MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020307	GCG	2	6	159384	159389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_020307	TGG	2	6	159459	159464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020307	GAC	2	6	159473	159478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_020307	CTGG	2	8	159499	159506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_020307	GGCT	2	8	159569	159576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_020307	GTCGCC	2	12	159605	159616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_020307	GGT	2	6	159682	159687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020307	GCG	2	6	159714	159719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_020307	CTG	2	6	159723	159728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_020307	A	6	6	159827	159832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020307	ACC	2	6	159854	159859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_020307	CG	3	6	159909	159914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_020307	GGA	2	6	159916	159921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020307	GCG	2	6	159927	159932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_020307	CGC	2	6	159957	159962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_020307	CTG	2	6	160022	160027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_020307	TGC	2	6	160046	160051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_020307	CG	3	6	160206	160211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_020307	GGTA	2	8	160219	160226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020307	CGT	2	6	160235	160240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_020307	CGG	2	6	160282	160287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_020307	TCG	2	6	160296	160301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_020307	TTGA	2	8	160345	160352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020307	TGGC	2	8	160410	160417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_020307	TAA	2	6	160542	160547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020307	GCG	2	6	160549	160554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_020307	A	6	6	160705	160710	100 %	0 %	0 %	0 %	452119702
3528	NC_020307	GCG	2	6	160717	160722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119702
3529	NC_020307	ATC	2	6	160794	160799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
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3532	NC_020307	GCGAT	2	10	160987	160996	20 %	20 %	40 %	20 %	452119702
3533	NC_020307	GCA	2	6	161075	161080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119702
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3535	NC_020307	GCT	2	6	161243	161248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119702
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3538	NC_020307	CAT	2	6	161477	161482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
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3540	NC_020307	GTG	2	6	161685	161690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3541	NC_020307	GCT	2	6	161693	161698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119702
3542	NC_020307	TCGG	2	8	161703	161710	0 %	25 %	50 %	25 %	452119702
3543	NC_020307	GC	3	6	161742	161747	0 %	0 %	50 %	50 %	452119702
3544	NC_020307	TGG	2	6	161810	161815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3545	NC_020307	TGG	2	6	161854	161859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119702
3546	NC_020307	ATC	2	6	161865	161870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119702
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3549	NC_020307	TTA	2	6	161977	161982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119702
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3553	NC_020307	TTG	2	6	162127	162132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119702
3554	NC_020307	TTA	2	6	162153	162158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119702
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3557	NC_020307	GTG	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119703
3558	NC_020307	GATG	2	8	162296	162303	25 %	25 %	50 %	0 %	452119703
3559	NC_020307	TGA	2	6	162304	162309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119703
3560	NC_020307	ATT	2	6	162351	162356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119703
3561	NC_020307	CAG	2	6	162387	162392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
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3564	NC_020307	CGT	2	6	162435	162440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119703
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3571	NC_020307	CG	3	6	162884	162889	0 %	0 %	50 %	50 %	452119703
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3574	NC_020307	ATCG	2	8	163044	163051	25 %	25 %	25 %	25 %	452119703
3575	NC_020307	CGCC	2	8	163231	163238	0 %	0 %	25 %	75 %	452119703
3576	NC_020307	ATTA	2	8	163245	163252	50 %	50 %	0 %	0 %	452119703
3577	NC_020307	CCG	2	6	163264	163269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119703
3578	NC_020307	GCA	2	6	163277	163282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119703
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3584	NC_020307	CTG	2	6	163487	163492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119704
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3592	NC_020307	CAG	2	6	163973	163978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119704
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3598	NC_020307	A	6	6	164168	164173	100 %	0 %	0 %	0 %	452119704
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3601	NC_020307	T	7	7	164370	164376	0 %	100 %	0 %	0 %	452119704
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3604	NC_020307	GGCT	2	8	164513	164520	0 %	25 %	50 %	25 %	452119704
3605	NC_020307	GGC	2	6	164548	164553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119704
3606	NC_020307	CG	3	6	164607	164612	0 %	0 %	50 %	50 %	452119704
3607	NC_020307	CAG	2	6	164642	164647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119704
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3609	NC_020307	GGT	2	6	164694	164699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3625	NC_020307	TTAAA	2	10	165709	165718	60 %	40 %	0 %	0 %	452119705
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3998	NC_020307	GAT	2	6	182409	182414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119721
3999	NC_020307	GAA	2	6	182445	182450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119721
4000	NC_020307	CGC	2	6	182453	182458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119721

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