MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020532	TTG	2	6	99196	99201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2502	NC_020532	GTT	2	6	99311	99316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2503	NC_020532	TGT	2	6	99361	99366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2504	NC_020532	TTG	2	6	99370	99375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2505	NC_020532	T	6	6	99414	99419	0 %	100 %	0 %	0 %	470192345
2506	NC_020532	GTC	2	6	99453	99458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192345
2507	NC_020532	TGAA	2	8	99469	99476	50 %	25 %	25 %	0 %	470192345
2508	NC_020532	TTG	2	6	99534	99539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2509	NC_020532	TTG	2	6	99544	99549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2510	NC_020532	TTG	2	6	99558	99563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2511	NC_020532	ATC	2	6	99636	99641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192345
2512	NC_020532	TTG	2	6	99717	99722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192345
2513	NC_020532	GCA	2	6	99739	99744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192345
2514	NC_020532	GCA	2	6	99748	99753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192345
2515	NC_020532	CCA	2	6	99763	99768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192345
2516	NC_020532	TTTTTC	2	12	99835	99846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470192345
2517	NC_020532	TGTA	2	8	99861	99868	25 %	50 %	25 %	0 %	470192345
2518	NC_020532	TCA	2	6	99878	99883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192345
2519	NC_020532	TTAAAT	2	12	99930	99941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_020532	AAAT	2	8	99961	99968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_020532	TAA	2	6	100033	100038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_020532	T	6	6	100061	100066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_020532	A	6	6	100097	100102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_020532	GTT	2	6	100184	100189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020532	A	6	6	100212	100217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020532	ATT	2	6	100268	100273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192346
2527	NC_020532	TAA	2	6	100305	100310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192346
2528	NC_020532	TAA	2	6	100326	100331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192346
2529	NC_020532	TGC	2	6	100348	100353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192346
2530	NC_020532	TTTC	2	8	100378	100385	0 %	75 %	0 %	25 %	470192346
2531	NC_020532	TTA	2	6	100406	100411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192346
2532	NC_020532	T	6	6	100423	100428	0 %	100 %	0 %	0 %	470192346
2533	NC_020532	ATT	2	6	100431	100436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192346
2534	NC_020532	TGG	2	6	100465	100470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192346
2535	NC_020532	AAG	2	6	100491	100496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192346
2536	NC_020532	ATA	2	6	100522	100527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192346
2537	NC_020532	T	6	6	100566	100571	0 %	100 %	0 %	0 %	470192346
2538	NC_020532	ATA	2	6	100573	100578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192346
2539	NC_020532	CAT	2	6	100599	100604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192346
2540	NC_020532	ATC	2	6	100636	100641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192346
2541	NC_020532	TC	3	6	100715	100720	0 %	50 %	0 %	50 %	470192346
2542	NC_020532	GTT	2	6	100721	100726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192346
2543	NC_020532	TCA	2	6	100756	100761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192346
2544	NC_020532	AT	3	6	100783	100788	50 %	50 %	0 %	0 %	470192346
2545	NC_020532	TCT	2	6	100856	100861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192346
2546	NC_020532	GT	3	6	100871	100876	0 %	50 %	50 %	0 %	470192346
2547	NC_020532	TGA	2	6	100885	100890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192346
2548	NC_020532	AATA	2	8	100891	100898	75 %	25 %	0 %	0 %	470192346
2549	NC_020532	T	6	6	100947	100952	0 %	100 %	0 %	0 %	470192346
2550	NC_020532	AT	3	6	100966	100971	50 %	50 %	0 %	0 %	470192346
2551	NC_020532	TTA	2	6	101008	101013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192346
2552	NC_020532	ATA	2	6	101067	101072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020532	AAT	2	6	101078	101083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020532	ATA	2	6	101103	101108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020532	TTA	2	6	101117	101122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020532	GAA	2	6	101200	101205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020532	ATTG	2	8	101207	101214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_020532	TA	3	6	101245	101250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_020532	TAACAA	2	12	101287	101298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2560	NC_020532	A	7	7	101312	101318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_020532	GTTA	2	8	101329	101336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_020532	TAA	2	6	101379	101384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_020532	TAA	3	9	101408	101416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192347
2564	NC_020532	GAA	2	6	101423	101428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192347
2565	NC_020532	AGC	2	6	101441	101446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192347
