MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020536	GAA	3	9	225795	225803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196373
5502	NC_020536	CAT	2	6	225939	225944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_020536	AGG	2	6	225951	225956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020536	CAT	2	6	225959	225964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196374
5505	NC_020536	TGG	2	6	225995	226000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196374
5506	NC_020536	GAT	2	6	226088	226093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196374
5507	NC_020536	TTG	2	6	226156	226161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196374
5508	NC_020536	GGT	2	6	226166	226171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196374
5509	NC_020536	GAC	2	6	226262	226267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196374
5510	NC_020536	TAA	2	6	226298	226303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196374
5511	NC_020536	ATT	2	6	226313	226318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196374
5512	NC_020536	CA	3	6	226341	226346	50 %	0 %	0 %	50 %	470196374
5513	NC_020536	A	6	6	226365	226370	100 %	0 %	0 %	0 %	470196374
5514	NC_020536	TGGT	2	8	226387	226394	0 %	50 %	50 %	0 %	470196374
5515	NC_020536	TAG	2	6	226402	226407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196374
5516	NC_020536	TGGG	2	8	226442	226449	0 %	25 %	75 %	0 %	470196374
5517	NC_020536	AAC	2	6	226591	226596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196374
5518	NC_020536	GAT	2	6	226647	226652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196374
5519	NC_020536	AGCA	2	8	226685	226692	50 %	0 %	25 %	25 %	470196374
5520	NC_020536	ATTT	2	8	226774	226781	25 %	75 %	0 %	0 %	470196374
5521	NC_020536	AT	3	6	226791	226796	50 %	50 %	0 %	0 %	470196374
5522	NC_020536	AAAGC	2	10	226822	226831	60 %	0 %	20 %	20 %	470196374
5523	NC_020536	GA	3	6	226863	226868	50 %	0 %	50 %	0 %	470196374
5524	NC_020536	AGA	2	6	226904	226909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196374
5525	NC_020536	GAA	2	6	226926	226931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196374
5526	NC_020536	ATT	2	6	227006	227011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_020536	AT	3	6	227012	227017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020536	AAG	2	6	227040	227045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020536	TAT	2	6	227080	227085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196375
5530	NC_020536	TGGAT	2	10	227132	227141	20 %	40 %	40 %	0 %	470196375
5531	NC_020536	GGT	2	6	227160	227165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196375
5532	NC_020536	GTT	2	6	227198	227203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196375
5533	NC_020536	CAGA	2	8	227245	227252	50 %	0 %	25 %	25 %	470196375
5534	NC_020536	AAG	2	6	227317	227322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196375
5535	NC_020536	GTT	2	6	227376	227381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196375
5536	NC_020536	GAT	2	6	227409	227414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196375
5537	NC_020536	AT	3	6	227627	227632	50 %	50 %	0 %	0 %	470196375
5538	NC_020536	TGG	2	6	227661	227666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196375
5539	NC_020536	TGC	2	6	227684	227689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196375
5540	NC_020536	TCA	2	6	227720	227725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196375
5541	NC_020536	TTA	3	9	227884	227892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196375
5542	NC_020536	TAT	2	6	227933	227938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196375
5543	NC_020536	AGA	2	6	227945	227950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196375
5544	NC_020536	CAG	2	6	228004	228009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470196375
5545	NC_020536	TGG	2	6	228015	228020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196375
5546	NC_020536	ATA	2	6	228023	228028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196375
5547	NC_020536	TGG	2	6	228068	228073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020536	TGAA	2	8	228080	228087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020536	TTGT	2	8	228139	228146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020536	AAG	2	6	228148	228153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020536	TA	3	6	228162	228167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020536	TA	3	6	228224	228229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020536	ATA	2	6	228254	228259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020536	A	7	7	228259	228265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020536	TGT	2	6	228269	228274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020536	AATAT	2	10	228314	228323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020536	TGA	2	6	228366	228371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_020536	TCT	2	6	228406	228411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196376
5559	NC_020536	TAA	2	6	228450	228455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5560	NC_020536	GT	3	6	228474	228479	0 %	50 %	50 %	0 %	470196376
