MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020307	T	6	6	44623	44628	0 %	100 %	0 %	0 %	452119598
1003	NC_020307	GTA	2	6	44651	44656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119598
1004	NC_020307	ATAAA	2	10	44657	44666	80 %	20 %	0 %	0 %	452119598
1005	NC_020307	TAT	2	6	44701	44706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020307	GCG	2	6	44719	44724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_020307	A	6	6	44768	44773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020307	GTT	2	6	44776	44781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020307	TTAT	2	8	44847	44854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020307	AT	3	6	44909	44914	50 %	50 %	0 %	0 %	452119599
1011	NC_020307	TCCA	2	8	44931	44938	25 %	25 %	0 %	50 %	452119599
1012	NC_020307	GC	3	6	44961	44966	0 %	0 %	50 %	50 %	452119599
1013	NC_020307	GCT	2	6	45099	45104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119599
1014	NC_020307	GAT	2	6	45286	45291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119599
1015	NC_020307	GGC	2	6	45456	45461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119599
1016	NC_020307	TGA	3	9	45464	45472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119599
1017	NC_020307	GCC	2	6	45485	45490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119599
1018	NC_020307	GCA	2	6	45540	45545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119599
1019	NC_020307	GC	3	6	45606	45611	0 %	0 %	50 %	50 %	452119599
1020	NC_020307	T	6	6	45657	45662	0 %	100 %	0 %	0 %	452119599
1021	NC_020307	GAA	2	6	45706	45711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119599
1022	NC_020307	GCG	2	6	45719	45724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119599
1023	NC_020307	CCAA	2	8	45742	45749	50 %	0 %	0 %	50 %	452119599
1024	NC_020307	CAT	2	6	45762	45767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119599
1025	NC_020307	CTG	2	6	45780	45785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119599
1026	NC_020307	CGC	2	6	45803	45808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119599
1027	NC_020307	TTC	2	6	45832	45837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119599
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1029	NC_020307	TGT	2	6	45860	45865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119599
1030	NC_020307	GGCGT	2	10	45919	45928	0 %	20 %	60 %	20 %	452119599
1031	NC_020307	GGC	3	9	45936	45944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119599
1032	NC_020307	CAT	2	6	46012	46017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119599
1033	NC_020307	GGGC	2	8	46041	46048	0 %	0 %	75 %	25 %	452119599
1034	NC_020307	AG	3	6	46068	46073	50 %	0 %	50 %	0 %	452119599
1035	NC_020307	CGA	2	6	46109	46114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119599
1036	NC_020307	TGC	2	6	46164	46169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119599
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1038	NC_020307	AATAC	2	10	46269	46278	60 %	20 %	0 %	20 %	452119600
1039	NC_020307	ACG	2	6	46287	46292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119600
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1041	NC_020307	CGCT	2	8	46312	46319	0 %	25 %	25 %	50 %	452119600
1042	NC_020307	GTCT	2	8	46332	46339	0 %	50 %	25 %	25 %	452119600
1043	NC_020307	CAG	3	9	46352	46360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119600
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1046	NC_020307	G	6	6	46411	46416	0 %	0 %	100 %	0 %	452119600
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1048	NC_020307	GCC	2	6	46545	46550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119600
1049	NC_020307	CAG	2	6	46562	46567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119600
1050	NC_020307	ATA	2	6	46581	46586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119600
1051	NC_020307	CGC	2	6	46596	46601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119600
1052	NC_020307	GGA	2	6	46606	46611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119600
1053	NC_020307	GCG	2	6	46625	46630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119600
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1055	NC_020307	CG	3	6	46782	46787	0 %	0 %	50 %	50 %	452119601
1056	NC_020307	GGCT	2	8	46802	46809	0 %	25 %	50 %	25 %	452119601
1057	NC_020307	GGCT	2	8	46875	46882	0 %	25 %	50 %	25 %	452119601
1058	NC_020307	GCC	2	6	47057	47062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119601
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1060	NC_020307	TG	3	6	47178	47183	0 %	50 %	50 %	0 %	452119601
1061	NC_020307	TCG	2	6	47229	47234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119601
1062	NC_020307	CTG	2	6	47290	47295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119601
1063	NC_020307	GC	3	6	47305	47310	0 %	0 %	50 %	50 %	452119601
1064	NC_020307	TGG	2	6	47317	47322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119601
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1066	NC_020307	CAGTA	2	10	47358	47367	40 %	20 %	20 %	20 %	452119601
1067	NC_020307	CGG	2	6	47393	47398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119601
1068	NC_020307	GGC	2	6	47435	47440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119601
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1070	NC_020307	GCT	2	6	47455	47460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119601
