MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 4802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020529	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020529	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020529	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020529	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	470190316
5	NC_020529	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	470190316
6	NC_020529	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	470190316
7	NC_020529	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020529	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020529	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020529	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020529	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020529	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	470190317
13	NC_020529	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020529	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020529	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	470190318
16	NC_020529	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	470190319
17	NC_020529	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	470190319
18	NC_020529	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	470190319
19	NC_020529	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	470190320
20	NC_020529	AG	4	8	8312	8319	50 %	0 %	50 %	0 %	470190320
21	NC_020529	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020529	AT	3	6	10896	10901	50 %	50 %	0 %	0 %	470190322
23	NC_020529	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	470190322
24	NC_020529	TA	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	470190322
25	NC_020529	GT	3	6	12209	12214	0 %	50 %	50 %	0 %	470190322
26	NC_020529	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020529	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020529	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020529	TA	3	6	13469	13474	50 %	50 %	0 %	0 %	470190323
30	NC_020529	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020529	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020529	TA	3	6	14873	14878	50 %	50 %	0 %	0 %	470190324
33	NC_020529	AT	3	6	15191	15196	50 %	50 %	0 %	0 %	470190324
34	NC_020529	AT	3	6	16320	16325	50 %	50 %	0 %	0 %	470190325
35	NC_020529	TA	3	6	17088	17093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020529	CA	3	6	17234	17239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020529	GT	3	6	18075	18080	0 %	50 %	50 %	0 %	470190326
38	NC_020529	AT	3	6	18968	18973	50 %	50 %	0 %	0 %	470190327
39	NC_020529	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	470190327
40	NC_020529	AG	3	6	19510	19515	50 %	0 %	50 %	0 %	470190327
41	NC_020529	AT	4	8	19693	19700	50 %	50 %	0 %	0 %	470190327
42	NC_020529	AC	3	6	20720	20725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020529	TC	3	6	21800	21805	0 %	50 %	0 %	50 %	470190328
44	NC_020529	AT	3	6	22242	22247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020529	CG	3	6	22537	22542	0 %	0 %	50 %	50 %	470190329
46	NC_020529	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020529	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020529	AT	3	6	24730	24735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020529	TA	3	6	24781	24786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020529	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	470190330
51	NC_020529	TA	3	6	26093	26098	50 %	50 %	0 %	0 %	470190331
52	NC_020529	AT	3	6	27535	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	470190332
53	NC_020529	CA	3	6	28896	28901	50 %	0 %	0 %	50 %	470190333
54	NC_020529	GT	3	6	29160	29165	0 %	50 %	50 %	0 %	470190333
55	NC_020529	AG	3	6	29951	29956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020529	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	470190334
57	NC_020529	CG	3	6	31768	31773	0 %	0 %	50 %	50 %	470190335
58	NC_020529	GC	3	6	33203	33208	0 %	0 %	50 %	50 %	470190335
59	NC_020529	AT	3	6	33326	33331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020529	TA	3	6	34584	34589	50 %	50 %	0 %	0 %	470190338
61	NC_020529	AT	3	6	34706	34711	50 %	50 %	0 %	0 %	470190338
62	NC_020529	TA	4	8	35993	36000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020529	AT	3	6	36025	36030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020529	CA	3	6	36289	36294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020529	AG	3	6	36427	36432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020529	TC	3	6	36748	36753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020529	GA	3	6	38168	38173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020529	AT	3	6	38175	38180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020529	AT	3	6	38280	38285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020529	AT	3	6	40450	40455	50 %	50 %	0 %	0 %	470190340
71	NC_020529	AT	3	6	40597	40602	50 %	50 %	0 %	0 %	470190340
