MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020307	TCG	2	6	182522	182527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119721
4003	NC_020307	CCG	2	6	182593	182598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119721
4004	NC_020307	AGA	2	6	182765	182770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119721
4005	NC_020307	CA	4	8	182817	182824	50 %	0 %	0 %	50 %	452119721
4006	NC_020307	GTG	2	6	182832	182837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119721
4007	NC_020307	GCTG	2	8	182850	182857	0 %	25 %	50 %	25 %	452119721
4008	NC_020307	AT	3	6	182890	182895	50 %	50 %	0 %	0 %	452119721
4009	NC_020307	ATC	2	6	182905	182910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119721
4010	NC_020307	ACA	2	6	183024	183029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
4011	NC_020307	TGG	2	6	183040	183045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119721
4012	NC_020307	TAA	2	6	183047	183052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119721
4013	NC_020307	A	7	7	183072	183078	100 %	0 %	0 %	0 %	452119721
4014	NC_020307	ATT	2	6	183085	183090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
4015	NC_020307	ACA	2	6	183119	183124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
4016	NC_020307	AAG	2	6	183127	183132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119721
4017	NC_020307	TGAT	2	8	183160	183167	25 %	50 %	25 %	0 %	452119721
4018	NC_020307	CAC	2	6	183237	183242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119721
4019	NC_020307	TAT	2	6	183262	183267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
4020	NC_020307	TCC	2	6	183335	183340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119721
4021	NC_020307	GAT	2	6	183423	183428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119721
4022	NC_020307	ATT	2	6	183429	183434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119721
4023	NC_020307	AAC	2	6	183442	183447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119721
4024	NC_020307	TAA	2	6	183486	183491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119721
4025	NC_020307	ATTC	2	8	183505	183512	25 %	50 %	0 %	25 %	452119722
4026	NC_020307	TGC	2	6	183579	183584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
4027	NC_020307	TTG	2	6	183599	183604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119722
4028	NC_020307	AGT	2	6	183664	183669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
4029	NC_020307	TGC	3	9	183690	183698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
4030	NC_020307	T	6	6	183725	183730	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
4031	NC_020307	ATG	2	6	183869	183874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
4032	NC_020307	GCT	2	6	183946	183951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
4033	NC_020307	TA	3	6	183958	183963	50 %	50 %	0 %	0 %	452119722
4034	NC_020307	TTTA	2	8	184059	184066	25 %	75 %	0 %	0 %	452119722
4035	NC_020307	TTA	2	6	184085	184090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119722
4036	NC_020307	TGA	2	6	184236	184241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119722
4037	NC_020307	TAT	2	6	184277	184282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119722
4038	NC_020307	GCC	2	6	184306	184311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119722
4039	NC_020307	TCT	2	6	184342	184347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119722
4040	NC_020307	T	6	6	184354	184359	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
4041	NC_020307	T	6	6	184464	184469	0 %	100 %	0 %	0 %	452119722
4042	NC_020307	AAT	2	6	184542	184547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119722
4043	NC_020307	GATG	2	8	184771	184778	25 %	25 %	50 %	0 %	452119722
4044	NC_020307	GC	3	6	184791	184796	0 %	0 %	50 %	50 %	452119722
4045	NC_020307	GCT	2	6	184820	184825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119722
4046	NC_020307	TTA	2	6	184840	184845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119722
4047	NC_020307	A	6	6	184888	184893	100 %	0 %	0 %	0 %	452119722
4048	NC_020307	TATTT	2	10	184939	184948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_020307	ATA	2	6	184984	184989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119723
4050	NC_020307	ATA	2	6	184993	184998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119723
4051	NC_020307	T	7	7	185023	185029	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
4052	NC_020307	GATTT	2	10	185040	185049	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
4053	NC_020307	T	8	8	185047	185054	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
4054	NC_020307	TATTT	2	10	185088	185097	20 %	80 %	0 %	0 %	452119723
4055	NC_020307	TTA	2	6	185146	185151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119723
4056	NC_020307	ATTTT	2	10	185155	185164	20 %	80 %	0 %	0 %	452119723
4057	NC_020307	AGT	2	6	185168	185173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
4058	NC_020307	GGTT	2	8	185181	185188	0 %	50 %	50 %	0 %	452119723
4059	NC_020307	ATTTG	2	10	185276	185285	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
4060	NC_020307	TTG	2	6	185336	185341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119723
4061	NC_020307	T	7	7	185366	185372	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
4062	NC_020307	GAA	2	6	185414	185419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119723
4063	NC_020307	A	7	7	185418	185424	100 %	0 %	0 %	0 %	452119723
4064	NC_020307	ATC	2	6	185427	185432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
4065	NC_020307	GTG	2	6	185455	185460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119723
