MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI8T7 complete sequence

Total Repeats: 338

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020539	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020539	GTG	2	6	95	100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020539	TCA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020539	GAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020539	TTA	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020539	TGA	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816324
7	NC_020539	CAT	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816324
8	NC_020539	GCT	2	6	761	766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020539	TTC	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020539	TCA	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
11	NC_020539	TAG	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
12	NC_020539	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
13	NC_020539	ATC	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
14	NC_020539	GCA	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
15	NC_020539	CAT	2	6	1202	1207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
16	NC_020539	TGA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
17	NC_020539	AAT	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
18	NC_020539	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
19	NC_020539	ATT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
20	NC_020539	TGT	2	6	1711	1716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816325
21	NC_020539	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
22	NC_020539	TTC	2	6	1860	1865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
23	NC_020539	CCA	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816325
24	NC_020539	AAT	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
25	NC_020539	AGT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
26	NC_020539	TCA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
27	NC_020539	AGC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816325
28	NC_020539	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816325
29	NC_020539	ATT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816325
30	NC_020539	CTT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
31	NC_020539	ACA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816325
32	NC_020539	ATG	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
33	NC_020539	TCA	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816325
34	NC_020539	TCT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
35	NC_020539	TAG	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816325
36	NC_020539	TCT	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
37	NC_020539	TTC	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
38	NC_020539	TCT	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816325
39	NC_020539	CTT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020539	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020539	TCA	2	6	3131	3136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020539	CTT	2	6	3162	3167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020539	ACC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020539	ATG	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020539	TTC	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020539	ATC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020539	TAT	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020539	TCA	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020539	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020539	AAT	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020539	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020539	TGA	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020539	TAT	2	6	3816	3821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020539	ATA	2	6	3888	3893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020539	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020539	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020539	CAT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
58	NC_020539	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
59	NC_020539	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816326
60	NC_020539	GTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816326
61	NC_020539	TAT	2	6	4474	4479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
62	NC_020539	ATC	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816326
63	NC_020539	TTA	2	6	4602	4607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816326
64	NC_020539	AAT	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816326
65	NC_020539	TAT	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
66	NC_020539	AAG	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
67	NC_020539	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
68	NC_020539	TTA	2	6	5004	5009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
69	NC_020539	CTT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
70	NC_020539	TAA	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
71	NC_020539	AAT	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
72	NC_020539	ACC	2	6	5196	5201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816327
73	NC_020539	ATA	2	6	5257	5262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
74	NC_020539	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
75	NC_020539	TTA	2	6	5322	5327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
76	NC_020539	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
77	NC_020539	TAT	3	9	5612	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
78	NC_020539	TAA	2	6	5699	5704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
79	NC_020539	TAT	2	6	5741	5746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
80	NC_020539	AGA	2	6	5826	5831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
81	NC_020539	AAG	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
82	NC_020539	GAA	2	6	6053	6058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816327
83	NC_020539	ATG	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816327
84	NC_020539	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
85	NC_020539	ATG	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816327
86	NC_020539	TCT	2	6	6477	6482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816327
87	NC_020539	ATT	2	6	6485	6490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
88	NC_020539	TAA	2	6	6557	6562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816327
89	NC_020539	GGT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816327
90	NC_020539	TAT	2	6	6603	6608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816327
91	NC_020539	AAG	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020539	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020539	AGA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020539	TAA	2	6	6957	6962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020539	GAA	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020539	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020539	ATA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020539	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020539	TAA	2	6	7144	7149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020539	TTG	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816328
101	NC_020539	TAA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816328
102	NC_020539	AGA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816328
103	NC_020539	GCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816328
104	NC_020539	TTC	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816328
105	NC_020539	GTC	2	6	7759	7764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816328
106	NC_020539	AAT	2	6	7893	7898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816328
107	NC_020539	TTG	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020539	ATC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816329
109	NC_020539	AAG	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
110	NC_020539	ATG	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816329
111	NC_020539	ATT	2	6	8264	8269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816329
112	NC_020539	ATT	2	6	8280	8285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816329
113	NC_020539	ATG	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816329
114	NC_020539	GTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816329
115	NC_020539	AGA	2	6	8560	8565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
116	NC_020539	AAG	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816329
117	NC_020539	ATT	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020539	TAA	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020539	TAA	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020539	TAT	3	9	8916	8924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020539	ACA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020539	ATT	2	6	9415	9420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020539	GTA	3	9	9477	9485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020539	ATA	2	6	9524	9529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020539	ATT	2	6	9559	9564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816330
126	NC_020539	TGC	2	6	9668	9673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816330
127	NC_020539	CAT	2	6	9694	9699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
128	NC_020539	CCT	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816330
129	NC_020539	ATT	2	6	9828	9833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816330
130	NC_020539	ATA	2	6	9848	9853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816330
131	NC_020539	GTT	2	6	9861	9866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816330
132	NC_020539	TTC	2	6	9953	9958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816330
133	NC_020539	ATA	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816330
134	NC_020539	TAC	2	6	10021	10026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
135	NC_020539	AGT	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816330
136	NC_020539	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816330
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269	NC_020539	ATA	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816335
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.