MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020534	ACAT	2	8	272	279	50 %	25 %	0 %	25 %	469816272
2	NC_020534	AAGA	2	8	506	513	75 %	0 %	25 %	0 %	469816272
3	NC_020534	CTTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	0 %	25 %	469816273
4	NC_020534	AGTA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	469816273
5	NC_020534	TAGA	2	8	1866	1873	50 %	25 %	25 %	0 %	469816273
6	NC_020534	CCAT	2	8	2320	2327	25 %	25 %	0 %	50 %	469816273
7	NC_020534	CGTA	2	8	3199	3206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020534	GTAA	2	8	3289	3296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020534	TCTT	2	8	3422	3429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020534	TTCA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020534	ATTT	2	8	3461	3468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020534	GCAA	2	8	3500	3507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020534	TGAA	2	8	3513	3520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020534	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020534	AACG	2	8	3561	3568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020534	TAAA	2	8	3680	3687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020534	AAAT	2	8	3873	3880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020534	TATT	2	8	3976	3983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020534	TTAA	2	8	4206	4213	50 %	50 %	0 %	0 %	469816274
20	NC_020534	TTTA	2	8	4295	4302	25 %	75 %	0 %	0 %	469816274
21	NC_020534	AAGT	2	8	5162	5169	50 %	25 %	25 %	0 %	469816275
22	NC_020534	AAAG	2	8	5650	5657	75 %	0 %	25 %	0 %	469816275
23	NC_020534	CATT	2	8	5793	5800	25 %	50 %	0 %	25 %	469816275
24	NC_020534	TTAA	2	8	5832	5839	50 %	50 %	0 %	0 %	469816275
25	NC_020534	AATT	2	8	5872	5879	50 %	50 %	0 %	0 %	469816275
26	NC_020534	AAAG	2	8	6084	6091	75 %	0 %	25 %	0 %	469816275
27	NC_020534	ATTT	2	8	6126	6133	25 %	75 %	0 %	0 %	469816275
28	NC_020534	TGGA	2	8	6372	6379	25 %	25 %	50 %	0 %	469816275
29	NC_020534	ATTT	2	8	6892	6899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020534	TAGA	2	8	7528	7535	50 %	25 %	25 %	0 %	469816276
31	NC_020534	TAAA	2	8	7774	7781	75 %	25 %	0 %	0 %	469816276
32	NC_020534	ATAA	2	8	7912	7919	75 %	25 %	0 %	0 %	469816276
33	NC_020534	AAGA	2	8	7934	7941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020534	TATT	2	8	8022	8029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020534	ATGA	2	8	8041	8048	50 %	25 %	25 %	0 %	469816277
36	NC_020534	TTAT	2	8	8532	8539	25 %	75 %	0 %	0 %	469816277
37	NC_020534	ATTG	2	8	8657	8664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020534	TAAC	2	8	8954	8961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020534	AATA	2	8	9347	9354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020534	CATT	2	8	9429	9436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020534	AACG	2	8	9506	9513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020534	ATAA	2	8	10080	10087	75 %	25 %	0 %	0 %	469816278
43	NC_020534	GTTT	2	8	10383	10390	0 %	75 %	25 %	0 %	469816279
44	NC_020534	ATTA	2	8	10414	10421	50 %	50 %	0 %	0 %	469816279
45	NC_020534	AAAG	2	8	10721	10728	75 %	0 %	25 %	0 %	469816279
46	NC_020534	TAAT	2	8	10836	10843	50 %	50 %	0 %	0 %	469816279
47	NC_020534	TATG	2	8	11527	11534	25 %	50 %	25 %	0 %	469816279
48	NC_020534	AATT	2	8	12168	12175	50 %	50 %	0 %	0 %	469816280
49	NC_020534	AAAC	2	8	12664	12671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020534	TAAT	2	8	12917	12924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020534	CAAA	2	8	12937	12944	75 %	0 %	0 %	25 %	469816281
52	NC_020534	TCTT	2	8	13220	13227	0 %	75 %	0 %	25 %	469816281
53	NC_020534	TTTA	2	8	13301	13308	25 %	75 %	0 %	0 %	469816281
54	NC_020534	TCTT	2	8	13499	13506	0 %	75 %	0 %	25 %	469816281
55	NC_020534	CTTT	2	8	13536	13543	0 %	75 %	0 %	25 %	469816281
56	NC_020534	TAAT	2	8	13590	13597	50 %	50 %	0 %	0 %	469816281
57	NC_020534	GTTT	2	8	13650	13657	0 %	75 %	25 %	0 %	469816281
58	NC_020534	TATG	2	8	14259	14266	25 %	50 %	25 %	0 %	469816282
59	NC_020534	ATCC	2	8	14292	14299	25 %	25 %	0 %	50 %	469816282