4066	NC_020307	GAG	2	6	185481	185486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119723
4067	NC_020307	ATG	2	6	185487	185492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
4068	NC_020307	T	7	7	185510	185516	0 %	100 %	0 %	0 %	452119723
4069	NC_020307	AAAT	2	8	185539	185546	75 %	25 %	0 %	0 %	452119723
4070	NC_020307	ATT	2	6	185574	185579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119723
4071	NC_020307	CAT	2	6	185676	185681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
4072	NC_020307	TA	3	6	185725	185730	50 %	50 %	0 %	0 %	452119723
4073	NC_020307	GTTAT	2	10	185763	185772	20 %	60 %	20 %	0 %	452119723
4074	NC_020307	GTC	2	6	185801	185806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119723
4075	NC_020307	TTGT	2	8	185833	185840	0 %	75 %	25 %	0 %	452119723
4076	NC_020307	AAT	2	6	185843	185848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119723
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4079	NC_020307	TCA	2	6	185927	185932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119723
4080	NC_020307	TGA	2	6	186122	186127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
4081	NC_020307	TGA	2	6	186215	186220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
4082	NC_020307	ATT	3	9	186226	186234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119723
4083	NC_020307	AGTG	2	8	186269	186276	25 %	25 %	50 %	0 %	452119723
4084	NC_020307	ATG	2	6	186283	186288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119723
4085	NC_020307	GTT	2	6	186381	186386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119723
4086	NC_020307	GCG	2	6	186389	186394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119723
4087	NC_020307	AAT	3	9	186429	186437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_020307	CGT	2	6	186594	186599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119724
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4090	NC_020307	TTA	2	6	186732	186737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119724
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4092	NC_020307	TCG	2	6	186774	186779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119724
4093	NC_020307	ATT	2	6	186862	186867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119724
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4098	NC_020307	TGG	2	6	187025	187030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119724
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4101	NC_020307	CTG	2	6	187180	187185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119724
4102	NC_020307	GGC	2	6	187189	187194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119724
4103	NC_020307	A	6	6	187294	187299	100 %	0 %	0 %	0 %	452119724
4104	NC_020307	TGG	2	6	187319	187324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119724
4105	NC_020307	TGA	2	6	187335	187340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119724
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4107	NC_020307	CCAG	2	8	187370	187377	25 %	0 %	25 %	50 %	452119724
4108	NC_020307	GC	3	6	187379	187384	0 %	0 %	50 %	50 %	452119724
4109	NC_020307	CG	3	6	187540	187545	0 %	0 %	50 %	50 %	452119724
4110	NC_020307	CGC	2	6	187596	187601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119724
4111	NC_020307	TGA	2	6	187605	187610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119724
4112	NC_020307	TGA	2	6	187764	187769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119724
4113	NC_020307	CAG	2	6	187774	187779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119724
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4117	NC_020307	AAG	2	6	187946	187951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119724
4118	NC_020307	T	8	8	188019	188026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020307	TAA	2	6	188070	188075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020307	TA	3	6	188130	188135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020307	CAT	2	6	188178	188183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4123	NC_020307	CAT	2	6	188280	188285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119725
4124	NC_020307	TGG	2	6	188290	188295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119725
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4126	NC_020307	TTG	2	6	188350	188355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119725
4127	NC_020307	TCA	2	6	188446	188451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119725
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4244	NC_020307	GC	3	6	193558	193563	0 %	0 %	50 %	50 %	452119731
4245	NC_020307	CATC	2	8	193572	193579	25 %	25 %	0 %	50 %	452119731
4246	NC_020307	TCT	2	6	193661	193666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119731
4247	NC_020307	GTG	2	6	193672	193677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119731
4248	NC_020307	TCG	2	6	193679	193684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119731
4249	NC_020307	GCC	2	6	193723	193728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119731
4250	NC_020307	GTGG	2	8	193729	193736	0 %	25 %	75 %	0 %	452119731
4251	NC_020307	AAG	2	6	193760	193765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119731
4252	NC_020307	CCAG	2	8	193803	193810	25 %	0 %	25 %	50 %	452119731
4253	NC_020307	ATC	2	6	193889	193894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119731
4254	NC_020307	CCA	2	6	194028	194033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119731
4255	NC_020307	GCAGTC	2	12	194053	194064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452119731