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1072	NC_020307	TTC	2	6	47542	47547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_020307	ATA	2	6	47548	47553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020307	ATT	2	6	47557	47562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020307	TCA	2	6	47609	47614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020307	CAA	2	6	47703	47708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_020307	AAT	2	6	47751	47756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_020307	TTC	2	6	48259	48264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119602
1083	NC_020307	CAA	2	6	48298	48303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119602
1084	NC_020307	AAT	2	6	48337	48342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119602
1085	NC_020307	GC	3	6	48382	48387	0 %	0 %	50 %	50 %	452119602
1086	NC_020307	ACG	3	9	48412	48420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119602
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1088	NC_020307	CAT	2	6	48487	48492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119602
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1092	NC_020307	TGC	2	6	48736	48741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119603
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1094	NC_020307	ACGCG	2	10	48878	48887	20 %	0 %	40 %	40 %	452119603
1095	NC_020307	CTG	3	9	48951	48959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119603
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1097	NC_020307	GC	3	6	49105	49110	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
1098	NC_020307	TGGC	2	8	49115	49122	0 %	25 %	50 %	25 %	452119603
1099	NC_020307	ATG	2	6	49134	49139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119603
1100	NC_020307	CTG	2	6	49140	49145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119603
1101	NC_020307	GGCT	2	8	49167	49174	0 %	25 %	50 %	25 %	452119603
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1103	NC_020307	CCTG	2	8	49247	49254	0 %	25 %	25 %	50 %	452119603
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1106	NC_020307	CG	3	6	49318	49323	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
1107	NC_020307	GC	3	6	49330	49335	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
1108	NC_020307	CTG	2	6	49449	49454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119603
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1111	NC_020307	GC	3	6	49631	49636	0 %	0 %	50 %	50 %	452119603
1112	NC_020307	CATT	2	8	49668	49675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_020307	GCC	2	6	49749	49754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_020307	GC	3	6	49826	49831	0 %	0 %	50 %	50 %	452119604
1115	NC_020307	CTG	2	6	49928	49933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119604
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1120	NC_020307	TGTC	2	8	50269	50276	0 %	50 %	25 %	25 %	452119604
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1128	NC_020307	ATA	2	6	50541	50546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119604
1129	NC_020307	GGC	2	6	50548	50553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119604
1130	NC_020307	GC	3	6	50556	50561	0 %	0 %	50 %	50 %	452119604
1131	NC_020307	TCTG	2	8	50602	50609	0 %	50 %	25 %	25 %	452119604
1132	NC_020307	GAT	2	6	50621	50626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119604
1133	NC_020307	GTGGC	2	10	50789	50798	0 %	20 %	60 %	20 %	452119604
1134	NC_020307	TTA	2	6	50875	50880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020307	ATG	2	6	50895	50900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_020307	AGTT	2	8	50934	50941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_020307	CGC	2	6	51104	51109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_020307	GCG	2	6	51112	51117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_020307	TAC	2	6	51153	51158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_020307	T	7	7	51285	51291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020307	ATA	2	6	51306	51311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1150	NC_020307	GGT	2	6	51652	51657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119605
1151	NC_020307	TAT	2	6	51710	51715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119605
1152	NC_020307	GACT	2	8	51721	51728	25 %	25 %	25 %	25 %	452119605
1153	NC_020307	CTG	2	6	51827	51832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119605
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1160	NC_020307	TTG	2	6	52348	52353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_020307	GCA	2	6	52462	52467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119606
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1168	NC_020307	CCA	2	6	52801	52806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119606
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1249	NC_020307	TGC	2	6	56507	56512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119609
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1262	NC_020307	CTG	2	6	57217	57222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119609
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1269	NC_020307	A	7	7	57667	57673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_020307	ATA	3	9	57712	57720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_020307	ATA	2	6	57742	57747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_020307	A	6	6	57794	57799	100 %	0 %	0 %	0 %	452119610
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1377	NC_020307	GC	3	6	63099	63104	0 %	0 %	50 %	50 %	452119616
1378	NC_020307	GT	3	6	63114	63119	0 %	50 %	50 %	0 %	452119616
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