2566	NC_020532	AATA	2	8	101447	101454	75 %	25 %	0 %	0 %	470192347
2567	NC_020532	CTG	2	6	101458	101463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192347
2568	NC_020532	CTT	2	6	101467	101472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192347
2569	NC_020532	AAT	2	6	101528	101533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192347
2570	NC_020532	GTG	2	6	101590	101595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192347
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2572	NC_020532	TAG	2	6	101653	101658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192347
2573	NC_020532	TAAGCC	2	12	101696	101707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192347
2574	NC_020532	TCA	2	6	101721	101726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192347
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2576	NC_020532	GCA	2	6	101859	101864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192347
2577	NC_020532	AAC	2	6	101910	101915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192347
2578	NC_020532	GAT	2	6	101933	101938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192347
2579	NC_020532	ATC	2	6	101988	101993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192347
2580	NC_020532	ACA	2	6	102069	102074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192347
2581	NC_020532	CAC	2	6	102088	102093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192347
2582	NC_020532	ATA	2	6	102105	102110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192347
2583	NC_020532	T	6	6	102129	102134	0 %	100 %	0 %	0 %	470192347
2584	NC_020532	ATC	2	6	102300	102305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192347
2585	NC_020532	AGATG	2	10	102346	102355	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_020532	T	6	6	102365	102370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_020532	ATA	2	6	102410	102415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
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2590	NC_020532	TGG	2	6	102562	102567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192348
2591	NC_020532	TAA	2	6	102568	102573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
2592	NC_020532	TGA	2	6	102654	102659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192348
2593	NC_020532	ATA	2	6	102662	102667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
2594	NC_020532	ATC	2	6	102668	102673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192348
2595	NC_020532	GTC	2	6	102715	102720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192348
2596	NC_020532	TCA	2	6	102726	102731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192348
2597	NC_020532	TG	3	6	102741	102746	0 %	50 %	50 %	0 %	470192348
2598	NC_020532	AAT	2	6	102790	102795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
2599	NC_020532	ATA	2	6	102846	102851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
2600	NC_020532	ATA	2	6	102875	102880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192348
2601	NC_020532	ATCGCA	2	12	102911	102922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470192348
2602	NC_020532	GGTGA	2	10	102942	102951	20 %	20 %	60 %	0 %	470192348
2603	NC_020532	CAA	2	6	102981	102986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192348
2604	NC_020532	AAC	2	6	102997	103002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192348
2605	NC_020532	A	6	6	103078	103083	100 %	0 %	0 %	0 %	470192348
2606	NC_020532	CAA	2	6	103150	103155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192348
2607	NC_020532	GCA	2	6	103172	103177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192348
2608	NC_020532	ACA	2	6	103223	103228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192348
2609	NC_020532	CTA	2	6	103323	103328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192348
2610	NC_020532	ATT	2	6	103395	103400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192349
2611	NC_020532	ATC	2	6	103498	103503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192349
2612	NC_020532	GTT	2	6	103513	103518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192349
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2616	NC_020532	ATA	2	6	103673	103678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192349
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2619	NC_020532	AAC	2	6	103795	103800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192349
2620	NC_020532	ATC	2	6	103867	103872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192349
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2622	NC_020532	TTTC	2	8	103902	103909	0 %	75 %	0 %	25 %	470192349
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2624	NC_020532	T	6	6	104114	104119	0 %	100 %	0 %	0 %	470192349
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2747	NC_020532	CA	3	6	109583	109588	50 %	0 %	0 %	50 %	470192353
2748	NC_020532	A	6	6	109614	109619	100 %	0 %	0 %	0 %	470192353
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2995	NC_020532	ATG	2	6	120635	120640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192363
2996	NC_020532	TAT	2	6	120677	120682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192363
2997	NC_020532	ATACG	2	10	120687	120696	40 %	20 %	20 %	20 %	470192363
2998	NC_020532	TAA	2	6	120704	120709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192363
2999	NC_020532	TAG	2	6	120800	120805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192363
3000	NC_020532	TATG	2	8	120818	120825	25 %	50 %	25 %	0 %	470192363

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