MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020533	TATG	2	8	120820	120827	25 %	50 %	25 %	0 %	470194328
3002	NC_020533	AAC	2	6	120831	120836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194328
3003	NC_020533	AATC	2	8	120903	120910	50 %	25 %	0 %	25 %	470194328
3004	NC_020533	GAG	2	6	120939	120944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194328
3005	NC_020533	AAG	2	6	120955	120960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194328
3006	NC_020533	TTTA	2	8	121106	121113	25 %	75 %	0 %	0 %	470194329
3007	NC_020533	TTA	2	6	121132	121137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3008	NC_020533	T	6	6	121149	121154	0 %	100 %	0 %	0 %	470194329
3009	NC_020533	ATT	2	6	121165	121170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3010	NC_020533	ATT	2	6	121189	121194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3011	NC_020533	TTTG	2	8	121199	121206	0 %	75 %	25 %	0 %	470194329
3012	NC_020533	T	6	6	121210	121215	0 %	100 %	0 %	0 %	470194329
3013	NC_020533	GAT	2	6	121216	121221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194329
3014	NC_020533	TTA	2	6	121229	121234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3015	NC_020533	ATTT	2	8	121282	121289	25 %	75 %	0 %	0 %	470194329
3016	NC_020533	GAT	2	6	121299	121304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194329
3017	NC_020533	A	6	6	121327	121332	100 %	0 %	0 %	0 %	470194329
3018	NC_020533	TTATA	2	10	121347	121356	40 %	60 %	0 %	0 %	470194329
3019	NC_020533	TAT	2	6	121383	121388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3020	NC_020533	TGA	2	6	121434	121439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194329
3021	NC_020533	AATG	2	8	121458	121465	50 %	25 %	25 %	0 %	470194329
3022	NC_020533	ATT	2	6	121492	121497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3023	NC_020533	ATTT	2	8	121624	121631	25 %	75 %	0 %	0 %	470194329
3024	NC_020533	TTA	2	6	121634	121639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3025	NC_020533	TAG	2	6	121650	121655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194329
3026	NC_020533	ACT	2	6	121727	121732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194329
3027	NC_020533	CAT	2	6	121808	121813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194329
3028	NC_020533	TTG	2	6	121943	121948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194329
3029	NC_020533	ATA	2	6	121952	121957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194329
3030	NC_020533	ATT	2	6	122001	122006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3031	NC_020533	TTTA	2	8	122021	122028	25 %	75 %	0 %	0 %	470194329
3032	NC_020533	ATT	2	6	122037	122042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194329
3033	NC_020533	TTG	2	6	122078	122083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194329
3034	NC_020533	TAA	2	6	122124	122129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194329
3035	NC_020533	TTTTA	2	10	122145	122154	20 %	80 %	0 %	0 %	470194329
3036	NC_020533	ATT	2	6	122231	122236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_020533	ATT	2	6	122291	122296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3038	NC_020533	GTG	2	6	122316	122321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194330
3039	NC_020533	TTTC	2	8	122337	122344	0 %	75 %	0 %	25 %	470194330
3040	NC_020533	TGA	2	6	122364	122369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3041	NC_020533	CAG	2	6	122444	122449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194330
3042	NC_020533	ATT	2	6	122473	122478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3043	NC_020533	TATT	2	8	122523	122530	25 %	75 %	0 %	0 %	470194330
3044	NC_020533	GAT	2	6	122531	122536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3045	NC_020533	CTA	2	6	122552	122557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194330
3046	NC_020533	TAT	2	6	122569	122574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3047	NC_020533	GCA	2	6	122579	122584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194330
3048	NC_020533	TTG	2	6	122646	122651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194330
3049	NC_020533	GTATT	2	10	122658	122667	20 %	60 %	20 %	0 %	470194330
3050	NC_020533	GTT	2	6	122675	122680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194330
3051	NC_020533	ATCA	2	8	122694	122701	50 %	25 %	0 %	25 %	470194330
3052	NC_020533	TGTA	2	8	122712	122719	25 %	50 %	25 %	0 %	470194330
3053	NC_020533	CTATTG	2	12	122724	122735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470194330
3054	NC_020533	TCGT	2	8	122827	122834	0 %	50 %	25 %	25 %	470194330
3055	NC_020533	TTA	2	6	122846	122851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3056	NC_020533	TA	3	6	122871	122876	50 %	50 %	0 %	0 %	470194330
3057	NC_020533	GTT	2	6	122891	122896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194330
3058	NC_020533	TAG	2	6	122904	122909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3059	NC_020533	CAA	2	6	122918	122923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194330
3060	NC_020533	TAA	2	6	123058	123063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194330
3061	NC_020533	CAT	2	6	123123	123128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194330