4256	NC_020307	TCA	2	6	194096	194101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119731
4257	NC_020307	CAT	2	6	194131	194136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119731
4258	NC_020307	ATC	2	6	194204	194209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119731
4259	NC_020307	GCAG	2	8	194426	194433	25 %	0 %	50 %	25 %	452119732
4260	NC_020307	GTT	2	6	194447	194452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119732
4261	NC_020307	GCT	2	6	194502	194507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119732
4262	NC_020307	GCG	2	6	194668	194673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119732
4263	NC_020307	CAG	2	6	194721	194726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119732
4264	NC_020307	CGCAG	2	10	194759	194768	20 %	0 %	40 %	40 %	452119732
4265	NC_020307	CCAG	2	8	194828	194835	25 %	0 %	25 %	50 %	452119732
4266	NC_020307	TCG	2	6	194875	194880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119732
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4268	NC_020307	CAG	2	6	194913	194918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119732
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4270	NC_020307	CCGCG	2	10	195176	195185	0 %	0 %	40 %	60 %	452119732
4271	NC_020307	TGGC	2	8	195249	195256	0 %	25 %	50 %	25 %	452119732
4272	NC_020307	TTG	2	6	195279	195284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119732
4273	NC_020307	ATTC	2	8	195314	195321	25 %	50 %	0 %	25 %	452119732
4274	NC_020307	CGG	2	6	195355	195360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119732
4275	NC_020307	TGCT	2	8	195437	195444	0 %	50 %	25 %	25 %	452119732
4276	NC_020307	GCC	3	9	195501	195509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119733
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4278	NC_020307	CGG	2	6	195664	195669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119733
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4281	NC_020307	GAT	2	6	195749	195754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119733
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4284	NC_020307	CAG	2	6	195926	195931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119733
4285	NC_020307	CGA	2	6	195982	195987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119733
4286	NC_020307	CTGAC	2	10	196074	196083	20 %	20 %	20 %	40 %	452119733
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4288	NC_020307	CA	3	6	196210	196215	50 %	0 %	0 %	50 %	452119733
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4292	NC_020307	GAGCC	2	10	196330	196339	20 %	0 %	40 %	40 %	452119733
4293	NC_020307	CTG	2	6	196382	196387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119733
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4295	NC_020307	CTGG	2	8	196399	196406	0 %	25 %	50 %	25 %	452119733
4296	NC_020307	TCG	2	6	196491	196496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119733
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4300	NC_020307	CAG	2	6	196676	196681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119733
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4302	NC_020307	AGCGC	2	10	196817	196826	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4303	NC_020307	CAT	2	6	196847	196852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119734
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4321	NC_020307	ATC	2	6	197681	197686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119734
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4323	NC_020307	A	8	8	197787	197794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4324	NC_020307	GAT	2	6	197805	197810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4326	NC_020307	CA	3	6	197868	197873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4327	NC_020307	GAT	2	6	197894	197899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4328	NC_020307	TGA	2	6	197902	197907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4329	NC_020307	TGG	2	6	197908	197913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4330	NC_020307	T	6	6	198009	198014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4331	NC_020307	GTCA	2	8	198039	198046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4332	NC_020307	CGG	2	6	198047	198052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4333	NC_020307	GGTT	2	8	198126	198133	0 %	50 %	50 %	0 %	452119735
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4348	NC_020307	CTG	2	6	198978	198983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119736
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4353	NC_020307	GAAC	2	8	199244	199251	50 %	0 %	25 %	25 %	452119736
4354	NC_020307	GAT	2	6	199266	199271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119736
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4360	NC_020307	GGCTTT	2	12	199440	199451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452119736
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4495	NC_020307	TTTC	2	8	205902	205909	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4496	NC_020307	CAT	2	6	205928	205933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4497	NC_020307	AG	3	6	205983	205988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_020307	CGGGT	2	10	205989	205998	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4499	NC_020307	T	6	6	206051	206056	0 %	100 %	0 %	0 %	452119740
4500	NC_020307	TCG	2	6	206074	206079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119740

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