MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020536	TATG	2	8	120819	120826	25 %	50 %	25 %	0 %	470196294
3002	NC_020536	AAC	2	6	120830	120835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196294
3003	NC_020536	AATC	2	8	120902	120909	50 %	25 %	0 %	25 %	470196294
3004	NC_020536	GAG	2	6	120938	120943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196294
3005	NC_020536	AAG	2	6	120954	120959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196294
3006	NC_020536	TTTA	2	8	121105	121112	25 %	75 %	0 %	0 %	470196295
3007	NC_020536	TTA	2	6	121131	121136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3008	NC_020536	T	6	6	121148	121153	0 %	100 %	0 %	0 %	470196295
3009	NC_020536	ATT	2	6	121164	121169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3010	NC_020536	ATT	2	6	121188	121193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3011	NC_020536	TTTG	2	8	121198	121205	0 %	75 %	25 %	0 %	470196295
3012	NC_020536	T	6	6	121209	121214	0 %	100 %	0 %	0 %	470196295
3013	NC_020536	GAT	2	6	121215	121220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196295
3014	NC_020536	TTA	2	6	121228	121233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3015	NC_020536	ATTT	2	8	121281	121288	25 %	75 %	0 %	0 %	470196295
3016	NC_020536	GAT	2	6	121298	121303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196295
3017	NC_020536	A	6	6	121326	121331	100 %	0 %	0 %	0 %	470196295
3018	NC_020536	TTATA	2	10	121346	121355	40 %	60 %	0 %	0 %	470196295
3019	NC_020536	TAT	2	6	121382	121387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3020	NC_020536	TGA	2	6	121433	121438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196295
3021	NC_020536	AATG	2	8	121457	121464	50 %	25 %	25 %	0 %	470196295
3022	NC_020536	ATT	2	6	121491	121496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3023	NC_020536	ATTT	2	8	121623	121630	25 %	75 %	0 %	0 %	470196295
3024	NC_020536	TTA	2	6	121633	121638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3025	NC_020536	TAG	2	6	121649	121654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196295
3026	NC_020536	ACT	2	6	121726	121731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196295
3027	NC_020536	CAT	2	6	121807	121812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196295
3028	NC_020536	TTG	2	6	121942	121947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196295
3029	NC_020536	ATA	2	6	121951	121956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196295
3030	NC_020536	ATT	2	6	122000	122005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3031	NC_020536	TTTA	2	8	122020	122027	25 %	75 %	0 %	0 %	470196295
3032	NC_020536	ATT	2	6	122036	122041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196295
3033	NC_020536	TTG	2	6	122077	122082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196295
3034	NC_020536	TAA	2	6	122123	122128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196295
3035	NC_020536	TTTTA	2	10	122144	122153	20 %	80 %	0 %	0 %	470196295
3036	NC_020536	ATT	2	6	122230	122235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020536	ATT	2	6	122290	122295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3038	NC_020536	GTG	2	6	122315	122320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196296
3039	NC_020536	TTTC	2	8	122336	122343	0 %	75 %	0 %	25 %	470196296
3040	NC_020536	TGA	2	6	122363	122368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3041	NC_020536	CAG	2	6	122443	122448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196296
3042	NC_020536	ATT	2	6	122472	122477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3043	NC_020536	TATT	2	8	122522	122529	25 %	75 %	0 %	0 %	470196296
3044	NC_020536	GAT	2	6	122530	122535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3045	NC_020536	CTA	2	6	122551	122556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196296
3046	NC_020536	TAT	2	6	122568	122573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3047	NC_020536	GCA	2	6	122578	122583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196296
3048	NC_020536	TTG	2	6	122645	122650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196296
3049	NC_020536	GTATT	2	10	122657	122666	20 %	60 %	20 %	0 %	470196296
3050	NC_020536	GTT	2	6	122674	122679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196296
3051	NC_020536	ATCA	2	8	122693	122700	50 %	25 %	0 %	25 %	470196296
3052	NC_020536	TGTA	2	8	122711	122718	25 %	50 %	25 %	0 %	470196296
3053	NC_020536	CTATTG	2	12	122723	122734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470196296
3054	NC_020536	TCGT	2	8	122826	122833	0 %	50 %	25 %	25 %	470196296
3055	NC_020536	TTA	2	6	122845	122850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3056	NC_020536	TA	3	6	122870	122875	50 %	50 %	0 %	0 %	470196296
3057	NC_020536	GTT	2	6	122890	122895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196296
3058	NC_020536	TAG	2	6	122903	122908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3059	NC_020536	CAA	2	6	122917	122922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196296
3060	NC_020536	TAA	2	6	123057	123062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196296
3061	NC_020536	CAT	2	6	123122	123127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196296
3062	NC_020536	TTTA	2	8	123128	123135	25 %	75 %	0 %	0 %	470196296
3063	NC_020536	TGA	2	6	123173	123178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3064	NC_020536	TTA	2	6	123238	123243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3065	NC_020536	AATAA	2	10	123250	123259	80 %	20 %	0 %	0 %	470196296
3066	NC_020536	TA	3	6	123263	123268	50 %	50 %	0 %	0 %	470196296
3067	NC_020536	TAT	2	6	123305	123310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3068	NC_020536	AT	3	6	123322	123327	50 %	50 %	0 %	0 %	470196296
3069	NC_020536	CTTA	2	8	123378	123385	25 %	50 %	0 %	25 %	470196296
3070	NC_020536	TTG	2	6	123395	123400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196296
3071	NC_020536	TGC	2	6	123456	123461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196296
3072	NC_020536	ATG	2	6	123466	123471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3073	NC_020536	ATT	2	6	123497	123502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196296
3074	NC_020536	TACGC	2	10	123517	123526	20 %	20 %	20 %	40 %	470196296