72	NC_020529	TA	3	6	40672	40677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020529	TA	3	6	40837	40842	50 %	50 %	0 %	0 %	470190341
74	NC_020529	AT	3	6	41355	41360	50 %	50 %	0 %	0 %	470190341
75	NC_020529	TA	4	8	41456	41463	50 %	50 %	0 %	0 %	470190341
76	NC_020529	AT	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	470190342
77	NC_020529	AC	3	6	43286	43291	50 %	0 %	0 %	50 %	470190342
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79	NC_020529	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020529	TA	3	6	44861	44866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020529	TA	3	6	44952	44957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020529	TA	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020529	TA	3	6	45089	45094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020529	AT	3	6	45310	45315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_020529	AT	3	6	46427	46432	50 %	50 %	0 %	0 %	470190345
89	NC_020529	AT	4	8	46843	46850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_020529	AC	3	6	46941	46946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020529	TA	3	6	48384	48389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020529	TA	3	6	50033	50038	50 %	50 %	0 %	0 %	470190347
94	NC_020529	AT	3	6	50372	50377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020529	TA	3	6	50964	50969	50 %	50 %	0 %	0 %	470190348
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98	NC_020529	AT	3	6	51662	51667	50 %	50 %	0 %	0 %	470190348
99	NC_020529	AT	3	6	51704	51709	50 %	50 %	0 %	0 %	470190348
100	NC_020529	AT	3	6	51713	51718	50 %	50 %	0 %	0 %	470190348
101	NC_020529	AT	3	6	51905	51910	50 %	50 %	0 %	0 %	470190348
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104	NC_020529	AT	3	6	53651	53656	50 %	50 %	0 %	0 %	470190349
105	NC_020529	TA	3	6	53786	53791	50 %	50 %	0 %	0 %	470190350
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107	NC_020529	GT	4	8	54257	54264	0 %	50 %	50 %	0 %	470190350
108	NC_020529	AT	3	6	54986	54991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020529	CT	3	6	55351	55356	0 %	50 %	0 %	50 %	470190351
110	NC_020529	TA	3	6	55584	55589	50 %	50 %	0 %	0 %	470190351
111	NC_020529	AT	3	6	56149	56154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020529	AT	3	6	56818	56823	50 %	50 %	0 %	0 %	470190352
113	NC_020529	TA	3	6	57377	57382	50 %	50 %	0 %	0 %	470190352
114	NC_020529	AT	3	6	57495	57500	50 %	50 %	0 %	0 %	470190352
115	NC_020529	TA	3	6	58764	58769	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
116	NC_020529	AT	3	6	59210	59215	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
117	NC_020529	AT	3	6	59262	59267	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
118	NC_020529	AT	3	6	59821	59826	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
119	NC_020529	AT	3	6	59952	59957	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
120	NC_020529	AT	3	6	60121	60126	50 %	50 %	0 %	0 %	470190353
121	NC_020529	TC	3	6	60346	60351	0 %	50 %	0 %	50 %	470190354
122	NC_020529	AT	3	6	60421	60426	50 %	50 %	0 %	0 %	470190354
123	NC_020529	TG	3	6	61145	61150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020529	AG	3	6	61295	61300	50 %	0 %	50 %	0 %	470190355
125	NC_020529	AT	3	6	61482	61487	50 %	50 %	0 %	0 %	470190355
126	NC_020529	GT	3	6	61899	61904	0 %	50 %	50 %	0 %	470190355
127	NC_020529	TA	3	6	62002	62007	50 %	50 %	0 %	0 %	470190355
128	NC_020529	AT	5	10	62249	62258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020529	TA	3	6	62315	62320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020529	AT	3	6	63041	63046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020529	AT	3	6	63050	63055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020529	TA	3	6	63663	63668	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
133	NC_020529	TA	3	6	63820	63825	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
134	NC_020529	TA	3	6	64020	64025	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
135	NC_020529	AT	3	6	64288	64293	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
136	NC_020529	AT	3	6	64300	64305	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
137	NC_020529	AT	5	10	64363	64372	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
138	NC_020529	AC	3	6	64675	64680	50 %	0 %	0 %	50 %	470190356
139	NC_020529	AT	3	6	64721	64726	50 %	50 %	0 %	0 %	470190356
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141	NC_020529	TC	3	6	65181	65186	0 %	50 %	0 %	50 %	470190356
142	NC_020529	CA	3	6	65295	65300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020529	TG	3	6	65424	65429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020529	TG	3	6	65584	65589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020529	AT	4	8	66075	66082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020529	AT	3	6	66612	66617	50 %	50 %	0 %	0 %	470190357
147	NC_020529	AT	3	6	66798	66803	50 %	50 %	0 %	0 %	470190357
148	NC_020529	AT	3	6	67240	67245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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