3	6	46413	46418	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1052	NC_020542	GCGG	2	8	46430	46437	0 %	0 %	75 %	25 %	472433709
1053	NC_020542	GCT	2	6	46556	46561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1054	NC_020542	CG	3	6	46567	46572	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1055	NC_020542	CGA	2	6	46586	46591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1056	NC_020542	GGT	2	6	46658	46663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433709
1057	NC_020542	CGCT	2	8	46716	46723	0 %	25 %	25 %	50 %	472433709
1058	NC_020542	GCA	2	6	46766	46771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1059	NC_020542	GGCGA	2	10	46821	46830	20 %	0 %	60 %	20 %	472433709
1060	NC_020542	CG	3	6	46873	46878	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1061	NC_020542	GGC	2	6	46880	46885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1062	NC_020542	GCGCC	2	10	46919	46928	0 %	0 %	40 %	60 %	472433709
1063	NC_020542	ATC	2	6	46947	46952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433709
1064	NC_020542	GC	3	6	46995	47000	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1065	NC_020542	GC	4	8	47059	47066	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1066	NC_020542	CGG	2	6	47074	47079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1067	NC_020542	CAT	2	6	47087	47092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433709
1068	NC_020542	GAA	2	6	47099	47104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433709
1069	NC_020542	GAA	2	6	47123	47128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472433709
1070	NC_020542	TGC	2	6	47243	47248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1071	NC_020542	GAC	2	6	47379	47384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1072	NC_020542	CGA	2	6	47390	47395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1073	NC_020542	CTT	2	6	47559	47564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472433709
1074	NC_020542	CG	4	8	47569	47576	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1075	NC_020542	CACG	2	8	47605	47612	25 %	0 %	25 %	50 %	472433709
1076	NC_020542	CG	3	6	47611	47616	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1077	NC_020542	CGG	2	6	47685	47690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1078	NC_020542	GGC	2	6	47732	47737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1079	NC_020542	GGC	2	6	47765	47770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1080	NC_020542	GC	4	8	47847	47854	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1081	NC_020542	GC	3	6	47894	47899	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1082	NC_020542	CGGG	2	8	47938	47945	0 %	0 %	75 %	25 %	472433709
1083	NC_020542	GC	3	6	47978	47983	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1084	NC_020542	CCAGG	2	10	47999	48008	20 %	0 %	40 %	40 %	472433709
1085	NC_020542	GCA	2	6	48030	48035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1086	NC_020542	TGC	2	6	48058	48063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433709
1087	NC_020542	CGG	3	9	48070	48078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433709
1088	NC_020542	GAT	2	6	48092	48097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433709
1089	NC_020542	GC	3	6	48143	48148	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1090	NC_020542	CAA	2	6	48171	48176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472433709
1091	NC_020542	GACCGC	2	12	48186	48197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	472433709
1092	NC_020542	CGACA	2	10	48212	48221	40 %	0 %	20 %	40 %	472433709
1093	NC_020542	GGCA	2	8	48233	48240	25 %	0 %	50 %	25 %	472433709
1094	NC_020542	CG	3	6	48310	48315	0 %	0 %	50 %	50 %	472433709
1095	NC_020542	GGGGC	2	10	48338	48347	0 %	0 %	80 %	20 %	472433709
1096	NC_020542	GAT	3	9	48447	48455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472433710
1097	NC_020542	CGA	2	6	48461	48466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433710
1098	NC_020542	CGA	2	6	48470	48475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433710
1099	NC_020542	CG	3	6	48491	48496	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1100	NC_020542	TGC	2	6	48538	48543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433710
1101	NC_020542	GC	3	6	48542	48547	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1102	NC_020542	CCG	2	6	48565	48570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433710
1103	NC_020542	CG	4	8	48569	48576	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1104	NC_020542	TGG	2	6	48631	48636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472433710
1105	NC_020542	CGG	2	6	48718	48723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433710
1106	NC_020542	CG	3	6	48746	48751	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1107	NC_020542	GC	4	8	48765	48772	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1108	NC_020542	CG	4	8	48788	48795	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1109	NC_020542	CGGCA	2	10	48817	48826	20 %	0 %	40 %	40 %	472433710
1110	NC_020542	CGA	2	6	48830	48835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433710
1111	NC_020542	GCG	2	6	48868	48873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433710
1112	NC_020542	CCTT	2	8	48898	48905	0 %	50 %	0 %	50 %	472433710
1113	NC_020542	CG	3	6	48917	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	472433710
1114	NC_020542	G	6	6	48991	48996	0 %	0 %	100 %	0 %	472433710
1115	NC_020542	GGC	2	6	49016	49021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433710
1116	NC_020542	TCG	2	6	49045	49050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433710
1117	NC_020542	CGC	2	6	49057	49062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433710
1118	NC_020542	GCC	2	6	49107	49112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472433710
1119	NC_020542	ATA	2	6	49154	49159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472433710