3075	NC_020536	TAG	2	6	123548	123553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3076	NC_020536	ATG	2	6	123568	123573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196296
3077	NC_020536	AAG	2	6	123669	123674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_020536	T	6	6	123710	123715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_020536	TA	3	6	123805	123810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_020536	AAAT	2	8	123823	123830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_020536	AAT	3	9	123828	123836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_020536	AC	3	6	123846	123851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_020536	ATTA	2	8	123857	123864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_020536	AGG	2	6	123886	123891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_020536	CATATG	2	12	123926	123937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196297
3086	NC_020536	AT	3	6	123951	123956	50 %	50 %	0 %	0 %	470196297
3087	NC_020536	TCA	2	6	123978	123983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196297
3088	NC_020536	TACG	2	8	123999	124006	25 %	25 %	25 %	25 %	470196297
3089	NC_020536	ATCA	2	8	124049	124056	50 %	25 %	0 %	25 %	470196297
3090	NC_020536	TAA	2	6	124116	124121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196297
3091	NC_020536	GGT	2	6	124126	124131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196297
3092	NC_020536	CATT	2	8	124141	124148	25 %	50 %	0 %	25 %	470196297
3093	NC_020536	GAA	2	6	124177	124182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196297
3094	NC_020536	CAA	2	6	124259	124264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196297
3095	NC_020536	ATT	2	6	124266	124271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196297
3096	NC_020536	GTT	2	6	124294	124299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196297
3097	NC_020536	ATG	2	6	124301	124306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196297
3098	NC_020536	CTA	2	6	124398	124403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196297
3099	NC_020536	A	6	6	124465	124470	100 %	0 %	0 %	0 %	470196297
3100	NC_020536	TGA	2	6	124473	124478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196297
3101	NC_020536	AGC	2	6	124488	124493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196297
3102	NC_020536	ATA	2	6	124497	124502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196297
3103	NC_020536	T	6	6	124546	124551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020536	ATA	2	6	124612	124617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020536	TTA	2	6	124642	124647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020536	TTG	2	6	124648	124653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020536	ATG	2	6	124660	124665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_020536	TA	3	6	124676	124681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_020536	ACA	2	6	124688	124693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_020536	ATTA	2	8	124696	124703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020536	TAAA	2	8	124720	124727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_020536	ATT	2	6	124743	124748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020536	A	6	6	124773	124778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020536	TTG	2	6	124798	124803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020536	AATGTA	2	12	124827	124838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020536	A	6	6	124870	124875	100 %	0 %	0 %	0 %	470196298
3117	NC_020536	AATG	2	8	124962	124969	50 %	25 %	25 %	0 %	470196298
3118	NC_020536	ATC	2	6	125000	125005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196298
3119	NC_020536	AGT	2	6	125019	125024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196298
3120	NC_020536	ATG	2	6	125123	125128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196298
3121	NC_020536	TGG	2	6	125286	125291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196298
3122	NC_020536	CAA	2	6	125329	125334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196298
3123	NC_020536	AC	4	8	125351	125358	50 %	0 %	0 %	50 %	470196298
3124	NC_020536	ACA	2	6	125379	125384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196298
3125	NC_020536	ATC	2	6	125397	125402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196298
3126	NC_020536	ATG	2	6	125413	125418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196298
3127	NC_020536	TCA	2	6	125440	125445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196298
3128	NC_020536	ATC	2	6	125447	125452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196298
3129	NC_020536	A	6	6	125470	125475	100 %	0 %	0 %	0 %	470196298
3130	NC_020536	GCT	2	6	125485	125490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196298
3131	NC_020536	ACT	2	6	125535	125540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196298
3132	NC_020536	GAC	2	6	125570	125575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196298
3133	NC_020536	CAA	2	6	125579	125584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196298
3134	NC_020536	ATAA	2	8	125585	125592	75 %	25 %	0 %	0 %	470196298
3135	NC_020536	ATA	2	6	125595	125600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_020536	TAA	2	6	125605	125610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_020536	GAGC	2	8	125633	125640	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_020536	AGT	2	6	125686	125691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020536	TGAA	2	8	125696	125703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020536	TCA	2	6	125752	125757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_020536	A	6	6	125757	125762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_020536	TAA	2	6	125775	125780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_020536	TAA	2	6	125784	125789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196299
3144	NC_020536	TTA	2	6	125847	125852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196299
3145	NC_020536	AAT	2	6	125891	125896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196299
3146	NC_020536	CAA	2	6	125901	125906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196299
3147	NC_020536	TGAT	2	8	125978	125985	25 %	50 %	25 %	0 %	470196299
