MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI5S5 complete sequence

Total Repeats: 1036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020535	TA	4	8	5	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020535	TA	3	6	24	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020535	TCA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020535	T	6	6	113	118	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
5	NC_020535	AGA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
6	NC_020535	T	6	6	167	172	0 %	100 %	0 %	0 %	469816295
7	NC_020535	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	469816295
8	NC_020535	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
9	NC_020535	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
10	NC_020535	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
11	NC_020535	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
12	NC_020535	A	6	6	390	395	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
13	NC_020535	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	469816295
14	NC_020535	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	469816295
15	NC_020535	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	469816295
16	NC_020535	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	469816295
17	NC_020535	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
18	NC_020535	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	469816295
19	NC_020535	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
20	NC_020535	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	469816295
21	NC_020535	TAA	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
22	NC_020535	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
23	NC_020535	A	6	6	830	835	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
24	NC_020535	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816295
25	NC_020535	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
26	NC_020535	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
27	NC_020535	A	6	6	929	934	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
28	NC_020535	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
29	NC_020535	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816295
30	NC_020535	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816295
31	NC_020535	A	6	6	1021	1026	100 %	0 %	0 %	0 %	469816295
32	NC_020535	A	8	8	1080	1087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020535	TCT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020535	CTA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020535	AT	3	6	1266	1271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020535	GTG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020535	TCA	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020535	GAA	2	6	1363	1368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020535	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020535	TTA	2	6	1384	1389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020535	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020535	ACAT	2	8	1467	1474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020535	AAT	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020535	TTAAAC	2	12	1620	1631	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020535	AAGA	2	8	1699	1706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020535	TA	3	6	1770	1775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020535	CAT	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020535	AT	3	6	1864	1869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020535	T	6	6	1885	1890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020535	ATAGT	2	10	1916	1925	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020535	TA	3	6	1994	1999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020535	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020535	AGT	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020535	TAT	2	6	2029	2034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020535	ACTTT	2	10	2036	2045	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020535	AT	3	6	2051	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020535	AGG	2	6	2141	2146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020535	A	6	6	2223	2228	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
59	NC_020535	GTTTT	2	10	2257	2266	0 %	80 %	20 %	0 %	469816296
60	NC_020535	T	6	6	2263	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
61	NC_020535	C	6	6	2276	2281	0 %	0 %	0 %	100 %	469816296
62	NC_020535	AGAA	2	8	2375	2382	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
63	NC_020535	A	9	9	2428	2436	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
64	NC_020535	A	7	7	2499	2505	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
65	NC_020535	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
66	NC_020535	AAT	2	6	2595	2600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
67	NC_020535	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
68	NC_020535	A	6	6	2640	2645	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
69	NC_020535	TAT	2	6	2650	2655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
70	NC_020535	TGT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
71	NC_020535	TAAA	2	8	2851	2858	75 %	25 %	0 %	0 %	469816296
72	NC_020535	ATT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
73	NC_020535	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
74	NC_020535	TAAT	2	8	2917	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
75	NC_020535	TAA	2	6	2929	2934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
76	NC_020535	ATT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
77	NC_020535	TAATT	2	10	2972	2981	40 %	60 %	0 %	0 %	469816296
78	NC_020535	TCC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	469816296
79	NC_020535	GTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
80	NC_020535	TA	3	6	3172	3177	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
81	NC_020535	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
82	NC_020535	ATT	2	6	3239	3244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
83	NC_020535	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
84	NC_020535	TA	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
85	NC_020535	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
86	NC_020535	TTG	2	6	3299	3304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469816296
87	NC_020535	AT	3	6	3324	3329	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
88	NC_020535	GGTT	2	8	3342	3349	0 %	50 %	50 %	0 %	469816296
89	NC_020535	AAC	2	6	3356	3361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
90	NC_020535	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
91	NC_020535	AAT	4	12	3387	3398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
92	NC_020535	AAGG	2	8	3423	3430	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
93	NC_020535	AGT	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
94	NC_020535	AAT	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
95	NC_020535	TGA	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
96	NC_020535	ATA	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
97	NC_020535	AGA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816296
98	NC_020535	GTTTG	2	10	3687	3696	0 %	60 %	40 %	0 %	469816296
99	NC_020535	CAT	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
100	NC_020535	CTA	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816296
101	NC_020535	TCT	2	6	3855	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
102	NC_020535	A	7	7	3906	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
103	NC_020535	TTA	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
104	NC_020535	AATT	2	8	3949	3956	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
105	NC_020535	TAG	2	6	4039	4044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
106	NC_020535	ATA	2	6	4078	4083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
107	NC_020535	TAA	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
108	NC_020535	TAA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
109	NC_020535	TAA	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
110	NC_020535	AAT	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
111	NC_020535	ATTA	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
112	NC_020535	CAATA	2	10	4268	4277	60 %	20 %	0 %	20 %	469816296
113	NC_020535	A	6	6	4338	4343	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
114	NC_020535	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
115	NC_020535	A	6	6	4420	4425	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
116	NC_020535	AAAG	2	8	4479	4486	75 %	0 %	25 %	0 %	469816296
117	NC_020535	TTA	2	6	4489	4494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
118	NC_020535	T	6	6	4634	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	469816296
119	NC_020535	AAT	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
120	NC_020535	A	6	6	4679	4684	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
121	NC_020535	ATA	2	6	4699	4704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
122	NC_020535	TCT	2	6	4743	4748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
123	NC_020535	A	7	7	4818	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
124	NC_020535	TAA	2	6	4838	4843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
125	NC_020535	TCT	2	6	4857	4862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816296
126	NC_020535	GAT	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816296
127	NC_020535	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
128	NC_020535	AATT	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	469816296
129	NC_020535	AG	3	6	4998	5003	50 %	0 %	50 %	0 %	469816296
130	NC_020535	CAA	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816296
131	NC_020535	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	469816296
132	NC_020535	ATT	2	6	5090	5095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
133	NC_020535	TAA	3	9	5195	5203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816296
134	NC_020535	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816296
135	NC_020535	AAAC	2	8	5230	5237	75 %	0 %	0 %	25 %	469816296
136	NC_020535	TAG	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020535	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020535	A	6	6	5344	5349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020535	ATCT	2	8	5377	5384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020535	CAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020535	A	6	6	5406	5411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020535	T	6	6	5414	5419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020535	T	7	7	5447	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020535	ATT	2	6	5511	5516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020535	CAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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