MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI4T8 complete sequence

Total Repeats: 782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020534	AAAT	2	8	18648	18655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020534	AT	3	6	18654	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020534	CAAA	2	8	18670	18677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_020534	T	6	6	18702	18707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020534	ATA	2	6	18872	18877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020534	TACA	2	8	18964	18971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_020534	T	6	6	18999	19004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020534	A	6	6	19007	19012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020534	A	6	6	19018	19023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020534	TCA	2	6	19032	19037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_020534	ATA	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816283
512	NC_020534	CTT	2	6	19103	19108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816283
513	NC_020534	TCA	2	6	19126	19131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816283
514	NC_020534	ATTA	2	8	19137	19144	50 %	50 %	0 %	0 %	469816283
515	NC_020534	CCA	2	6	19201	19206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	469816283
516	NC_020534	T	7	7	19264	19270	0 %	100 %	0 %	0 %	469816283
517	NC_020534	A	6	6	19285	19290	100 %	0 %	0 %	0 %	469816283
518	NC_020534	ACA	2	6	19384	19389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816283
519	NC_020534	TTC	2	6	19434	19439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816283
520	NC_020534	TA	3	6	19446	19451	50 %	50 %	0 %	0 %	469816283
521	NC_020534	T	7	7	19458	19464	0 %	100 %	0 %	0 %	469816283
522	NC_020534	TTA	2	6	19528	19533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816283
523	NC_020534	CAA	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816283
524	NC_020534	TTAG	2	8	19612	19619	25 %	50 %	25 %	0 %	469816283
525	NC_020534	T	6	6	19660	19665	0 %	100 %	0 %	0 %	469816283
526	NC_020534	CAAC	2	8	19683	19690	50 %	0 %	0 %	50 %	469816283
527	NC_020534	CTT	2	6	19715	19720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816283
528	NC_020534	TCGG	2	8	19831	19838	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_020534	T	6	6	19882	19887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020534	CAA	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020534	A	6	6	19967	19972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020534	ATT	2	6	19990	19995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
533	NC_020534	CTA	2	6	20042	20047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816284
534	NC_020534	AT	3	6	20074	20079	50 %	50 %	0 %	0 %	469816284
535	NC_020534	GA	3	6	20090	20095	50 %	0 %	50 %	0 %	469816284
536	NC_020534	CAA	2	6	20119	20124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816284
537	NC_020534	GAA	2	6	20171	20176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816284
538	NC_020534	A	8	8	20175	20182	100 %	0 %	0 %	0 %	469816284
539	NC_020534	AAGC	2	8	20184	20191	50 %	0 %	25 %	25 %	469816284
540	NC_020534	TTA	2	6	20192	20197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
541	NC_020534	ATT	2	6	20245	20250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
542	NC_020534	TTA	2	6	20332	20337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
543	NC_020534	TTA	2	6	20344	20349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816284
544	NC_020534	AAT	2	6	20472	20477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816284
545	NC_020534	ATC	2	6	20491	20496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816284
546	NC_020534	TA	3	6	20581	20586	50 %	50 %	0 %	0 %	469816284
547	NC_020534	TTC	2	6	20602	20607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816284
548	NC_020534	CAT	2	6	20642	20647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469816284
549	NC_020534	GCTA	2	8	20648	20655	25 %	25 %	25 %	25 %	469816284
550	NC_020534	TAT	2	6	20668	20673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020534	T	6	6	20698	20703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020534	TAT	2	6	20756	20761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020534	GAA	3	9	20810	20818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020534	A	7	7	20823	20829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020534	ACC	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_020534	GTGG	2	8	20881	20888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020534	ATTT	2	8	20901	20908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020534	ATTT	2	8	20916	20923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020534	GTT	2	6	20924	20929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020534	TGA	2	6	20931	20936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020534	A	6	6	20950	20955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020534	T	7	7	20983	20989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020534	TTA	2	6	20996	21001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020534	A	6	6	21153	21158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020534	A	6	6	21166	21171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020534	TAAAAT	2	12	21172	21183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020534	T	6	6	21199	21204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020534	AGGT	2	8	21207	21214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_020534	T	6	6	21272	21277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020534	T	7	7	21362	21368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020534	A	8	8	21427	21434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020534	TA	3	6	21435	21440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020534	A	7	7	21461	21467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020534	ATG	2	6	21477	21482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020534	TA	3	6	21503	21508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020534	TGTA	2	8	21533	21540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020534	A	6	6	21574	21579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020534	T	7	7	21590	21596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_020534	GA	3	6	21733	21738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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584	NC_020534	T	7	7	21751	21757	0 %	100 %	0 %	0 %	469816285
