MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes M1 476 DNA

Total Repeats: 39050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020540	TTA	2	6	234331	234336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5002	NC_020540	AAG	2	6	234339	234344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5003	NC_020540	TCT	2	6	234383	234388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200371
5004	NC_020540	ATT	2	6	234428	234433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5005	NC_020540	ATC	2	6	234474	234479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200371
5006	NC_020540	CTTTGG	2	12	234508	234519	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470200371
5007	NC_020540	GTC	2	6	234588	234593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5008	NC_020540	ATG	2	6	234653	234658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5009	NC_020540	CCA	2	6	234659	234664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5010	NC_020540	AGC	2	6	234709	234714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5011	NC_020540	CAGG	2	8	234722	234729	25 %	0 %	50 %	25 %	470200371
5012	NC_020540	GATTGA	2	12	234757	234768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5013	NC_020540	GAA	2	6	234773	234778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5014	NC_020540	ATC	2	6	234845	234850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200371
5015	NC_020540	CCT	2	6	234873	234878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200371
5016	NC_020540	GAG	2	6	234911	234916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470200371
5017	NC_020540	CAG	2	6	235013	235018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5018	NC_020540	TTGA	2	8	235136	235143	25 %	50 %	25 %	0 %	470200371
5019	NC_020540	TTG	2	6	235272	235277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200371
5020	NC_020540	AAT	2	6	235376	235381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200371
5021	NC_020540	TGA	2	6	235438	235443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5022	NC_020540	ACC	2	6	235478	235483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5023	NC_020540	CA	3	6	235651	235656	50 %	0 %	0 %	50 %	470200371
5024	NC_020540	TGAT	2	8	235662	235669	25 %	50 %	25 %	0 %	470200371
5025	NC_020540	ACC	2	6	235755	235760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5026	NC_020540	ACG	2	6	235776	235781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5027	NC_020540	TGG	2	6	235872	235877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200371
5028	NC_020540	A	6	6	235892	235897	100 %	0 %	0 %	0 %	470200371
5029	NC_020540	CTAT	2	8	235917	235924	25 %	50 %	0 %	25 %	470200371
5030	NC_020540	AG	3	6	236033	236038	50 %	0 %	50 %	0 %	470200371
5031	NC_020540	TAT	2	6	236129	236134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5032	NC_020540	CCA	2	6	236153	236158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5033	NC_020540	GAA	2	6	236300	236305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5034	NC_020540	ATT	2	6	236321	236326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5035	NC_020540	CTC	2	6	236394	236399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470200371
5036	NC_020540	AAC	2	6	236419	236424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200371
5037	NC_020540	AGT	2	6	236476	236481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5038	NC_020540	GGAAGT	2	12	236518	236529	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	470200371
5039	NC_020540	ATT	2	6	236636	236641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5040	NC_020540	CCA	2	6	236787	236792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5041	NC_020540	GCC	2	6	236821	236826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470200371
5042	NC_020540	TAA	2	6	236902	236907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200371
5043	NC_020540	TGA	2	6	237022	237027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5044	NC_020540	A	6	6	237111	237116	100 %	0 %	0 %	0 %	470200371
5045	NC_020540	AGC	2	6	237190	237195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5046	NC_020540	TGC	2	6	237199	237204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5047	NC_020540	ACGA	2	8	237214	237221	50 %	0 %	25 %	25 %	470200371
5048	NC_020540	GCA	2	6	237226	237231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5049	NC_020540	G	6	6	237236	237241	0 %	0 %	100 %	0 %	470200371
5050	NC_020540	TTG	2	6	237243	237248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200371
5051	NC_020540	GAT	2	6	237302	237307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5052	NC_020540	CTT	2	6	237315	237320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200371
5053	NC_020540	TGA	2	6	237352	237357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5054	NC_020540	ATG	2	6	237387	237392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5055	NC_020540	CTG	2	6	237450	237455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5056	NC_020540	CT	3	6	237474	237479	0 %	50 %	0 %	50 %	470200371
5057	NC_020540	AAG	2	6	237681	237686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5058	NC_020540	GAC	2	6	237722	237727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470200371
5059	NC_020540	GAA	2	6	237824	237829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5060	NC_020540	CAC	2	6	237974	237979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5061	NC_020540	TAT	2	6	237989	237994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200371
5062	NC_020540	GTG	2	6	238044	238049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200371
5063	NC_020540	AAT	2	6	238100	238105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200371
5064	NC_020540	CCA	2	6	238110	238115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470200371
5065	NC_020540	AAG	2	6	238311	238316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5066	NC_020540	CT	3	6	238325	238330	0 %	50 %	0 %	50 %	470200371
5067	NC_020540	AGA	2	6	238414	238419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200371
5068	NC_020540	TGA	2	6	238438	238443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200371
5069	NC_020540	ATG	2	6	238460	238465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_020540	AGA	2	6	238489	238494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020540	TC	3	6	238515	238520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_020540	TGG	2	6	238600	238605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523414959
5073	NC_020540	TA	3	6	238702	238707	50 %	50 %	0 %	0 %	523414959
5074	NC_020540	AATC	2	8	238724	238731	50 %	25 %	0 %	25 %	523414959
5075	NC_020540	TTGA	2	8	238734	238741	25 %	50 %	25 %	0 %	523414959
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5079	NC_020540	GAA	2	6	238914	238919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523414959
5080	NC_020540	AAC	2	6	238945	238950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523414959
