MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 2460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020536	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	470196212
2	NC_020536	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	470196213
3	NC_020536	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	470196213
4	NC_020536	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	470196213
5	NC_020536	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	470196215
6	NC_020536	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020536	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	470196216
8	NC_020536	ATCGC	2	10	10192	10201	20 %	20 %	20 %	40 %	470196217
9	NC_020536	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	470196218
10	NC_020536	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020536	TTATT	2	10	15450	15459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020536	GCAAG	2	10	16624	16633	40 %	0 %	40 %	20 %	470196221
13	NC_020536	TTTGA	2	10	16783	16792	20 %	60 %	20 %	0 %	470196221
14	NC_020536	TCAAT	2	10	18920	18929	40 %	40 %	0 %	20 %	470196223
15	NC_020536	AGTTA	2	10	22098	22107	40 %	40 %	20 %	0 %	470196224
16	NC_020536	ATGTA	2	10	23656	23665	40 %	40 %	20 %	0 %	470196225
17	NC_020536	TCGAT	2	10	23820	23829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020536	ATATT	2	10	24357	24366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020536	ACCAA	2	10	26266	26275	60 %	0 %	0 %	40 %	470196227
20	NC_020536	ATCAA	2	10	26978	26987	60 %	20 %	0 %	20 %	470196227
21	NC_020536	GAAAC	2	10	27599	27608	60 %	0 %	20 %	20 %	470196228
22	NC_020536	GAAGT	2	10	27749	27758	40 %	20 %	40 %	0 %	470196228
23	NC_020536	ATTAT	2	10	29392	29401	40 %	60 %	0 %	0 %	470196229
24	NC_020536	AACGA	2	10	29465	29474	60 %	0 %	20 %	20 %	470196229
25	NC_020536	AAACG	2	10	31311	31320	60 %	0 %	20 %	20 %	470196231
26	NC_020536	AAGGT	2	10	32483	32492	40 %	20 %	40 %	0 %	470196231
27	NC_020536	TATGA	2	10	32680	32689	40 %	40 %	20 %	0 %	470196231
28	NC_020536	CATTA	2	10	33910	33919	40 %	40 %	0 %	20 %	470196232
29	NC_020536	TTTCA	2	10	34313	34322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020536	AAATG	2	10	35554	35563	60 %	20 %	20 %	0 %	470196234
31	NC_020536	ATTTT	2	10	35635	35644	20 %	80 %	0 %	0 %	470196234
32	NC_020536	TAAAA	2	10	35766	35775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020536	AGATA	2	10	35924	35933	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020536	ATGAG	2	10	37186	37195	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020536	TGAAT	2	10	37533	37542	40 %	40 %	20 %	0 %	470196235
36	NC_020536	TTGGT	2	10	37575	37584	0 %	60 %	40 %	0 %	470196235
37	NC_020536	AATAT	2	10	37643	37652	60 %	40 %	0 %	0 %	470196235
38	NC_020536	TTCGT	2	10	37854	37863	0 %	60 %	20 %	20 %	470196235
39	NC_020536	CAAAA	2	10	38214	38223	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020536	AAATT	2	10	40313	40322	60 %	40 %	0 %	0 %	470196236
41	NC_020536	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470196238
42	NC_020536	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470196238
43	NC_020536	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020536	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020536	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470196240
46	NC_020536	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470196241
47	NC_020536	TCAGT	2	10	48177	48186	20 %	40 %	20 %	20 %	470196242
