MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	469816295
2	NC_020535	ATAGT	2	10	1916	1925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020535	ACTTT	2	10	2036	2045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020535	GTTTT	2	10	2257	2266	0 %	80 %	20 %	0 %	469816296
5	NC_020535	TAATT	2	10	2972	2981	40 %	60 %	0 %	0 %	469816296
6	NC_020535	GTTTG	2	10	3687	3696	0 %	60 %	40 %	0 %	469816296
7	NC_020535	CAATA	2	10	4268	4277	60 %	20 %	0 %	20 %	469816296
8	NC_020535	ACAAT	2	10	6888	6897	60 %	20 %	0 %	20 %	469816298
9	NC_020535	AGCGA	2	10	8698	8707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020535	ACATG	2	10	9925	9934	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020535	ACATG	3	15	9969	9983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020535	ATAAC	2	10	10036	10045	60 %	20 %	0 %	20 %	469816301
13	NC_020535	AGAAA	2	10	10988	10997	80 %	0 %	20 %	0 %	469816301
14	NC_020535	TTTTC	2	10	12260	12269	0 %	80 %	0 %	20 %	469816303
15	NC_020535	AAACA	2	10	12812	12821	80 %	0 %	0 %	20 %	469816304
16	NC_020535	AAAGC	2	10	14754	14763	60 %	0 %	20 %	20 %	469816305
17	NC_020535	TGAAT	2	10	15082	15091	40 %	40 %	20 %	0 %	469816305
18	NC_020535	AAGTA	2	10	15283	15292	60 %	20 %	20 %	0 %	469816305
19	NC_020535	AATTG	2	10	15412	15421	40 %	40 %	20 %	0 %	469816305
20	NC_020535	AATAA	2	10	15476	15485	80 %	20 %	0 %	0 %	469816305
21	NC_020535	AGAAA	2	10	15529	15538	80 %	0 %	20 %	0 %	469816305
22	NC_020535	GATTT	2	10	16499	16508	20 %	60 %	20 %	0 %	469816306
23	NC_020535	AGAAA	2	10	16597	16606	80 %	0 %	20 %	0 %	469816306
24	NC_020535	TTATT	2	10	16928	16937	20 %	80 %	0 %	0 %	469816307
25	NC_020535	AGGGC	2	10	17903	17912	20 %	0 %	60 %	20 %	469816308
26	NC_020535	AATGA	2	10	19156	19165	60 %	20 %	20 %	0 %	469816308
27	NC_020535	ACATG	3	15	21644	21658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020535	TGGAT	2	10	21705	21714	20 %	40 %	40 %	0 %	469816311
29	NC_020535	TATAA	2	10	23258	23267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020535	ATTAT	2	10	24718	24727	40 %	60 %	0 %	0 %	469816313
31	NC_020535	AAAAG	2	10	24817	24826	80 %	0 %	20 %	0 %	469816313
32	NC_020535	TTATT	2	10	24911	24920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020535	ACAAT	2	10	25191	25200	60 %	20 %	0 %	20 %	469816314
34	NC_020535	ATTCA	2	10	25514	25523	40 %	40 %	0 %	20 %	469816314
35	NC_020535	GTAAA	2	10	27076	27085	60 %	20 %	20 %	0 %	469816316
36	NC_020535	GAACT	2	10	27088	27097	40 %	20 %	20 %	20 %	469816316
37	NC_020535	ATATA	2	10	27550	27559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020535	AAGAA	2	10	27563	27572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020535	AAATT	2	10	28343	28352	60 %	40 %	0 %	0 %	469816317
40	NC_020535	TAACT	2	10	28967	28976	40 %	40 %	0 %	20 %	469816318
41	NC_020535	TAACT	2	10	29342	29351	40 %	40 %	0 %	20 %	469816318
42	NC_020535	ATATG	2	10	31164	31173	40 %	40 %	20 %	0 %	469816319
43	NC_020535	AACGT	2	10	34378	34387	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020535	AATTA	2	10	34463	34472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020535	ACATG	3	15	35127	35141	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020535	TCAAA	2	10	36900	36909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.