MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020307	CAT	3	9	229016	229024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119766
5003	NC_020307	CAA	2	6	229054	229059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452119766
5004	NC_020307	GGT	2	6	229079	229084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119766
5005	NC_020307	CTT	2	6	229162	229167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119766
5006	NC_020307	CTT	2	6	229318	229323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119766
5007	NC_020307	CGC	2	6	229663	229668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119767
5008	NC_020307	GC	3	6	229684	229689	0 %	0 %	50 %	50 %	452119767
5009	NC_020307	CGT	2	6	229828	229833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119767
5010	NC_020307	GCC	2	6	229835	229840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119767
5011	NC_020307	AAT	2	6	229844	229849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119767
5012	NC_020307	CGC	2	6	229867	229872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119767
5013	NC_020307	CG	3	6	229882	229887	0 %	0 %	50 %	50 %	452119767
5014	NC_020307	ACT	2	6	229902	229907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119767
5015	NC_020307	TGG	2	6	229915	229920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119767
5016	NC_020307	CCG	2	6	229936	229941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119767
5017	NC_020307	CAG	2	6	230021	230026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119767
5018	NC_020307	T	6	6	230104	230109	0 %	100 %	0 %	0 %	452119767
5019	NC_020307	TC	3	6	230122	230127	0 %	50 %	0 %	50 %	452119767
5020	NC_020307	TGT	2	6	230157	230162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119767
5021	NC_020307	CCA	2	6	230206	230211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119767
5022	NC_020307	TGC	2	6	230218	230223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119767
5023	NC_020307	T	6	6	230250	230255	0 %	100 %	0 %	0 %	452119768
5024	NC_020307	TTCAC	2	10	230294	230303	20 %	40 %	0 %	40 %	452119768
5025	NC_020307	TGCG	2	8	230310	230317	0 %	25 %	50 %	25 %	452119768
5026	NC_020307	CGC	2	6	230361	230366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119768
5027	NC_020307	CTT	2	6	230496	230501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119768
5028	NC_020307	AAG	2	6	230547	230552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_020307	AAT	2	6	230596	230601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020307	ATTTA	2	10	230657	230666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020307	ATT	2	6	230681	230686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_020307	TAT	2	6	230694	230699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020307	TAT	2	6	230807	230812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_020307	ATG	2	6	230848	230853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020307	GCT	2	6	230855	230860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_020307	AGGC	2	8	230911	230918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_020307	CAA	2	6	230930	230935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_020307	ATGA	2	8	231033	231040	50 %	25 %	25 %	0 %	452119769
5039	NC_020307	T	6	6	231093	231098	0 %	100 %	0 %	0 %	452119769
5040	NC_020307	GTT	2	6	231106	231111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119769
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5042	NC_020307	CGG	2	6	231215	231220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119769
5043	NC_020307	TAT	2	6	231293	231298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119769
5044	NC_020307	GGC	2	6	231321	231326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119769
5045	NC_020307	CTG	2	6	231330	231335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119769
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5051	NC_020307	AGC	2	6	231767	231772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119769
5052	NC_020307	AT	3	6	231774	231779	50 %	50 %	0 %	0 %	452119769
5053	NC_020307	ATG	2	6	231853	231858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020307	TAA	2	6	231979	231984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020307	TGTTT	2	10	232004	232013	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_020307	TAA	2	6	232079	232084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119770
5057	NC_020307	GGTTGT	2	12	232121	232132	0 %	50 %	50 %	0 %	452119770
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5066	NC_020307	CGA	2	6	232661	232666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119770
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5071	NC_020307	CAA	2	6	233054	233059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_020307	AAT	2	6	233060	233065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020307	TGA	2	6	233104	233109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020307	TTA	2	6	233135	233140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020307	ATT	2	6	233248	233253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_020307	CCTG	2	8	233433	233440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_020307	CAA	2	6	233452	233457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_020307	ACC	2	6	233529	233534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_020307	GGC	2	6	233555	233560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119771
5084	NC_020307	GCT	2	6	233636	233641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119771
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5086	NC_020307	TGGCG	2	10	233720	233729	0 %	20 %	60 %	20 %	452119771
