MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020307	A	6	6	68529	68534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020307	ATT	2	6	68548	68553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020307	TGT	2	6	68586	68591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020307	TGA	2	6	68593	68598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020307	A	6	6	68618	68623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020307	CT	3	6	68643	68648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_020307	T	7	7	68656	68662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020307	CAG	2	6	68776	68781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1509	NC_020307	CGG	2	6	68813	68818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1510	NC_020307	GTG	2	6	68847	68852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119623
1511	NC_020307	TGAT	2	8	68885	68892	25 %	50 %	25 %	0 %	452119623
1512	NC_020307	CGG	2	6	69071	69076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1513	NC_020307	CGG	2	6	69119	69124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1514	NC_020307	CG	3	6	69168	69173	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
1515	NC_020307	GC	3	6	69190	69195	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
1516	NC_020307	GGAGCA	2	12	69201	69212	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452119623
1517	NC_020307	CTG	2	6	69223	69228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1518	NC_020307	GCG	2	6	69233	69238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1519	NC_020307	GGC	2	6	69270	69275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1520	NC_020307	AGC	2	6	69308	69313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1521	NC_020307	GTG	2	6	69319	69324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119623
1522	NC_020307	CTT	2	6	69359	69364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119623
1523	NC_020307	CAG	2	6	69409	69414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1524	NC_020307	CGG	2	6	69482	69487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1525	NC_020307	CGT	2	6	69516	69521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1526	NC_020307	GC	3	6	69562	69567	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
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1530	NC_020307	CAG	2	6	69673	69678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119623
1531	NC_020307	CGG	2	6	69735	69740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1532	NC_020307	ACA	2	6	69827	69832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119623
1533	NC_020307	GGT	2	6	69837	69842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119623
1534	NC_020307	ATG	2	6	69854	69859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119623
1535	NC_020307	GC	4	8	69862	69869	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
1536	NC_020307	ATCAGC	2	12	69902	69913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	452119623
1537	NC_020307	GGTC	2	8	69942	69949	0 %	25 %	50 %	25 %	452119623
1538	NC_020307	GC	3	6	69958	69963	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
1539	NC_020307	ATT	2	6	69976	69981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119623
1540	NC_020307	GC	3	6	70085	70090	0 %	0 %	50 %	50 %	452119623
1541	NC_020307	GCG	2	6	70094	70099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119623
1542	NC_020307	GAT	2	6	70122	70127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020307	ATC	2	6	70162	70167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020307	GTT	2	6	70235	70240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119624
1545	NC_020307	GC	3	6	70294	70299	0 %	0 %	50 %	50 %	452119624
1546	NC_020307	A	6	6	70311	70316	100 %	0 %	0 %	0 %	452119624
1547	NC_020307	GCG	2	6	70317	70322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119624
1548	NC_020307	GC	3	6	70378	70383	0 %	0 %	50 %	50 %	452119624
1549	NC_020307	AAT	2	6	70434	70439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119624
1550	NC_020307	GGC	2	6	70489	70494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119624
1551	NC_020307	GC	3	6	70531	70536	0 %	0 %	50 %	50 %	452119624
1552	NC_020307	CGC	2	6	70541	70546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119624
1553	NC_020307	GAGG	2	8	70569	70576	25 %	0 %	75 %	0 %	452119624
1554	NC_020307	CGC	2	6	70612	70617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119624
1555	NC_020307	CAT	2	6	70698	70703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119624
1556	NC_020307	ATGA	2	8	70746	70753	50 %	25 %	25 %	0 %	452119624
1557	NC_020307	AGCC	2	8	70829	70836	25 %	0 %	25 %	50 %	452119624
1558	NC_020307	TCG	2	6	70837	70842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119624
1559	NC_020307	ACC	2	6	70872	70877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119624
1560	NC_020307	CGG	2	6	70898	70903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119624
1561	NC_020307	GGC	2	6	70957	70962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_020307	CCA	2	6	71022	71027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119625
1563	NC_020307	CAC	2	6	71037	71042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119625
1564	NC_020307	CGC	2	6	71120	71125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119625
1565	NC_020307	CAG	2	6	71148	71153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119625
1566	NC_020307	GC	3	6	71165	71170	0 %	0 %	50 %	50 %	452119625
1567	NC_020307	GGC	2	6	71200	71205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119625
1568	NC_020307	GGC	2	6	71207	71212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119625
1569	NC_020307	ACC	2	6	71236	71241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119625
1570	NC_020307	GC	3	6	71306	71311	0 %	0 %	50 %	50 %	452119625
1571	NC_020307	ACG	2	6	71340	71345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119625
1572	NC_020307	CAT	2	6	71397	71402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119625
1573	NC_020307	GCC	3	9	71419	71427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119625
1574	NC_020307	C	6	6	71467	71472	0 %	0 %	0 %	100 %	452119625
1575	NC_020307	TAA	2	6	71537	71542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119625
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1577	NC_020307	GCGT	2	8	71601	71608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_020307	GCA	2	6	71699	71704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1585	NC_020307	TGG	2	6	71987	71992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119626
1586	NC_020307	GC	3	6	72026	72031	0 %	0 %	50 %	50 %	452119626
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1588	NC_020307	TGG	2	6	72081	72086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119626
1589	NC_020307	AG	3	6	72191	72196	50 %	0 %	50 %	0 %	452119626
1590	NC_020307	CGCT	2	8	72222	72229	0 %	25 %	25 %	50 %	452119626
1591	NC_020307	GCA	2	6	72337	72342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_020307	ATG	2	6	72386	72391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020307	ACG	2	6	72436	72441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_020307	CG	3	6	72440	72445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1598	NC_020307	ACC	2	6	72639	72644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119627
1599	NC_020307	CG	3	6	72706	72711	0 %	0 %	50 %	50 %	452119627
1600	NC_020307	TGC	2	6	72819	72824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119627
1601	NC_020307	GCG	2	6	72851	72856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119627
1602	NC_020307	TAT	2	6	72872	72877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119627
1603	NC_020307	CGG	2	6	72880	72885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119627
1604	NC_020307	TTA	2	6	72897	72902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119627
1605	NC_020307	CG	3	6	72991	72996	0 %	0 %	50 %	50 %	452119627
1606	NC_020307	CTG	2	6	73010	73015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119627
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1608	NC_020307	ACCA	2	8	73115	73122	50 %	0 %	0 %	50 %	452119627
1609	NC_020307	GCG	2	6	73178	73183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119627
1610	NC_020307	TGG	2	6	73233	73238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119627
1611	NC_020307	GGC	2	6	73369	73374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119627
1612	NC_020307	GCCAGC	2	12	73376	73387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	452119627
1613	NC_020307	CGC	2	6	73420	73425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_020307	GGCA	2	8	73432	73439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_020307	CGC	2	6	73443	73448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_020307	TCG	2	6	73485	73490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119628
1617	NC_020307	GTTG	2	8	73550	73557	0 %	50 %	50 %	0 %	452119628
1618	NC_020307	CCG	2	6	73624	73629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119628
1619	NC_020307	CG	3	6	73642	73647	0 %	0 %	50 %	50 %	452119628
1620	NC_020307	TTC	2	6	73698	73703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119628
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1622	NC_020307	CGG	2	6	73781	73786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119628
1623	NC_020307	GCG	2	6	73814	73819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119628
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1628	NC_020307	CTT	2	6	73927	73932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119628
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1756	NC_020307	TGC	2	6	79445	79450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119631
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