MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
2	NC_020535	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	469816295
3	NC_020535	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	469816295
4	NC_020535	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
5	NC_020535	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
6	NC_020535	ACAT	2	8	1467	1474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020535	AAGA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020535	AGAA	2	8	2375	2382	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
9	NC_020535	TAAA	2	8	2851	2858	75 %	25 %	0 %	0 %	469816296
10	NC_020535	TAAT	2	8	2917	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
11	NC_020535	GGTT	2	8	3342	3349	0 %	50 %	50 %	0 %	469816296
12	NC_020535	AAGG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
13	NC_020535	AATT	2	8	3949	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
14	NC_020535	ATTA	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
15	NC_020535	AAAG	2	8	4479	4486	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
16	NC_020535	AATT	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
17	NC_020535	AAAC	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	469816296
18	NC_020535	ATCT	2	8	5377	5384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020535	ACAT	2	8	6019	6026	50 %	25 %	0 %	25 %	469816297
20	NC_020535	AAGA	2	8	6251	6258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020535	TTTG	2	8	6559	6566	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020535	GAAA	2	8	6676	6683	75 %	0 %	25 %	0 %	469816298
23	NC_020535	AAAC	2	8	6767	6774	75 %	0 %	0 %	25 %	469816298
24	NC_020535	TTGG	2	8	7418	7425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020535	CAAC	2	8	7489	7496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020535	CCAA	2	8	7529	7536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020535	CTTT	2	8	7686	7693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020535	ATTT	2	8	8224	8231	25 %	75 %	0 %	0 %	469816299
29	NC_020535	ACAT	2	8	9179	9186	50 %	25 %	0 %	25 %	469816300
30	NC_020535	AAGA	2	8	9413	9420	75 %	0 %	25 %	0 %	469816300
31	NC_020535	ATCA	2	8	10117	10124	50 %	25 %	0 %	25 %	469816301
32	NC_020535	AAGG	2	8	11005	11012	50 %	0 %	50 %	0 %	469816301
33	NC_020535	ATTA	2	8	11016	11023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020535	TGGT	2	8	11305	11312	0 %	50 %	50 %	0 %	469816302
35	NC_020535	CTTA	2	8	11600	11607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020535	TGAT	2	8	11713	11720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020535	GACG	2	8	11875	11882	25 %	0 %	50 %	25 %	469816303
38	NC_020535	AGAA	2	8	12776	12783	75 %	0 %	25 %	0 %	469816304
39	NC_020535	TCAA	2	8	12804	12811	50 %	25 %	0 %	25 %	469816304
40	NC_020535	TAAA	2	8	13264	13271	75 %	25 %	0 %	0 %	469816304
41	NC_020535	GTTC	2	8	13572	13579	0 %	50 %	25 %	25 %	469816304
42	NC_020535	TGAC	2	8	14014	14021	25 %	25 %	25 %	25 %	469816304
43	NC_020535	TAGA	2	8	14347	14354	50 %	25 %	25 %	0 %	469816304
44	NC_020535	TTCC	2	8	14731	14738	0 %	50 %	0 %	50 %	469816305
45	NC_020535	AATA	2	8	14911	14918	75 %	25 %	0 %	0 %	469816305
