MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020532	TTTA	2	8	205623	205630	25 %	75 %	0 %	0 %	470192427
5003	NC_020532	ATT	2	6	205664	205669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
5004	NC_020532	TA	3	6	205696	205701	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
5005	NC_020532	GA	3	6	205712	205717	50 %	0 %	50 %	0 %	470192427
5006	NC_020532	AT	3	6	205737	205742	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
5007	NC_020532	A	6	6	205757	205762	100 %	0 %	0 %	0 %	470192427
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5009	NC_020532	TTG	2	6	205782	205787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192427
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5011	NC_020532	CAA	2	6	205870	205875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192427
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5013	NC_020532	A	7	7	205925	205931	100 %	0 %	0 %	0 %	470192427
5014	NC_020532	ATG	2	6	205965	205970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192427
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5018	NC_020532	TAA	2	6	206059	206064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192427
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5021	NC_020532	TA	3	6	206157	206162	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
5022	NC_020532	AT	3	6	206200	206205	50 %	50 %	0 %	0 %	470192427
5023	NC_020532	ATT	2	6	206214	206219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
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5051	NC_020532	ATTTAT	2	12	207070	207081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192427
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5053	NC_020532	TTTTTA	2	12	207101	207112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020532	AT	3	6	207113	207118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020532	TAA	2	6	207125	207130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192428
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5095	NC_020532	ATT	2	6	208420	208425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020532	TA	3	6	208435	208440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020532	A	8	8	208458	208465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020532	AAT	2	6	208474	208479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020532	AAT	2	6	208491	208496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020532	CTAT	2	8	208518	208525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5102	NC_020532	CT	3	6	208604	208609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_020532	GA	3	6	208666	208671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020532	AT	3	6	208717	208722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020532	TTC	2	6	208723	208728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_020532	TAT	2	6	208740	208745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020532	GAAAA	2	10	208749	208758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020532	TAT	2	6	208765	208770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020532	ATT	2	6	208795	208800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020532	A	6	6	208818	208823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020532	ATTT	2	8	208854	208861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020532	GAAA	2	8	208877	208884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020532	AC	3	6	208927	208932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_020532	TAA	2	6	208951	208956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020532	ATAA	2	8	208960	208967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_020532	TAGT	2	8	209098	209105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020532	TAACA	2	10	209120	209129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5118	NC_020532	TTTA	2	8	209191	209198	25 %	75 %	0 %	0 %	470192430
5119	NC_020532	ATA	2	6	209256	209261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192430
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5124	NC_020532	TAA	2	6	209393	209398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192430
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5128	NC_020532	CCA	2	6	209511	209516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192430
5129	NC_020532	AAC	2	6	209571	209576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192430
5130	NC_020532	TAA	2	6	209590	209595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192430
5131	NC_020532	TCA	2	6	209598	209603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192430
5132	NC_020532	ATGA	2	8	209621	209628	50 %	25 %	25 %	0 %	470192430
5133	NC_020532	TCA	2	6	209730	209735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192430
5134	NC_020532	TAAA	2	8	209740	209747	75 %	25 %	0 %	0 %	470192430
5135	NC_020532	CGA	2	6	209800	209805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192430
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5142	NC_020532	ATA	2	6	210156	210161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192430
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5147	NC_020532	TGT	2	6	210525	210530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192430
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5150	NC_020532	TG	3	6	210590	210595	0 %	50 %	50 %	0 %	470192430
5151	NC_020532	GTA	2	6	210610	210615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192430
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5155	NC_020532	T	6	6	210708	210713	0 %	100 %	0 %	0 %	470192430
5156	NC_020532	TCA	2	6	210732	210737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192430
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5159	NC_020532	ATG	2	6	210783	210788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192430