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5090	NC_020307	CGACC	2	10	233978	233987	20 %	0 %	20 %	60 %	452119771
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5099	NC_020307	GAT	2	6	234434	234439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119771
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5105	NC_020307	GGA	2	6	234584	234589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119771
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5107	NC_020307	TCA	2	6	234605	234610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119771
5108	NC_020307	ACT	2	6	234742	234747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119771
5109	NC_020307	CCG	2	6	234769	234774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119771
5110	NC_020307	GGC	2	6	234825	234830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119771
5111	NC_020307	GCA	2	6	234896	234901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119771
5112	NC_020307	CTGG	2	8	234902	234909	0 %	25 %	50 %	25 %	452119771
5113	NC_020307	CGG	2	6	234910	234915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119771
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5115	NC_020307	ATC	2	6	234971	234976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119772
5116	NC_020307	GGC	3	9	235085	235093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
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5118	NC_020307	CTGGCG	2	12	235145	235156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119772
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5121	NC_020307	CGCGC	2	10	235235	235244	0 %	0 %	40 %	60 %	452119772
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5123	NC_020307	TCG	2	6	235308	235313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119772
5124	NC_020307	CAGC	2	8	235334	235341	25 %	0 %	25 %	50 %	452119772
5125	NC_020307	GTG	2	6	235358	235363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119772
5126	NC_020307	CGC	2	6	235401	235406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119772
5127	NC_020307	CGG	2	6	235423	235428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
5128	NC_020307	CGC	2	6	235431	235436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119772
5129	NC_020307	TGG	2	6	235476	235481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119772
5130	NC_020307	GAC	2	6	235532	235537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119772
5131	NC_020307	CCCG	2	8	235553	235560	0 %	0 %	25 %	75 %	452119772
5132	NC_020307	GCTG	2	8	235566	235573	0 %	25 %	50 %	25 %	452119772
5133	NC_020307	GGCG	2	8	235614	235621	0 %	0 %	75 %	25 %	452119772
5134	NC_020307	TGGC	2	8	235630	235637	0 %	25 %	50 %	25 %	452119772
5135	NC_020307	GT	3	6	235684	235689	0 %	50 %	50 %	0 %	452119772
5136	NC_020307	CGG	2	6	235714	235719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
5137	NC_020307	ACT	2	6	235728	235733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119772
5138	NC_020307	CGATT	2	10	235806	235815	20 %	40 %	20 %	20 %	452119772
5139	NC_020307	CTGGCG	2	12	235835	235846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452119772
5140	NC_020307	GCG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119772
5141	NC_020307	GAC	2	6	235890	235895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_020307	CAG	2	6	235911	235916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119773
5143	NC_020307	ATT	2	6	235947	235952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
5144	NC_020307	ATT	2	6	235959	235964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
5145	NC_020307	ACC	2	6	236034	236039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119773
5146	NC_020307	CTGG	2	8	236051	236058	0 %	25 %	50 %	25 %	452119773
5147	NC_020307	AGC	2	6	236089	236094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119773
5148	NC_020307	ATT	2	6	236121	236126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119773
5149	NC_020307	TAA	2	6	236159	236164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119773
5150	NC_020307	GGC	2	6	236184	236189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
5151	NC_020307	CG	3	6	236215	236220	0 %	0 %	50 %	50 %	452119773
5152	NC_020307	GC	3	6	236225	236230	0 %	0 %	50 %	50 %	452119773
5153	NC_020307	GCC	2	6	236262	236267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119773
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5155	NC_020307	GCG	2	6	236368	236373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
5156	NC_020307	TGG	2	6	236374	236379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119773
5157	NC_020307	CGGCG	2	10	236399	236408	0 %	0 %	60 %	40 %	452119773
5158	NC_020307	GGC	2	6	236469	236474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119773
5159	NC_020307	GCT	2	6	236504	236509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119773
5160	NC_020307	TGA	2	6	236529	236534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119773
5161	NC_020307	CTTT	2	8	236540	236547	0 %	75 %	0 %	25 %	452119774
5162	NC_020307	ACC	2	6	236594	236599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452119774
5163	NC_020307	CGG	3	9	236613	236621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
5164	NC_020307	CGC	2	6	236629	236634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
5165	NC_020307	TCA	2	6	236662	236667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119774
5166	NC_020307	CGC	2	6	236718	236723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
5167	NC_020307	GGC	2	6	236765	236770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
