MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020536	GCTAAA	2	12	41852	41863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1002	NC_020536	CCA	2	6	41906	41911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_020536	A	6	6	41919	41924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020536	AGCA	2	8	41946	41953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_020536	A	7	7	41976	41982	100 %	0 %	0 %	0 %	470196238
1006	NC_020536	A	6	6	42025	42030	100 %	0 %	0 %	0 %	470196238
1007	NC_020536	ATA	2	6	42047	42052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196238
1008	NC_020536	T	6	6	42064	42069	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1009	NC_020536	T	6	6	42075	42080	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1010	NC_020536	ATT	2	6	42082	42087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196238
1011	NC_020536	CTA	2	6	42102	42107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1012	NC_020536	GACA	2	8	42172	42179	50 %	0 %	25 %	25 %	470196238
1013	NC_020536	T	6	6	42254	42259	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1014	NC_020536	TTC	2	6	42317	42322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196238
1015	NC_020536	ATT	2	6	42323	42328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196238
1016	NC_020536	T	7	7	42327	42333	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1017	NC_020536	GTTT	2	8	42334	42341	0 %	75 %	25 %	0 %	470196238
1018	NC_020536	TTGAA	2	10	42342	42351	40 %	40 %	20 %	0 %	470196238
1019	NC_020536	ATC	2	6	42388	42393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1020	NC_020536	TAT	2	6	42471	42476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196238
1021	NC_020536	T	6	6	42547	42552	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1022	NC_020536	AT	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	470196238
1023	NC_020536	TTGAA	2	10	42688	42697	40 %	40 %	20 %	0 %	470196238
1024	NC_020536	ATC	2	6	42710	42715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1025	NC_020536	TTG	2	6	42771	42776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196238
1026	NC_020536	TCT	2	6	42824	42829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196238
1027	NC_020536	CAT	2	6	42849	42854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1028	NC_020536	AAT	2	6	42927	42932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196238
1029	NC_020536	T	6	6	42952	42957	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1030	NC_020536	TTG	2	6	43010	43015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196238
1031	NC_020536	TCT	2	6	43073	43078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196238
1032	NC_020536	TCT	2	6	43100	43105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196238
1033	NC_020536	TCAT	2	8	43163	43170	25 %	50 %	0 %	25 %	470196238
1034	NC_020536	ATC	2	6	43264	43269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1035	NC_020536	AC	3	6	43286	43291	50 %	0 %	0 %	50 %	470196238
1036	NC_020536	AATA	2	8	43306	43313	75 %	25 %	0 %	0 %	470196238
1037	NC_020536	TAA	2	6	43321	43326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196238
1038	NC_020536	AAG	2	6	43371	43376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196238
1039	NC_020536	CAT	2	6	43399	43404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1040	NC_020536	T	6	6	43425	43430	0 %	100 %	0 %	0 %	470196238
1041	NC_020536	TG	3	6	43457	43462	0 %	50 %	50 %	0 %	470196238
1042	NC_020536	CAT	2	6	43486	43491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196238
1043	NC_020536	CAC	2	6	43512	43517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_020536	TCG	2	6	43532	43537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_020536	CAA	2	6	43560	43565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_020536	TTTGT	2	10	43592	43601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020536	TGA	2	6	43698	43703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196239
1048	NC_020536	T	6	6	43706	43711	0 %	100 %	0 %	0 %	470196239
1049	NC_020536	CTTT	2	8	43713	43720	0 %	75 %	0 %	25 %	470196239
1050	NC_020536	AAC	2	6	43765	43770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196239
1051	NC_020536	TCA	2	6	43830	43835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196239
1052	NC_020536	ATTG	2	8	43953	43960	25 %	50 %	25 %	0 %	470196239
1053	NC_020536	ATA	2	6	43989	43994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196239
1054	NC_020536	GTT	2	6	44076	44081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196239
1055	NC_020536	CAT	2	6	44082	44087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196239
1056	NC_020536	TCA	2	6	44130	44135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196239
1057	NC_020536	TTC	2	6	44154	44159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_020536	ATA	2	6	44175	44180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020536	A	6	6	44180	44185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020536	CAT	2	6	44192	44197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_020536	T	6	6	44239	44244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020536	GTT	2	6	44282	44287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020536	TCT	2	6	44320	44325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_020536	TCTT	2	8	44370	44377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_020536	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020536	TCC	2	6	44467	44472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_020536	ATG	2	6	44489	44494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020536	ATT	2	6	44545	44550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020536	CTT	2	