48	NC_020536	GGCCA	2	10	53184	53193	20 %	0 %	40 %	40 %	470196245
49	NC_020536	AAGTA	2	10	56410	56419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020536	TTTTA	2	10	56774	56783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020536	TAAAT	2	10	58894	58903	60 %	40 %	0 %	0 %	470196249
52	NC_020536	ATATT	2	10	60766	60775	40 %	60 %	0 %	0 %	470196250
53	NC_020536	AATGT	2	10	61491	61500	40 %	40 %	20 %	0 %	470196251
54	NC_020536	CATTT	2	10	62395	62404	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020536	TAGTA	2	10	65039	65048	40 %	40 %	20 %	0 %	470196252
56	NC_020536	TTTTA	2	10	65255	65264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020536	TACTA	2	10	66398	66407	40 %	40 %	0 %	20 %	470196253
58	NC_020536	ATCAA	2	10	69148	69157	60 %	20 %	0 %	20 %	470196255
59	NC_020536	TAATA	2	10	70980	70989	60 %	40 %	0 %	0 %	470196256
60	NC_020536	GTGTT	2	10	71063	71072	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020536	ATTCA	2	10	73655	73664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020536	TATAT	2	10	73916	73925	40 %	60 %	0 %	0 %	470196258
63	NC_020536	CTAAA	2	10	75556	75565	60 %	20 %	0 %	20 %	470196259
64	NC_020536	CAAAA	2	10	75587	75596	80 %	0 %	0 %	20 %	470196259
65	NC_020536	GATAT	2	10	80279	80288	40 %	40 %	20 %	0 %	470196262
66	NC_020536	ATATA	2	10	81101	81110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020536	GATAT	2	10	81935	81944	40 %	40 %	20 %	0 %	470196264
68	NC_020536	AATAA	2	10	82565	82574	80 %	20 %	0 %	0 %	470196265
69	NC_020536	ATTGC	2	10	84545	84554	20 %	40 %	20 %	20 %	470196267
70	NC_020536	TCATT	2	10	84733	84742	20 %	60 %	0 %	20 %	470196267
71	NC_020536	CATGG	2	10	85949	85958	20 %	20 %	40 %	20 %	470196267
72	NC_020536	TGAAA	2	10	86617	86626	60 %	20 %	20 %	0 %	470196268
73	NC_020536	TCAAT	2	10	86989	86998	40 %	40 %	0 %	20 %	470196268
74	NC_020536	GTATT	2	10	87478	87487	20 %	60 %	20 %	0 %	470196269
75	NC_020536	ATTAA	2	10	90220	90229	60 %	40 %	0 %	0 %	470196270
76	NC_020536	AGATA	2	10	93339	93348	60 %	20 %	20 %	0 %	470196272
77	NC_020536	TAAAA	2	10	93899	93908	80 %	20 %	0 %	0 %	470196272
78	NC_020536	ATACA	2	10	94329	94338	60 %	20 %	0 %	20 %	470196273
79	NC_020536	AAAGA	2	10	95532	95541	80 %	0 %	20 %	0 %	470196273
80	NC_020536	GTAAT	2	10	95751	95760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020536	ATGTT	2	10	97017	97026	20 %	60 %	20 %	0 %	470196275
82	NC_020536	TTGCG	2	10	97588	97597	0 %	40 %	40 %	20 %	470196275
83	NC_020536	AGTTA	2	10	99148	99157	40 %	40 %	20 %	0 %	470196276
84	NC_020536	AGATG	2	10	102347	102356	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020536	GGTGA	2	10	102943	102952	20 %	20 %	60 %	0 %	470196279
86	NC_020536	GAAAA	2	10	106380	106389	80 %	0 %	20 %	0 %	470196282
87	NC_020536	TTATT	2	10	106547	106556	20 %	80 %	0 %	0 %	470196282
88	NC_020536	AATCA	2	10	109569	109578	60 %	20 %	0 %	20 %	470196284
89	NC_020536	ATTTT	2	10	110267	110276	20 %	80 %	0 %	0 %	470196285
90	NC_020536	ATCAA	2	10	110294	110303	60 %	20 %	0 %	20 %	470196285
91	NC_020536	ATCAC	2	10	111527	111536	40 %	20 %	0 %	40 %	470196286
92	NC_020536	AACGA	2	10	112204	112213	60 %	0 %	20 %	20 %	470196286
93	NC_020536	ACACA	2	10	114260	114269	60 %	0 %	0 %	40 %	470196288
94	NC_020536	GACAA	2	10	115411	115420	60 %	0 %	20 %	20 %	470196289
95	NC_020536	ATTAC	2	10	117595	117604	40 %	40 %	0 %	20 %	470196291
96	NC_020536	ATTTT	2	10	117899	117908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020536	TATCT	2	10	118255	118264	20 %	60 %	0 %	20 %	470196292
