MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020533	TCA	2	6	249534	249539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194422
6002	NC_020533	ATTG	2	8	249616	249623	25 %	50 %	25 %	0 %	470194423
6003	NC_020533	AATT	2	8	249663	249670	50 %	50 %	0 %	0 %	470194423
6004	NC_020533	AAT	2	6	249684	249689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194423
6005	NC_020533	CTT	2	6	249809	249814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194423
6006	NC_020533	TTTA	2	8	249963	249970	25 %	75 %	0 %	0 %	470194423
6007	NC_020533	CCA	2	6	249994	249999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470194423
6008	NC_020533	TAAA	2	8	250096	250103	75 %	25 %	0 %	0 %	470194423
6009	NC_020533	CAT	2	6	250214	250219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194423
6010	NC_020533	TTC	2	6	250230	250235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194423
6011	NC_020533	AG	3	6	250248	250253	50 %	0 %	50 %	0 %	470194423
6012	NC_020533	ATT	2	6	250257	250262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194423
6013	NC_020533	AGC	2	6	250308	250313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194423
6014	NC_020533	TTC	2	6	250377	250382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194423
6015	NC_020533	AAT	2	6	250400	250405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194423
6016	NC_020533	TCT	2	6	250438	250443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194423
6017	NC_020533	AAC	2	6	250479	250484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194423
6018	NC_020533	GTC	2	6	250506	250511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194423
6019	NC_020533	CTT	2	6	250595	250600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194423
6020	NC_020533	TAAA	2	8	250605	250612	75 %	25 %	0 %	0 %	470194423
6021	NC_020533	TTG	2	6	250620	250625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194423
6022	NC_020533	AGT	2	6	250645	250650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194423
6023	NC_020533	TGTAA	2	10	250673	250682	40 %	40 %	20 %	0 %	470194423
6024	NC_020533	ATC	2	6	250719	250724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194423
6025	NC_020533	GTT	2	6	250726	250731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194423
6026	NC_020533	TTTAC	2	10	250738	250747	20 %	60 %	0 %	20 %	470194423
6027	NC_020533	TAA	2	6	250793	250798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194423
6028	NC_020533	TAA	2	6	250806	250811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194423
6029	NC_020533	A	6	6	250855	250860	100 %	0 %	0 %	0 %	470194423
6030	NC_020533	ATT	2	6	250875	250880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194423
6031	NC_020533	GAA	2	6	250903	250908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194423
6032	NC_020533	ATC	2	6	250959	250964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194423
6033	NC_020533	CGG	2	6	251072	251077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194423
6034	NC_020533	ATCAC	2	10	251110	251119	40 %	20 %	0 %	40 %	470194423
6035	NC_020533	TGT	2	6	251134	251139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194423
6036	NC_020533	CAAG	2	8	251163	251170	50 %	0 %	25 %	25 %	470194423
6037	NC_020533	ATAAC	2	10	251235	251244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6038	NC_020533	ATA	2	6	251282	251287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020533	TGAAT	2	10	251346	251355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020533	TA	3	6	251370	251375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020533	ATTAA	2	10	251487	251496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020533	TAT	2	6	251505	251510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_020533	ATC	2	6	251547	251552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194424
6044	NC_020533	GAA	2	6	251553	251558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194424
6045	NC_020533	AGA	2	6	251569	251574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194424
6046	NC_020533	ACA	2	6	251576	251581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194424
6047	NC_020533	TCA	2	6	251624	251629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194424
6048	NC_020533	ACAT	2	8	251658	251665	50 %	25 %	0 %	25 %	470194424
6049	NC_020533	AAG	2	6	251740	251745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194424
6050	NC_020533	AATC	2	8	251766	251773	50 %	25 %	0 %	25 %	470194424
6051	NC_020533	ATG	2	6	251790	251795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194424
6052	NC_020533	AGA	2	6	251920	251925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194424
6053	NC_020533	TAA	2	6	252010	252015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194424
6054	NC_020533	TTC	2	6	252077	252082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470194424
6055	NC_020533	TTA	2	6	252126	252131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194424
6056	NC_020533	GGC	2	6	252146	252151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470194424
6057	NC_020533	TAT	2	6	252177	252182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194424
6058	NC_020533	TAG	2	6	252249	252254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194424
6059	NC_020533	GAA	2	6	252263	252268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194424
6060	NC_020533	ATT	2	6	252284	252289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194424
6061	NC_020533	ATT	2	6	252334	252339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194424
6062	NC_020533	TGC	2	6	252346	252351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194424
6063	NC_020533	CAG	2	6	252381	252386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194424
6064	NC_020533	ATT	2	6	252424	252429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470194424
6065	NC_020533	CGTG	2	8	252446	252453	0 %	25 %	50 %	25 %	470194424
6066	NC_020533	TGG	2	6	252463	252468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470194424
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6068	NC_020533	TGC	2	6	252496	252501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470194424
6069	NC_020533	ATTT	2	8	252646	252653	25 %	75 %	0 %	0 %	470194424
6070	NC_020533	TG	3	6	252664	252669	0 %	50 %	50 %	0 %	470194424
6071	NC_020533	AGAA	2	8	252723	252730	75 %	0 %	25 %	0 %	470194424
6072	NC_020533	AAC	2	6	252738	252743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470194424
6073	NC_020533	A	6	6	252746	252751	100 %	0 %	0 %	0 %	470194424
6074	NC_020533	AAT	3	9	252759	252767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194424
6075	NC_020533	GGAATA	2	12	252832	252843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020533	A	6	6	252856	252861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020533	TA	3	6	252897	252902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_020533	TAA	2	6	252930	252935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020533	TCA	2	6	252951	252956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_020533	GTT	2	6	253090	253095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470194425
6081	NC_020533	AGC	2	6	253155	253160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194425
6082	NC_020533	TAA	2	6	253217	253222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470194425
6083	NC_020533	ATTA	2	8	253275	253282	50 %	50 %	0 %	0 %	470194425
6084	NC_020533	ATC	2	6	253284	253289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194425
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6088	NC_020533	TCA	2	6	253441	253446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470194425
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6093	NC_020533	AT	3	6	253639	253644	50 %	50 %	0 %	0 %	470194425
6094	NC_020533	ATGAT	2	10	253723	253732	40 %	40 %	20 %	0 %	470194425
6095	NC_020533	T	7	7	253760	253766	0 %	100 %	0 %	0 %	470194425
6096	NC_020533	AAG	2	6	253790	253795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470194425
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6106	NC_020533	TGA	2	6	254326	254331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470194425
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6108	NC_020533	GCA	2	6	254392	254397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470194425
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6110	NC_020533	TTCAT	2	10	254548	254557	20 %	60 %	0 %	20 %	470194425
6111	NC_020533	CT	3	6	254563	254568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_020533	CAA	2	6	254590	254595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_020533	TGT	2	6	254631	254636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020533	ATT	2	6	254649	254654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020533	AATT	2	8	254662	254669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020533	GTA	2	6	254670	254675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020533	AAAT	2	8	254690	254697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_020533	AT	3	6	254742	254747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_020533	CTG	2	6	254765	254770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_020533	TAC	2	6	254774	254779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_020533	TGC	2	6	254804	254809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_020533	AAT	2	6	254989	254994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020533	TAT	2	6	255064	255069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_020533	GAC	2	6	255165	255170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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