MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020532	CAT	2	6	164428	164433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_020532	TCA	2	6	164514	164519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020532	TGTA	2	8	164522	164529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020532	ATG	2	6	164541	164546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020532	TA	4	8	164637	164644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020532	TTTA	2	8	164647	164654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020532	AT	3	6	164690	164695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020532	A	7	7	164721	164727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020532	T	6	6	164769	164774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020532	AGG	2	6	164788	164793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020532	TTA	2	6	164796	164801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020532	ATT	2	6	164807	164812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192400
4013	NC_020532	TTA	2	6	164814	164819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192400
4014	NC_020532	AGA	2	6	164852	164857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192400
4015	NC_020532	GCA	2	6	164871	164876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192400
4016	NC_020532	TTATT	2	10	164942	164951	20 %	80 %	0 %	0 %	470192400
4017	NC_020532	AAG	2	6	165022	165027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192400
4018	NC_020532	GAA	2	6	165165	165170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192400
4019	NC_020532	ATGT	2	8	165199	165206	25 %	50 %	25 %	0 %	470192400
4020	NC_020532	TGA	2	6	165245	165250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192400
4021	NC_020532	CG	4	8	165264	165271	0 %	0 %	50 %	50 %	470192400
4022	NC_020532	TAA	2	6	165312	165317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192400
4023	NC_020532	ACA	2	6	165319	165324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_020532	TGA	2	6	165328	165333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020532	AT	3	6	165335	165340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020532	TA	3	6	165342	165347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020532	AGT	2	6	165404	165409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020532	GAA	2	6	165416	165421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020532	TAG	2	6	165473	165478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020532	CGT	2	6	165496	165501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_020532	ATC	2	6	165548	165553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020532	TAG	2	6	165630	165635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020532	CAA	2	6	165668	165673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192401
4034	NC_020532	ACA	2	6	165676	165681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192401
4035	NC_020532	CATC	2	8	165809	165816	25 %	25 %	0 %	50 %	470192401
4036	NC_020532	ATT	2	6	165830	165835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192401
4037	NC_020532	ACA	2	6	165850	165855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192401
4038	NC_020532	CAT	2	6	165887	165892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192401
4039	NC_020532	TGC	2	6	165897	165902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192401
4040	NC_020532	ACA	2	6	165921	165926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192401
4041	NC_020532	GGATT	2	10	165930	165939	20 %	40 %	40 %	0 %	470192401
4042	NC_020532	TGA	2	6	165955	165960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192401
4043	NC_020532	AGA	2	6	165994	165999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192401
4044	NC_020532	AAC	2	6	166041	166046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192401
4045	NC_020532	GATG	2	8	166093	166100	25 %	25 %	50 %	0 %	470192401
4046	NC_020532	TAT	2	6	166183	166188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192401
4047	NC_020532	TGA	2	6	166207	166212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192401
4048	NC_020532	ATT	2	6	166262	166267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192401
4049	NC_020532	ATC	3	9	166362	166370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192401
4050	NC_020532	ATT	2	6	166386	166391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192401
4051	NC_020532	GAGT	2	8	166398	166405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020532	TCA	2	6	166432	166437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192402
4053	NC_020532	TGA	3	9	166558	166566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192402
4054	NC_020532	A	6	6	166569	166574	100 %	0 %	0 %	0 %	470192402
4055	NC_020532	TTA	2	6	166575	166580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192402
4056	NC_020532	ATC	2	6	166591	166596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192402
4057	NC_020532	AAT	2	6	166626	166631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192402
4058	NC_020532	CAT	2	6	166749	166754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192402
4059	NC_020532	TAA	2	6	166802	166807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192402
4060	NC_020532	GAT	2	6	166812	166817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192402
4061	NC_020532	CAG	2	6	166927	166932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192402
4062	NC_020532	TGA	2	6	167039	167044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192402
4063	NC_020532	TG	3	6	167067	167072	0 %	50 %	50 %	0 %	470192402
4064	NC_020532	ATGA	2	8	167157	167164	50 %	25 %	25 %	0 %	470192402
4065	NC_020532	GCAA	2	8	167167	167174	50 %	0 %	25 %	25 %	470192402
4066	NC_020532	CAT	2	6	167193	167198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192402
4067	NC_020532	ACA	2	6	167303	167308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192402
