MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020532	CATA	2	8	60961	60968	50 %	25 %	0 %	25 %	470192319
1502	NC_020532	AAT	2	6	61063	61068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192319
1503	NC_020532	TTA	2	6	61070	61075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192319
1504	NC_020532	A	6	6	61081	61086	100 %	0 %	0 %	0 %	470192319
1505	NC_020532	TTTG	2	8	61088	61095	0 %	75 %	25 %	0 %	470192319
1506	NC_020532	TG	3	6	61143	61148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020532	ATC	2	6	61150	61155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192320
1508	NC_020532	CTT	2	6	61189	61194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192320
1509	NC_020532	AG	3	6	61293	61298	50 %	0 %	50 %	0 %	470192320
1510	NC_020532	AATT	2	8	61324	61331	50 %	50 %	0 %	0 %	470192320
1511	NC_020532	TTG	2	6	61411	61416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192320
1512	NC_020532	TAA	2	6	61441	61446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192320
1513	NC_020532	TTTG	2	8	61459	61466	0 %	75 %	25 %	0 %	470192320
1514	NC_020532	AT	3	6	61480	61485	50 %	50 %	0 %	0 %	470192320
1515	NC_020532	AATGT	2	10	61489	61498	40 %	40 %	20 %	0 %	470192320
1516	NC_020532	ATTA	2	8	61505	61512	50 %	50 %	0 %	0 %	470192320
1517	NC_020532	AGC	2	6	61598	61603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192320
1518	NC_020532	TTA	2	6	61636	61641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192320
1519	NC_020532	ATG	2	6	61645	61650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192320
1520	NC_020532	ATA	3	9	61723	61731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192320
1521	NC_020532	TTA	3	9	61752	61760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192320
1522	NC_020532	ATA	2	6	61778	61783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192320
1523	NC_020532	CAA	2	6	61846	61851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192320
1524	NC_020532	TTC	2	6	61877	61882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192320
1525	NC_020532	TAGT	2	8	61891	61898	25 %	50 %	25 %	0 %	470192320
1526	NC_020532	GT	3	6	61897	61902	0 %	50 %	50 %	0 %	470192320
1527	NC_020532	GAG	2	6	61927	61932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192320
1528	NC_020532	TAA	2	6	61966	61971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192320
1529	NC_020532	CTT	2	6	61994	61999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192320
1530	NC_020532	TA	3	6	62000	62005	50 %	50 %	0 %	0 %	470192320
1531	NC_020532	CTT	2	6	62014	62019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192320
1532	NC_020532	TAT	2	6	62086	62091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192320
1533	NC_020532	ATT	2	6	62117	62122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192320
1534	NC_020532	CCT	2	6	62163	62168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470192320
1535	NC_020532	AT	5	10	62247	62256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020532	TA	3	6	62313	62318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020532	ATG	2	6	62353	62358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020532	CATTT	2	10	62393	62402	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_020532	GATT	2	8	62452	62459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020532	ATT	2	6	62461	62466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020532	GAA	2	6	62494	62499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020532	ATG	2	6	62579	62584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020532	TTA	2	6	62618	62623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020532	TAGA	2	8	62639	62646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020532	T	6	6	62704	62709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020532	GTT	2	6	62713	62718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020532	ATT	2	6	62737	62742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020532	GCA	2	6	62782	62787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020532	TAA	2	6	62889	62894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020532	AAT	2	6	62912	62917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020532	CAT	2	6	62927	62932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_020532	A	6	6	62968	62973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020532	GAG	2	6	62982	62987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020532	ATA	2	6	62988	62993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020532	TGG	2	6	63011	63016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020532	TTCA	2	8	63031	63038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_020532	AT	3	6	63039	63044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020532	AT	3	6	63048	63053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020532	AGT	2	6	63078	63083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020532	CTT	2	6	63147	63152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_020532	TTA	2	6	63160	63165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020532	ATAA	2	8	63237	63244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020532	ATAA	2	8	63247	63254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020532	A	6	6	63271	63276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020532	ATA	2	6	63333	63338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020532	TTA	2	6	63352	63357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020532	ATCA	2	8	63372	63379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_020532	T	6	6	63392	63397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020532	AAT	2	6	63414	63419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020532	TAA	2	6	63463	63468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020532	ACAAAT	2	12	63547	63558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470192321
1572	NC_020532	T	6	6	63558	63563	0 %	100 %	0 %	0 %	470192321
1573	NC_020532	ATG	2	6	63584	63589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192321
1574	NC_020532	AATTAA	2	12	63638	63649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1575	NC_020532	TA	3	6	63661	63666	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1576	NC_020532	A	6	6	63670	63675	100 %	0 %	0 %	0 %	470192321