60	NC_020534	TAGA	2	8	14312	14319	50 %	25 %	25 %	0 %	469816282
61	NC_020534	TATT	2	8	14470	14477	25 %	75 %	0 %	0 %	469816282
62	NC_020534	TTTA	2	8	15936	15943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020534	TAGA	2	8	16014	16021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020534	TATT	2	8	16278	16285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020534	GTAT	2	8	16701	16708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020534	TTAG	2	8	16860	16867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020534	TGAA	2	8	17004	17011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020534	TTAC	2	8	17126	17133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020534	TTTA	2	8	17266	17273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020534	CTAG	2	8	18059	18066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020534	TAAA	2	8	18430	18437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020534	ATAA	2	8	18472	18479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020534	AAAT	2	8	18648	18655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020534	CAAA	2	8	18670	18677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020534	TACA	2	8	18964	18971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020534	ATTA	2	8	19137	19144	50 %	50 %	0 %	0 %	469816283
77	NC_020534	TTAG	2	8	19612	19619	25 %	50 %	25 %	0 %	469816283
78	NC_020534	CAAC	2	8	19683	19690	50 %	0 %	0 %	50 %	469816283
79	NC_020534	TCGG	2	8	19831	19838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020534	AAGC	2	8	20184	20191	50 %	0 %	25 %	25 %	469816284
81	NC_020534	GCTA	2	8	20648	20655	25 %	25 %	25 %	25 %	469816284
82	NC_020534	GTGG	2	8	20881	20888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020534	ATTT	2	8	20901	20908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020534	ATTT	2	8	20916	20923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020534	AGGT	2	8	21207	21214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020534	TGTA	2	8	21533	21540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020534	TAAA	2	8	21806	21813	75 %	25 %	0 %	0 %	469816285
88	NC_020534	AAAT	2	8	21998	22005	75 %	25 %	0 %	0 %	469816285
89	NC_020534	AAGA	2	8	22799	22806	75 %	0 %	25 %	0 %	469816286
90	NC_020534	TATT	2	8	23196	23203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020534	ACAT	2	8	24031	24038	50 %	25 %	0 %	25 %	469816287
92	NC_020534	AAGA	2	8	24265	24272	75 %	0 %	25 %	0 %	469816287
93	NC_020534	AGTA	2	8	24606	24613	50 %	25 %	25 %	0 %	469816288
94	NC_020534	TATT	2	8	25144	25151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020534	TAGA	2	8	25177	25184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020534	CCGA	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	469816289
97	NC_020534	CGGA	2	8	25512	25519	25 %	0 %	50 %	25 %	469816289
98	NC_020534	ACGG	2	8	25807	25814	25 %	0 %	50 %	25 %	469816289
99	NC_020534	TCAC	2	8	26145	26152	25 %	25 %	0 %	50 %	469816290
100	NC_020534	CGAT	2	8	26320	26327	25 %	25 %	25 %	25 %	469816290
101	NC_020534	CGCT	2	8	26769	26776	0 %	25 %	25 %	50 %	469816290
102	NC_020534	TCAT	2	8	26919	26926	25 %	50 %	0 %	25 %	469816290
103	NC_020534	TGAC	2	8	27099	27106	25 %	25 %	25 %	25 %	469816290
104	NC_020534	GGCT	2	8	27402	27409	0 %	25 %	50 %	25 %	469816290
105	NC_020534	CATC	2	8	28006	28013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020534	TACA	2	8	28059	28066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020534	ATAG	2	8	28463	28470	50 %	25 %	25 %	0 %	469816291
108	NC_020534	CTTT	2	8	29030	29037	0 %	75 %	0 %	25 %	469816292
109	NC_020534	AACT	2	8	29058	29065	50 %	25 %	0 %	25 %	469816292
110	NC_020534	TAGG	2	8	29181	29188	25 %	25 %	50 %	0 %	469816292
111	NC_020534	ATTC	2	8	29223	29230	25 %	50 %	0 %	25 %	469816292
112	NC_020534	ATTT	2	8	29328	29335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020534	TTAT	2	8	29847	29854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020534	TACC	2	8	30324	30331	25 %	25 %	0 %	50 %	469816293
115	NC_020534	TTAC	2	8	30503	30510	25 %	50 %	0 %	25 %	469816293

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.