MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 39050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020540	TTG	2	6	184589	184594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414942
4002	NC_020540	ATA	2	6	184598	184603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523414942
4003	NC_020540	TTG	2	6	184628	184633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523414942
4004	NC_020540	T	6	6	184638	184643	0 %	100 %	0 %	0 %	523414942
4005	NC_020540	A	6	6	184654	184659	100 %	0 %	0 %	0 %	523414942
4006	NC_020540	TCA	2	6	184753	184758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414942
4007	NC_020540	TCTAA	2	10	184769	184778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4008	NC_020540	TTA	2	6	184784	184789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020540	ATA	3	9	184966	184974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020540	GGA	2	6	185009	185014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020540	CAG	2	6	185018	185023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_020540	GT	3	6	185041	185046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020540	T	7	7	185051	185057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020540	TCC	2	6	185079	185084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_020540	TCA	2	6	185095	185100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_020540	GTT	2	6	185101	185106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020540	TTTA	2	8	185123	185130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020540	AAAC	2	8	185172	185179	75 %	0 %	0 %	25 %	470200327
4019	NC_020540	AAG	2	6	185263	185268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200327
4020	NC_020540	TAC	2	6	185329	185334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200327
4021	NC_020540	CATA	2	8	185341	185348	50 %	25 %	0 %	25 %	470200327
4022	NC_020540	A	6	6	185361	185366	100 %	0 %	0 %	0 %	470200327
4023	NC_020540	ATA	2	6	185487	185492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200327
4024	NC_020540	TGG	2	6	185497	185502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200327
4025	NC_020540	AAAT	2	8	185527	185534	75 %	25 %	0 %	0 %	470200327
4026	NC_020540	GAAA	2	8	185569	185576	75 %	0 %	25 %	0 %	470200327
4027	NC_020540	A	6	6	185605	185610	100 %	0 %	0 %	0 %	470200327
4028	NC_020540	TTTAC	2	10	185618	185627	20 %	60 %	0 %	20 %	470200327
4029	NC_020540	CTA	2	6	185721	185726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200327
4030	NC_020540	ATTT	2	8	185751	185758	25 %	75 %	0 %	0 %	470200327
4031	NC_020540	GAT	2	6	185765	185770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200327
4032	NC_020540	ATA	2	6	185811	185816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200327
4033	NC_020540	GAA	2	6	185831	185836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200327
4034	NC_020540	C	6	6	185882	185887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4035	NC_020540	AGTA	2	8	185933	185940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020540	AAG	2	6	185946	185951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_020540	ATG	2	6	186030	186035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_020540	TTA	2	6	186039	186044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020540	TTA	2	6	186078	186083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020540	T	6	6	186105	186110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020540	A	6	6	186150	186155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020540	ATG	2	6	186161	186166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020540	A	6	6	186202	186207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020540	A	6	6	186221	186226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_020540	TAGA	2	8	186272	186279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_020540	ATT	2	6	186347	186352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414943
4047	NC_020540	ACA	2	6	186378	186383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414943
4048	NC_020540	T	6	6	186393	186398	0 %	100 %	0 %	0 %	523414943
4049	NC_020540	GGCT	2	8	186466	186473	0 %	25 %	50 %	25 %	523414943
4050	NC_020540	CTG	3	9	186521	186529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4051	NC_020540	ATCGGT	2	12	186565	186576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	523414943
4052	NC_020540	AGC	2	6	186597	186602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4053	NC_020540	GATT	2	8	186603	186610	25 %	50 %	25 %	0 %	523414943
4054	NC_020540	T	6	6	186609	186614	0 %	100 %	0 %	0 %	523414943
4055	NC_020540	ATC	2	6	186617	186622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523414943
4056	NC_020540	A	6	6	186820	186825	100 %	0 %	0 %	0 %	523414943
4057	NC_020540	AAG	3	9	186833	186841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414943
4058	NC_020540	AAC	2	6	186907	186912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414943
4059	NC_020540	TGG	2	6	186942	186947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414943
4060	NC_020540	CTG	2	6	186965	186970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4061	NC_020540	TGC	2	6	186987	186992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4062	NC_020540	TGC	2	6	187032	187037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4063	NC_020540	TTC	2	6	187050	187055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414943
4064	NC_020540	GCT	2	6	187090	187095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4065	NC_020540	TGG	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414943
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4067	NC_020540	AAG	2	6	187283	187288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414943
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4070	NC_020540	CA	3	6	187447	187452	50 %	0 %	0 %	50 %	523414943
4071	NC_020540	GGC	2	6	187456	187461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523414943
4072	NC_020540	CTT	2	6	187524	187529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414943
4073	NC_020540	CTT	2	6	187621	187626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523414943
4074	NC_020540	CAG	2	6	187652	187657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523414943