1120	NC_020542	CAG	2	6	49176	49181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_020542	GGA	2	6	49223	49228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020542	TCA	2	6	49243	49248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_020542	ATT	2	6	49253	49258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020542	CTT	2	6	49260	49265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_020542	CG	4	8	49300	49307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_020542	CAT	2	6	49337	49342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_020542	GCT	2	6	49371	49376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_020542	CGGG	2	8	49415	49422	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_020542	AAG	2	6	49444	49449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020542	CG	3	6	49452	49457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_020542	TTCCGA	2	12	49517	49528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020542	GC	4	8	49583	49590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_020542	AGG	2	6	49592	49597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020542	TAA	2	6	49598	49603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020542	A	6	6	49634	49639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020542	GCC	2	6	49736	49741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_020542	TAT	2	6	49763	49768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_020542	TAGA	2	8	49772	49779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_020542	TGCCAT	2	12	49834	49845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_020542	GTG	2	6	49900	49905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_020542	TCAA	2	8	49944	49951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_020542	TTG	2	6	50004	50009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020542	CTT	2	6	50017	50022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1144	NC_020542	CGC	2	6	50158	50163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1145	NC_020542	CTC	2	6	50204	50209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_020542	CT	3	6	50278	50283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1147	NC_020542	GGC	2	6	50352	50357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1148	NC_020542	G	6	6	50363	50368	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_020542	ACT	2	6	50491	50496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472433711
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1209	NC_020542	GAC	2	6	53641	53646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1230	NC_020542	CG	3	6	54545	54550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1231	NC_020542	CGA	2	6	54569	54574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1233	NC_020542	CGGCT	2	10	54612	54621	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1238	NC_020542	TCG	2	6	54781	54786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1241	NC_020542	TCG	2	6	54904	54909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1242	NC_020542	TCC	2	6	54931	54936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1243	NC_020542	TGC	2	6	54964	54969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_020542	GGCG	2	8	54970	54977	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1245	NC_020542	CTG	2	6	55023	55028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_020542	CGA	2	6	55065	55070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1248	NC_020542	CG	3	6	55170	55175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_020542	GCC	2	6	55288	55293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1250	NC_020542	GGC	2	6	55304	55309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_020542	GCA	2	6	55375	55380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_020542	GA	3	6	55396	55401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_020542	GCC	2	6	55487	55492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_020542	CG	3	6	55503	55508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_020542	GCA	2	6	55554	55559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_020542	CCG	2	6	55619	55624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_020542	CGGCGC	2	12	55692	55703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1258	NC_020542	CAT	2	6	55731	55736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_020542	GCC	2	6	55797	55802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1260	NC_020542	AT	3	6	55901	55906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_020542	CCG	2	6	55954	55959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_020542	GCG	2	6	55969	55974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_020542	TCA	2	6	56129	56134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_020542	CGC	2	6	56138	56143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_020542	GGC	2	6	56148	56153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_020542	CCGC	2	8	56158	56165	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1267	NC_020542	CGC	2	6	56184	56189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_020542	CG	3	6	56204	56209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1269	NC_020542	TCT	2	6	56223	56228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_020542	CATC	2	8	56268	56275	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1271	NC_020542	CGA	2	6	56295	56300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_020542	GCT	2	6	56310	56315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_020542	GCC	2	6	56428	56433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1274	NC_020542	CGC	2	6	56484	56489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1275	NC_020542	CAC	2	6	56505	56510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1276	NC_020542	TCG	2	6	56512	56517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1277	NC_020542	CG	3	6	56574	56579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1279	NC_020542	CGGG	2	8	56744	56751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1280	NC_020542	CTT	2	6	56781	56786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1282	NC_020542	CGT	2	6	56827	56832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1283	NC_020542	CCT	2	6	56838	56843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1284	NC_020542	CTTG	2	8	56865	56872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1285	NC_020542	CTG	2	6	56929	56934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_020542	CTT	2	6	57159	57164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NC_020542	TCG	2	6	57189	57194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1293	NC_020542	TCG	2	6	57236	57241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1294	NC_020542	CAT	2	6	57246	57251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1322	NC_020542	CA	3	6	58540	58545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1323	NC_020542	GC	3	6	58605	58610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1326	NC_020542	CGA	2	6	58700	58705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1329	NC_020542	GATC	2	8	58957	58964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1333	NC_020542	GACGC	2	10	59183	59192	20 %	0 %	40 %	40 %	472433717
1334	NC_020542	CGT	2	6	59207	59212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472433717
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1383	NC_020542	AGC	2	6	61646	61651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472433719
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1497	NC_020542	GCG	2	6	66739	66744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472433725
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1500	NC_020542	CGGCG	2	10	66800	66809	0 %	0 %	60 %	40 %	472433725

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