5160	NC_020532	ATT	2	6	210858	210863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192431
5161	NC_020532	TAT	2	6	210940	210945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192431
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5163	NC_020532	A	6	6	211007	211012	100 %	0 %	0 %	0 %	470192431
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5172	NC_020532	AT	3	6	211289	211294	50 %	50 %	0 %	0 %	470192431
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5201	NC_020532	CAT	2	6	212426	212431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192432
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5373	NC_020532	ACATTT	2	12	219801	219812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470192437
5374	NC_020532	AGA	2	6	219849	219854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192437
5375	NC_020532	AGA	2	6	219917	219922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_020532	A	6	6	219936	219941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_020532	TG	3	6	219954	219959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5378	NC_020532	T	6	6	219985	219990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_020532	GTT	2	6	220056	220061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_020532	A	7	7	220088	220094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_020532	ATT	2	6	220096	220101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_020532	TAA	2	6	220196	220201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_020532	AT	3	6	220209	220214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_020532	AAC	2	6	220338	220343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192438
5385	NC_020532	TTG	2	6	220399	220404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192438
5386	NC_020532	CAA	2	6	220426	220431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192438
5387	NC_020532	GTAAA	2	10	220606	220615	60 %	20 %	20 %	0 %	470192438
5388	NC_020532	A	6	6	220617	220622	100 %	0 %	0 %	0 %	470192438
5389	NC_020532	AGC	2	6	220646	220651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192438
5390	NC_020532	TGG	2	6	220703	220708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192438
5391	NC_020532	TAC	2	6	220850	220855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192438
5392	NC_020532	TTG	2	6	220909	220914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192438
5393	NC_020532	AT	3	6	220959	220964	50 %	50 %	0 %	0 %	470192438
5394	NC_020532	CAT	2	6	221064	221069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192438
5395	NC_020532	ATA	2	6	221080	221085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192438
5396	NC_020532	A	6	6	221085	221090	100 %	0 %	0 %	0 %	470192438
5397	NC_020532	GCT	2	6	221106	221111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192438
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5399	NC_020532	GAA	2	6	221163	221168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192438
5400	NC_020532	AGT	2	6	221213	221218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192438
5401	NC_020532	GTT	2	6	221228	221233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192438
5402	NC_020532	GGAAT	2	10	221268	221277	40 %	20 %	40 %	0 %	470192438
5403	NC_020532	TGA	2	6	221308	221313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192438
5404	NC_020532	T	6	6	221358	221363	0 %	100 %	0 %	0 %	470192438
5405	NC_020532	A	6	6	221368	221373	100 %	0 %	0 %	0 %	470192438
5406	NC_020532	ATCGT	2	10	221380	221389	20 %	40 %	20 %	20 %	470192438
5407	NC_020532	TTA	2	6	221448	221453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192439
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5409	NC_020532	A	7	7	221583	221589	100 %	0 %	0 %	0 %	470192439
5410	NC_020532	A	7	7	221607	221613	100 %	0 %	0 %	0 %	470192439
5411	NC_020532	ATA	2	6	221722	221727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192439
5412	NC_020532	GCT	2	6	221754	221759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192439
5413	NC_020532	AAGC	2	8	221799	221806	50 %	0 %	25 %	25 %	470192439
5414	NC_020532	AAC	2	6	221861	221866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192439
5415	NC_020532	TAA	2	6	221879	221884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192439
5416	NC_020532	A	6	6	221883	221888	100 %	0 %	0 %	0 %	470192439
5417	NC_020532	AGA	2	6	221915	221920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192439
5418	NC_020532	TGC	2	6	221933	221938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192439
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5420	NC_020532	TCA	2	6	222068	222073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192439
5421	NC_020532	GTC	2	6	222096	222101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192439
5422	NC_020532	GCA	2	6	222153	222158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192439
5423	NC_020532	ATG	2	6	222163	222168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192439
5424	NC_020532	AAG	2	6	222187	222192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192439
5425	NC_020532	AAC	2	6	222269	222274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192439
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5427	NC_020532	TGGT	2	8	222323	222330	0 %	50 %	50 %	0 %	470192439
5428	NC_020532	ATC	2	6	222455	222460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192439
5429	NC_020532	AGCA	2	8	222487	222494	50 %	0 %	25 %	25 %	470192439
5430	NC_020532	CGA	2	6	222610	222615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192439
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5432	NC_020532	ATT	2	6	222709	222714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192440
