MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020532	ATTG	2	8	249614	249621	25 %	50 %	25 %	0 %	470192458
6002	NC_020532	AATT	2	8	249661	249668	50 %	50 %	0 %	0 %	470192458
6003	NC_020532	AAT	2	6	249682	249687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192458
6004	NC_020532	CTT	2	6	249807	249812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192458
6005	NC_020532	TTTA	2	8	249961	249968	25 %	75 %	0 %	0 %	470192458
6006	NC_020532	CCA	2	6	249992	249997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192458
6007	NC_020532	TAAA	2	8	250094	250101	75 %	25 %	0 %	0 %	470192458
6008	NC_020532	CAT	2	6	250212	250217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192458
6009	NC_020532	TTC	2	6	250228	250233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192458
6010	NC_020532	AG	3	6	250246	250251	50 %	0 %	50 %	0 %	470192458
6011	NC_020532	ATT	2	6	250255	250260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192458
6012	NC_020532	AGC	2	6	250306	250311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192458
6013	NC_020532	TTC	2	6	250375	250380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192458
6014	NC_020532	AAT	2	6	250398	250403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192458
6015	NC_020532	TCT	2	6	250436	250441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192458
6016	NC_020532	AAC	2	6	250477	250482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192458
6017	NC_020532	GTC	2	6	250504	250509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192458
6018	NC_020532	CTT	2	6	250593	250598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192458
6019	NC_020532	TAAA	2	8	250603	250610	75 %	25 %	0 %	0 %	470192458
6020	NC_020532	TTG	2	6	250618	250623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192458
6021	NC_020532	AGT	2	6	250643	250648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192458
6022	NC_020532	TGTAA	2	10	250671	250680	40 %	40 %	20 %	0 %	470192458
6023	NC_020532	ATC	2	6	250717	250722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192458
6024	NC_020532	GTT	2	6	250724	250729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192458
6025	NC_020532	TTTAC	2	10	250736	250745	20 %	60 %	0 %	20 %	470192458
6026	NC_020532	TAA	2	6	250791	250796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192458
6027	NC_020532	TAA	2	6	250804	250809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192458
6028	NC_020532	A	6	6	250853	250858	100 %	0 %	0 %	0 %	470192458
6029	NC_020532	ATT	2	6	250873	250878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192458
6030	NC_020532	GAA	2	6	250901	250906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192458
6031	NC_020532	ATC	2	6	250957	250962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192458
6032	NC_020532	CGG	2	6	251070	251075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192458
6033	NC_020532	ATCAC	2	10	251108	251117	40 %	20 %	0 %	40 %	470192458
6034	NC_020532	TGT	2	6	251132	251137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192458
6035	NC_020532	CAAG	2	8	251161	251168	50 %	0 %	25 %	25 %	470192458
6036	NC_020532	ATAAC	2	10	251233	251242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6037	NC_020532	ATA	2	6	251280	251285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_020532	TGAAT	2	10	251344	251353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_020532	TA	3	6	251368	251373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_020532	ATTAA	2	10	251485	251494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_020532	TAT	2	6	251503	251508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_020532	ATC	2	6	251545	251550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192459
6043	NC_020532	GAA	2	6	251551	251556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192459
6044	NC_020532	AGA	2	6	251567	251572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192459
6045	NC_020532	ACA	2	6	251574	251579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192459
6046	NC_020532	TCA	2	6	251622	251627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192459
6047	NC_020532	ACAT	2	8	251656	251663	50 %	25 %	0 %	25 %	470192459
6048	NC_020532	AAG	2	6	251738	251743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192459
6049	NC_020532	AATC	2	8	251764	251771	50 %	25 %	0 %	25 %	470192459
6050	NC_020532	ATG	2	6	251788	251793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192459
6051	NC_020532	AGA	2	6	251918	251923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192459
6052	NC_020532	TAA	2	6	252008	252013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192459
6053	NC_020532	TTC	2	6	252075	252080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470192459
6054	NC_020532	TTA	2	6	252124	252129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192459
6055	NC_020532	GGC	2	6	252144	252149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470192459
6056	NC_020532	TAT	2	6	252175	252180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192459
6057	NC_020532	TAG	2	6	252247	252252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192459
6058	NC_020532	GAA	2	6	252261	252266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192459
6059	NC_020532	ATT	2	6	252282	252287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192459
6060	NC_020532	ATT	2	6	252332	252337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192459
6061	NC_020532	TGC	2	6	252344	252349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192459
6062	NC_020532	CAG	2	6	252379	252384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192459
6063	NC_020532	ATT	2	6	252422	252427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192459
6064	NC_020532	CGTG	2	8	252444	252451	0 %	25 %	50 %	25 %	470192459
6065	NC_020532	TGG	2	6	252461	252466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192459
6066	NC_020532	TTG	2	6	252487	252492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192459
6067	NC_020532	TGC	2	6	252494	252499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192459
6068	NC_020532	ATTT	2	8	252644	252651	25 %	75 %	0 %	0 %	470192459
6069	NC_020532	TG	3	6	252662	252667	0 %	50 %	50 %	0 %	470192459
6070	NC_020532	AGAA	2	8	252721	252728	75 %	0 %	25 %	0 %	470192459
6071	NC_020532	AAC	2	6	252736	252741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192459
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6073	NC_020532	AAT	3	9	252757	252765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192459
6074	NC_020532	GGAATA	2	12	252830	252841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020532	A	6	6	252854	252859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020532	TA	3	6	252895	252900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_020532	TAA	2	6	252928	252933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_020532	TCA	2	6	252949	252954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_020532	GTT	2	6	253088	253093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192460
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6081	NC_020532	TAA	2	6	253215	253220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192460
6082	NC_020532	ATTA	2	8	253273	253280	50 %	50 %	0 %	0 %	470192460
6083	NC_020532	ATC	2	6	253282	253287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192460
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6091	NC_020532	TTTG	2	8	253611	253618	0 %	75 %	25 %	0 %	470192460
6092	NC_020532	AT	3	6	253637	253642	50 %	50 %	0 %	0 %	470192460
6093	NC_020532	ATGAT	2	10	253721	253730	40 %	40 %	20 %	0 %	470192460
6094	NC_020532	T	7	7	253758	253764	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
6095	NC_020532	AAG	2	6	253788	253793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192460
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6104	NC_020532	T	7	7	254211	254217	0 %	100 %	0 %	0 %	470192460
6105	NC_020532	TGA	2	6	254324	254329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192460
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6107	NC_020532	GCA	2	6	254390	254395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192460
6108	NC_020532	CTG	2	6	254514	254519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192460
6109	NC_020532	TTCAT	2	10	254546	254555	20 %	60 %	0 %	20 %	470192460
6110	NC_020532	CT	3	6	254561	254566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_020532	CAA	2	6	254588	254593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_020532	TGT	2	6	254629	254634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_020532	ATT	2	6	254647	254652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_020532	AATT	2	8	254660	254667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_020532	GTA	2	6	254668	254673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_020532	AAAT	2	8	254688	254695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_020532	AT	3	6	254740	254745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_020532	CTG	2	6	254763	254768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_020532	TAC	2	6	254772	254777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_020532	TGC	2	6	254802	254807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_020532	AAT	2	6	254987	254992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_020532	TAT	2	6	255062	255067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_020532	TGT	2	6	255152	255157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_020532	GAC	2	6	255163	255168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_020532	AAAT	2	8	255170	255177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_020532	ATC	2	6	255189	255194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6157	NC_020532	TTG	2	6	256815	256820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6237	NC_020532	AAC	2	6	260315	260320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6238	NC_020532	AT	3	6	260334	260339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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