3062	NC_020533	TTTA	2	8	123129	123136	25 %	75 %	0 %	0 %	470194330
3063	NC_020533	TGA	2	6	123174	123179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3064	NC_020533	TTA	2	6	123239	123244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3065	NC_020533	AATAA	2	10	123251	123260	80 %	20 %	0 %	0 %	470194330
3066	NC_020533	TA	3	6	123264	123269	50 %	50 %	0 %	0 %	470194330
3067	NC_020533	TAT	2	6	123306	123311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3068	NC_020533	AT	3	6	123323	123328	50 %	50 %	0 %	0 %	470194330
3069	NC_020533	CTTA	2	8	123379	123386	25 %	50 %	0 %	25 %	470194330
3070	NC_020533	TTG	2	6	123396	123401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194330
3071	NC_020533	TGC	2	6	123457	123462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194330
3072	NC_020533	ATG	2	6	123467	123472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3073	NC_020533	ATT	2	6	123498	123503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194330
3074	NC_020533	TACGC	2	10	123518	123527	20 %	20 %	20 %	40 %	470194330
3075	NC_020533	TAG	2	6	123549	123554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
3076	NC_020533	ATG	2	6	123569	123574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194330
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3078	NC_020533	T	6	6	123711	123716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_020533	TA	3	6	123806	123811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_020533	AAAT	2	8	123824	123831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_020533	AAT	3	9	123829	123837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_020533	AC	3	6	123847	123852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_020533	ATTA	2	8	123858	123865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_020533	AGG	2	6	123887	123892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_020533	CATATG	2	12	123927	123938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194331
3086	NC_020533	AT	3	6	123952	123957	50 %	50 %	0 %	0 %	470194331
3087	NC_020533	TCA	2	6	123979	123984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194331
3088	NC_020533	TACG	2	8	124000	124007	25 %	25 %	25 %	25 %	470194331
3089	NC_020533	ATCA	2	8	124050	124057	50 %	25 %	0 %	25 %	470194331
3090	NC_020533	TAA	2	6	124117	124122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194331
3091	NC_020533	GGT	2	6	124127	124132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194331
3092	NC_020533	CATT	2	8	124142	124149	25 %	50 %	0 %	25 %	470194331
3093	NC_020533	GAA	2	6	124178	124183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194331
3094	NC_020533	CAA	2	6	124260	124265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194331
3095	NC_020533	ATT	2	6	124267	124272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194331
3096	NC_020533	GTT	2	6	124295	124300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194331
3097	NC_020533	ATG	2	6	124302	124307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194331
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3099	NC_020533	A	6	6	124466	124471	100 %	0 %	0 %	0 %	470194331
3100	NC_020533	TGA	2	6	124474	124479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194331
3101	NC_020533	AGC	2	6	124489	124494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194331
3102	NC_020533	ATA	2	6	124498	124503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194331
3103	NC_020533	T	6	6	124547	124552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020533	ATA	2	6	124613	124618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_020533	TTA	2	6	124643	124648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020533	TTG	2	6	124649	124654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020533	ATG	2	6	124661	124666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_020533	TA	3	6	124677	124682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_020533	ACA	2	6	124689	124694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_020533	ATTA	2	8	124697	124704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020533	TAAA	2	8	124721	124728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_020533	ATT	2	6	124744	124749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020533	A	6	6	124774	124779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020533	TTG	2	6	124799	124804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020533	AATGTA	2	12	124828	124839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_020533	A	6	6	124871	124876	100 %	0 %	0 %	0 %	470194332
3117	NC_020533	AATG	2	8	124963	124970	50 %	25 %	25 %	0 %	470194332
3118	NC_020533	ATC	2	6	125001	125006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194332
3119	NC_020533	AGT	2	6	125020	125025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194332
3120	NC_020533	ATG	2	6	125124	125129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194332
3121	NC_020533	TGG	2	6	125287	125292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194332
3122	NC_020533	CAA	2	6	125330	125335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194332
3123	NC_020533	AC	4	8	125352	125359	50 %	0 %	0 %	50 %	470194332
3124	NC_020533	ACA	2	6	125380	125385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194332