46	NC_020535	ACAG	2	8	15097	15104	50 %	0 %	25 %	25 %	469816305
47	NC_020535	TGAA	2	8	15114	15121	50 %	25 %	25 %	0 %	469816305
48	NC_020535	ACAA	2	8	15267	15274	75 %	0 %	0 %	25 %	469816305
49	NC_020535	ATAA	2	8	15695	15702	75 %	25 %	0 %	0 %	469816305
50	NC_020535	CTAT	2	8	16225	16232	25 %	50 %	0 %	25 %	469816306
51	NC_020535	GTAG	2	8	16681	16688	25 %	25 %	50 %	0 %	469816306
52	NC_020535	TAGT	2	8	16799	16806	25 %	50 %	25 %	0 %	469816306
53	NC_020535	ATTT	2	8	16878	16885	25 %	75 %	0 %	0 %	469816306
54	NC_020535	CTGG	2	8	16948	16955	0 %	25 %	50 %	25 %	469816307
55	NC_020535	AGCA	2	8	17129	17136	50 %	0 %	25 %	25 %	469816307
56	NC_020535	ATCA	2	8	17147	17154	50 %	25 %	0 %	25 %	469816307
57	NC_020535	ACAA	2	8	17254	17261	75 %	0 %	0 %	25 %	469816307
58	NC_020535	AGAT	2	8	17333	17340	50 %	25 %	25 %	0 %	469816307
59	NC_020535	AGTA	2	8	17370	17377	50 %	25 %	25 %	0 %	469816307
60	NC_020535	TTTG	2	8	18177	18184	0 %	75 %	25 %	0 %	469816308
61	NC_020535	GTTA	2	8	18216	18223	25 %	50 %	25 %	0 %	469816308
62	NC_020535	ATGA	2	8	18295	18302	50 %	25 %	25 %	0 %	469816308
63	NC_020535	TAAA	2	8	18731	18738	75 %	25 %	0 %	0 %	469816308
64	NC_020535	AAAT	2	8	18978	18985	75 %	25 %	0 %	0 %	469816308
65	NC_020535	AAAG	2	8	19198	19205	75 %	0 %	25 %	0 %	469816308
66	NC_020535	ATAG	2	8	19282	19289	50 %	25 %	25 %	0 %	469816308
67	NC_020535	AAAC	2	8	19482	19489	75 %	0 %	0 %	25 %	469816308
68	NC_020535	GAAA	2	8	19911	19918	75 %	0 %	25 %	0 %	469816309
69	NC_020535	TAAA	2	8	20029	20036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020535	AATT	2	8	20332	20339	50 %	50 %	0 %	0 %	469816310
71	NC_020535	ATAA	2	8	20364	20371	75 %	25 %	0 %	0 %	469816310
72	NC_020535	GAAG	2	8	20598	20605	50 %	0 %	50 %	0 %	469816310
73	NC_020535	TGAT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	25 %	0 %	469816310
74	NC_020535	AGAA	2	8	21472	21479	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
75	NC_020535	AAAG	2	8	21516	21523	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
76	NC_020535	AAGA	2	8	21549	21556	75 %	0 %	25 %	0 %	469816310
77	NC_020535	TAAA	2	8	21620	21627	75 %	25 %	0 %	0 %	469816310
78	NC_020535	TATT	2	8	22224	22231	25 %	75 %	0 %	0 %	469816311
79	NC_020535	CTTT	2	8	22419	22426	0 %	75 %	0 %	25 %	469816311
80	NC_020535	CCTT	2	8	22514	22521	0 %	50 %	0 %	50 %	469816311
81	NC_020535	TAAA	2	8	22615	22622	75 %	25 %	0 %	0 %	469816311
82	NC_020535	ATCT	2	8	23000	23007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020535	ACAT	2	8	23582	23589	50 %	25 %	0 %	25 %	469816312
84	NC_020535	AAGA	2	8	23816	23823	75 %	0 %	25 %	0 %	469816312
85	NC_020535	CATT	2	8	24611	24618	25 %	50 %	0 %	25 %	469816313
86	NC_020535	CTTT	2	8	25319	25326	0 %	75 %	0 %	25 %	469816314
87	NC_020535	AATA	2	8	25794	25801	75 %	25 %	0 %	0 %	469816314
88	NC_020535	AAAG	2	8	25953	25960	75 %	0 %	25 %	0 %	469816314
89	NC_020535	ATTT	2	8	26478	26485	25 %	75 %	0 %	0 %	469816315
90	NC_020535	TATT	2	8	26746	26753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020535	AATT	2	8	26891	26898	50 %	50 %	0 %	0 %	469816316
92	NC_020535	TAGA	2	8	27151	27158	50 %	25 %	25 %	0 %	469816316
