MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti 2011

Total Repeats: 85048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020528	GGCT	2	8	149741	149748	0 %	25 %	50 %	25 %	470187081
3502	NC_020528	TCA	2	6	149775	149780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187081
3503	NC_020528	CCA	2	6	149781	149786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470187081
3504	NC_020528	CTG	2	6	149825	149830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187081
3505	NC_020528	GGGC	2	8	149887	149894	0 %	0 %	75 %	25 %	470187081
3506	NC_020528	GCT	2	6	149914	149919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187081
3507	NC_020528	CTG	2	6	149969	149974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187081
3508	NC_020528	GGC	2	6	149980	149985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187081
3509	NC_020528	CG	3	6	150064	150069	0 %	0 %	50 %	50 %	470187081
3510	NC_020528	CGT	2	6	150100	150105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187081
3511	NC_020528	ATG	2	6	150110	150115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187081
3512	NC_020528	ATG	2	6	150137	150142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187081
3513	NC_020528	TCG	2	6	150207	150212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187081
3514	NC_020528	CAT	2	6	150253	150258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187081
3515	NC_020528	CGC	2	6	150262	150267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187081
3516	NC_020528	GCG	2	6	150294	150299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187081
3517	NC_020528	TCA	2	6	150345	150350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187081
3518	NC_020528	CCGG	2	8	150397	150404	0 %	0 %	50 %	50 %	470187081
3519	NC_020528	CG	3	6	150411	150416	0 %	0 %	50 %	50 %	470187081
3520	NC_020528	GC	3	6	150436	150441	0 %	0 %	50 %	50 %	470187081
3521	NC_020528	GCC	2	6	150443	150448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187081
3522	NC_020528	TTC	2	6	150483	150488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187082
3523	NC_020528	TCG	2	6	150496	150501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187082
3524	NC_020528	CGA	2	6	150514	150519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187082
3525	NC_020528	GC	3	6	150572	150577	0 %	0 %	50 %	50 %	470187082
3526	NC_020528	GCC	2	6	150627	150632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187082
3527	NC_020528	GCG	2	6	150636	150641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187082
3528	NC_020528	TGGG	2	8	150663	150670	0 %	25 %	75 %	0 %	470187082
3529	NC_020528	GCG	2	6	150678	150683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187082
3530	NC_020528	TCG	2	6	150778	150783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187082
3531	NC_020528	GGC	2	6	150825	150830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187082
3532	NC_020528	GC	3	6	150853	150858	0 %	0 %	50 %	50 %	470187082
3533	NC_020528	CCT	2	6	150932	150937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187082
3534	NC_020528	TGG	2	6	150990	150995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187082
3535	NC_020528	GC	3	6	151028	151033	0 %	0 %	50 %	50 %	470187082
3536	NC_020528	CCG	2	6	151063	151068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187082
3537	NC_020528	CG	3	6	151095	151100	0 %	0 %	50 %	50 %	470187082
3538	NC_020528	CTG	2	6	151106	151111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187082
3539	NC_020528	CGG	2	6	151159	151164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187082
3540	NC_020528	CGG	2	6	151183	151188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187082
3541	NC_020528	TGCC	2	8	151253	151260	0 %	25 %	25 %	50 %	470187082
3542	NC_020528	CCG	2	6	151407	151412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187082
3543	NC_020528	GGCG	2	8	151415	151422	0 %	0 %	75 %	25 %	470187082
3544	NC_020528	ATGC	2	8	151448	151455	25 %	25 %	25 %	25 %	470187082
3545	NC_020528	GCC	2	6	151596	151601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187083
3546	NC_020528	GAC	2	6	151679	151684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187083
3547	NC_020528	GGCC	2	8	151706	151713	0 %	0 %	50 %	50 %	470187083
3548	NC_020528	GGT	2	6	151736	151741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187083
3549	NC_020528	GCCC	2	8	151762	151769	0 %	0 %	25 %	75 %	470187083
3550	NC_020528	GCG	2	6	151771	151776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187083
3551	NC_020528	GCC	2	6	151780	151785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187083
3552	NC_020528	ATCT	2	8	151821	151828	25 %	50 %	0 %	25 %	470187083
3553	NC_020528	CGA	2	6	151832	151837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187083
3554	NC_020528	CTG	2	6	151872	151877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187083