4068	NC_020532	ATG	2	6	167332	167337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192402
4069	NC_020532	TTG	2	6	167341	167346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192402
4070	NC_020532	AGG	2	6	167362	167367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192402
4071	NC_020532	TAT	2	6	167413	167418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_020532	TAT	2	6	167425	167430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020532	ATT	3	9	167456	167464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192403
4074	NC_020532	TGT	2	6	167590	167595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192403
4075	NC_020532	TTG	2	6	167600	167605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192403
4076	NC_020532	CTT	2	6	167623	167628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192403
4077	NC_020532	GGAA	2	8	167633	167640	50 %	0 %	50 %	0 %	470192403
4078	NC_020532	ACA	2	6	167652	167657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192403
4079	NC_020532	TGT	2	6	167716	167721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192403
4080	NC_020532	TTGGTA	2	12	167730	167741	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470192403
4081	NC_020532	GCGATT	2	12	167750	167761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470192403
4082	NC_020532	GCT	2	6	167771	167776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192403
4083	NC_020532	T	6	6	167776	167781	0 %	100 %	0 %	0 %	470192403
4084	NC_020532	AAATTT	2	12	167848	167859	50 %	50 %	0 %	0 %	470192403
4085	NC_020532	GGT	2	6	167865	167870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192403
4086	NC_020532	AT	3	6	167883	167888	50 %	50 %	0 %	0 %	470192403
4087	NC_020532	T	6	6	167998	168003	0 %	100 %	0 %	0 %	470192403
4088	NC_020532	AGA	2	6	168034	168039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192403
4089	NC_020532	AGC	2	6	168046	168051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192403
4090	NC_020532	ATT	2	6	168067	168072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192403
4091	NC_020532	TAT	2	6	168079	168084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192403
4092	NC_020532	AGA	2	6	168122	168127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192403
4093	NC_020532	GA	3	6	168141	168146	50 %	0 %	50 %	0 %	470192404
4094	NC_020532	TGA	3	9	168147	168155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192404
4095	NC_020532	TAG	2	6	168195	168200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192404
4096	NC_020532	TGA	2	6	168205	168210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192404
4097	NC_020532	TAT	2	6	168218	168223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192404
4098	NC_020532	CAA	2	6	168239	168244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192404
4099	NC_020532	GGC	2	6	168271	168276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192404
4100	NC_020532	A	6	6	168283	168288	100 %	0 %	0 %	0 %	470192404
4101	NC_020532	ACA	2	6	168326	168331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192404
4102	NC_020532	AAT	2	6	168398	168403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192404
4103	NC_020532	ACA	2	6	168409	168414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192404
4104	NC_020532	AC	3	6	168502	168507	50 %	0 %	0 %	50 %	470192404
4105	NC_020532	GTAA	2	8	168551	168558	50 %	25 %	25 %	0 %	470192404
4106	NC_020532	AAG	2	6	168564	168569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192404
4107	NC_020532	ATT	2	6	168573	168578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192404
4108	NC_020532	ATC	2	6	168601	168606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192404
4109	NC_020532	A	6	6	168663	168668	100 %	0 %	0 %	0 %	470192404
4110	NC_020532	T	6	6	168673	168678	0 %	100 %	0 %	0 %	470192404
4111	NC_020532	ATC	2	6	168743	168748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192404
4112	NC_020532	ATG	2	6	168753	168758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192404
4113	NC_020532	ATG	2	6	168897	168902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192404
4114	NC_020532	A	6	6	168914	168919	100 %	0 %	0 %	0 %	470192404
4115	NC_020532	AG	3	6	168935	168940	50 %	0 %	50 %	0 %	470192404
4116	NC_020532	TAACT	2	10	168967	168976	40 %	40 %	0 %	20 %	470192404
4117	NC_020532	GAA	2	6	169003	169008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192404
4118	NC_020532	TATT	2	8	169019	169026	25 %	75 %	0 %	0 %	470192404
4119	NC_020532	GTC	2	6	169049	169054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192404
4120	NC_020532	TGG	2	6	169057	169062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192404
4121	NC_020532	AC	3	6	169074	169079	50 %	0 %	0 %	50 %	470192404
4122	NC_020532	TTC	3	9	169115	169123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192404
4123	NC_020532	GCA	2	6	169124	169129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192404
4124	NC_020532	T	6	6	169198	169203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020532	TTG	2	6	169216	169221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020532	T	6	6	169227	169232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020532	ATA	2	6	169236	169241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020532	TAA	4	12	169311	169322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_020532	TAA	2	6	169344	169349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020532	CTT	2	6	169382	169387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_020532	AAC	2	6	169428	169433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4165	NC_020532	AGT	2	6	171042	171047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_020532	ATT	2	6	171132	171137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4171	NC_020532	T	7	7	171184	171190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4172	NC_020532	TTTG	2	8	171229	171236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4176	NC_020532	AT	3	6	171316	171321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4220	NC_020532	TAT	2	6	173014	173019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_020532	GT	3	6	173729	173734	0 %	50 %	50 %	0 %	470192407