5561	NC_020536	TAA	3	9	228480	228488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5562	NC_020536	ATG	2	6	228508	228513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196376
5563	NC_020536	AAG	2	6	228517	228522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196376
5564	NC_020536	TA	3	6	228545	228550	50 %	50 %	0 %	0 %	470196376
5565	NC_020536	TAA	2	6	228560	228565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5566	NC_020536	AAT	2	6	228586	228591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5567	NC_020536	ACC	2	6	228606	228611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470196376
5568	NC_020536	TAA	2	6	228620	228625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5569	NC_020536	ATAA	2	8	228628	228635	75 %	25 %	0 %	0 %	470196376
5570	NC_020536	TAA	2	6	228701	228706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196376
5571	NC_020536	GT	3	6	228741	228746	0 %	50 %	50 %	0 %	470196376
5572	NC_020536	ATAG	2	8	228868	228875	50 %	25 %	25 %	0 %	470196376
5573	NC_020536	ATG	2	6	228880	228885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196376
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5575	NC_020536	ACA	2	6	228925	228930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196376
5576	NC_020536	TATT	2	8	228971	228978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020536	TAA	2	6	229038	229043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020536	AT	3	6	229076	229081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020536	T	6	6	229120	229125	0 %	100 %	0 %	0 %	470196377
5580	NC_020536	CTTT	2	8	229202	229209	0 %	75 %	0 %	25 %	470196377
5581	NC_020536	AAC	2	6	229249	229254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196377
5582	NC_020536	GGC	2	6	229260	229265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470196377
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5584	NC_020536	CTTA	2	8	229410	229417	25 %	50 %	0 %	25 %	470196377
5585	NC_020536	ATT	2	6	229482	229487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196377
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5588	NC_020536	GGT	2	6	229621	229626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196377
5589	NC_020536	GGT	2	6	229636	229641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470196377
5590	NC_020536	TTC	2	6	229666	229671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196377
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5592	NC_020536	GAT	2	6	229753	229758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470196377
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5596	NC_020536	TAT	2	6	230042	230047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196377
5597	NC_020536	TTA	2	6	230065	230070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196377
5598	NC_020536	GTC	2	6	230075	230080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470196377
5599	NC_020536	TGT	2	6	230121	230126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196377
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5602	NC_020536	GGC	2	6	230325	230330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470196377
5603	NC_020536	TGGA	2	8	230382	230389	25 %	25 %	50 %	0 %	470196377
5604	NC_020536	TCT	2	6	230405	230410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470196377
5605	NC_020536	ATT	2	6	230418	230423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470196377
5606	NC_020536	GAA	2	6	230461	230466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470196377
5607	NC_020536	AT	3	6	230600	230605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_020536	CT	3	6	230751	230756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_020536	GAAA	2	8	230769	230776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020536	GCTT	2	8	230859	230866	0 %	50 %	25 %	25 %	470196378
5611	NC_020536	AAT	2	6	230869	230874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196378
5612	NC_020536	T	6	6	230897	230902	0 %	100 %	0 %	0 %	470196378
5613	NC_020536	AAT	2	6	231016	231021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196378
5614	NC_020536	TCGCA	2	10	231056	231065	20 %	20 %	20 %	40 %	470196378
5615	NC_020536	CAA	2	6	231142	231147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470196378
5616	NC_020536	ATA	2	6	231158	231163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196378
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5618	NC_020536	CAT	2	6	231199	231204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196378
5619	NC_020536	TTG	2	6	231236	231241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196378
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5621	NC_020536	TAA	2	6	231305	231310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470196378
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5623	NC_020536	AT	3	6	231345	231350	50 %	50 %	0 %	0 %	470196378
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5998	NC_020536	GTT	2	6	249478	249483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470196388
5999	NC_020536	TGTT	2	8	249497	249504	0 %	75 %	25 %	0 %	470196388
6000	NC_020536	TCA	2	6	249531	249536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470196388

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