MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020307	GCT	2	6	20394	20399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119578
502	NC_020307	CA	3	6	20401	20406	50 %	0 %	0 %	50 %	452119578
503	NC_020307	ATAA	2	8	20463	20470	75 %	25 %	0 %	0 %	452119578
504	NC_020307	AG	3	6	20571	20576	50 %	0 %	50 %	0 %	452119578
505	NC_020307	GCC	2	6	20673	20678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119578
506	NC_020307	CGC	2	6	20741	20746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119578
507	NC_020307	CGC	2	6	20762	20767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119578
508	NC_020307	GCC	2	6	20808	20813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119578
509	NC_020307	A	6	6	20832	20837	100 %	0 %	0 %	0 %	452119578
510	NC_020307	TAA	2	6	20846	20851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119578
511	NC_020307	CGG	2	6	20884	20889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119578
512	NC_020307	TAC	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
513	NC_020307	GGC	2	6	20940	20945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119579
514	NC_020307	CAT	2	6	20954	20959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
515	NC_020307	ACC	2	6	20960	20965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119579
516	NC_020307	TA	3	6	20984	20989	50 %	50 %	0 %	0 %	452119579
517	NC_020307	CCA	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119579
518	NC_020307	GCA	2	6	21059	21064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119579
519	NC_020307	CTGCG	2	10	21132	21141	0 %	20 %	40 %	40 %	452119579
520	NC_020307	CCA	2	6	21164	21169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119579
521	NC_020307	CGCC	2	8	21258	21265	0 %	0 %	25 %	75 %	452119579
522	NC_020307	CAT	2	6	21276	21281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
523	NC_020307	CTG	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119579
524	NC_020307	AGGA	2	8	21408	21415	50 %	0 %	50 %	0 %	452119579
525	NC_020307	CAA	2	6	21492	21497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119579
526	NC_020307	AAG	2	6	21510	21515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119579
527	NC_020307	CGG	2	6	21549	21554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119579
528	NC_020307	AGG	2	6	21579	21584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119579
529	NC_020307	T	6	6	21591	21596	0 %	100 %	0 %	0 %	452119579
530	NC_020307	GGC	2	6	21642	21647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119579
531	NC_020307	CCG	2	6	21753	21758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119579
532	NC_020307	AGCC	2	8	21789	21796	25 %	0 %	25 %	50 %	452119579
533	NC_020307	GT	3	6	21800	21805	0 %	50 %	50 %	0 %	452119579
534	NC_020307	TTC	2	6	21828	21833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119579
535	NC_020307	ATG	2	6	21838	21843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119579
536	NC_020307	CGT	2	6	21893	21898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119579
537	NC_020307	TCA	2	6	21952	21957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
538	NC_020307	GTA	2	6	21960	21965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119579
539	NC_020307	GCC	2	6	22018	22023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119579
540	NC_020307	AGT	2	6	22025	22030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119579
541	NC_020307	GCG	2	6	22103	22108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119579
542	NC_020307	TCT	2	6	22186	22191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119579
543	NC_020307	GTA	2	6	22246	22251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119579
544	NC_020307	CGG	2	6	22391	22396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119579
545	NC_020307	TCA	2	6	22441	22446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
546	NC_020307	GTAC	2	8	22483	22490	25 %	25 %	25 %	25 %	452119579
547	NC_020307	GCA	2	6	22573	22578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119579
548	NC_020307	CTTT	2	8	22648	22655	0 %	75 %	0 %	25 %	452119579
549	NC_020307	CCTGGG	2	12	22661	22672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119579
550	NC_020307	CG	3	6	22709	22714	0 %	0 %	50 %	50 %	452119579
551	NC_020307	ATC	2	6	22717	22722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119579
552	NC_020307	AAT	2	6	22777	22782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020307	CGAT	2	8	23066	23073	25 %	25 %	25 %	25 %	452119580
554	NC_020307	ATC	2	6	23134	23139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119580
555	NC_020307	CGG	2	6	23157	23162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119580
556	NC_020307	CTG	2	6	23197	23202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119580
557	NC_020307	TGC	2	6	23396	23401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119580
558	NC_020307	TGC	2	6	23420	23425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119580
559	NC_020307	CGG	2	6	23452	23457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119580
560	NC_020307	TC	3	6	23460	23465	0 %	50 %	0 %	50 %	452119580
561	NC_020307	CGA	2	6	23529	23534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119580
562	NC_020307	TGTC	2	8	23740	23747	0 %	50 %	25 %	25 %	452119580
563	NC_020307	CAG	2	6	23779	23784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119580
