MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	TA	4	8	5	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020535	TA	3	6	24	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020535	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	469816295
4	NC_020535	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
5	NC_020535	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	469816295
6	NC_020535	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
7	NC_020535	AT	3	6	1266	1271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020535	TA	3	6	1770	1775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020535	AT	3	6	1864	1869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020535	TA	3	6	1994	1999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020535	AT	3	6	2051	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020535	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
13	NC_020535	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
14	NC_020535	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
15	NC_020535	TA	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
16	NC_020535	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
17	NC_020535	AG	3	6	4998	5003	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
18	NC_020535	AT	3	6	5817	5822	50 %	50 %	0 %	0 %	469816297
19	NC_020535	TA	3	6	6322	6327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020535	TA	3	6	6491	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020535	AT	3	6	6796	6801	50 %	50 %	0 %	0 %	469816298
22	NC_020535	GT	3	6	7441	7446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020535	AC	4	8	7515	7522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020535	AC	3	6	7608	7613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_020535	TC	3	6	7722	7727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020535	AT	3	6	8108	8113	50 %	50 %	0 %	0 %	469816299
27	NC_020535	CA	3	6	8408	8413	50 %	0 %	0 %	50 %	469816299
28	NC_020535	TA	3	6	8686	8691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020535	AT	3	6	8977	8982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816300
30	NC_020535	TA	3	6	9484	9489	50 %	50 %	0 %	0 %	469816300
31	NC_020535	AG	3	6	10218	10223	50 %	0 %	50 %	0 %	469816301
32	NC_020535	AT	3	6	11661	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020535	AT	3	6	11862	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
34	NC_020535	TA	3	6	12112	12117	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
35	NC_020535	TA	3	6	12396	12401	50 %	50 %	0 %	0 %	469816303
36	NC_020535	AT	3	6	13391	13396	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
37	NC_020535	TA	3	6	13750	13755	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
38	NC_020535	AT	3	6	13954	13959	50 %	50 %	0 %	0 %	469816304
39	NC_020535	AT	3	6	14578	14583	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
40	NC_020535	AT	3	6	14604	14609	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
41	NC_020535	AC	3	6	15432	15437	50 %	0 %	0 %	50 %	469816305
42	NC_020535	TA	3	6	15456	15461	50 %	50 %	0 %	0 %	469816305
43	NC_020535	AT	3	6	17105	17110	50 %	50 %	0 %	0 %	469816307
44	NC_020535	AT	3	6	17490	17495	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
45	NC_020535	AT	3	6	17864	17869	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
46	NC_020535	GA	3	6	18047	18052	50 %	0 %	50 %	0 %	469816308
47	NC_020535	AT	3	6	18393	18398	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
48	NC_020535	AT	3	6	18984	18989	50 %	50 %	0 %	0 %	469816308
49	NC_020535	AT	3	6	19573	19578	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
50	NC_020535	AT	3	6	19649	19654	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
51	NC_020535	TA	4	8	19764	19771	50 %	50 %	0 %	0 %	469816309
52	NC_020535	AT	3	6	20083	20088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020535	AT	3	6	20730	20735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
54	NC_020535	TC	3	6	20788	20793	0 %	50 %	0 %	50 %	469816310
55	NC_020535	TA	3	6	20809	20814	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
56	NC_020535	AT	3	6	21068	21073	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
57	NC_020535	TA	3	6	21318	21323	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
58	NC_020535	TG	3	6	21923	21928	0 %	50 %	50 %	0 %	469816311
59	NC_020535	TA	3	6	22355	22360	50 %	50 %	0 %	0 %	469816311
60	NC_020535	AT	3	6	22653	22658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020535	AT	3	6	23380	23385	50 %	50 %	0 %	0 %	469816312
62	NC_020535	TA	3	6	23883	23888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020535	TA	3	6	24685	24690	50 %	50 %	0 %	0 %	469816313
64	NC_020535	TA	3	6	24786	24791	50 %	50 %	0 %	0 %	469816313
65	NC_020535	AT	3	6	24933	24938	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
66	NC_020535	AT	3	6	25585	25590	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
67	NC_020535	AT	4	8	25968	25975	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
68	NC_020535	AT	4	8	26095	26102	50 %	50 %	0 %	0 %	469816314
69	NC_020535	AT	5	10	26367	26376	50 %	50 %	0 %	0 %	469816315
70	NC_020535	AT	3	6	26405	26410	50 %	50 %	0 %	0 %	469816315
71	NC_020535	TA	3	6	29278	29283	50 %	50 %	0 %	0 %	469816318
72	NC_020535	TA	3	6	30385	30390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020535	TA	3	6	30470	30475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020535	TA	3	6	31016	31021	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
75	NC_020535	AT	3	6	31464	31469	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
76	NC_020535	TA	3	6	31505	31510	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
77	NC_020535	AT	3	6	31862	31867	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
78	NC_020535	TA	3	6	32125	32130	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
79	NC_020535	AT	3	6	32249	32254	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
80	NC_020535	TA	3	6	32372	32377	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320
81	NC_020535	TA	3	6	32720	32725	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320
82	NC_020535	GT	3	6	34950	34955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020535	CA	3	6	35217	35222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020535	TA	3	6	35224	35229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020535	TA	3	6	35234	35239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020535	AT	3	6	35255	35260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020535	AT	3	6	35265	35270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020535	AT	3	6	35277	35282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020535	TA	3	6	35296	35301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020535	AG	3	6	36520	36525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020535	AC	3	6	36582	36587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020535	TA	3	6	36975	36980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020535	AT	3	6	37030	37035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020535	AT	3	6	37240	37245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.