6	44566	44571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_020536	TAG	2	6	44573	44578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020536	TGA	2	6	44659	44664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020536	GATA	2	8	44692	44699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020536	TCA	2	6	44715	44720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020536	TAG	2	6	44724	44729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020536	CTG	2	6	44797	44802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020536	CTT	2	6	44803	44808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020536	TA	3	6	44861	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020536	GTT	2	6	44886	44891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_020536	CCT	2	6	44904	44909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_020536	ATA	2	6	44948	44953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020536	TA	3	6	44952	44957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_020536	TTA	2	6	44971	44976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020536	TTG	2	6	45064	45069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_020536	TA	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_020536	TA	3	6	45089	45094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_020536	ATTTGG	2	12	45097	45108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020536	TTA	2	6	45114	45119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020536	ACTT	2	8	45122	45129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_020536	TAT	2	6	45140	45145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020536	TTAT	3	12	45142	45153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020536	ATA	2	6	45156	45161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020536	TTTTG	2	10	45238	45247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020536	AT	3	6	45310	45315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020536	ATATT	2	10	45359	45368	40 %	60 %	0 %	0 %	470196240
1095	NC_020536	ATT	4	12	45428	45439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196240
1096	NC_020536	GTT	2	6	45445	45450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196240
1097	NC_020536	TAA	2	6	45451	45456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196240
1098	NC_020536	ATT	2	6	45461	45466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196240
1099	NC_020536	TAA	2	6	45599	45604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020536	AGC	2	6	45605	45610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020536	TTG	2	6	45647	45652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020536	TGA	2	6	45705	45710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020536	TGGT	2	8	45712	45719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020536	TCA	2	6	45789	45794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_020536	TTG	3	9	45797	45805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020536	TTGA	2	8	45854	45861	25 %	50 %	25 %	0 %	470196241
1107	NC_020536	TAC	2	6	45994	45999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196241
1108	NC_020536	GT	3	6	46038	46043	0 %	50 %	50 %	0 %	470196241
1109	NC_020536	ATT	2	6	46091	46096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196241
1110	NC_020536	ACTT	2	8	46141	46148	25 %	50 %	0 %	25 %	470196241
1111	NC_020536	TAA	2	6	46188	46193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196241
1112	NC_020536	GT	3	6	46199	46204	0 %	50 %	50 %	0 %	470196241
1113	NC_020536	CGT	2	6	46244	46249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196241
1114	NC_020536	GAATT	2	10	46276	46285	40 %	40 %	20 %	0 %	470196241
1115	NC_020536	GA	3	6	46307	46312	50 %	0 %	50 %	0 %	470196241
1116	NC_020536	T	6	6	46348	46353	0 %	100 %	0 %	0 %	470196241
1117	NC_020536	AT	3	6	46427	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	470196241
1118	NC_020536	T	6	6	46471	46476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020536	TTA	2	6	46490	46495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020536	ATA	2	6	46519	46524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020536	TTTC	2	8	46577	46584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_020536	A	6	6	46663	46668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020536	TTC	2	6	46690	46695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_020536	GTAA	2	8	46703	46710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020536	CAT	2	6	46779	46784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_020536	AT	4	8	46843	46850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020536	CAA	2	6	46851	46856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_020536	TC	3	6	46930	46935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_020536	AC	3	6	46941	46946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_020536	CCT	2	6	46955	46960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_020536	TTC	2	6	46970	46975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_020536	ATCC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_020536	TCA	2	6	47105	47110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196242
1134	NC_020536	ACA	2	6	47121	47126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196242
1135	NC_020536	GTT	2	6	47142	47147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196242
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1257	NC_020536	AATT	2	8	51916	51923	50 %	50 %	0 %	0 %	470196244
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1261	NC_020536	TAA	2	6	52061	52066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196244
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