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4248	NC_020532	ATC	2	6	173966	173971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
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4252	NC_020532	ATG	2	6	174020	174025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
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4372	NC_020532	ATG	2	6	179344	179349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
4373	NC_020532	TTG	2	6	179369	179374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
4374	NC_020532	GAT	2	6	179392	179397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
4375	NC_020532	GTT	2	6	179398	179403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192407
4376	NC_020532	ATT	2	6	179425	179430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192407
4377	NC_020532	TGA	4	12	179460	179471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192407
4378	NC_020532	CAA	2	6	179521	179526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192407
4379	NC_020532	CAT	2	6	179527	179532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
4380	NC_020532	AT	3	6	179542	179547	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
4381	NC_020532	AGA	2	6	179589	179594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192407
4382	NC_020532	ACT	2	6	179631	179636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192407
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4385	NC_020532	AC	3	6	179912	179917	50 %	0 %	0 %	50 %	470192407
4386	NC_020532	TAA	2	6	179946	179951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192407
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4389	NC_020532	AACATT	2	12	180108	180119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470192407
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4391	NC_020532	TAAC	2	8	180158	180165	50 %	25 %	0 %	25 %	470192407
4392	NC_020532	AT	3	6	180189	180194	50 %	50 %	0 %	0 %	470192407
4393	NC_020532	TAAG	2	8	180210	180217	50 %	25 %	25 %	0 %	470192407
4394	NC_020532	GAA	2	6	180274	180279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192408
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4398	NC_020532	AAAG	2	8	180670	180677	75 %	0 %	25 %	0 %	470192408
4399	NC_020532	ATTG	2	8	180687	180694	25 %	50 %	25 %	0 %	470192408
4400	NC_020532	TATGA	2	10	180724	180733	40 %	40 %	20 %	0 %	470192408
4401	NC_020532	ATCA	2	8	180749	180756	50 %	25 %	0 %	25 %	470192408
4402	NC_020532	GTGAA	2	10	180758	180767	40 %	20 %	40 %	0 %	470192408
4403	NC_020532	ATTT	2	8	180777	180784	25 %	75 %	0 %	0 %	470192408
4404	NC_020532	A	6	6	180838	180843	100 %	0 %	0 %	0 %	470192408
4405	NC_020532	AGT	2	6	180865	180870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192408
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4407	NC_020532	ATA	2	6	181056	181061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_020532	ACG	2	6	181069	181074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4409	NC_020532	ATCAT	2	10	181111	181120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4410	NC_020532	TAA	2	6	181127	181132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4411	NC_020532	ATCA	2	8	181145	181152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4412	NC_020532	GAT	2	6	181165	181170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4413	NC_020532	TTAAT	2	10	181201	181210	40 %	60 %	0 %	0 %	470192409
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4419	NC_020532	T	6	6	181414	181419	0 %	100 %	0 %	0 %	470192409
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4424	NC_020532	AAT	2	6	181744	181749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4426	NC_020532	T	6	6	181813	181818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_020532	TAAA	2	8	181870	181877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4428	NC_020532	ATC	2	6	181908	181913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4432	NC_020532	AT	3	6	182116	182121	50 %	50 %	0 %	0 %	470192410
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4449	NC_020532	ATG	2	6	182741	182746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192411
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4481	NC_020532	TCAT	2	8	184428	184435	25 %	50 %	0 %	25 %	470192412
4482	NC_020532	AAT	3	9	184499	184507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192412
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4484	NC_020532	T	6	6	184525	184530	0 %	100 %	0 %	0 %	470192412
4485	NC_020532	TAA	2	6	184534	184539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192412
4486	NC_020532	TAA	2	6	184553	184558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192412
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4489	NC_020532	AT	3	6	184694	184699	50 %	50 %	0 %	0 %	470192412
4490	NC_020532	CTA	2	6	184756	184761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192412
4491	NC_020532	AGGG	2	8	184762	184769	25 %	0 %	75 %	0 %	470192412
4492	NC_020532	TTAC	2	8	184779	184786	25 %	50 %	0 %	25 %	470192412
4493	NC_020532	ATT	2	6	184823	184828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192412
4494	NC_020532	ATA	2	6	184857	184862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192412
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4496	NC_020532	TG	3	6	184921	184926	0 %	50 %	50 %	0 %	470192412
4497	NC_020532	AATT	2	8	184961	184968	50 %	50 %	0 %	0 %	470192412
4498	NC_020532	ATC	2	6	185010	185015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192412
4499	NC_020532	CCT	2	6	185023	185028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4500	NC_020532	AT	3	6	185034	185039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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