3555	NC_020528	GCG	2	6	151916	151921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187084
3556	NC_020528	CT	3	6	151990	151995	0 %	50 %	0 %	50 %	470187084
3557	NC_020528	AGC	2	6	152057	152062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187084
3558	NC_020528	ATT	2	6	152139	152144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470187084
3559	NC_020528	CCG	2	6	152229	152234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187084
3560	NC_020528	GCC	2	6	152254	152259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187084
3561	NC_020528	TCG	2	6	152340	152345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187084
3562	NC_020528	GGA	2	6	152386	152391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470187084
3563	NC_020528	GCC	2	6	152393	152398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187084
3564	NC_020528	CG	4	8	152419	152426	0 %	0 %	50 %	50 %	470187084
3565	NC_020528	GCCG	2	8	152464	152471	0 %	0 %	50 %	50 %	470187084
3566	NC_020528	TTC	2	6	152546	152551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187084
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3568	NC_020528	CGT	2	6	152575	152580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187084
3569	NC_020528	CGC	2	6	152590	152595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187084
3570	NC_020528	GAA	2	6	152624	152629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187084
3571	NC_020528	CGG	2	6	152650	152655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187084
3572	NC_020528	GGC	2	6	152665	152670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187084
3573	NC_020528	GAT	2	6	152683	152688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187084
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3575	NC_020528	CGG	2	6	152763	152768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187085
3576	NC_020528	GGC	2	6	152821	152826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187085
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3579	NC_020528	TGCGG	2	10	153014	153023	0 %	20 %	60 %	20 %	470187085
3580	NC_020528	GAT	2	6	153031	153036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187085
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3583	NC_020528	CGA	2	6	153139	153144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187085
3584	NC_020528	ATC	2	6	153158	153163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187085
3585	NC_020528	GCCG	2	8	153184	153191	0 %	0 %	50 %	50 %	470187085
3586	NC_020528	CGC	2	6	153277	153282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187085
3587	NC_020528	CGGC	2	8	153447	153454	0 %	0 %	50 %	50 %	470187085
3588	NC_020528	GCG	2	6	153492	153497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187085
3589	NC_020528	CGAAGC	3	18	153577	153594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187085
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3591	NC_020528	TCGGC	2	10	153655	153664	0 %	20 %	40 %	40 %	470187085
3592	NC_020528	TGCCG	2	10	153724	153733	0 %	20 %	40 %	40 %	470187085
3593	NC_020528	CG	3	6	153768	153773	0 %	0 %	50 %	50 %	470187085
3594	NC_020528	CGG	3	9	153799	153807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187085
3595	NC_020528	GATC	2	8	153829	153836	25 %	25 %	25 %	25 %	470187085
3596	NC_020528	TGC	2	6	153910	153915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187085
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3598	NC_020528	TCGA	2	8	154207	154214	25 %	25 %	25 %	25 %	470187086
3599	NC_020528	GCAG	2	8	154280	154287	25 %	0 %	50 %	25 %	470187086
3600	NC_020528	CGA	3	9	154370	154378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187086
3601	NC_020528	CGTT	2	8	154387	154394	0 %	50 %	25 %	25 %	470187086
3602	NC_020528	TGT	2	6	154397	154402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470187086
3603	NC_020528	GAA	2	6	154413	154418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187086
3604	NC_020528	CG	3	6	154472	154477	0 %	0 %	50 %	50 %	470187086
3605	NC_020528	GC	3	6	154522	154527	0 %	0 %	50 %	50 %	470187086
3606	NC_020528	CTT	2	6	154548	154553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187086
3607	NC_020528	GTC	2	6	154606	154611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187086
3608	NC_020528	CG	3	6	154622	154627	0 %	0 %	50 %	50 %	470187086
3609	NC_020528	AGCAG	2	10	154637	154646	40 %	0 %	40 %	20 %	470187086
3610	NC_020528	AGC	2	6	154663	154668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187086
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3612	NC_020528	CTT	2	6	154695	154700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187086
3613	NC_020528	ATG	2	6	154705	154710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187086
3614	NC_020528	TGC	2	6	154720	154725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187086