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5082	NC_020540	AGA	2	6	239018	239023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020540	TAC	2	6	239030	239035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_020540	AAG	2	6	239054	239059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020540	A	7	7	239103	239109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020540	TATT	2	8	239135	239142	25 %	75 %	0 %	0 %	470200373
5087	NC_020540	CTTA	2	8	239225	239232	25 %	50 %	0 %	25 %	470200373
5088	NC_020540	GTT	2	6	239290	239295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200373
5089	NC_020540	TCAG	2	8	239313	239320	25 %	25 %	25 %	25 %	470200373
5090	NC_020540	GGT	2	6	239451	239456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470200373
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5092	NC_020540	T	7	7	239690	239696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_020540	CTT	2	6	239718	239723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200374
5094	NC_020540	GATGC	2	10	239827	239836	20 %	20 %	40 %	20 %	470200374
5095	NC_020540	TGT	2	6	239837	239842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200374
5096	NC_020540	CTT	2	6	239844	239849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200374
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5098	NC_020540	CAA	2	6	239898	239903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200374
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5106	NC_020540	CAT	2	6	240163	240168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200374
5107	NC_020540	TCA	2	6	240191	240196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200374
5108	NC_020540	CA	3	6	240195	240200	50 %	0 %	0 %	50 %	470200374
5109	NC_020540	CTT	2	6	240213	240218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200374
5110	NC_020540	AAT	2	6	240253	240258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200374
5111	NC_020540	TAAT	2	8	240288	240295	50 %	50 %	0 %	0 %	470200374
5112	NC_020540	T	8	8	240327	240334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020540	T	6	6	240365	240370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_020540	TAT	2	6	240404	240409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020540	GCT	2	6	240517	240522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200375
5116	NC_020540	TAA	2	6	240569	240574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200375
5117	NC_020540	TTGG	2	8	240596	240603	0 %	50 %	50 %	0 %	470200375
5118	NC_020540	TTG	2	6	240659	240664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200375
5119	NC_020540	TAA	2	6	240719	240724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020540	GAAA	2	8	240797	240804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020540	TTA	2	6	240881	240886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020540	GCAA	2	8	240888	240895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_020540	GGT	2	6	240964	240969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_020540	AAT	2	6	240988	240993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_020540	CGT	2	6	246374	246379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5242	NC_020540	AAC	2	6	246442	246447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_020540	AT	3	6	246502	246507	50 %	50 %	0 %	0 %	470200384
5244	NC_020540	AAAC	2	8	246512	246519	75 %	0 %	0 %	25 %	470200384
5245	NC_020540	ACA	3	9	246524	246532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470200384
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5248	NC_020540	GTT	2	6	246596	246601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470200384
5249	NC_020540	TTC	2	6	246665	246670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470200384
5250	NC_020540	GAA	2	6	246689	246694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470200384
5251	NC_020540	A	6	6	246693	246698	100 %	0 %	0 %	0 %	470200384
5252	NC_020540	AGG	2	6	246721	246726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470200384
5253	NC_020540	TTGA	2	8	246779	246786	25 %	50 %	25 %	0 %	470200384
5254	NC_020540	ATG	2	6	246858	246863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200384
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5261	NC_020540	A	6	6	247286	247291	100 %	0 %	0 %	0 %	470200384
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5269	NC_020540	GCT	2	6	247697	247702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200384
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5277	NC_020540	ATTGAT	2	12	248273	248284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470200384
5278	NC_020540	TCTA	2	8	248300	248307	25 %	50 %	0 %	25 %	470200384
5279	NC_020540	ATT	2	6	248345	248350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200384
5280	NC_020540	TGA	2	6	248551	248556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470200384
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5309	NC_020540	TAG	2	6	250031	250036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5321	NC_020540	TTA	2	6	250609	250614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5322	NC_020540	TTG	2	6	250623	250628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5323	NC_020540	AT	3	6	250780	250785	50 %	50 %	0 %	0 %	470200388
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5329	NC_020540	TCATT	2	10	251071	251080	20 %	60 %	0 %	20 %	470200388
5330	NC_020540	AGCT	2	8	251167	251174	25 %	25 %	25 %	25 %	470200388
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5353	NC_020540	AG	3	6	252505	252510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_020540	A	6	6	252552	252557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_020540	A	6	6	252572	252577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_020540	AAT	2	6	252586	252591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_020540	TAT	2	6	252651	252656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200390
5358	NC_020540	A	6	6	252668	252673	100 %	0 %	0 %	0 %	470200390
5359	NC_020540	TTA	2	6	252682	252687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470200390
5360	NC_020540	GTCAG	2	10	252791	252800	20 %	20 %	40 %	20 %	470200390
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5363	NC_020540	ATA	2	6	252911	252916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470200390
5364	NC_020540	TA	3	6	252932	252937	50 %	50 %	0 %	0 %	470200390
5365	NC_020540	CGT	2	6	252955	252960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470200390
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5369	NC_020540	CTA	2	6	253223	253228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470200390
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5497	NC_020540	CTC	2	6	259313	259318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5498	NC_020540	AAT	2	6	259365	259370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5499	NC_020540	GAT	2	6	259380	259385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_020540	T	8	8	259395	259402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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