MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 8665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020533	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020533	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020533	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	470194246
4	NC_020533	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	470194246
5	NC_020533	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	470194246
6	NC_020533	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
7	NC_020533	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
8	NC_020533	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	470194247
9	NC_020533	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	470194247
10	NC_020533	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	470194247
11	NC_020533	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	470194247
12	NC_020533	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	470194247
13	NC_020533	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	470194247
14	NC_020533	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020533	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020533	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020533	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020533	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020533	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020533	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	470194249
21	NC_020533	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	470194249
22	NC_020533	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	470194249
23	NC_020533	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	470194249
24	NC_020533	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	470194249
25	NC_020533	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	470194250
26	NC_020533	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	470194250
27	NC_020533	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	470194250
28	NC_020533	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	470194250
29	NC_020533	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	470194250
30	NC_020533	ACAA	2	8	7969	7976	75 %	0 %	0 %	25 %	470194250
31	NC_020533	TTAG	2	8	8406	8413	25 %	50 %	25 %	0 %	470194250
32	NC_020533	GTCA	2	8	8640	8647	25 %	25 %	25 %	25 %	470194250
33	NC_020533	AATA	2	8	8906	8913	75 %	25 %	0 %	0 %	470194250
34	NC_020533	TGTA	2	8	9266	9273	25 %	50 %	25 %	0 %	470194250
35	NC_020533	TGAT	2	8	9565	9572	25 %	50 %	25 %	0 %	470194250
36	NC_020533	CATA	2	8	9824	9831	50 %	25 %	0 %	25 %	470194251
37	NC_020533	GTCA	2	8	10305	10312	25 %	25 %	25 %	25 %	470194251
38	NC_020533	AATG	2	8	11811	11818	50 %	25 %	25 %	0 %	470194252
39	NC_020533	CCAT	2	8	12319	12326	25 %	25 %	0 %	50 %	470194252
40	NC_020533	CAAT	2	8	12382	12389	50 %	25 %	0 %	25 %	470194252
41	NC_020533	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020533	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020533	ATTA	2	8	12912	12919	50 %	50 %	0 %	0 %	470194253
44	NC_020533	ATTT	2	8	13442	13449	25 %	75 %	0 %	0 %	470194253
45	NC_020533	GCAA	2	8	13783	13790	50 %	0 %	25 %	25 %	470194253
46	NC_020533	TAAA	2	8	14073	14080	75 %	25 %	0 %	0 %	470194253
47	NC_020533	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020533	ATTT	2	8	15145	15152	25 %	75 %	0 %	0 %	470194254
49	NC_020533	GCAA	2	8	16518	16525	50 %	0 %	25 %	25 %	470194255
50	NC_020533	AAGG	2	8	16651	16658	50 %	0 %	50 %	0 %	470194255
51	NC_020533	GTAA	2	8	17075	17082	50 %	25 %	25 %	0 %	470194255
52	NC_020533	AAAG	2	8	17660	17667	75 %	0 %	25 %	0 %	470194256
53	NC_020533	AAAG	2	8	17675	17682	75 %	0 %	25 %	0 %	470194256
54	NC_020533	TTAA	2	8	17924	17931	50 %	50 %	0 %	0 %	470194256
55	NC_020533	TAGA	2	8	18707	18714	50 %	25 %	25 %	0 %	470194257
56	NC_020533	ACAA	2	8	18813	18820	75 %	0 %	0 %	25 %	470194257
57	NC_020533	ATGA	2	8	18895	18902	50 %	25 %	25 %	0 %	470194257
58	NC_020533	TAAA	2	8	19619	19626	75 %	25 %	0 %	0 %	470194257
59	NC_020533	CAAC	2	8	19753	19760	50 %	0 %	0 %	50 %	470194257
60	NC_020533	AATT	2	8	19952	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	470194257
61	NC_020533	AGTA	2	8	20567	20574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020533	ATTC	2	8	20652	20659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020533	GTCT	2	8	20823	20830	0 %	50 %	25 %	25 %	470194258
64	NC_020533	TGAA	2	8	21008	21015	50 %	25 %	25 %	0 %	470194258
65	NC_020533	GCAT	2	8	21102	21109	25 %	25 %	25 %	25 %	470194258
66	NC_020533	GATT	2	8	21119	21126	25 %	50 %	25 %	0 %	470194258
67	NC_020533	GGTA	2	8	21609	21616	25 %	25 %	50 %	0 %	470194258
68	NC_020533	GGTT	2	8	23366	23373	0 %	50 %	50 %	0 %	470194259
69	NC_020533	AACA	2	8	23700	23707	75 %	0 %	0 %	25 %	470194259
70	NC_020533	TTTG	2	8	23804	23811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020533	ATCT	2	8	24139	24146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020533	GCCT	2	8	24267	24274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020533	ATTT	2	8	24599	24606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020533	GTAC	2	8	25516	25523	25 %	25 %	25 %	25 %	470194260
