MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020539	TA	3	6	577	582	50 %	50 %	0 %	0 %	469816324
3	NC_020539	AC	3	6	1889	1894	50 %	0 %	0 %	50 %	469816325
4	NC_020539	GC	3	6	2116	2121	0 %	0 %	50 %	50 %	469816325
5	NC_020539	AC	3	6	2300	2305	50 %	0 %	0 %	50 %	469816325
6	NC_020539	AC	3	6	3260	3265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020539	AT	3	6	3711	3716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020539	TA	3	6	3835	3840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020539	TC	3	6	5113	5118	0 %	50 %	0 %	50 %	469816327
10	NC_020539	AT	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
11	NC_020539	AT	3	6	5537	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
12	NC_020539	AT	3	6	5782	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	469816327
13	NC_020539	TA	3	6	6851	6856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020539	AT	3	6	7158	7163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020539	CT	3	6	7207	7212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020539	TA	5	10	7222	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020539	TA	3	6	7322	7327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020539	AC	3	6	7956	7961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020539	AG	3	6	8413	8418	50 %	0 %	50 %	0 %	469816329
20	NC_020539	TA	3	6	8475	8480	50 %	50 %	0 %	0 %	469816329
21	NC_020539	TC	3	6	8681	8686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020539	TA	3	6	8771	8776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020539	AT	3	6	8807	8812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020539	AG	3	6	9447	9452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020539	CT	3	6	9465	9470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020539	AT	5	10	9548	9557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020539	GA	3	6	9589	9594	50 %	0 %	50 %	0 %	469816330
28	NC_020539	TA	3	6	9755	9760	50 %	50 %	0 %	0 %	469816330
29	NC_020539	TA	3	6	9880	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	469816330
30	NC_020539	AG	3	6	10442	10447	50 %	0 %	50 %	0 %	469816331
31	NC_020539	AT	3	6	10485	10490	50 %	50 %	0 %	0 %	469816331
32	NC_020539	CT	3	6	10492	10497	0 %	50 %	0 %	50 %	469816331
33	NC_020539	AT	3	6	11857	11862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020539	GA	3	6	12303	12308	50 %	0 %	50 %	0 %	469816332
35	NC_020539	TA	3	6	12624	12629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020539	TA	3	6	12879	12884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020539	CT	3	6	12996	13001	0 %	50 %	0 %	50 %	469816333
38	NC_020539	TC	3	6	13023	13028	0 %	50 %	0 %	50 %	469816333
39	NC_020539	AT	3	6	13359	13364	50 %	50 %	0 %	0 %	469816333
40	NC_020539	TA	3	6	13461	13466	50 %	50 %	0 %	0 %	469816333
41	NC_020539	AT	3	6	13618	13623	50 %	50 %	0 %	0 %	469816333
42	NC_020539	TA	3	6	13913	13918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020539	TA	3	6	14020	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020539	AT	4	8	14045	14052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020539	TA	3	6	14632	14637	50 %	50 %	0 %	0 %	469816334
46	NC_020539	AT	3	6	15645	15650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020539	AT	3	6	15966	15971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020539	TA	4	8	16235	16242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020539	AG	3	6	16986	16991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020539	TA	3	6	17252	17257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020539	TG	3	6	17511	17516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020539	TA	3	6	17580	17585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020539	AG	3	6	17654	17659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020539	TA	3	6	17724	17729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020539	GA	3	6	17969	17974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020539	TA	3	6	18129	18134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020539	AT	3	6	18654	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020539	TA	3	6	19446	19451	50 %	50 %	0 %	0 %	469816335
59	NC_020539	AT	3	6	20074	20079	50 %	50 %	0 %	0 %	469816336
60	NC_020539	GA	3	6	20090	20095	50 %	0 %	50 %	0 %	469816336
61	NC_020539	TA	3	6	20581	20586	50 %	50 %	0 %	0 %	469816336
62	NC_020539	TA	3	6	21435	21440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020539	TA	3	6	21503	21508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020539	GA	3	6	21733	21738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020539	TA	3	6	22266	22271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020539	AT	3	6	22490	22495	50 %	50 %	0 %	0 %	469816338
67	NC_020539	GA	3	6	23076	23081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020539	AT	3	6	23116	23121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020539	TA	3	6	23291	23296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020539	TC	3	6	23366	23371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020539	AG	3	6	23391	23396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.