MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020529	GTTT	2	8	164410	164417	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020529	CAT	2	6	164430	164435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_020529	TCA	2	6	164516	164521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_020529	TGTA	2	8	164524	164531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020529	ATG	2	6	164543	164548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020529	TA	4	8	164639	164646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020529	TTTA	2	8	164649	164656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020529	AT	3	6	164692	164697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020529	A	7	7	164723	164729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020529	T	6	6	164771	164776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020529	AGG	2	6	164790	164795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020529	TTA	2	6	164798	164803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020529	ATT	2	6	164809	164814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190435
4014	NC_020529	TTA	2	6	164816	164821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190435
4015	NC_020529	AGA	2	6	164854	164859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190435
4016	NC_020529	GCA	2	6	164873	164878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190435
4017	NC_020529	TTATT	2	10	164944	164953	20 %	80 %	0 %	0 %	470190435
4018	NC_020529	AAG	2	6	165024	165029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190435
4019	NC_020529	GAA	2	6	165167	165172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190435
4020	NC_020529	ATGT	2	8	165201	165208	25 %	50 %	25 %	0 %	470190435
4021	NC_020529	TGA	2	6	165247	165252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190435
4022	NC_020529	CG	4	8	165266	165273	0 %	0 %	50 %	50 %	470190435
4023	NC_020529	TAA	2	6	165314	165319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190435
4024	NC_020529	ACA	2	6	165321	165326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_020529	TGA	2	6	165330	165335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020529	AT	3	6	165337	165342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020529	TA	3	6	165344	165349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020529	AGT	2	6	165406	165411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020529	GAA	2	6	165418	165423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020529	TAG	2	6	165475	165480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020529	CGT	2	6	165498	165503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020529	ATC	2	6	165550	165555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020529	TAG	2	6	165632	165637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020529	CAA	2	6	165670	165675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190436
4035	NC_020529	ACA	2	6	165678	165683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190436
4036	NC_020529	CATC	2	8	165811	165818	25 %	25 %	0 %	50 %	470190436
4037	NC_020529	ATT	2	6	165832	165837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190436
4038	NC_020529	ACA	2	6	165852	165857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190436
4039	NC_020529	CAT	2	6	165889	165894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190436
4040	NC_020529	TGC	2	6	165899	165904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190436
4041	NC_020529	ACA	2	6	165923	165928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190436
4042	NC_020529	GGATT	2	10	165932	165941	20 %	40 %	40 %	0 %	470190436
4043	NC_020529	TGA	2	6	165957	165962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190436
4044	NC_020529	AGA	2	6	165996	166001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190436
4045	NC_020529	AAC	2	6	166043	166048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190436
4046	NC_020529	GATG	2	8	166095	166102	25 %	25 %	50 %	0 %	470190436
4047	NC_020529	TAT	2	6	166185	166190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190436
4048	NC_020529	TGA	2	6	166209	166214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190436
4049	NC_020529	ATT	2	6	166264	166269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190436
4050	NC_020529	ATC	3	9	166364	166372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190436
4051	NC_020529	ATT	2	6	166388	166393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190436
4052	NC_020529	GAGT	2	8	166400	166407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020529	TCA	2	6	166434	166439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190437
4054	NC_020529	TGA	3	9	166560	166568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190437
4055	NC_020529	A	6	6	166571	166576	100 %	0 %	0 %	0 %	470190437
4056	NC_020529	TTA	2	6	166577	166582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190437
4057	NC_020529	ATC	2	6	166593	166598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190437