3125	NC_020533	ATC	2	6	125398	125403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194332
3126	NC_020533	ATG	2	6	125414	125419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194332
3127	NC_020533	TCA	2	6	125441	125446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194332
3128	NC_020533	ATC	2	6	125448	125453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194332
3129	NC_020533	A	6	6	125471	125476	100 %	0 %	0 %	0 %	470194332
3130	NC_020533	GCT	2	6	125486	125491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194332
3131	NC_020533	ACT	2	6	125536	125541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194332
3132	NC_020533	GAC	2	6	125571	125576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194332
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3134	NC_020533	ATAA	2	8	125586	125593	75 %	25 %	0 %	0 %	470194332
3135	NC_020533	ATA	2	6	125596	125601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_020533	TAA	2	6	125606	125611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_020533	GAGC	2	8	125634	125641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_020533	AGT	2	6	125687	125692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020533	TGAA	2	8	125697	125704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020533	TCA	2	6	125753	125758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_020533	A	6	6	125758	125763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_020533	TAA	2	6	125776	125781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_020533	TAA	2	6	125785	125790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194333
3144	NC_020533	TTA	2	6	125848	125853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194333
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3146	NC_020533	CAA	2	6	125902	125907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194333
3147	NC_020533	TGAT	2	8	125979	125986	25 %	50 %	25 %	0 %	470194333
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3154	NC_020533	TGA	2	6	126222	126227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194333
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3156	NC_020533	TCCCT	2	10	126324	126333	0 %	40 %	0 %	60 %	470194333
3157	NC_020533	CT	3	6	126340	126345	0 %	50 %	0 %	50 %	470194333
3158	NC_020533	GC	3	6	126408	126413	0 %	0 %	50 %	50 %	470194333
3159	NC_020533	TA	3	6	126476	126481	50 %	50 %	0 %	0 %	470194333
3160	NC_020533	TAT	2	6	126485	126490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194333
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3162	NC_020533	AAT	2	6	126567	126572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020533	ATAG	2	8	126608	126615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_020533	TAG	2	6	126643	126648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_020533	CTGTAA	2	12	126649	126660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3166	NC_020533	A	6	6	126705	126710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_020533	TAT	3	9	126711	126719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020533	GGA	2	6	126762	126767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470194334
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3184	NC_020533	CAA	2	6	127415	127420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194334
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3220	NC_020533	AT	3	6	128861	128866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020533	TAAA	2	8	128885	128892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020533	TA	3	6	128898	128903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_020533	GAG	2	6	128908	128913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_020533	AGTA	2	8	128915	128922	50 %	25 %	25 %	0 %	470194336
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3234	NC_020533	ATT	2	6	129291	129296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194336
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3237	NC_020533	CGTA	2	8	129473	129480	25 %	25 %	25 %	25 %	470194336
3238	NC_020533	AGA	2	6	129485	129490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194336
3239	NC_020533	CAGATT	2	12	129568	129579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470194336
3240	NC_020533	AT	4	8	129584	129591	50 %	50 %	0 %	0 %	470194336
3241	NC_020533	AGT	2	6	129794	129799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194337
3242	NC_020533	AAC	2	6	129811	129816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194337
3243	NC_020533	ATACT	2	10	129824	129833	40 %	40 %	0 %	20 %	470194337
3244	NC_020533	CAA	2	6	129951	129956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194337
3245	NC_020533	GAA	2	6	129960	129965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194337
3246	NC_020533	GTT	2	6	129981	129986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194337
3247	NC_020533	TGC	2	6	130094	130099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194337
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3499	NC_020533	ATTT	2	8	141713	141720	25 %	75 %	0 %	0 %	470194346
3500	NC_020533	GAA	2	6	141722	141727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194346

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