5168	NC_020307	GAT	2	6	236771	236776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119774
5169	NC_020307	CACG	2	8	236785	236792	25 %	0 %	25 %	50 %	452119774
5170	NC_020307	GGC	2	6	236849	236854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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5172	NC_020307	CGC	2	6	236922	236927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
5173	NC_020307	A	6	6	237021	237026	100 %	0 %	0 %	0 %	452119774
5174	NC_020307	GGC	2	6	237053	237058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119774
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5177	NC_020307	CGCT	2	8	237116	237123	0 %	25 %	25 %	50 %	452119774
5178	NC_020307	AC	3	6	237225	237230	50 %	0 %	0 %	50 %	452119774
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5181	NC_020307	CGC	2	6	237340	237345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
5182	NC_020307	GC	3	6	237380	237385	0 %	0 %	50 %	50 %	452119774
5183	NC_020307	GC	3	6	237420	237425	0 %	0 %	50 %	50 %	452119774
5184	NC_020307	ATC	2	6	237516	237521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119774
5185	NC_020307	TTTG	2	8	237534	237541	0 %	75 %	25 %	0 %	452119774
5186	NC_020307	TGC	2	6	237555	237560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119774
5187	NC_020307	CGC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119774
5188	NC_020307	CGA	2	6	237640	237645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119774
5189	NC_020307	TGA	2	6	237704	237709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119775
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5191	NC_020307	GGC	2	6	237790	237795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119775
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5197	NC_020307	CG	3	6	238116	238121	0 %	0 %	50 %	50 %	452119775
5198	NC_020307	CG	3	6	238131	238136	0 %	0 %	50 %	50 %	452119775
5199	NC_020307	ATGAA	2	10	238232	238241	60 %	20 %	20 %	0 %	452119775
5200	NC_020307	GTG	2	6	238246	238251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119775
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5208	NC_020307	TGA	2	6	238641	238646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119776
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5210	NC_020307	CAGCTT	2	12	238724	238735	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452119776
5211	NC_020307	CGC	2	6	238746	238751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119776
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5213	NC_020307	TCG	2	6	238855	238860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119777
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5220	NC_020307	CCG	2	6	239135	239140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119777
5221	NC_020307	GCG	2	6	239190	239195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119777
5222	NC_020307	TACCG	2	10	239213	239222	20 %	20 %	20 %	40 %	452119777
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5233	NC_020307	GTC	2	6	239848	239853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119778
5234	NC_020307	TGA	2	6	239856	239861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119778
5235	NC_020307	GCGG	2	8	239899	239906	0 %	0 %	75 %	25 %	452119778
5236	NC_020307	CGG	2	6	240044	240049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119778
5237	NC_020307	GTCA	2	8	240073	240080	25 %	25 %	25 %	25 %	452119778
5238	NC_020307	TGG	2	6	240097	240102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119778
5239	NC_020307	TGA	2	6	240159	240164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119778
5240	NC_020307	GTG	2	6	240265	240270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119778
5241	NC_020307	CGC	2	6	240286	240291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119778
5242	NC_020307	GC	3	6	240325	240330	0 %	0 %	50 %	50 %	452119778
5243	NC_020307	A	6	6	240391	240396	100 %	0 %	0 %	0 %	452119778
5244	NC_020307	CCT	2	6	240422	240427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452119778
5245	NC_020307	CCG	2	6	240455	240460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119778
5246	NC_020307	CCGGC	2	10	240536	240545	0 %	0 %	40 %	60 %	452119778
5247	NC_020307	TTA	2	6	240553	240558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119778
5248	NC_020307	ATG	2	6	240669	240674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119779
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5250	NC_020307	TCG	2	6	240712	240717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119779
5251	NC_020307	GGC	2	6	240812	240817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119779
5252	NC_020307	TCA	2	6	240853	240858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119779
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5260	NC_020307	GTG	2	6	241194	241199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119779
5261	NC_020307	CCG	2	6	241204	241209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119779
5262	NC_020307	AAGA	2	8	241215	241222	75 %	0 %	25 %	0 %	452119779
5263	NC_020307	TAA	2	6	241295	241300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452119779
5264	NC_020307	TGA	2	6	241324	241329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119779
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5270	NC_020307	GTC	2	6	241506	241511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119780
5271	NC_020307	GCATC	2	10	241571	241580	20 %	20 %	20 %	40 %	452119780
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5489	NC_020307	AT	4	8	250672	250679	50 %	50 %	0 %	0 %	452119791
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