MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 plasmid pI1T1 complete sequence

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020530	AT	3	6	71	76	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020530	TA	3	6	578	583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020530	AC	3	6	1890	1895	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
4	NC_020530	GC	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	472455755
5	NC_020530	AC	3	6	2301	2306	50 %	0 %	0 %	50 %	472455755
6	NC_020530	AC	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020530	AT	3	6	3712	3717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020530	TA	3	6	3836	3841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020530	TC	3	6	5114	5119	0 %	50 %	0 %	50 %	472455757
10	NC_020530	AT	3	6	5481	5486	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
11	NC_020530	AT	3	6	5538	5543	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
12	NC_020530	AT	3	6	5783	5788	50 %	50 %	0 %	0 %	472455757
13	NC_020530	TA	3	6	6852	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020530	AT	3	6	7159	7164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020530	CT	3	6	7208	7213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020530	TA	5	10	7223	7232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020530	TA	3	6	7323	7328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020530	AC	3	6	7957	7962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020530	AG	3	6	8414	8419	50 %	0 %	50 %	0 %	472455759
20	NC_020530	TA	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	472455759
21	NC_020530	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020530	TA	3	6	8772	8777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020530	AT	3	6	8808	8813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020530	AG	3	6	9448	9453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020530	CT	3	6	9466	9471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020530	AT	5	10	9549	9558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020530	GA	3	6	9590	9595	50 %	0 %	50 %	0 %	472455760
28	NC_020530	TA	3	6	9756	9761	50 %	50 %	0 %	0 %	472455760
29	NC_020530	TA	3	6	9881	9886	50 %	50 %	0 %	0 %	472455760
30	NC_020530	AG	3	6	10443	10448	50 %	0 %	50 %	0 %	472455761
31	NC_020530	AT	3	6	10486	10491	50 %	50 %	0 %	0 %	472455761
32	NC_020530	CT	3	6	10493	10498	0 %	50 %	0 %	50 %	472455761
33	NC_020530	AT	3	6	11858	11863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020530	GA	3	6	12304	12309	50 %	0 %	50 %	0 %	472455762
35	NC_020530	TA	3	6	12625	12630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020530	TA	3	6	12880	12885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020530	CT	3	6	12997	13002	0 %	50 %	0 %	50 %	472455763
38	NC_020530	TC	3	6	13024	13029	0 %	50 %	0 %	50 %	472455763
39	NC_020530	AT	3	6	13360	13365	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
40	NC_020530	TA	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
41	NC_020530	AT	3	6	13619	13624	50 %	50 %	0 %	0 %	472455763
42	NC_020530	TA	3	6	13914	13919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020530	TA	3	6	14021	14026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020530	AT	4	8	14046	14053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020530	TA	3	6	14633	14638	50 %	50 %	0 %	0 %	472455764
46	NC_020530	AT	3	6	15646	15651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020530	AT	3	6	15967	15972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020530	TA	4	8	16236	16243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020530	AG	3	6	16987	16992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020530	TA	3	6	17253	17258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020530	TG	3	6	17512	17517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020530	TA	3	6	17581	17586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020530	AG	3	6	17655	17660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020530	TA	3	6	17725	17730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020530	GA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020530	TA	3	6	18130	18135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020530	AT	3	6	18655	18660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020530	TA	3	6	19447	19452	50 %	50 %	0 %	0 %	472455765
59	NC_020530	AT	3	6	20075	20080	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
60	NC_020530	GA	3	6	20091	20096	50 %	0 %	50 %	0 %	472455766
61	NC_020530	TA	3	6	20582	20587	50 %	50 %	0 %	0 %	472455766
62	NC_020530	TA	3	6	21436	21441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020530	TA	3	6	21504	21509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020530	GA	3	6	21734	21739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020530	TA	3	6	22267	22272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020530	AT	3	6	22491	22496	50 %	50 %	0 %	0 %	472455768
67	NC_020530	GA	3	6	23077	23082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020530	AT	3	6	23117	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020530	TA	3	6	23292	23297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020530	TC	3	6	23367	23372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020530	AG	3	6	23392	23397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020530	AT	3	6	23830	23835	50 %	50 %	0 %	0 %	472455769
73	NC_020530	TA	3	6	24337	24342	50 %	50 %	0 %	0 %	472455769
74	NC_020530	TA	3	6	24686	24691	50 %	50 %	0 %	0 %	472455770
75	NC_020530	GT	3	6	25586	25591	0 %	50 %	50 %	0 %	472455771
76	NC_020530	AT	3	6	26469	26474	50 %	50 %	0 %	0 %	472455772
77	NC_020530	TA	3	6	27078	27083	50 %	50 %	0 %	0 %	472455772
78	NC_020530	CT	3	6	27706	27711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020530	TA	3	6	29127	29132	50 %	50 %	0 %	0 %	472455774
80	NC_020530	TC	3	6	29505	29510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020530	AT	3	6	29616	29621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020530	TG	3	6	30046	30051	0 %	50 %	50 %	0 %	472455775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.