3615	NC_020528	CAGC	2	8	154885	154892	25 %	0 %	25 %	50 %	470187087
3616	NC_020528	TC	3	6	154897	154902	0 %	50 %	0 %	50 %	470187087
3617	NC_020528	GGC	2	6	154922	154927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187087
3618	NC_020528	GCGA	2	8	155007	155014	25 %	0 %	50 %	25 %	470187087
3619	NC_020528	GAA	2	6	155021	155026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470187087
3620	NC_020528	TCG	2	6	155034	155039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187087
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3622	NC_020528	ACG	2	6	155148	155153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187087
3623	NC_020528	TCG	2	6	155157	155162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187087
3624	NC_020528	CGGGC	2	10	155217	155226	0 %	0 %	60 %	40 %	470187087
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3724	NC_020528	GCG	2	6	160525	160530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3725	NC_020528	GACG	2	8	160668	160675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3726	NC_020528	AAC	2	6	160681	160686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3727	NC_020528	GAG	2	6	160698	160703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3728	NC_020528	TGA	2	6	160733	160738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187093
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3731	NC_020528	CGG	2	6	160824	160829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187093
3732	NC_020528	GCC	2	6	160919	160924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3733	NC_020528	GGC	2	6	160931	160936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3734	NC_020528	GAT	2	6	160988	160993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470187094
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3741	NC_020528	CGG	2	6	161438	161443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187094
3742	NC_020528	TCGGC	2	10	161666	161675	0 %	20 %	40 %	40 %	470187095
3743	NC_020528	GCT	2	6	161688	161693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3744	NC_020528	GCCC	2	8	161715	161722	0 %	0 %	25 %	75 %	470187095
3745	NC_020528	CGG	2	6	161729	161734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187095
3746	NC_020528	TCG	2	6	161771	161776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3747	NC_020528	TCCA	2	8	161818	161825	25 %	25 %	0 %	50 %	470187095
3748	NC_020528	GTC	2	6	161988	161993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3749	NC_020528	GCT	2	6	161994	161999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3750	NC_020528	GCCG	2	8	162000	162007	0 %	0 %	50 %	50 %	470187095
3751	NC_020528	GC	3	6	162012	162017	0 %	0 %	50 %	50 %	470187095
3752	NC_020528	CCGGCG	2	12	162044	162055	0 %	0 %	50 %	50 %	470187095
3753	NC_020528	CGAT	2	8	162158	162165	25 %	25 %	25 %	25 %	470187095
3754	NC_020528	CAG	2	6	162166	162171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187095
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3756	NC_020528	GTC	2	6	162202	162207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3757	NC_020528	GCA	2	6	162264	162269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187095
3758	NC_020528	CGGC	2	8	162360	162367	0 %	0 %	50 %	50 %	470187095
3759	NC_020528	TCA	2	6	162380	162385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187095
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3762	NC_020528	TC	3	6	162481	162486	0 %	50 %	0 %	50 %	470187096
3763	NC_020528	TCTG	2	8	162503	162510	0 %	50 %	25 %	25 %	470187096
3764	NC_020528	TCC	2	6	162559	162564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470187096
3765	NC_020528	TCG	2	6	162578	162583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187096
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3767	NC_020528	GTC	2	6	162634	162639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187096
3768	NC_020528	TCG	2	6	162671	162676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187096
3769	NC_020528	CTCG	2	8	162684	162691	0 %	25 %	25 %	50 %	470187096
3770	NC_020528	CGC	2	6	162715	162720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187096
3771	NC_020528	ATCT	2	8	162721	162728	25 %	50 %	0 %	25 %	470187096
3772	NC_020528	TCTTCG	2	12	162758	162769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470187096
3773	NC_020528	GGC	2	6	162775	162780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187096
3774	NC_020528	GAG	2	6	162781	162786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470187096
3775	NC_020528	ATC	2	6	162880	162885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187096
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3777	NC_020528	CTCGA	2	10	162925	162934	20 %	20 %	20 %	40 %	470187096
3778	NC_020528	GCG	2	6	162971	162976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187096
