MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020536	TGGTA	2	10	141787	141796	20 %	40 %	40 %	0 %	470196312
3503	NC_020536	CGAAC	2	10	141877	141886	40 %	0 %	20 %	40 %	470196312
3504	NC_020536	TA	3	6	141903	141908	50 %	50 %	0 %	0 %	470196312
3505	NC_020536	ATG	2	6	141920	141925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196312
3506	NC_020536	TGG	3	9	141958	141966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196312
3507	NC_020536	GATG	2	8	141973	141980	25 %	25 %	50 %	0 %	470196312
3508	NC_020536	CAT	2	6	142020	142025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196312
3509	NC_020536	ATT	2	6	142223	142228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196312
3510	NC_020536	TGA	2	6	142242	142247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196312
3511	NC_020536	CAG	2	6	142266	142271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196312
3512	NC_020536	ATC	2	6	142387	142392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196312
3513	NC_020536	AG	3	6	142418	142423	50 %	0 %	50 %	0 %	470196312
3514	NC_020536	TGG	2	6	142507	142512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196312
3515	NC_020536	TAC	2	6	142551	142556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196312
3516	NC_020536	ATT	2	6	142600	142605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196312
3517	NC_020536	TTC	2	6	142619	142624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196312
3518	NC_020536	GT	3	6	142767	142772	0 %	50 %	50 %	0 %	470196312
3519	NC_020536	GAA	3	9	142775	142783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196312
3520	NC_020536	AAG	2	6	142851	142856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196312
3521	NC_020536	CAT	2	6	142890	142895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196312
3522	NC_020536	AAT	2	6	142908	142913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196312
3523	NC_020536	ATA	2	6	142921	142926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020536	A	6	6	142957	142962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020536	TATT	2	8	143010	143017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020536	T	7	7	143051	143057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020536	TAC	2	6	143101	143106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_020536	ATT	2	6	143118	143123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020536	AAT	2	6	143152	143157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020536	TAAT	2	8	143170	143177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020536	TA	5	10	143207	143216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020536	AAT	2	6	143251	143256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196313
3533	NC_020536	AAG	2	6	143286	143291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196313
3534	NC_020536	A	7	7	143298	143304	100 %	0 %	0 %	0 %	470196313
3535	NC_020536	ATT	2	6	143318	143323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196313
3536	NC_020536	TAT	2	6	143331	143336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196313
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3538	NC_020536	A	6	6	143646	143651	100 %	0 %	0 %	0 %	470196313
3539	NC_020536	CAG	2	6	143742	143747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196313
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3541	NC_020536	TCT	2	6	143823	143828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196313
3542	NC_020536	GAA	2	6	143861	143866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196313
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3544	NC_020536	TTCAA	2	10	143902	143911	40 %	40 %	0 %	20 %	470196313
3545	NC_020536	TTAA	2	8	143916	143923	50 %	50 %	0 %	0 %	470196313
3546	NC_020536	A	6	6	143944	143949	100 %	0 %	0 %	0 %	470196314
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3549	NC_020536	CAT	2	6	144031	144036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196314
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3553	NC_020536	A	7	7	144489	144495	100 %	0 %	0 %	0 %	470196314
3554	NC_020536	A	6	6	144512	144517	100 %	0 %	0 %	0 %	470196314
3555	NC_020536	GCAG	2	8	144539	144546	25 %	0 %	50 %	25 %	470196314
3556	NC_020536	TCT	2	6	144590	144595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196314
3557	NC_020536	TTA	2	6	144598	144603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196314
3558	NC_020536	TAT	2	6	144608	144613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196314
3559	NC_020536	TGAT	2	8	144629	144636	25 %	50 %	25 %	0 %	470196315
3560	NC_020536	AT	3	6	144647	144652	50 %	50 %	0 %	0 %	470196315
3561	NC_020536	GAT	2	6	144690	144695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196315
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3563	NC_020536	ACATC	2	10	144745	144754	40 %	20 %	0 %	40 %	470196315
3564	NC_020536	TAT	2	6	144853	144858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196315
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3569	NC_020536	A	7	7	145144	145150	100 %	0 %	0 %	0 %	470196315
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3589	NC_020536	GAT	2	6	145931	145936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196316
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3591	NC_020536	TCA	2	6	146037	146042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196316
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3595	NC_020536	AGA	2	6	146134	146139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196316
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3597	NC_020536	AGA	2	6	146188	146193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196316
3598	NC_020536	GATATG	2	12	146222	146233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196316
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3600	NC_020536	TAT	2	6	146335	146340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196316
3601	NC_020536	TATT	2	8	146365	146372	25 %	75 %	0 %	0 %	470196316
3602	NC_020536	AATC	2	8	146374	146381	50 %	25 %	0 %	25 %	470196316
3603	NC_020536	A	6	6	146404	146409	100 %	0 %	0 %	0 %	470196316
3604	NC_020536	TAT	2	6	146425	146430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196316
3605	NC_020536	GCA	3	9	146501	146509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196316
3606	NC_020536	CA	3	6	146508	146513	50 %	0 %	0 %	50 %	470196316
3607	NC_020536	GAA	2	6	146543	146548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196316
3608	NC_020536	ATA	3	9	146556	146564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196316
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3610	NC_020536	GCT	2	6	146591	146596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196316
3611	NC_020536	ATT	2	6	146693	146698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196316
3612	NC_020536	ATG	2	6	146709	146714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196316
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3615	NC_020536	GCAG	2	8	146887	146894	25 %	0 %	50 %	25 %	470196316
3616	NC_020536	TAATT	2	10	146968	146977	40 %	60 %	0 %	0 %	470196316
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3620	NC_020536	A	6	6	147096	147101	100 %	0 %	0 %	0 %	470196316
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3623	NC_020536	A	6	6	147183	147188	100 %	0 %	0 %	0 %	470196316
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3870	NC_020536	ATC	2	6	159003	159008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196328
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