4075	NC_020540	CTT	2	6	187698	187703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_020540	GGC	2	6	187749	187754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_020540	CAT	2	6	187760	187765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_020540	ATA	2	6	187794	187799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_020540	TAT	2	6	187831	187836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_020540	A	6	6	187860	187865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_020540	GAA	2	6	187868	187873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_020540	CAGTTC	2	12	187904	187915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_020540	AG	3	6	187945	187950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020540	CCT	2	6	187984	187989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_020540	AGG	2	6	188007	188012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_020540	A	6	6	188020	188025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_020540	AAG	2	6	188028	188033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200330
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4091	NC_020540	AGATA	2	10	188251	188260	60 %	20 %	20 %	0 %	470200330
4092	NC_020540	AAG	2	6	188286	188291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200330
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4095	NC_020540	TAG	3	9	188491	188499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200330
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4097	NC_020540	AG	3	6	188562	188567	50 %	0 %	50 %	0 %	470200330
4098	NC_020540	A	6	6	188576	188581	100 %	0 %	0 %	0 %	470200330
4099	NC_020540	GTT	2	6	188691	188696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200330
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4101	NC_020540	AAG	2	6	188726	188731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200330
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4103	NC_020540	ATC	2	6	188773	188778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200330
4104	NC_020540	TCAACA	2	12	188919	188930	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470200330
4105	NC_020540	A	6	6	188938	188943	100 %	0 %	0 %	0 %	470200330
4106	NC_020540	AAG	2	6	188945	188950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200330
4107	NC_020540	TCTA	2	8	188953	188960	25 %	50 %	0 %	25 %	470200330
4108	NC_020540	T	7	7	188981	188987	0 %	100 %	0 %	0 %	470200330
4109	NC_020540	TGC	2	6	188989	188994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200330
4110	NC_020540	ATATA	2	10	189040	189049	60 %	40 %	0 %	0 %	470200330
4111	NC_020540	AAT	2	6	189147	189152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200330
4112	NC_020540	GATT	2	8	189220	189227	25 %	50 %	25 %	0 %	470200330
4113	NC_020540	TAA	2	6	189247	189252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200330
4114	NC_020540	A	7	7	189297	189303	100 %	0 %	0 %	0 %	470200330
4115	NC_020540	AATA	2	8	189333	189340	75 %	25 %	0 %	0 %	470200330
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4121	NC_020540	ATA	2	6	189520	189525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200330
4122	NC_020540	TC	3	6	189544	189549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_020540	TTAAA	2	10	189551	189560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020540	TA	3	6	189572	189577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020540	ATC	2	6	189643	189648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_020540	AGC	2	6	189653	189658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_020540	TCA	2	6	189664	189669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_020540	GATT	2	8	189673	189680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_020540	GA	3	6	189705	189710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020540	TTTAAA	2	12	189753	189764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_020540	AGGG	2	8	189801	189808	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020540	AAG	2	6	189814	189819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020540	T	6	6	189973	189978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_020540	GA	3	6	189979	189984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020540	GAA	2	6	190008	190013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_020540	ATCA	2	8	190051	190058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_020540	AGT	2	6	190060	190065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_020540	GAT	2	6	190088	190093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523414944
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4161	NC_020540	GAG	2	6	191387	191392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4236	NC_020540	AGT	2	6	194886	194891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4238	NC_020540	A	8	8	194953	194960	100 %	0 %	0 %	0 %	523414946
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4242	NC_020540	TGG	2	6	195018	195023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414946
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4245	NC_020540	A	6	6	195180	195185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_020540	T	7	7	195201	195207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_020540	TAA	2	6	195243	195248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_020540	TAA	2	6	195344	195349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200336
4249	NC_020540	TGA	2	6	195350	195355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200336
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4377	NC_020540	A	6	6	201625	201630	100 %	0 %	0 %	0 %	523414948
4378	NC_020540	GTTTT	2	10	201634	201643	0 %	80 %	20 %	0 %	523414948
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4381	NC_020540	TAT	2	6	201679	201684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523414948
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4384	NC_020540	A	6	6	201823	201828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4481	NC_020540	A	6	6	207246	207251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4489	NC_020540	CAA	2	6	207676	207681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200349
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4495	NC_020540	AGT	2	6	207992	207997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200350
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4497	NC_020540	A	6	6	208127	208132	100 %	0 %	0 %	0 %	470200350
4498	NC_020540	CTG	2	6	208200	208205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200350
4499	NC_020540	GGGACA	2	12	208244	208255	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470200350
4500	NC_020540	GTG	3	9	208302	208310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200350

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