75	NC_020533	AATC	2	8	25983	25990	50 %	25 %	0 %	25 %	470194261
76	NC_020533	ATCT	2	8	27417	27424	25 %	50 %	0 %	25 %	470194261
77	NC_020533	ACAA	2	8	28076	28083	75 %	0 %	0 %	25 %	470194262
78	NC_020533	AATG	2	8	28180	28187	50 %	25 %	25 %	0 %	470194262
79	NC_020533	TCGT	2	8	28212	28219	0 %	50 %	25 %	25 %	470194262
80	NC_020533	AACA	2	8	28657	28664	75 %	0 %	0 %	25 %	470194262
81	NC_020533	AATT	2	8	29194	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	470194263
82	NC_020533	CAAT	2	8	29309	29316	50 %	25 %	0 %	25 %	470194263
83	NC_020533	GATG	2	8	29317	29324	25 %	25 %	50 %	0 %	470194263
84	NC_020533	TACT	2	8	29539	29546	25 %	50 %	0 %	25 %	470194263
85	NC_020533	GGCA	2	8	30238	30245	25 %	0 %	50 %	25 %	470194264
86	NC_020533	AAAG	2	8	30251	30258	75 %	0 %	25 %	0 %	470194264
87	NC_020533	GAAC	2	8	30695	30702	50 %	0 %	25 %	25 %	470194264
88	NC_020533	ATCA	2	8	30940	30947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020533	CAAC	2	8	31205	31212	50 %	0 %	0 %	50 %	470194265
90	NC_020533	TACA	2	8	31460	31467	50 %	25 %	0 %	25 %	470194265
91	NC_020533	AATG	2	8	31635	31642	50 %	25 %	25 %	0 %	470194265
92	NC_020533	GACT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	25 %	25 %	470194265
93	NC_020533	TAAA	2	8	32729	32736	75 %	25 %	0 %	0 %	470194265
94	NC_020533	ATGA	2	8	32788	32795	50 %	25 %	25 %	0 %	470194265
95	NC_020533	CAAG	2	8	33155	33162	50 %	0 %	25 %	25 %	470194265
96	NC_020533	AAGC	2	8	33740	33747	50 %	0 %	25 %	25 %	470194266
97	NC_020533	TTCT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020533	ATAA	2	8	34430	34437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020533	ATTA	2	8	34522	34529	50 %	50 %	0 %	0 %	470194268
100	NC_020533	GGAT	2	8	34738	34745	25 %	25 %	50 %	0 %	470194268
101	NC_020533	AATA	2	8	34886	34893	75 %	25 %	0 %	0 %	470194268
102	NC_020533	TGAA	2	8	35022	35029	50 %	25 %	25 %	0 %	470194268
103	NC_020533	AAGA	2	8	35384	35391	75 %	0 %	25 %	0 %	470194268
104	NC_020533	TAAA	2	8	35807	35814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020533	AAAT	2	8	36632	36639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020533	TTAA	2	8	37304	37311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020533	TCAT	2	8	37481	37488	25 %	50 %	0 %	25 %	470194269
108	NC_020533	AAAC	2	8	37989	37996	75 %	0 %	0 %	25 %	470194269
109	NC_020533	AAGA	2	8	38162	38169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020533	GCAT	2	8	38342	38349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020533	TAGC	2	8	38729	38736	25 %	25 %	25 %	25 %	470194270
112	NC_020533	TTTA	2	8	38917	38924	25 %	75 %	0 %	0 %	470194270
113	NC_020533	TTTG	2	8	39142	39149	0 %	75 %	25 %	0 %	470194270
114	NC_020533	CATA	2	8	39540	39547	50 %	25 %	0 %	25 %	470194270
115	NC_020533	TAGT	2	8	39678	39685	25 %	50 %	25 %	0 %	470194270
116	NC_020533	ATGT	2	8	39723	39730	25 %	50 %	25 %	0 %	470194270
117	NC_020533	GTTT	2	8	40348	40355	0 %	75 %	25 %	0 %	470194270
118	NC_020533	ATGA	2	8	41335	41342	50 %	25 %	25 %	0 %	470194271
119	NC_020533	ATAA	2	8	41593	41600	75 %	25 %	0 %	0 %	470194271
120	NC_020533	TGTA	2	8	41718	41725	25 %	50 %	25 %	0 %	470194271
121	NC_020533	AGCA	2	8	41946	41953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020533	GACA	2	8	42172	42179	50 %	0 %	25 %	25 %	470194272
123	NC_020533	GTTT	2	8	42334	42341	0 %	75 %	25 %	0 %	470194272
124	NC_020533	TCAT	2	8	43163	43170	25 %	50 %	0 %	25 %	470194272
125	NC_020533	AATA	2	8	43306	43313	75 %	25 %	0 %	0 %	470194272
126	NC_020533	CTTT	2	8	43713	43720	0 %	75 %	0 %	25 %	470194273
127	NC_020533	ATTG	2	8	43953	43960	25 %	50 %	25 %	0 %	470194273
128	NC_020533	TCTT	2	8	44370	44377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020533	GATA	2	8	44692	44699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020533	ACTT	2	8	45122	45129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020533	TTAT	3	12	45142	45153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020533	TGGT	2	8	45712	45719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020533	TTGA	2	8	45854	45861	25 %	50 %	25 %	0 %	470194275
134	NC_020533	ACTT	2	8	46141	46148	25 %	50 %	0 %	25 %	470194275
135	NC_020533	TTTC	2	8	46577	46584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020533	GTAA	2	8	46703	46710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020533	ATCC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020533	TGAT	2	8	47187	47194	25 %	50 %	25 %	0 %	470194276
139	NC_020533	TTAG	2	8	47528	47535	25 %	50 %	25 %	0 %	470194276
140	NC_020533	ATTG	2	8	47685	47692	25 %	50 %	25 %	0 %	470194276
141	NC_020533	GTTT	2	8	48287	48294	0 %	75 %	25 %	0 %	470194276
142	NC_020533	GTAA	2	8	48333	48340	50 %	25 %	25 %	0 %	470194276
143	NC_020533	TCAA	2	8	48493	48500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020533	TTAG	2	8	48639	48646	25 %	50 %	25 %	0 %	470194277
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