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3793	NC_020528	GCA	2	6	163760	163765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187096
3794	NC_020528	CAGCG	2	10	163774	163783	20 %	0 %	40 %	40 %	470187096
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3796	NC_020528	GAC	2	6	163855	163860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187096
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3798	NC_020528	GCCG	2	8	163945	163952	0 %	0 %	50 %	50 %	470187096
3799	NC_020528	GAAGC	2	10	164000	164009	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3800	NC_020528	TCG	2	6	164086	164091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187097
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3805	NC_020528	TGC	2	6	164311	164316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187097
3806	NC_020528	CG	3	6	164317	164322	0 %	0 %	50 %	50 %	470187097
3807	NC_020528	CCG	2	6	164366	164371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187097
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3817	NC_020528	CGAT	2	8	164635	164642	25 %	25 %	25 %	25 %	470187097
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3823	NC_020528	AGC	2	6	164825	164830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187098
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3829	NC_020528	GTCATC	2	12	165088	165099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470187098
3830	NC_020528	AT	3	6	165156	165161	50 %	50 %	0 %	0 %	470187098
3831	NC_020528	GCCTT	2	10	165245	165254	0 %	40 %	20 %	40 %	470187098
3832	NC_020528	GGC	2	6	165268	165273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187098
3833	NC_020528	TCG	2	6	165280	165285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187098
3834	NC_020528	CGATCT	2	12	165348	165359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470187098
3835	NC_020528	GCT	2	6	165492	165497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187098
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3844	NC_020528	CGA	2	6	165801	165806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187098
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3847	NC_020528	GC	3	6	165982	165987	0 %	0 %	50 %	50 %	470187098
3848	NC_020528	G	9	9	165989	165997	0 %	0 %	100 %	0 %	470187098
3849	NC_020528	GTG	2	6	166132	166137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470187099
3850	NC_020528	CG	3	6	166138	166143	0 %	0 %	50 %	50 %	470187099
3851	NC_020528	CCG	2	6	166168	166173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187099
3852	NC_020528	CCG	2	6	166198	166203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187099
3853	NC_020528	CCCG	2	8	166237	166244	0 %	0 %	25 %	75 %	470187099
3854	NC_020528	GGC	2	6	166247	166252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187099
3855	NC_020528	GCC	2	6	166256	166261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187099
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3857	NC_020528	CG	3	6	166272	166277	0 %	0 %	50 %	50 %	470187099
3858	NC_020528	ATT	2	6	166291	166296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470187099
3859	NC_020528	TCT	2	6	166315	166320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470187099
3860	NC_020528	GC	4	8	166375	166382	0 %	0 %	50 %	50 %	470187099
3861	NC_020528	ATC	2	6	166410	166415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470187099
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3863	NC_020528	CGA	2	6	166463	166468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187099
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3987	NC_020528	AGGT	2	8	171479	171486	25 %	25 %	50 %	0 %	470187103
3988	NC_020528	CGG	2	6	171489	171494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187103
3989	NC_020528	CAG	2	6	171511	171516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470187103
3990	NC_020528	CGG	2	6	171597	171602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187103
3991	NC_020528	CCG	2	6	171756	171761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470187103
3992	NC_020528	CTG	2	6	171778	171783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187103
3993	NC_020528	CGG	3	9	171894	171902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470187103
3994	NC_020528	GTC	2	6	171962	171967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470187103
3995	NC_020528	TTCC	2	8	171970	171977	0 %	50 %	0 %	50 %	470187103
3996	NC_020528	TGT	2	6	171983	171988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470187103
3997	NC_020528	CCA	2	6	172014	172019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470187103
3998	NC_020528	GCG	2	6	172127	172132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_020528	AAT	2	6	172149	172154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_020528	CGATC	2	10	172321	172330	20 %	20 %	20 %	40 %	470187104

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