MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_020307	TCT	2	6	416512	416517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119967
9003	NC_020307	ATG	2	6	416596	416601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119967
9004	NC_020307	CT	3	6	416682	416687	0 %	50 %	0 %	50 %	452119967
9005	NC_020307	GC	3	6	416804	416809	0 %	0 %	50 %	50 %	452119967
9006	NC_020307	CGT	2	6	416884	416889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119967
9007	NC_020307	CTGGC	2	10	416926	416935	0 %	20 %	40 %	40 %	452119967
9008	NC_020307	TGA	2	6	416943	416948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119967
9009	NC_020307	AAGCA	2	10	416980	416989	60 %	0 %	20 %	20 %	452119967
9010	NC_020307	TGC	2	6	417020	417025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119967
9011	NC_020307	GTGC	2	8	417040	417047	0 %	25 %	50 %	25 %	452119967
9012	NC_020307	GAA	2	6	417070	417075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119967
9013	NC_020307	GAA	2	6	417079	417084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119967
9014	NC_020307	AGA	2	6	417174	417179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119967
9015	NC_020307	AC	3	6	417207	417212	50 %	0 %	0 %	50 %	452119967
9016	NC_020307	CGC	2	6	417213	417218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119967
9017	NC_020307	TTA	2	6	417271	417276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_020307	A	8	8	417287	417294	100 %	0 %	0 %	0 %	452119968
9019	NC_020307	GCT	2	6	417313	417318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119968
9020	NC_020307	T	7	7	417318	417324	0 %	100 %	0 %	0 %	452119968
9021	NC_020307	AGA	2	6	417353	417358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119968
9022	NC_020307	TGTC	2	8	417362	417369	0 %	50 %	25 %	25 %	452119968
9023	NC_020307	TTA	2	6	417384	417389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_020307	ATT	2	6	417394	417399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9026	NC_020307	ATT	2	6	417435	417440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_020307	ATT	2	6	417461	417466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_020307	CCA	2	6	417487	417492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119969
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9031	NC_020307	TCA	2	6	417655	417660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119969
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9033	NC_020307	TAC	2	6	417716	417721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_020307	CTTTT	2	10	417724	417733	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9035	NC_020307	TTAG	2	8	417734	417741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_020307	ATTG	2	8	417760	417767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_020307	GAGTG	2	10	417866	417875	20 %	20 %	60 %	0 %	452119970
9038	NC_020307	A	6	6	417876	417881	100 %	0 %	0 %	0 %	452119970
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9041	NC_020307	GTA	2	6	417912	417917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119970
9042	NC_020307	TTCC	2	8	418035	418042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_020307	GGT	2	6	418078	418083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_020307	ACG	2	6	418091	418096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119971
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9049	NC_020307	CAT	2	6	418347	418352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119971
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9051	NC_020307	TAC	2	6	418456	418461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9052	NC_020307	ATA	2	6	418478	418483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_020307	TC	4	8	418578	418585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_020307	TTGT	2	8	418600	418607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_020307	ATT	2	6	418610	418615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_020307	CTTTT	2	10	418669	418678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9057	NC_020307	TAT	2	6	418680	418685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_020307	T	6	6	418701	418706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_020307	GAA	2	6	418787	418792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_020307	CAG	2	6	418829	418834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_020307	AT	3	6	418867	418872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_020307	TTG	2	6	418884	418889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_020307	TG	3	6	419024	419029	0 %	50 %	50 %	0 %	452119972
9064	NC_020307	AAG	2	6	419042	419047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119972
9065	NC_020307	ACGTTG	2	12	419060	419071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452119972
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9070	NC_020307	T	6	6	419539	419544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9072	NC_020307	ATCA	2	8	419572	419579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_020307	AAAAG	2	10	419612	419621	80 %	0 %	20 %	0 %	452119974
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9081	NC_020307	CG	3	6	420475	420480	0 %	0 %	50 %	50 %	452119974
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9085	NC_020307	TTA	2	6	420784	420789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119974
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9097	NC_020307	TGC	2	6	421256	421261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119974
9098	NC_020307	TAA	2	6	421463	421468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119975
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9101	NC_020307	ATG	2	6	421578	421583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119975
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9104	NC_020307	TGGAC	2	10	421757	421766	20 %	20 %	40 %	20 %	452119975
9105	NC_020307	GCG	3	9	421788	421796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119975
9106	NC_020307	TG	3	6	421821	421826	0 %	50 %	50 %	0 %	452119975
9107	NC_020307	GC	3	6	421911	421916	0 %	0 %	50 %	50 %	452119975
9108	NC_020307	GTG	2	6	421917	421922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119975
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9249	NC_020307	GAA	3	9	427722	427730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119981
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9253	NC_020307	TGG	2	6	427936	427941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119981
9254	NC_020307	CGC	2	6	427973	427978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119981
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9494	NC_020307	CTGC	2	8	440315	440322	0 %	25 %	25 %	50 %	452119992
9495	NC_020307	TGA	2	6	440329	440334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119992
9496	NC_020307	GCA	2	6	440347	440352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119992
9497	NC_020307	CGT	2	6	440354	440359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119992
9498	NC_020307	GGC	2	6	440457	440462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119992
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