585	NC_020534	T	6	6	21759	21764	0 %	100 %	0 %	0 %	469816285
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592	NC_020534	AAAT	2	8	21998	22005	75 %	25 %	0 %	0 %	469816285
593	NC_020534	AAT	2	6	22027	22032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816285
594	NC_020534	ATT	2	6	22059	22064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816285
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599	NC_020534	T	6	6	22236	22241	0 %	100 %	0 %	0 %	469816285
600	NC_020534	ATA	2	6	22243	22248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816285
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602	NC_020534	TAA	3	9	22277	22285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020534	A	6	6	22284	22289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_020534	GAA	2	6	22325	22330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816286
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607	NC_020534	ATT	3	9	22379	22387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816286
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610	NC_020534	AT	3	6	22490	22495	50 %	50 %	0 %	0 %	469816286
611	NC_020534	GAT	2	6	22515	22520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816286
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616	NC_020534	CTT	2	6	22714	22719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469816286
617	NC_020534	TGG	2	6	22727	22732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469816286
618	NC_020534	A	7	7	22787	22793	100 %	0 %	0 %	0 %	469816286
619	NC_020534	AAGA	2	8	22799	22806	75 %	0 %	25 %	0 %	469816286
620	NC_020534	AAG	2	6	22883	22888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469816286
621	NC_020534	T	7	7	22978	22984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020534	T	6	6	22986	22991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020534	AGT	2	6	23005	23010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020534	TGA	2	6	23032	23037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020534	TAA	2	6	23059	23064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020534	GA	3	6	23076	23081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020534	AT	3	6	23116	23121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020534	TATT	2	8	23196	23203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020534	T	6	6	23210	23215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020534	TGA	2	6	23237	23242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020534	TCT	2	6	23257	23262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_020534	A	6	6	23279	23284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020534	TA	3	6	23291	23296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020534	GAC	2	6	23303	23308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_020534	TAA	2	6	23348	23353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020534	TC	3	6	23366	23371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_020534	AG	3	6	23391	23396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020534	TCA	2	6	23443	23448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_020534	TTG	2	6	23458	23463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_020534	A	6	6	23523	23528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020534	TAG	2	6	23605	23610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020534	ATT	2	6	23657	23662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020534	TCT	2	6	23733	23738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_020534	TTA	2	6	23947	23952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469816287
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653	NC_020534	TTAAAC	2	12	24186	24197	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	469816287
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663	NC_020534	ATG	2	6	24775	24780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469816288
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665	NC_020534	ATA	2	6	25012	25017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469816288
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667	NC_020534	TATT	2	8	25144	25151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_020534	TAGA	2	8	25177	25184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
669	NC_020534	CAT	2	6	25200	25205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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724	NC_020534	T	6	6	28103	28108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_020534	TCACA	2	10	29695	29704	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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761	NC_020534	T	6	6	29799	29804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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764	NC_020534	TTAT	2	8	29847	29854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_020534	T	6	6	29872	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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768	NC_020534	A	6	6	29951	29956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_020534	CAA	2	6	30180	30185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469816293
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775	NC_020534	TACC	2	8	30324	30331	25 %	25 %	0 %	50 %	469816293
776	NC_020534	CAG	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469816293
777	NC_020534	T	7	7	30384	30390	0 %	100 %	0 %	0 %	469816293
778	NC_020534	TGC	2	6	30469	30474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469816293
779	NC_020534	TTAC	2	8	30503	30510	25 %	50 %	0 %	25 %	469816293
780	NC_020534	T	6	6	30544	30549	0 %	100 %	0 %	0 %	469816293
781	NC_020534	T	7	7	30646	30652	0 %	100 %	0 %	0 %	469816293
782	NC_020534	TCT	2	6	30828	30833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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