98	NC_020536	ATACG	2	10	120688	120697	40 %	20 %	20 %	20 %	470196294
99	NC_020536	TTATA	2	10	121346	121355	40 %	60 %	0 %	0 %	470196295
100	NC_020536	TTTTA	2	10	122144	122153	20 %	80 %	0 %	0 %	470196295
101	NC_020536	GTATT	2	10	122657	122666	20 %	60 %	20 %	0 %	470196296
102	NC_020536	AATAA	2	10	123250	123259	80 %	20 %	0 %	0 %	470196296
103	NC_020536	TACGC	2	10	123517	123526	20 %	20 %	20 %	40 %	470196296
104	NC_020536	TCCCT	2	10	126323	126332	0 %	40 %	0 %	60 %	470196299
105	NC_020536	GCTTT	2	10	128557	128566	0 %	60 %	20 %	20 %	470196301
106	NC_020536	TAATT	2	10	128642	128651	40 %	60 %	0 %	0 %	470196301
107	NC_020536	ATACT	2	10	129823	129832	40 %	40 %	0 %	20 %	470196303
108	NC_020536	TAATA	2	10	130987	130996	60 %	40 %	0 %	0 %	470196304
109	NC_020536	ATTTT	2	10	131978	131987	20 %	80 %	0 %	0 %	470196305
110	NC_020536	TTGTA	2	10	134181	134190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020536	TGCAA	2	10	135186	135195	40 %	20 %	20 %	20 %	470196308
112	NC_020536	ATATG	2	10	137204	137213	40 %	40 %	20 %	0 %	470196309
113	NC_020536	TATGA	2	10	138884	138893	40 %	40 %	20 %	0 %	470196311
114	NC_020536	AATAT	2	10	139890	139899	60 %	40 %	0 %	0 %	470196311
115	NC_020536	TGGTA	2	10	141787	141796	20 %	40 %	40 %	0 %	470196312
116	NC_020536	CGAAC	2	10	141877	141886	40 %	0 %	20 %	40 %	470196312
117	NC_020536	TTCAA	2	10	143902	143911	40 %	40 %	0 %	20 %	470196313
118	NC_020536	ACATC	2	10	144745	144754	40 %	20 %	0 %	40 %	470196315
119	NC_020536	TAATT	2	10	146968	146977	40 %	60 %	0 %	0 %	470196316
120	NC_020536	AGAGA	2	10	149994	150003	60 %	0 %	40 %	0 %	470196319
121	NC_020536	AATCC	2	10	150350	150359	40 %	20 %	0 %	40 %	470196319
122	NC_020536	TGAAT	2	10	159106	159115	40 %	40 %	20 %	0 %	470196328
123	NC_020536	TGATT	2	10	160237	160246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020536	CAAAA	2	10	160490	160499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020536	CAAAA	2	10	162601	162610	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020536	TAAAG	2	10	162950	162959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020536	TTCAT	2	10	163344	163353	20 %	60 %	0 %	20 %	470196330
128	NC_020536	TTTAC	2	10	163727	163736	20 %	60 %	0 %	20 %	470196330
129	NC_020536	TTATT	2	10	164941	164950	20 %	80 %	0 %	0 %	470196331
130	NC_020536	GGATT	2	10	165929	165938	20 %	40 %	40 %	0 %	470196332
131	NC_020536	TAACT	2	10	168966	168975	40 %	40 %	0 %	20 %	470196335
132	NC_020536	TTTAT	2	10	171874	171883	20 %	80 %	0 %	0 %	470196337
133	NC_020536	TATCA	2	10	172978	172987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020536	ATGCA	2	10	173477	173486	40 %	20 %	20 %	20 %	470196338
135	NC_020536	TATGA	2	10	180723	180732	40 %	40 %	20 %	0 %	470196339
136	NC_020536	GTGAA	2	10	180757	180766	40 %	20 %	40 %	0 %	470196339
137	NC_020536	ATCAT	2	10	181110	181119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020536	TTAAT	2	10	181200	181209	40 %	60 %	0 %	0 %	470196340
139	NC_020536	ATATA	2	10	184030	184039	60 %	40 %	0 %	0 %	470196343
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250	NC_020536	GCAAT	2	10	303641	303650	40 %	20 %	20 %	20 %	470196429
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266	NC_020536	TGAAA	2	10	324592	324601	60 %	20 %	20 %	0 %	470196441
267	NC_020536	TTTTA	2	10	328185	328194	20 %	80 %	0 %	0 %	470196444
268	NC_020536	TCATA	2	10	328552	328561	40 %	40 %	0 %	20 %	470196444
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