4058	NC_020529	AAT	2	6	166628	166633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190437
4059	NC_020529	CAT	2	6	166751	166756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190437
4060	NC_020529	TAA	2	6	166804	166809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190437
4061	NC_020529	GAT	2	6	166814	166819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190437
4062	NC_020529	CAG	2	6	166929	166934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190437
4063	NC_020529	TGA	2	6	167041	167046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190437
4064	NC_020529	TG	3	6	167069	167074	0 %	50 %	50 %	0 %	470190437
4065	NC_020529	ATGA	2	8	167159	167166	50 %	25 %	25 %	0 %	470190437
4066	NC_020529	GCAA	2	8	167169	167176	50 %	0 %	25 %	25 %	470190437
4067	NC_020529	CAT	2	6	167195	167200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190437
4068	NC_020529	ACA	2	6	167305	167310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190437
4069	NC_020529	ATG	2	6	167334	167339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190437
4070	NC_020529	TTG	2	6	167343	167348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190437
4071	NC_020529	AGG	2	6	167364	167369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470190437
4072	NC_020529	TAT	2	6	167415	167420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020529	TAT	2	6	167427	167432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020529	ATT	3	9	167458	167466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190438
4075	NC_020529	TGT	2	6	167592	167597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190438
4076	NC_020529	TTG	2	6	167602	167607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190438
4077	NC_020529	CTT	2	6	167625	167630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190438
4078	NC_020529	GGAA	2	8	167635	167642	50 %	0 %	50 %	0 %	470190438
4079	NC_020529	ACA	2	6	167654	167659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190438
4080	NC_020529	TGT	2	6	167718	167723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190438
4081	NC_020529	TTGGTA	2	12	167732	167743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470190438
4082	NC_020529	GCGATT	2	12	167752	167763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470190438
4083	NC_020529	GCT	2	6	167773	167778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190438
4084	NC_020529	T	6	6	167778	167783	0 %	100 %	0 %	0 %	470190438
4085	NC_020529	AAATTT	2	12	167850	167861	50 %	50 %	0 %	0 %	470190438
4086	NC_020529	GGT	2	6	167867	167872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190438
4087	NC_020529	AT	3	6	167885	167890	50 %	50 %	0 %	0 %	470190438
4088	NC_020529	T	6	6	168000	168005	0 %	100 %	0 %	0 %	470190438
4089	NC_020529	AGA	2	6	168036	168041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190438
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4091	NC_020529	ATT	2	6	168069	168074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190438
4092	NC_020529	TAT	2	6	168081	168086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190438
4093	NC_020529	AGA	2	6	168124	168129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190438
4094	NC_020529	GA	3	6	168143	168148	50 %	0 %	50 %	0 %	470190439
4095	NC_020529	TGA	3	9	168149	168157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190439
4096	NC_020529	TAG	2	6	168197	168202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190439
4097	NC_020529	TGA	2	6	168207	168212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190439
4098	NC_020529	TAT	2	6	168220	168225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190439
4099	NC_020529	CAA	2	6	168241	168246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190439
4100	NC_020529	GGC	2	6	168273	168278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470190439
4101	NC_020529	A	6	6	168285	168290	100 %	0 %	0 %	0 %	470190439
4102	NC_020529	ACA	2	6	168328	168333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190439
4103	NC_020529	AAT	2	6	168400	168405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190439
4104	NC_020529	ACA	2	6	168411	168416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190439
4105	NC_020529	AC	3	6	168504	168509	50 %	0 %	0 %	50 %	470190439
4106	NC_020529	GTAA	2	8	168553	168560	50 %	25 %	25 %	0 %	470190439
4107	NC_020529	AAG	2	6	168566	168571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190439
4108	NC_020529	ATT	2	6	168575	168580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190439
4109	NC_020529	ATC	2	6	168603	168608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190439
4110	NC_020529	A	6	6	168665	168670	100 %	0 %	0 %	0 %	470190439
4111	NC_020529	T	6	6	168675	168680	0 %	100 %	0 %	0 %	470190439
4112	NC_020529	ATC	2	6	168745	168750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190439
4113	NC_020529	ATG	2	6	168755	168760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190439
4114	NC_020529	ATG	2	6	168899	168904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190439
4115	NC_020529	A	6	6	168916	168921	100 %	0 %	0 %	0 %	470190439
