MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6125	NC_020307	CGG	2	6	282089	282094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119818
6126	NC_020307	GCTG	2	8	282117	282124	0 %	25 %	50 %	25 %	452119818
6127	NC_020307	GCT	2	6	282237	282242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119818
6128	NC_020307	TGG	2	6	282302	282307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119818
6129	NC_020307	TAT	2	6	282309	282314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119818
6130	NC_020307	GAT	2	6	282325	282330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119818
6131	NC_020307	CTGG	2	8	282339	282346	0 %	25 %	50 %	25 %	452119818
6132	NC_020307	AGCGT	2	10	282353	282362	20 %	20 %	40 %	20 %	452119818
6133	NC_020307	ATT	2	6	282387	282392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119818
6134	NC_020307	TTG	2	6	282428	282433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119818
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6136	NC_020307	GCA	3	9	282516	282524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119818
6137	NC_020307	TAT	2	6	282579	282584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119818
6138	NC_020307	TGG	2	6	282596	282601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119818
6139	NC_020307	AGG	2	6	282711	282716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_020307	GAT	2	6	282772	282777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119819
6141	NC_020307	ATG	2	6	282819	282824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119819
6142	NC_020307	GTC	2	6	282953	282958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6143	NC_020307	TGC	2	6	282970	282975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6144	NC_020307	TGA	2	6	283009	283014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6145	NC_020307	GCG	2	6	283122	283127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119820
6146	NC_020307	GTC	2	6	283144	283149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119820
6147	NC_020307	TGA	2	6	283205	283210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119820
6148	NC_020307	ATC	2	6	283244	283249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119820
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6153	NC_020307	GAC	2	6	283479	283484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119820
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6157	NC_020307	GCG	2	6	283727	283732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119820
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6167	NC_020307	TA	3	6	284288	284293	50 %	50 %	0 %	0 %	452119820
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6181	NC_020307	TCG	2	6	284845	284850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119821
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6184	NC_020307	CGA	2	6	284977	284982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119821
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6190	NC_020307	CTGGAG	2	12	285405	285416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452119821
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6193	NC_020307	CGG	2	6	285602	285607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6194	NC_020307	AAG	2	6	285643	285648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6195	NC_020307	GCA	2	6	285685	285690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6197	NC_020307	A	6	6	285745	285750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6198	NC_020307	A	7	7	285767	285773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6199	NC_020307	CTT	2	6	285829	285834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6200	NC_020307	T	7	7	285872	285878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6201	NC_020307	CGTC	2	8	285970	285977	0 %	25 %	25 %	50 %	452119822
6202	NC_020307	GCC	2	6	286042	286047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119822
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6216	NC_020307	T	6	6	286732	286737	0 %	100 %	0 %	0 %	452119824
6217	NC_020307	T	6	6	286802	286807	0 %	100 %	0 %	0 %	452119824
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6221	NC_020307	TTG	2	6	286900	286905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119824
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6223	NC_020307	TAA	2	6	286941	286946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119824
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6226	NC_020307	T	7	7	287019	287025	0 %	100 %	0 %	0 %	452119824
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6228	NC_020307	ATA	2	6	287084	287089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119824
6229	NC_020307	CTCA	2	8	287109	287116	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6230	NC_020307	ATC	2	6	287252	287257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6231	NC_020307	TAAAG	2	10	287259	287268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6232	NC_020307	AT	3	6	287317	287322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6233	NC_020307	T	6	6	287334	287339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6234	NC_020307	ATTT	2	8	287343	287350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6235	NC_020307	TTA	2	6	287389	287394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119825
6236	NC_020307	AGCA	2	8	287421	287428	50 %	0 %	25 %	25 %	452119825
6237	NC_020307	GCG	2	6	287549	287554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119825
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6240	NC_020307	TAC	2	6	287693	287698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119825
6241	NC_020307	CAG	2	6	287727	287732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119825
6242	NC_020307	ATA	2	6	287791	287796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119825
6243	NC_020307	CGA	2	6	287834	287839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119825
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6245	NC_020307	TGT	2	6	287947	287952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119825
6246	NC_020307	GCCA	2	8	287956	287963	25 %	0 %	25 %	50 %	452119825
6247	NC_020307	GGC	2	6	287967	287972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119825
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6249	NC_020307	GCG	2	6	287984	287989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119825
6250	NC_020307	ATT	2	6	288031	288036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119825
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6252	NC_020307	GCA	2	6	288113	288118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119825
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6362	NC_020307	CATC	2	8	292827	292834	25 %	25 %	0 %	50 %	452119833
6363	NC_020307	GCT	2	6	292914	292919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119833
6364	NC_020307	TGC	2	6	292985	292990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119833
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6370	NC_020307	CCT	2	6	293242	293247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6491	NC_020307	GAC	2	6	298357	298362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119838
6492	NC_020307	GC	3	6	298364	298369	0 %	0 %	50 %	50 %	452119838
6493	NC_020307	CGTC	2	8	298443	298450	0 %	25 %	25 %	50 %	452119838
6494	NC_020307	CGC	2	6	298489	298494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119838
6495	NC_020307	GCG	2	6	298578	298583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_020307	GACGC	2	10	298587	298596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6497	NC_020307	T	6	6	298629	298634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_020307	GC	3	6	298640	298645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6499	NC_020307	TTG	2	6	298673	298678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119839
6500	NC_020307	TTA	2	6	298686	298691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119839

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