1577	NC_020532	A	6	6	63679	63684	100 %	0 %	0 %	0 %	470192321
1578	NC_020532	ATT	2	6	63699	63704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192321
1579	NC_020532	GAA	2	6	63730	63735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192321
1580	NC_020532	ATTT	2	8	63743	63750	25 %	75 %	0 %	0 %	470192321
1581	NC_020532	TCA	2	6	63762	63767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192321
1582	NC_020532	ATT	2	6	63780	63785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192321
1583	NC_020532	AGA	2	6	63792	63797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192321
1584	NC_020532	TAC	2	6	63798	63803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192321
1585	NC_020532	TA	3	6	63818	63823	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1586	NC_020532	ATAA	2	8	63853	63860	75 %	25 %	0 %	0 %	470192321
1587	NC_020532	TGAT	2	8	63863	63870	25 %	50 %	25 %	0 %	470192321
1588	NC_020532	TAA	2	6	63924	63929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1589	NC_020532	T	7	7	63939	63945	0 %	100 %	0 %	0 %	470192321
1590	NC_020532	CAA	2	6	63946	63951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192321
1591	NC_020532	TA	3	6	64018	64023	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1592	NC_020532	AGC	2	6	64112	64117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192321
1593	NC_020532	TAT	2	6	64161	64166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192321
1594	NC_020532	A	6	6	64178	64183	100 %	0 %	0 %	0 %	470192321
1595	NC_020532	A	7	7	64254	64260	100 %	0 %	0 %	0 %	470192321
1596	NC_020532	TTC	2	6	64269	64274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192321
1597	NC_020532	AT	3	6	64286	64291	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1598	NC_020532	AT	3	6	64298	64303	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1599	NC_020532	GAT	2	6	64342	64347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192321
1600	NC_020532	AT	5	10	64361	64370	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1601	NC_020532	ATA	2	6	64385	64390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1602	NC_020532	TTA	2	6	64453	64458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192321
1603	NC_020532	ATG	2	6	64481	64486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192321
1604	NC_020532	GATA	2	8	64500	64507	50 %	25 %	25 %	0 %	470192321
1605	NC_020532	ATA	2	6	64523	64528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1606	NC_020532	CTA	2	6	64531	64536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192321
1607	NC_020532	TAC	2	6	64544	64549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192321
1608	NC_020532	GAAA	2	8	64574	64581	75 %	0 %	25 %	0 %	470192321
1609	NC_020532	TATT	2	8	64582	64589	25 %	75 %	0 %	0 %	470192321
1610	NC_020532	T	6	6	64624	64629	0 %	100 %	0 %	0 %	470192321
1611	NC_020532	AC	3	6	64673	64678	50 %	0 %	0 %	50 %	470192321
1612	NC_020532	GAA	2	6	64711	64716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192321
1613	NC_020532	AT	3	6	64719	64724	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1614	NC_020532	TAG	2	6	64733	64738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192321
1615	NC_020532	AGA	2	6	64749	64754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192321
1616	NC_020532	A	6	6	64771	64776	100 %	0 %	0 %	0 %	470192321
1617	NC_020532	AATA	2	8	64788	64795	75 %	25 %	0 %	0 %	470192321
1618	NC_020532	ATA	2	6	64921	64926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1619	NC_020532	GAA	2	6	64966	64971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192321
1620	NC_020532	AT	3	6	65003	65008	50 %	50 %	0 %	0 %	470192321
1621	NC_020532	TAGTA	2	10	65037	65046	40 %	40 %	20 %	0 %	470192321
1622	NC_020532	ATC	2	6	65061	65066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192321
1623	NC_020532	ATA	2	6	65072	65077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1624	NC_020532	TAA	2	6	65111	65116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192321
1625	NC_020532	TAG	2	6	65168	65173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192321
1626	NC_020532	TC	3	6	65179	65184	0 %	50 %	0 %	50 %	470192321
1627	NC_020532	ATT	2	6	65212	65217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192321
1628	NC_020532	TTTTA	2	10	65253	65262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020532	CA	3	6	65293	65298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_020532	AACA	2	8	65299	65306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_020532	AGG	2	6	65308	65313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020532	TCC	2	6	65324	65329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_020532	TTA	2	6	65336	65341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020532	ATTG	2	8	65416	65423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020532	TG	3	6	65422	65427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020532	TCA	2	6	65429	65434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_020532	CTTG	2	8	65576	65583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1638	NC_020532	TG	3	6	65582	65587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_020532	ATTT	2	8	65735	65742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1640	NC_020532	CGT	2	6	65743	65748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1642	NC_020532	CTA	2	6	65792	65797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1643	NC_020532	A	6	6	65822	65827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1644	NC_020532	ACT	2	6	65857	65862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1647	NC_020532	TCT	2	6	66027	66032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1648	NC_020532	ATTTAT	2	12	66057	66068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1649	NC_020532	AT	4	8	66073	66080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1651	NC_020532	CATA	2	8	66123	66130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1652	NC_020532	TTG	2	6	66132	66137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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