MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020307	ATGG	2	8	251732	251739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020307	T	6	6	251807	251812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020307	TTA	2	6	251898	251903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020307	AG	3	6	251971	251976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020307	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020307	TA	4	8	252080	252087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020307	A	6	6	252139	252144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_020307	ATA	2	6	252190	252195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_020307	AATG	2	8	252213	252220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_020307	ATTC	2	8	252293	252300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_020307	TTG	2	6	252338	252343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_020307	TTTC	2	8	252358	252365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_020307	ATT	2	6	252427	252432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_020307	CAT	2	6	252476	252481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_020307	TGAT	2	8	252557	252564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020307	CAAT	2	8	252577	252584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_020307	CAT	2	6	252762	252767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119793
5518	NC_020307	T	6	6	252826	252831	0 %	100 %	0 %	0 %	452119793
5519	NC_020307	TGA	2	6	252834	252839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119793
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5521	NC_020307	AC	3	6	252943	252948	50 %	0 %	0 %	50 %	452119793
5522	NC_020307	TC	3	6	252961	252966	0 %	50 %	0 %	50 %	452119793
5523	NC_020307	AAT	2	6	252987	252992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119793
5524	NC_020307	A	7	7	253005	253011	100 %	0 %	0 %	0 %	452119793
5525	NC_020307	AGA	2	6	253022	253027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119793
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5529	NC_020307	AGTT	2	8	253148	253155	25 %	50 %	25 %	0 %	452119793
5530	NC_020307	TAT	2	6	253164	253169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119793
5531	NC_020307	CCAA	2	8	253252	253259	50 %	0 %	0 %	50 %	452119793
5532	NC_020307	AT	4	8	253325	253332	50 %	50 %	0 %	0 %	452119793
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5535	NC_020307	TTC	2	6	253410	253415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119793
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5538	NC_020307	CCA	2	6	253492	253497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119793
5539	NC_020307	TTA	2	6	253526	253531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119793
5540	NC_020307	AAATA	2	10	253545	253554	80 %	20 %	0 %	0 %	452119793
5541	NC_020307	AATG	2	8	253555	253562	50 %	25 %	25 %	0 %	452119793
5542	NC_020307	ATT	2	6	253582	253587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119793
5543	NC_020307	TA	3	6	253598	253603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020307	TGAA	2	8	253650	253657	50 %	25 %	25 %	0 %	452119794
5545	NC_020307	ATT	2	6	253688	253693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119794
5546	NC_020307	ATT	2	6	253724	253729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119794
5547	NC_020307	A	6	6	253807	253812	100 %	0 %	0 %	0 %	452119794
5548	NC_020307	GTTG	2	8	253830	253837	0 %	50 %	50 %	0 %	452119794
5549	NC_020307	GCT	2	6	253838	253843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119794
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5552	NC_020307	TCA	2	6	254056	254061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119794
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5554	NC_020307	GCA	2	6	254258	254263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119794
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5556	NC_020307	TGG	2	6	254313	254318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119794
5557	NC_020307	GAT	2	6	254324	254329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119794
5558	NC_020307	TC	3	6	254354	254359	0 %	50 %	0 %	50 %	452119794
5559	NC_020307	TGA	2	6	254379	254384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119794
5560	NC_020307	CAT	2	6	254435	254440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119794
5561	NC_020307	TGGT	2	8	254457	254464	0 %	50 %	50 %	0 %	452119794
5562	NC_020307	TTCT	2	8	254562	254569	0 %	75 %	0 %	25 %	452119794
5563	NC_020307	TAA	2	6	254623	254628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119794
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5572	NC_020307	CAG	2	6	255117	255122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119794
5573	NC_020307	TA	3	6	255149	255154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_020307	ACA	2	6	255207	255212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_020307	TTA	2	6	255283	255288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119795
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5584	NC_020307	GAA	2	6	255609	255614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119795
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5594	NC_020307	CTGGT	2	10	255959	255968	0 %	40 %	40 %	20 %	452119795
5595	NC_020307	GTGCT	2	10	255973	255982	0 %	40 %	40 %	20 %	452119795
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5599	NC_020307	CAA	2	6	256137	256142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119795
5600	NC_020307	T	7	7	256228	256234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_020307	TTTA	2	8	256271	256278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5606	NC_020307	AACT	2	8	256752	256759	50 %	25 %	0 %	25 %	452119796
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5616	NC_020307	TATAA	2	10	257349	257358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_020307	ACT	2	6	257379	257384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5621	NC_020307	T	6	6	257657	257662	0 %	100 %	0 %	0 %	452119797
5622	NC_020307	CAT	2	6	257696	257701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119797
5623	NC_020307	AAAG	2	8	257709	257716	75 %	0 %	25 %	0 %	452119797
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5877	NC_020307	GTTT	2	8	270701	270708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5878	NC_020307	ACA	2	6	270719	270724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5879	NC_020307	T	6	6	270813	270818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5880	NC_020307	T	7	7	270829	270835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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