MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020536	ATTG	2	8	249613	249620	25 %	50 %	25 %	0 %	470196389
6002	NC_020536	AATT	2	8	249660	249667	50 %	50 %	0 %	0 %	470196389
6003	NC_020536	AAT	2	6	249681	249686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196389
6004	NC_020536	CTT	2	6	249806	249811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196389
6005	NC_020536	TTTA	2	8	249960	249967	25 %	75 %	0 %	0 %	470196389
6006	NC_020536	CCA	2	6	249991	249996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196389
6007	NC_020536	TAAA	2	8	250093	250100	75 %	25 %	0 %	0 %	470196389
6008	NC_020536	CAT	2	6	250211	250216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196389
6009	NC_020536	TTC	2	6	250227	250232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196389
6010	NC_020536	AG	3	6	250245	250250	50 %	0 %	50 %	0 %	470196389
6011	NC_020536	ATT	2	6	250254	250259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196389
6012	NC_020536	AGC	2	6	250305	250310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196389
6013	NC_020536	TTC	2	6	250374	250379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196389
6014	NC_020536	AAT	2	6	250397	250402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196389
6015	NC_020536	TCT	2	6	250435	250440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196389
6016	NC_020536	AAC	2	6	250476	250481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196389
6017	NC_020536	GTC	2	6	250503	250508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196389
6018	NC_020536	CTT	2	6	250592	250597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196389
6019	NC_020536	TAAA	2	8	250602	250609	75 %	25 %	0 %	0 %	470196389
6020	NC_020536	TTG	2	6	250617	250622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196389
6021	NC_020536	AGT	2	6	250642	250647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196389
6022	NC_020536	TGTAA	2	10	250670	250679	40 %	40 %	20 %	0 %	470196389
6023	NC_020536	ATC	2	6	250716	250721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196389
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6025	NC_020536	TTTAC	2	10	250735	250744	20 %	60 %	0 %	20 %	470196389
6026	NC_020536	TAA	2	6	250790	250795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196389
6027	NC_020536	TAA	2	6	250803	250808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196389
6028	NC_020536	A	6	6	250852	250857	100 %	0 %	0 %	0 %	470196389
6029	NC_020536	ATT	2	6	250872	250877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196389
6030	NC_020536	GAA	2	6	250900	250905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196389
6031	NC_020536	ATC	2	6	250956	250961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196389
6032	NC_020536	CGG	2	6	251069	251074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470196389
6033	NC_020536	ATCAC	2	10	251107	251116	40 %	20 %	0 %	40 %	470196389
6034	NC_020536	TGT	2	6	251131	251136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196389
6035	NC_020536	CAAG	2	8	251160	251167	50 %	0 %	25 %	25 %	470196389
6036	NC_020536	ATAAC	2	10	251232	251241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6037	NC_020536	ATA	2	6	251279	251284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_020536	TGAAT	2	10	251343	251352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020536	TA	3	6	251367	251372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020536	ATTAA	2	10	251484	251493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020536	TAT	2	6	251502	251507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020536	ATC	2	6	251544	251549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196390
6043	NC_020536	GAA	2	6	251550	251555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196390
6044	NC_020536	AGA	2	6	251566	251571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196390
6045	NC_020536	ACA	2	6	251573	251578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196390
6046	NC_020536	TCA	2	6	251621	251626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196390
6047	NC_020536	ACAT	2	8	251655	251662	50 %	25 %	0 %	25 %	470196390
6048	NC_020536	AAG	2	6	251737	251742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196390
6049	NC_020536	AATC	2	8	251763	251770	50 %	25 %	0 %	25 %	470196390
6050	NC_020536	ATG	2	6	251787	251792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196390
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6065	NC_020536	TGG	2	6	252460	252465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196390
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6069	NC_020536	TG	3	6	252661	252666	0 %	50 %	50 %	0 %	470196390
6070	NC_020536	AGAA	2	8	252720	252727	75 %	0 %	25 %	0 %	470196390
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6074	NC_020536	GGAATA	2	12	252829	252840	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_020536	TA	3	6	252894	252899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_020536	TCA	2	6	252948	252953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6083	NC_020536	ATC	2	6	253281	253286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196391
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6093	NC_020536	ATGAT	2	10	253720	253729	40 %	40 %	20 %	0 %	470196391
6094	NC_020536	T	7	7	253757	253763	0 %	100 %	0 %	0 %	470196391
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6105	NC_020536	TGA	2	6	254323	254328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196391
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6109	NC_020536	TTCAT	2	10	254545	254554	20 %	60 %	0 %	20 %	470196391
6110	NC_020536	CT	3	6	254560	254565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_020536	CAA	2	6	254587	254592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_020536	TGT	2	6	254628	254633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_020536	ATT	2	6	254646	254651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020536	AATT	2	8	254659	254666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020536	GTA	2	6	254667	254672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020536	AAAT	2	8	254687	254694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020536	AT	3	6	254739	254744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_020536	CTG	2	6	254762	254767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_020536	TAC	2	6	254771	254776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_020536	TGC	2	6	254801	254806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_020536	AAT	2	6	254986	254991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_020536	TAT	2	6	255061	255066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020536	TGT	2	6	255151	255156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_020536	AAAT	2	8	255169	255176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6377	NC_020536	GTA	2	6	267383	267388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196400
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