4116	NC_020529	AG	3	6	168937	168942	50 %	0 %	50 %	0 %	470190439
4117	NC_020529	TAACT	2	10	168969	168978	40 %	40 %	0 %	20 %	470190439
4118	NC_020529	GAA	2	6	169005	169010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190439
4119	NC_020529	TATT	2	8	169021	169028	25 %	75 %	0 %	0 %	470190439
4120	NC_020529	GTC	2	6	169051	169056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190439
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4122	NC_020529	AC	3	6	169076	169081	50 %	0 %	0 %	50 %	470190439
4123	NC_020529	TTC	3	9	169117	169125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190439
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4125	NC_020529	T	6	6	169200	169205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4127	NC_020529	T	6	6	169229	169234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4374	NC_020529	TTG	2	6	179371	179376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190442
4375	NC_020529	GAT	2	6	179394	179399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190442
4376	NC_020529	GTT	2	6	179400	179405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190442
4377	NC_020529	ATT	2	6	179427	179432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190442
4378	NC_020529	TGA	4	12	179462	179473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190442
4379	NC_020529	CAA	2	6	179523	179528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190442
4380	NC_020529	CAT	2	6	179529	179534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190442
4381	NC_020529	AT	3	6	179544	179549	50 %	50 %	0 %	0 %	470190442
4382	NC_020529	AGA	2	6	179591	179596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190442
4383	NC_020529	ACT	2	6	179633	179638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190442
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4385	NC_020529	AATG	2	8	179801	179808	50 %	25 %	25 %	0 %	470190442
4386	NC_020529	AC	3	6	179914	179919	50 %	0 %	0 %	50 %	470190442
4387	NC_020529	TAA	2	6	179948	179953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190442
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4390	NC_020529	AACATT	2	12	180110	180121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470190442
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4392	NC_020529	TAAC	2	8	180160	180167	50 %	25 %	0 %	25 %	470190442
4393	NC_020529	AT	3	6	180191	180196	50 %	50 %	0 %	0 %	470190442
4394	NC_020529	TAAG	2	8	180212	180219	50 %	25 %	25 %	0 %	470190442
4395	NC_020529	GAA	2	6	180276	180281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190443
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4399	NC_020529	AAAG	2	8	180672	180679	75 %	0 %	25 %	0 %	470190443
4400	NC_020529	ATTG	2	8	180689	180696	25 %	50 %	25 %	0 %	470190443
4401	NC_020529	TATGA	2	10	180726	180735	40 %	40 %	20 %	0 %	470190443
4402	NC_020529	ATCA	2	8	180751	180758	50 %	25 %	0 %	25 %	470190443
4403	NC_020529	GTGAA	2	10	180760	180769	40 %	20 %	40 %	0 %	470190443
4404	NC_020529	ATTT	2	8	180779	180786	25 %	75 %	0 %	0 %	470190443
4405	NC_020529	A	6	6	180840	180845	100 %	0 %	0 %	0 %	470190443
4406	NC_020529	AGT	2	6	180867	180872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190443
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4408	NC_020529	ATA	2	6	181058	181063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4409	NC_020529	ACG	2	6	181071	181076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4410	NC_020529	ATCAT	2	10	181113	181122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4411	NC_020529	TAA	2	6	181129	181134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_020529	ATCA	2	8	181147	181154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4413	NC_020529	GAT	2	6	181167	181172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_020529	TTAAT	2	10	181203	181212	40 %	60 %	0 %	0 %	470190444
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4420	NC_020529	T	6	6	181416	181421	0 %	100 %	0 %	0 %	470190444
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4428	NC_020529	TAAA	2	8	181872	181879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4429	NC_020529	ATC	2	6	181910	181915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4482	NC_020529	TCAT	2	8	184430	184437	25 %	50 %	0 %	25 %	470190447
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4491	NC_020529	CTA	2	6	184758	184763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190447
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4493	NC_020529	TTAC	2	8	184781	184788	25 %	50 %	0 %	25 %	470190447
4494	NC_020529	ATT	2	6	184825	184830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190447
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4497	NC_020529	TG	3	6	184923	184928	0 %	50 %	50 %	0 %	470190447
4498	NC_020529	AATT	2	8	184963	184970	50 %	50 %	0 %	0 %	470190447
4499	NC_020529	ATC	2	6	185012	185017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190447
4500	NC_020529	CCT	2	6	185025	185030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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