93	NC_020535	GAAA	2	8	27706	27713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020535	TAAG	2	8	28176	28183	50 %	25 %	25 %	0 %	469816317
95	NC_020535	AAAT	2	8	28303	28310	75 %	25 %	0 %	0 %	469816317
96	NC_020535	AAAT	2	8	28410	28417	75 %	25 %	0 %	0 %	469816317
97	NC_020535	AACA	2	8	28460	28467	75 %	0 %	0 %	25 %	469816317
98	NC_020535	ACTA	2	8	28483	28490	50 %	25 %	0 %	25 %	469816317
99	NC_020535	TATT	2	8	28608	28615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020535	ATGA	2	8	28800	28807	50 %	25 %	25 %	0 %	469816318
101	NC_020535	AGAT	2	8	29522	29529	50 %	25 %	25 %	0 %	469816318
102	NC_020535	ATTT	2	8	29545	29552	25 %	75 %	0 %	0 %	469816318
103	NC_020535	ACGA	2	8	29554	29561	50 %	0 %	25 %	25 %	469816318
104	NC_020535	AAAG	2	8	30018	30025	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
105	NC_020535	AAAG	2	8	30093	30100	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
106	NC_020535	AACT	2	8	30215	30222	50 %	25 %	0 %	25 %	469816318
107	NC_020535	AAGA	2	8	30304	30311	75 %	0 %	25 %	0 %	469816318
108	NC_020535	AAAT	2	8	30747	30754	75 %	25 %	0 %	0 %	469816319
109	NC_020535	TTCG	2	8	31410	31417	0 %	50 %	25 %	25 %	469816319
110	NC_020535	GATA	2	8	31527	31534	50 %	25 %	25 %	0 %	469816319
111	NC_020535	TTAA	2	8	31705	31712	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
112	NC_020535	TAAT	2	8	31772	31779	50 %	50 %	0 %	0 %	469816319
113	NC_020535	TAAA	2	8	31925	31932	75 %	25 %	0 %	0 %	469816319
114	NC_020535	GTAA	2	8	31975	31982	50 %	25 %	25 %	0 %	469816319
115	NC_020535	ACTT	2	8	32038	32045	25 %	50 %	0 %	25 %	469816319
116	NC_020535	ACAA	2	8	32228	32235	75 %	0 %	0 %	25 %	469816319
117	NC_020535	AATT	2	8	32816	32823	50 %	50 %	0 %	0 %	469816320
118	NC_020535	TGAT	2	8	33260	33267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020535	ATCT	2	8	33370	33377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020535	CATT	2	8	33788	33795	25 %	50 %	0 %	25 %	469816321
121	NC_020535	ATTT	2	8	33916	33923	25 %	75 %	0 %	0 %	469816321
122	NC_020535	ATTC	2	8	34011	34018	25 %	50 %	0 %	25 %	469816321
123	NC_020535	AAAT	2	8	34333	34340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020535	AATT	2	8	34345	34352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020535	TTTA	2	8	34490	34497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020535	TAAA	2	8	34642	34649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020535	AGAA	2	8	34688	34695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020535	AAAT	2	8	34741	34748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020535	TAAA	2	8	35187	35194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020535	CAAT	2	8	35482	35489	50 %	25 %	0 %	25 %	469816322
131	NC_020535	GATA	2	8	35621	35628	50 %	25 %	25 %	0 %	469816322
132	NC_020535	TAAA	2	8	35778	35785	75 %	25 %	0 %	0 %	469816322
133	NC_020535	CATT	2	8	36274	36281	25 %	50 %	0 %	25 %	469816322
134	NC_020535	AAGA	2	8	36418	36425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020535	ATGT	2	8	36834	36841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020535	ATTC	2	8	36996	37003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020535	TTTG	2	8	37222	37229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.