5433	NC_020532	TAA	2	6	222745	222750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192440
5434	NC_020532	T	6	6	222773	222778	0 %	100 %	0 %	0 %	470192440
5435	NC_020532	TCA	2	6	222786	222791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192440
5436	NC_020532	TAT	2	6	222898	222903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192440
5437	NC_020532	TGG	2	6	223020	223025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192440
5438	NC_020532	TACT	2	8	223049	223056	25 %	50 %	0 %	25 %	470192440
5439	NC_020532	AC	3	6	223162	223167	50 %	0 %	0 %	50 %	470192440
5440	NC_020532	GGTT	2	8	223177	223184	0 %	50 %	50 %	0 %	470192440
5441	NC_020532	TTA	2	6	223242	223247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192440
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5444	NC_020532	GTC	2	6	223331	223336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192440
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5447	NC_020532	ATAA	2	8	223442	223449	75 %	25 %	0 %	0 %	470192440
5448	NC_020532	TTA	2	6	223466	223471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192440
5449	NC_020532	TCA	2	6	223592	223597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192440
5450	NC_020532	AGC	2	6	223609	223614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192440
5451	NC_020532	ATGG	2	8	223619	223626	25 %	25 %	50 %	0 %	470192440
5452	NC_020532	AAT	2	6	223721	223726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192440
5453	NC_020532	TTAT	2	8	223734	223741	25 %	75 %	0 %	0 %	470192440
5454	NC_020532	TAA	2	6	223747	223752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192440
5455	NC_020532	CCA	2	6	223760	223765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470192440
5456	NC_020532	GTA	2	6	223785	223790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192440
5457	NC_020532	AAC	2	6	223835	223840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192440
5458	NC_020532	ATTA	2	8	223864	223871	50 %	50 %	0 %	0 %	470192440
5459	NC_020532	TTG	2	6	223881	223886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192440
5460	NC_020532	ATTCA	2	10	223901	223910	40 %	40 %	0 %	20 %	470192440
5461	NC_020532	GAGG	2	8	223934	223941	25 %	0 %	75 %	0 %	470192440
5462	NC_020532	AGA	2	6	223957	223962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192441
5463	NC_020532	GAT	2	6	224003	224008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192441
5464	NC_020532	TCA	2	6	224014	224019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192441
5465	NC_020532	ACT	2	6	224030	224035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470192441
5466	NC_020532	AGT	2	6	224142	224147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192441
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5469	NC_020532	TA	3	6	224386	224391	50 %	50 %	0 %	0 %	470192441
5470	NC_020532	TGG	2	6	224393	224398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192441
5471	NC_020532	TGA	2	6	224459	224464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192441
5472	NC_020532	GTT	2	6	224544	224549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470192441
5473	NC_020532	AAG	2	6	224606	224611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192441
5474	NC_020532	TTA	2	6	224650	224655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192441
5475	NC_020532	AAT	2	6	224670	224675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470192441
5476	NC_020532	GCA	2	6	224688	224693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192441
5477	NC_020532	TTCTTG	2	12	224730	224741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470192441
5478	NC_020532	AAC	2	6	224765	224770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470192441
5479	NC_020532	AGG	2	6	224849	224854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5480	NC_020532	ATG	2	6	224860	224865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
5481	NC_020532	GTG	2	6	224891	224896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470192442
5482	NC_020532	AGC	2	6	224982	224987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
5483	NC_020532	ATG	2	6	225029	225034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
5484	NC_020532	ATGTG	2	10	225140	225149	20 %	40 %	40 %	0 %	470192442
5485	NC_020532	CAG	2	6	225173	225178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
5486	NC_020532	A	6	6	225185	225190	100 %	0 %	0 %	0 %	470192442
5487	NC_020532	GATA	2	8	225192	225199	50 %	25 %	25 %	0 %	470192442
5488	NC_020532	A	6	6	225217	225222	100 %	0 %	0 %	0 %	470192442
5489	NC_020532	AGC	2	6	225276	225281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
5490	NC_020532	TCG	3	9	225330	225338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470192442
5491	NC_020532	GAA	2	6	225370	225375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192442
5492	NC_020532	GGA	2	6	225385	225390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470192442
5493	NC_020532	ACGC	2	8	225409	225416	25 %	0 %	25 %	50 %	470192442
5494	NC_020532	GAT	2	6	225435	225440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
5495	NC_020532	TAAAT	2	10	225483	225492	60 %	40 %	0 %	0 %	470192442
5496	NC_020532	AGC	2	6	225494	225499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442
5497	NC_020532	ATG	2	6	225500	225505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470192442
5498	NC_020532	TTA	2	6	225569	225574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470192442
5499	NC_020532	GAA	2	6	225579	225584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470192442
5500	NC_020532	CGA	2	6	225590	225595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470192442

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