3148	NC_020536	GTC	2	6	126026	126031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196299
3149	NC_020536	GCTT	2	8	126102	126109	0 %	50 %	25 %	25 %	470196299
3150	NC_020536	T	7	7	126123	126129	0 %	100 %	0 %	0 %	470196299
3151	NC_020536	ATA	2	6	126131	126136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196299
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3153	NC_020536	TAAT	2	8	126213	126220	50 %	50 %	0 %	0 %	470196299
3154	NC_020536	TGA	2	6	126221	126226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196299
3155	NC_020536	TTTG	2	8	126300	126307	0 %	75 %	25 %	0 %	470196299
3156	NC_020536	TCCCT	2	10	126323	126332	0 %	40 %	0 %	60 %	470196299
3157	NC_020536	CT	3	6	126339	126344	0 %	50 %	0 %	50 %	470196299
3158	NC_020536	GC	3	6	126407	126412	0 %	0 %	50 %	50 %	470196299
3159	NC_020536	TA	3	6	126475	126480	50 %	50 %	0 %	0 %	470196299
3160	NC_020536	TAT	2	6	126484	126489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196299
3161	NC_020536	TCA	2	6	126557	126562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_020536	AAT	2	6	126566	126571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020536	ATAG	2	8	126607	126614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_020536	TAG	2	6	126642	126647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_020536	CTGTAA	2	12	126648	126659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3166	NC_020536	A	6	6	126704	126709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_020536	TAT	3	9	126710	126718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020536	GGA	2	6	126761	126766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470196300
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3170	NC_020536	AATG	2	8	126800	126807	50 %	25 %	25 %	0 %	470196300
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3172	NC_020536	A	6	6	126945	126950	100 %	0 %	0 %	0 %	470196300
3173	NC_020536	GGTATG	2	12	126969	126980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470196300
3174	NC_020536	AATT	2	8	127006	127013	50 %	50 %	0 %	0 %	470196300
3175	NC_020536	A	6	6	127029	127034	100 %	0 %	0 %	0 %	470196300
3176	NC_020536	ATG	2	6	127084	127089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196300
3177	NC_020536	ATT	2	6	127092	127097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196300
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3184	NC_020536	CAA	2	6	127414	127419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196300
3185	NC_020536	GAT	2	6	127481	127486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196300
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3187	NC_020536	TAT	2	6	127531	127536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196301
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3192	NC_020536	TAT	2	6	127805	127810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196301
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3204	NC_020536	TA	3	6	128191	128196	50 %	50 %	0 %	0 %	470196301
3205	NC_020536	TAAA	2	8	128221	128228	75 %	25 %	0 %	0 %	470196301
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3207	NC_020536	ATC	2	6	128338	128343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196301
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3211	NC_020536	TTG	2	6	128398	128403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196301
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3219	NC_020536	AAAT	2	8	128835	128842	75 %	25 %	0 %	0 %	470196301
3220	NC_020536	AT	3	6	128860	128865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020536	TAAA	2	8	128884	128891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020536	TA	3	6	128897	128902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_020536	GAG	2	6	128907	128912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_020536	AGTA	2	8	128914	128921	50 %	25 %	25 %	0 %	470196302
3225	NC_020536	AT	3	6	128935	128940	50 %	50 %	0 %	0 %	470196302
3226	NC_020536	ATC	2	6	128990	128995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196302
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3231	NC_020536	TGA	2	6	129226	129231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196302
3232	NC_020536	ACA	2	6	129235	129240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196302
3233	NC_020536	CA	3	6	129275	129280	50 %	0 %	0 %	50 %	470196302
3234	NC_020536	ATT	2	6	129290	129295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196302
3235	NC_020536	TTG	2	6	129305	129310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196302
3236	NC_020536	AGA	2	6	129409	129414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196302
3237	NC_020536	CGTA	2	8	129472	129479	25 %	25 %	25 %	25 %	470196302
3238	NC_020536	AGA	2	6	129484	129489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196302
3239	NC_020536	CAGATT	2	12	129567	129578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470196302
3240	NC_020536	AT	4	8	129583	129590	50 %	50 %	0 %	0 %	470196302
3241	NC_020536	AGT	2	6	129793	129798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196303
3242	NC_020536	AAC	2	6	129810	129815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196303
3243	NC_020536	ATACT	2	10	129823	129832	40 %	40 %	0 %	20 %	470196303
3244	NC_020536	CAA	2	6	129950	129955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196303
3245	NC_020536	GAA	2	6	129959	129964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196303
3246	NC_020536	GTT	2	6	129980	129985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196303
3247	NC_020536	TGC	2	6	130093	130098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196303
3248	NC_020536	AGA	2	6	130120	130125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196303
3249	NC_020536	TAT	2	6	130189	130194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196303
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3251	NC_020536	ATG	2	6	130308	130313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196303
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3283	NC_020536	TG	3	6	131698	131703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_020536	GAA	2	6	141719	141724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196312
3500	NC_020536	AAC	2	6	141742	141747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196312

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