MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 65891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020529	TGA	2	6	141771	141776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190416
3503	NC_020529	TGGTA	2	10	141790	141799	20 %	40 %	40 %	0 %	470190416
3504	NC_020529	CGAAC	2	10	141880	141889	40 %	0 %	20 %	40 %	470190416
3505	NC_020529	TA	3	6	141906	141911	50 %	50 %	0 %	0 %	470190416
3506	NC_020529	ATG	2	6	141923	141928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190416
3507	NC_020529	TGG	3	9	141961	141969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190416
3508	NC_020529	GATG	2	8	141976	141983	25 %	25 %	50 %	0 %	470190416
3509	NC_020529	CAT	2	6	142023	142028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190416
3510	NC_020529	ATT	2	6	142226	142231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190416
3511	NC_020529	TGA	2	6	142245	142250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190416
3512	NC_020529	CAG	2	6	142269	142274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190416
3513	NC_020529	ATC	2	6	142390	142395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190416
3514	NC_020529	AG	3	6	142421	142426	50 %	0 %	50 %	0 %	470190416
3515	NC_020529	TGG	2	6	142510	142515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470190416
3516	NC_020529	TAC	2	6	142554	142559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190416
3517	NC_020529	ATT	2	6	142603	142608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190416
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3519	NC_020529	GT	3	6	142770	142775	0 %	50 %	50 %	0 %	470190416
3520	NC_020529	GAA	3	9	142778	142786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190416
3521	NC_020529	AAG	2	6	142854	142859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190416
3522	NC_020529	CAT	2	6	142893	142898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190416
3523	NC_020529	AAT	2	6	142911	142916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190416
3524	NC_020529	ATA	2	6	142924	142929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020529	A	6	6	142960	142965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020529	TATT	2	8	143013	143020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020529	T	7	7	143054	143060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020529	TAC	2	6	143104	143109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_020529	ATT	2	6	143121	143126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020529	AAT	2	6	143155	143160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020529	TAAT	2	8	143173	143180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020529	TA	5	10	143210	143219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020529	AAT	2	6	143254	143259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190417
3534	NC_020529	AAG	2	6	143289	143294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190417
3535	NC_020529	A	7	7	143301	143307	100 %	0 %	0 %	0 %	470190417
3536	NC_020529	ATT	2	6	143321	143326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190417
3537	NC_020529	TAT	2	6	143334	143339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190417
3538	NC_020529	ATT	2	6	143345	143350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190417
3539	NC_020529	A	6	6	143649	143654	100 %	0 %	0 %	0 %	470190417
3540	NC_020529	CAG	2	6	143745	143750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190417
3541	NC_020529	TA	4	8	143818	143825	50 %	50 %	0 %	0 %	470190417
3542	NC_020529	TCT	2	6	143826	143831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190417
3543	NC_020529	GAA	2	6	143864	143869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190417
3544	NC_020529	AGAA	2	8	143877	143884	75 %	0 %	25 %	0 %	470190417
3545	NC_020529	TTCAA	2	10	143905	143914	40 %	40 %	0 %	20 %	470190417
3546	NC_020529	TTAA	2	8	143919	143926	50 %	50 %	0 %	0 %	470190417
3547	NC_020529	A	6	6	143947	143952	100 %	0 %	0 %	0 %	470190418
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3550	NC_020529	CAT	2	6	144034	144039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190418
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3552	NC_020529	TAA	2	6	144382	144387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190418
3553	NC_020529	ATT	3	9	144398	144406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190418
3554	NC_020529	A	7	7	144492	144498	100 %	0 %	0 %	0 %	470190418
3555	NC_020529	A	6	6	144515	144520	100 %	0 %	0 %	0 %	470190418
3556	NC_020529	GCAG	2	8	144542	144549	25 %	0 %	50 %	25 %	470190418
3557	NC_020529	TCT	2	6	144593	144598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470190418
3558	NC_020529	TTA	2	6	144601	144606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190418
3559	NC_020529	TAT	2	6	144611	144616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190418
3560	NC_020529	TGAT	2	8	144632	144639	25 %	50 %	25 %	0 %	470190419
3561	NC_020529	AT	3	6	144650	144655	50 %	50 %	0 %	0 %	470190419
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3563	NC_020529	ACA	2	6	144718	144723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190419
3564	NC_020529	ACATC	2	10	144748	144757	40 %	20 %	0 %	40 %	470190419
3565	NC_020529	TAT	2	6	144856	144861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190419
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3570	NC_020529	A	7	7	145147	145153	100 %	0 %	0 %	0 %	470190419
3571	NC_020529	ATT	2	6	145277	145282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190419
3572	NC_020529	TTA	2	6	145301	145306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190419
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3574	NC_020529	TGA	2	6	145326	145331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190419
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3579	NC_020529	CAT	2	6	145577	145582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190420
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3581	NC_020529	ATC	2	6	145608	145613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190420
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3587	NC_020529	GAT	2	6	145750	145755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190420
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3591	NC_020529	A	7	7	146033	146039	100 %	0 %	0 %	0 %	470190420
3592	NC_020529	TCA	2	6	146040	146045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470190420
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3595	NC_020529	ATGG	2	8	146102	146109	25 %	25 %	50 %	0 %	470190420
3596	NC_020529	AGA	2	6	146137	146142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190420
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3598	NC_020529	AGA	2	6	146191	146196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190420
3599	NC_020529	GATATG	2	12	146225	146236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470190420
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3602	NC_020529	TATT	2	8	146368	146375	25 %	75 %	0 %	0 %	470190420
3603	NC_020529	AATC	2	8	146377	146384	50 %	25 %	0 %	25 %	470190420
3604	NC_020529	A	6	6	146407	146412	100 %	0 %	0 %	0 %	470190420
3605	NC_020529	TAT	2	6	146428	146433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190420
3606	NC_020529	GCA	3	9	146504	146512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190420
3607	NC_020529	CA	3	6	146511	146516	50 %	0 %	0 %	50 %	470190420
3608	NC_020529	GAA	2	6	146546	146551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470190420
3609	NC_020529	ATA	3	9	146559	146567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470190420
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3611	NC_020529	GCT	2	6	146594	146599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470190420
3612	NC_020529	ATT	2	6	146696	146701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470190420
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3614	NC_020529	TTG	2	6	146736	146741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470190420
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3616	NC_020529	GCAG	2	8	146890	146897	25 %	0 %	50 %	25 %	470190420
3617	NC_020529	TAATT	2	10	146971	146980	40 %	60 %	0 %	0 %	470190420
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3619	NC_020529	GAC	2	6	147002	147007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470190420
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3621	NC_020529	A	6	6	147099	147104	100 %	0 %	0 %	0 %	470190420
3622	NC_020529	ACA	2	6	147121	147126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470190420
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3998	NC_020529	CAA	2	6	164309	164314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_020529	AAAT	2	8	164369	164376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_020529	TCCCAC	2	12	164398	164409	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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