564	NC_020307	GAA	2	6	23789	23794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119580
565	NC_020307	AGTA	2	8	23864	23871	50 %	25 %	25 %	0 %	452119580
566	NC_020307	CGC	2	6	23904	23909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119580
567	NC_020307	TAA	2	6	23917	23922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119580
568	NC_020307	CAT	2	6	23962	23967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119580
569	NC_020307	T	6	6	24076	24081	0 %	100 %	0 %	0 %	452119580
570	NC_020307	AAG	2	6	24095	24100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119580
571	NC_020307	CTG	2	6	24151	24156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119580
572	NC_020307	GAA	2	6	24180	24185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119580
573	NC_020307	GGT	2	6	24190	24195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119580
574	NC_020307	TGT	2	6	24230	24235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119580
575	NC_020307	GTATT	2	10	24251	24260	20 %	60 %	20 %	0 %	452119580
576	NC_020307	TGC	3	9	24313	24321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119580
577	NC_020307	GT	3	6	24567	24572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020307	ATA	2	6	24628	24633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020307	GTC	2	6	24666	24671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_020307	TCA	2	6	24672	24677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020307	TGC	2	6	24694	24699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020307	TGA	2	6	24701	24706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020307	T	6	6	24749	24754	0 %	100 %	0 %	0 %	452119581
584	NC_020307	GTTC	2	8	24763	24770	0 %	50 %	25 %	25 %	452119581
585	NC_020307	CGC	2	6	24787	24792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119581
586	NC_020307	GAC	2	6	24844	24849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119581
587	NC_020307	CTG	2	6	24923	24928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119581
588	NC_020307	TGC	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119581
589	NC_020307	ACGC	2	8	25034	25041	25 %	0 %	25 %	50 %	452119581
590	NC_020307	TGG	2	6	25189	25194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119581
591	NC_020307	AT	3	6	25251	25256	50 %	50 %	0 %	0 %	452119581
592	NC_020307	TGT	2	6	25282	25287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119581
593	NC_020307	TGA	2	6	25341	25346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020307	AAT	2	6	25425	25430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020307	TTG	2	6	25467	25472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020307	GCGA	2	8	25481	25488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
597	NC_020307	T	6	6	25499	25504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020307	AAT	2	6	25599	25604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020307	ATG	2	6	25616	25621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020307	ATC	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020307	TCA	2	6	25773	25778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119582
602	NC_020307	CCA	2	6	25780	25785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
603	NC_020307	CGACC	2	10	25813	25822	20 %	0 %	20 %	60 %	452119582
604	NC_020307	CG	3	6	25857	25862	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
605	NC_020307	ATA	2	6	25883	25888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119582
606	NC_020307	CCG	2	6	25902	25907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119582
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609	NC_020307	CAT	2	6	25951	25956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119582
610	NC_020307	GCA	2	6	26007	26012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
611	NC_020307	AG	3	6	26041	26046	50 %	0 %	50 %	0 %	452119582
612	NC_020307	GC	3	6	26057	26062	0 %	0 %	50 %	50 %	452119582
613	NC_020307	CAC	2	6	26098	26103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
614	NC_020307	AGC	2	6	26111	26116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
615	NC_020307	GCC	2	6	26142	26147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119582
616	NC_020307	TCT	2	6	26159	26164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119582
617	NC_020307	CAG	2	6	26200	26205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119582
618	NC_020307	ATT	2	6	26227	26232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119582
619	NC_020307	CCA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
620	NC_020307	CCA	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119582
621	NC_020307	AAG	2	6	26285	26290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119582
622	NC_020307	CGG	2	6	26367	26372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119582
623	NC_020307	CAA	2	6	26472	26477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119583
624	NC_020307	CGG	2	6	26538	26543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
625	NC_020307	GAG	2	6	26661	26666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119583
626	NC_020307	TGA	2	6	26716	26721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119583
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628	NC_020307	GCG	2	6	26776	26781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119583
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